用于快速鉴定临床标本中皮肤癣菌的寡核苷酸阵列的评价

对疑似甲真菌病患者的指甲标本进行了分析。

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作为标准患者护理的一部分，样本是从台湾台南国立成功大学医院（NCKUH，三级转诊医院）皮肤科采集的。

指甲样本收集为甲下刮屑、剪下物或刮除物。 样品在室温下立即在无菌 Eppendorf 管中运送到 NCKUH 皮肤科实验室，用于 KOH 染色和常规真菌培养。

样品准备：

用手术刀片将每个样品切成小块，并用 2 毫升玻璃匀浆器匀浆。 悬液在 37°C 下用裂解酶处理 30 分钟，并用 Blood & Tissue 基因组 DNA 试剂盒提取 DNA。PCR 程序和阵列杂交与之前的研究相同。

分析：

如果阵列和培养方法之间的结果、重测序、KOH mount 和患者抗真菌治疗后的结果有差异分析。 在差异分析后计算具有灵敏度、特异性、阳性（PPV）和阴性预测值（NPV）的阵列和培养方法的性能评价。 通过 Fisher 精确检验估计显着差异。