小児肥満症における全エクソームシーケンス

履修科目数：

私たちの研究は、早期発症肥満に関連する感受性のある遺伝的変異体を特定することを目的としているため、以前の研究で収集した既存の DNA サンプルに加えて、この遺伝的研究に参加するために 400 人の肥満児を募集します (DSRB Ref C/00/501 ）。 これらの 400 人の肥満児は、健康増進委員会の NUH 小児科クリニックと学校保健クリニックを通じて募集されます。 また、調査研究への参加に関心のある肥満児の家族も募集します。 我々は、2000 年 1 月から 2004 年 12 月までに肥満遺伝子研究に参加した 250 人の肥満児の DNA サンプルと情報を使用します (DSRB Ref C/00/501)。 また、「アジア人集団における極端な近視の遺伝子を特定するための全エクソーム配列決定」というタイトルの進行中の研究のために募集された 500 人のやせた成人 (対照として) に対して WES を実行します (NUS-IRB 参照コード: 12-466)。

新たに募集する肥満児被験者の総数: 400 家族 (親と兄弟) の総数: 500 使用する既存の肥満児被験者の総数: 250 使用する既存の痩せた成人対照の総数: 500

採用基準：

医師は被験者の年齢と病歴について簡単な質問をします。

肥満の被験者の場合: 10 歳未満の過体重で、体重が身長の理想体重または 97 パーセンタイルを超える年齢の BMI を 40% 上回っており、主要な医学的疾患はありません。

家族の場合：肥満の子供の両親または直接の兄弟（選択基準なし） 対照の場合：BMI が 18.5 kg/m2 から 23 kg/m2 の間で、研究が進行中の痩せた成人（NUS-IRB 参照コード：12-466）

包含基準:

肥満の被験者は、この研究に参加するには、次の選択基準をすべて満たす必要があります。

1. 身長に対する理想体重 (WFH) が 140% 以上、または年齢に対する BMI が 97 パーセンタイル以上
2. 10歳になる前に太りすぎ
3. 肥満の子供の被験者と法定代理人の両方からのインフォームドコンセント。 両親

この研究に参加するには、家族が次の選択基準をすべて満たす必要があります。

1. -肥満の被験者の親または直接の兄弟でなければなりません
2. -被験者と親の両方からのインフォームドコンセントは、被験者が21歳未満である

除外基準:

ベースラインで除外基準のいずれかを満たすすべての被験者は、参加から除外されます。

1. 血液検査やOGTT検査には不向き
2. インフォームドコンセントなし

出金基準:

以下の場合、試験は中止されることがあります。

• OSHE の承認なし
• DSRB 承認なし
• 被験者に対して行われた不適切な処置に関する苦情
• 実験室毒性

研究訪問と手順:

1. スクリーニングの訪問と手順 被験者は、HPB または NUH 小児科クリニックの学校保健クリニックでスクリーニングされます。 被験者の年齢、体重、身長を測定します。 地元の子供たちの人口の 140% を超える身長の理想的な体重、または年齢の BMI が 97 パーセンタイルを超えると医師が判断した人のみが研究に招待されます。 被験者は同意書を持って帰宅し、募集の3か月前までに返信することが許可されます。

2. 研究訪問および手順 研究訪問 1: 訓練を受けた医師は、被験者が身体検査を行った場合、病歴に関するインタビューを行います。 肝臓パネル、脂質パネル、空腹時インスリンレベル、空腹時C-ペプチドレベルの試験のために、対象から15mlの血液を採取する(一晩絶食後)。 被験者は経口ブドウ糖負荷試験（OGTT）も受けます。OGTT 中、0 分と 120 分の時間間隔で 2ml の血液が採取されます。 2時間のOGTTの間、被験者は、動機付けレベル、社会経済的状態、身体活動および食事に関する3セットのアンケートに記入する必要があります。

   肥満被験者の家族は、OGTTを受ける必要がないことを除いて、被験者について上記のすべてのテストを受ける必要があります。

3. 最終研究訪問:

   最後の研究訪問は、最初の訪問の2〜3週間後に予定されます。 被験者のスクリーニングレポートは、被験者の主治医によってレビューおよび評価されます。

4. 研究後のフォローアップと手順 被験者は、健康スクリーニング検査レポートのコピーを保管することができます。 脂質異常症、高血圧、高体脂肪率、肝臓の機能不全、耐糖能異常などの病状に苦しんでいることが判明した被験者については、結果の測定を確認するためのさらなる検査と医療処置のために他の部門に紹介されます。 遺伝子検査でまれな遺伝子変異を持っていることが判明した被験者も、さらなる臨床検査と検査のために呼び戻されます。
5. 中止のための通院および手順 被験者は、いつでも研究への参加を自発的に辞退することができます。 被験者の生物学的サンプルは、被験者の要求に応じて廃棄されます。 ただし、患者が研究の健康スクリーニング中に他の合併症に苦しんでいることが判明した場合、彼らはアドバイスを受け、治療のために他の部門に紹介されます.

データ品質保証:

システムへの患者データの電子入力は、データ入力を独立して行う 2 人の研究コーディネーターによって処理されます。 したがって、各被験者のデータは、2 人の独立した研究コーディネーターによってシステムに 2 回入力されます。 件名ごとに 2 つのエントリをシステムで比較して、件名のすべての情報が正しく正確に入力されていることを確認します。 また、主任研究者は、データの品質を保証するために毎月システムを無作為にチェックします。

データ入力と保管:

臨床試験データとアンケートは、被験者が紙に記入します。 紙の文書は PI のオフィスに転送または返送され、各被験者のデータは 2 人の独立した研究コーディネーターによって電子的に入力され、データの品質が保証されます。 文書のすべての電子入力は、オフィスのコンピューターを使用してオフィス内でのみ実行でき、すべての紙の文書は、1 日の終わりに返却して施錠する必要があります。 電子文書はパスワードで保護され、紙の文書のハード コピーは PI のオフィスにあるロックとキーのアクセス キャビネットに保管されます。 データがどこに入力され（つまり、これらの入力は紙または電子的に）、保存され、処理されるかについて簡単に説明します。

サンプルサイズの決定:

電力計算は Quanto (ver 1.2.4) を使用して実行されました。 さまざまな MAF (α=0.01) での発見段階で 2.0 ～ 5.0 の奇数比でバリアントを検出するには、400 人の肥満児のサンプル サイズは、大きな効果を持つバリアントを検出するために約 51% ～ 98% の検出力です (OR = 3.5) 私たちの発見段階では、MAF はそれぞれ 0.5% から 3.0% の間です (α=0.01)。

統計および分析計画:

SPSSを使用したケースコントロールデザインで、優先順位が付けられたすべての有害な非同義バリアントが統計的関連性についてテストされます。 両側フィッシャーの正確確率検定は、MAF < 3% のバリアントとロジスティック回帰に利用され、MAF ≥ 3% のバリアントに対して性別の調整が実行されます。 これらは PLINK を使用して行われます。 また、Sequencing Kernel Association Test (SKAT) ソフトウェアを使用して、遺伝子レベルの負荷テストを実施します。 すべての単一バリアントおよび遺伝子レベルの結果は、Bonferonni 補正を使用して複数のテストに対して補正されます。 予測ツール (Polyphen2) によって非常に破壊的であると特定されたバリアント (ナンセンス、スプライス部位、フレームシフトの変化として定義され、タンパク質構造を著しく破壊する) は、検証のために優先されます。

de novo ジェノタイピング データの統計分析は、主要な目的 1 と同様です。その後、固定効果モデルを想定して、逆分散加重法を使用して、発見段階と検証段階からのデータをメタ分析し、プールされた全体的な結果を導き出します。推定値と両側 p 値。 不均一性チェックが実施され (Cochran の Q および I2 インデックス)、有意な (Q p 値 < 0.05 および/または I2 インデックス > 40%) 異質性が検出されたバリアントでは、ランダム効果モードでメタ分析が実行されます。同じように。

トライアル文書の保持:

病歴、臨床報告、血液検査結果、アンケート、OSHE文書、IRB文書およびDSRB文書を含むすべての参加者の記録は、主任研究者によって彼のカードアクセスオフィスのロックアップキャビネットに保管されます。 主任捜査官のみが鍵を保持し、ロックアップ キャビネットに直接アクセスできます。 これらの文書は、調査研究の終了後 6 年間保持されます。

治験責任医師主導治験の場合：

治験薬に関連する予想外の重篤な有害事象 (SAE) はすべて HSA に報告する必要があります。

「深刻な有害事象または深刻な薬物有害反応とは、次のいずれかの用量で発生した有害な医学的出来事です。

• 死に至る。
• 生命を脅かす (即時の死亡リスク)。
• 入院患者の入院または既存の入院の延長が必要です。
• 永続的または重大な障害/無能力をもたらす。
• 先天性異常/先天性欠損症を引き起こします。
• 医学的に重要なイベントです。

ある事象が重要な医学的事象であるかどうかを判断するには、医学的および科学的な判断を下す必要があります。 重要な医療イベントは、すぐに生命を脅かしたり、死亡または入院につながるとは限りません。 しかし、イベントが被験者を危険にさらす可能性がある、および/または他の有害なイベントの結果の1つを防ぐために介入を必要とする可能性があると判断された場合、重要な医学的イベントは深刻なものとして報告されるべきです.

予想外で治験薬に関連するすべての SAE が報告されます。 捜査官は、事件が迅速な報告の資格があることを最初に知ってから 15 暦日以内に HSA に通知する責任があります。 フォロー情報は、利用可能になり次第、積極的に求めて提出します。 致命的または生命を脅かすケースの場合、HSA はできるだけ早く通知されますが、ケースが適格であることが最初にわかってから 7 暦日以内に通知され、さらに 8 暦日以内に完全な報告が続きます。