소아 비만의 전체 엑솜 시퀀싱

등록할 과목 수:

본 연구의 목표는 초기 비만과 관련된 민감한 유전적 변이를 확인하는 것이므로 이전 연구에서 수집한 기존 DNA 샘플(DSRB 참조 C/00/501 ). 이 비만아동 400명은 건강증진원 산하 NUH 소아과와 학교보건진료소를 통해 모집한다. 또한 연구에 참여하고자 하는 비만 아동의 가족도 모집할 예정입니다. 우리는 이전에 2000년 1월부터 2004년 12월까지 비만 유전 연구에 모집된 비만 아동 250명의 DNA 샘플과 정보를 사용할 것입니다(DSRB 참조 C/00/501). 우리는 또한 "아시아 인구에서 극심한 근시를 위한 유전자를 식별하기 위한 전체 엑솜 시퀀싱"(NUS-IRB 참조 코드: 12-466)이라는 진행 중인 연구를 위해 모집된 500명의 날씬한 성인(대조군)에 대해 WES를 수행할 것입니다.

새로 모집할 비만아동 총 피험자 수: 400 총 가족 구성원(부모 및 형제자매): 500 기존 비만아동 피험자 총 수: 250 기존 마른 성인 대조군 총 수: 500

모집 기준:

의사는 피험자의 나이와 병력에 관한 몇 가지 간단한 질문을 할 것입니다.

비만 피험자의 경우: 10세 이전에 과체중이고 체중이 키에 대한 이상적인 체중보다 40% 이상 높거나 BMI가 97백분위수 이상인 경우 주요 의학적 질병이 없습니다.

가족 구성원의 경우: 비만 아동의 부모 또는 직계 형제자매(선택 기준 없음) 통제 대상: BMI가 18.5kg/m2 ~ 23kg/m2인 진행 중인 연구(NUS-IRB 참조 코드: 12-466)의 날씬한 성인

포함 기준:

비만 피험자는 본 연구에 참여하기 위해 다음 포함 기준을 모두 충족해야 합니다.

1. 최소 140%의 신장(WFH) 또는 97번째 백분위수 이상의 연령에 대한 BMI에 대한 이상적인 체중
2. 10세 이전의 과체중
3. 비만 아동 피험자와 법적 대리인 모두의 사전 동의 예. 부모

가족 구성원은 이 연구에 참여하기 위해 다음 포함 기준을 모두 충족해야 합니다.

1. 비만 피험자의 부모 또는 직계 형제자매여야 함
2. 대상자와 부모 모두의 사전 동의 대상자는 21세 미만입니다.

제외 기준:

기준선에서 제외 기준을 충족하는 모든 피험자는 참여에서 제외됩니다.

1. 혈액 검사 및 OGTT 검사에 부적합
2. 정보에 입각한 동의 없음

철회 기준:

다음과 같은 경우 연구가 중단될 수 있습니다.

• OSHE 승인 없음
• DSRB 승인 없음
• 피험자에게 수행된 부적절한 절차에 대한 불만
• 실험실 독성

연구 방문 및 절차:

1. 스크리닝 방문 및 절차 피험자는 HPB 또는 NUH 소아 클리닉의 학교 보건 클리닉에서 스크리닝됩니다. 피험자의 나이, 체중, 키를 측정합니다. 의사가 140% 이상의 키에 대한 이상적인 체중 또는 지역 어린이 인구의 97번째 백분위수 이상의 나이에 대한 BMI를 가지고 있다고 결정한 사람들만 연구에 초대될 것입니다. 피험자는 채용 전 3개월 이내에 동의서를 지참하고 회신할 수 있습니다.

2. 연구 방문 및 절차 연구 방문 1: 훈련된 의사는 피험자가 신체 검사를 수행한 경우 병력에 관한 인터뷰를 수행합니다. 간 패널, 지질 패널, 공복 인슐린 수치, 공복 C-펩티드 수치를 테스트하기 위해 피험자로부터 15ml의 혈액을 채취합니다(밤샘 금식 후). 대상자는 또한 OGTT 동안 0분 및 120분 시간 간격으로 2ml의 혈액을 채취하는 경구 포도당 내성 검사(OGTT)를 거치게 됩니다. 2시간 OGTT 동안 피험자는 동기 수준, 사회 경제적 지위, 신체 활동 및 식이요법에 관한 3세트의 설문지를 작성해야 합니다.

   비만 피험자의 가족은 OGTT를 받을 필요가 없다는 점을 제외하고 피험자에 대해 위에서 설명한 모든 테스트를 거쳐야 합니다.

3. 최종 연구 방문:

   최종 연구 방문은 첫 번째 방문 후 2-3주 후에 예정됩니다. 피험자의 선별 보고서는 담당 의사가 피험자를 검토하고 평가합니다.

4. 연구 후 후속 조치 및 절차 피험자는 자신의 건강 선별 검사 보고서 사본을 보관할 수 있습니다. 이상지질혈증, 고혈압, 높은 체지방률, 간 기능 부전 또는 포도당 불내증과 같은 의학적 상태를 앓고 있는 것으로 밝혀진 피험자의 경우, 결과 측정을 확인하기 위해 추가 검사 및 치료를 위해 다른 부서로 보내질 것입니다. 유전자 검사를 통해 희귀 유전 변이가 있는 것으로 밝혀진 피험자는 추가로 다시 임상 검사 및 검사를 위해 다시 호출됩니다.
5. 중단 방문 및 절차 피험자는 언제든지 연구 참여를 자발적으로 철회할 수 있습니다. 피험자의 생물학적 샘플은 피험자의 요청에 따라 폐기됩니다. 그러나 연구 건강 검진 중 환자가 다른 합병증을 앓고 있는 것으로 밝혀지면, 환자에게 조언하고 치료를 위해 다른 부서로 의뢰할 것입니다.

데이터 품질 보증:

시스템에 대한 환자 데이터의 전자 입력은 데이터 입력을 독립적으로 수행할 2명의 연구 코디네이터가 처리합니다. 따라서 각 주제의 데이터는 2명의 독립적인 연구 코디네이터에 의해 시스템에 두 번 입력됩니다. 주제에 대한 모든 정보가 올바르고 정확하게 입력되었는지 확인하기 위해 주제별로 2개의 항목 간에 시스템 비교를 수행합니다. 또한 연구책임자는 매월 시스템을 통해 무작위로 데이터 품질 보증을 확인합니다.

데이터 입력 및 저장:

임상 테스트 데이터 및 설문지는 피험자가 종이에 입력합니다. 종이 문서는 PI 사무실로 다시 전송되거나 운송되며 각 피험자의 데이터는 데이터 품질 보증을 보장하기 위해 2명의 독립적인 연구 코디네이터가 전자적으로 입력합니다. 문서의 모든 전자 입력은 사무용 컴퓨터를 사용하여 사무실 내에서만 수행할 수 있으며 모든 종이 문서는 일과 종료 시 잠금을 위해 반환해야 합니다. 전자 문서는 암호로 보호되며 종이 문서의 하드카피는 PI 사무실의 잠금 및 키 액세스 캐비닛에 보관됩니다. 데이터가 어디에 입력되고(즉, 이러한 항목이 종이에 기록될 것인지 전자적으로 기록될 것인지), 저장 및 처리되는 위치에 대해 간략하게 논의하십시오.

샘플 크기 결정:

전력 계산은 Quanto(버전 1.2.4)를 사용하여 수행되었습니다. 다양한 MAF(α=0.01)에서 발견 단계에서 2.0-5.0의 홀수 비율의 검정력으로 변이체를 감지하기 위해 400명의 비만 아동의 표본 크기는 큰 효과(OR = 3.5) 발견 단계에서 MAF에서 각각 0.5%와 3.0% 사이(α=0.01).

통계 및 분석 계획:

우선 순위가 지정된 모든 손상 비동의 변종은 SPSS를 사용하는 케이스 컨트롤 설계에서 통계적 연관성에 대해 테스트됩니다. 양측 피셔의 정확 테스트는 MAF < 3% 및 로지스틱 회귀를 가진 변이체에 활용될 것이며, 성별에 대한 조정은 MAF ≥ 3%인 변이체에 대해 수행될 것입니다. 이러한 작업은 PLINK를 사용하여 수행됩니다. 또한 SKAT(Sequencing Kernel Association Test) 소프트웨어를 사용하여 유전자 수준 부담 테스트를 수행합니다. 모든 단일 변형 및 유전자 수준 결과는 Bonferonni 보정을 사용하여 여러 테스트에 대해 보정됩니다. 예측 도구(Polyphen2)에 의해 매우 파괴적인 것으로 식별된 모든 변이체(단백질 구조를 심각하게 방해하는 넌센스, 스플라이스 사이트 및 프레임 이동 변경으로 정의됨)는 검증을 위해 우선 순위가 지정됩니다.

de novo genotyping 데이터의 통계 분석은 1차 목표 1과 유사합니다. 이후 고정 효과 모델을 가정하여 역 분산 가중 방법을 사용하여 발견 및 검증 단계의 데이터를 메타 분석하여 전체 통합을 도출합니다. 추정치 및 양측 p-값. 이질성 검사(Cochran의 Q 및 I2 인덱스)가 수행되고, 유의한(Q p-값 <0.05 및/또는 I2 인덱스 >40%) 이질성이 감지된 변이체에서 무작위 효과 모드에서 메타 분석이 수행됩니다. 또한.

재판 문서의 보관:

의료 기록, 임상 보고서, 혈액 검사 결과, 설문지, OSHE 문서, IRB 문서 및 DSRB 문서를 포함하는 모든 참가자의 기록은 수석 조사관이 카드 액세스 사무실의 잠금 캐비닛에 보관합니다. 수석 조사관만이 열쇠를 가지고 잠금 캐비닛에 직접 접근할 수 있습니다. 이 문서는 연구 종료 후 6년간 보관됩니다.

주요 조사자가 시작한 임상시험의 경우:

예상치 못한 연구 약물과 관련된 모든 심각한 부작용(SAE)은 HSA에 보고해야 합니다.

"심각한 이상 반응 또는 심각한 약물 이상 반응은 다음과 같은 모든 용량에서 발생하는 뜻밖의 의학적 사건입니다.

• 결과는 죽음입니다.
• 생명을 위협합니다(즉각적인 사망 위험).
• 입원 환자 입원 또는 기존 입원 기간 연장이 필요합니다.
• 지속적이거나 상당한 장애/무능력을 초래합니다.
• 선천적 기형/선천적 결손을 초래합니다.
• 의학적으로 중요한 사건입니다.

사건이 중요한 의학적 사건인지 여부를 결정하는 데 있어 의학적 및 과학적 판단이 이루어져야 합니다. 중요한 의학적 사건은 즉시 생명을 위협하거나 사망 또는 입원을 초래하지 않을 수 있습니다. 그러나 사건이 피험자를 위험에 빠뜨릴 수 있고/있거나 다른 부작용 결과 중 하나를 예방하기 위해 개입이 필요할 수 있다고 판단되는 경우 중요한 의료 사건은 심각한 것으로 보고되어야 합니다."

예상치 못한 연구 약물과 관련된 모든 SAE가 보고될 것입니다. 조사관은 사건이 신속 보고 대상임을 처음 알게 된 후 15일 이내에 HSA에 알릴 책임이 있습니다. 후속 정보는 입수 가능한 대로 적극적으로 찾고 제출될 것입니다. 치명적이거나 생명을 위협하는 사례의 경우, HSA는 해당 사례가 적격하다는 사실을 처음 알게 된 후 7일 이내에 가능한 한 빨리 통지하고 추가 8일 이내에 전체 보고서를 제출합니다.