Heleksom-sekventering i fedme hos børn

Antal fag, der skal tilmeldes:

Da vores undersøgelse sigter mod at identificere modtagelige genetiske varianter forbundet med tidligt opstået fedme, vil vi rekruttere 400 overvægtige børn til at deltage i denne genetiske undersøgelse, ud over de eksisterende DNA-prøver, vi indsamlede i en tidligere undersøgelse (DSRB Ref C/00/501 ). Disse 400 overvægtige børn vil blive rekrutteret gennem NUH pædiatrisk klinik og skolesundhedsklinik ved Health Promotion Board. Vi vil også rekruttere familiemedlemmer til de overvægtige børn, som er interesseret i at deltage i forskningsstudiet. Vi vil bruge DNA-prøver og information fra 250 overvægtige børn, der tidligere er rekrutteret til Obesity Genetic Study fra januar 2000 til december 2004 (DSRB Ref C/00/501). Vi vil også udføre WES på 500 magre voksne (som kontroller), der er rekrutteret til en igangværende undersøgelse med titlen "Hele exome-sekventering til at identificere gener for ekstrem nærsynethed i asiatiske populationer" (NUS-IRB referencekode: 12-466).

Samlet antal nye overvægtige børn forsøgspersoner, der skal rekrutteres: 400 Samlet antal familiemedlemmer (forældre og søskende): 500 Samlet antal eksisterende overvægtige børn forsøgspersoner, der skal bruges: 250 Samlet antal eksisterende magre voksenkontroller, der skal bruges: 500

Kriterier for rekruttering:

Lægen vil stille et par enkle spørgsmål vedrørende personers alder og sygehistorie.

For fede personer: Overvægtige før 10 års alderen, og kropsvægten er 40 % over den ideelle kropsvægt for højden, eller BMI for alder over 97. percentilen uden nogen større medicinsk sygdom.

For familiemedlemmer: Forældre eller direkte søskende til overvægtige børn (ingen udvælgelseskriterier) For kontroller: Magre voksne fra igangværende undersøgelse (NUS-IRB referencekode: 12-466) med BMI mellem 18,5 kg/m2 og 23 kg/m2

Inklusionskriterier:

Det overvægtige forsøgsperson skal opfylde alle følgende inklusionskriterier for at deltage i denne undersøgelse:

1. Ideel kropsvægt for højde (WFH) på mindst 140 % eller BMI for alder over 97. percentil
2. Overvægt før 10 års alderen
3. Informeret samtykke fra både overvægtige børn og juridisk repræsentant f.eks. forældre

Familiemedlem skal opfylde alle følgende inklusionskriterier for at deltage i denne undersøgelse:

1. Skal være forælder eller direkte søskende til overvægtige personer
2. Informeret samtykke fra både forsøgsperson og forælder er under 21 år

Ekskluderingskriterier:

Alle forsøgspersoner, der opfylder et af eksklusionskriterierne ved baseline, vil blive udelukket fra deltagelse:

1. Uegnet til blodprøver og OGTT-test
2. Intet informeret samtykke

Tilbagetrækningskriterier:

Undersøgelsen kan afbrydes, hvis:

• Ingen OSHE-godkendelse
• Ingen DSRB-godkendelse
• Klager over eventuelle upassende procedurer udført på emner
• Laboratorietoksicitet

Studiebesøg og procedurer:

1. Screeningsbesøg og -procedurer Emnet vil blive screenet på skolens sundhedsklinik på HPB eller NUH pædiatrisk klinik. Emnets alder, vægt og højde vil blive taget. Kun dem, som lægen har bestemt at de har en ideel kropsvægt for en højde på over 140 % eller BMI for en alder på over 97. percentil af den lokale børnepopulation, vil blive inviteret til undersøgelsen. Forsøgspersonen får lov til at gå hjem med samtykkeerklæringen og svare inden for 3 måneder før ansættelse.

2. Studiebesøg og procedurer Studiebesøg 1: Uddannet læge vil gennemføre en samtale vedrørende sygehistorien, hvis forsøgspersonen og udførte fysisk undersøgelse. 15 ml blod vil blive udtaget fra forsøgspersonen (efter faste natten over) til test af leverpanel, lipidpanel, fastende insulinniveau, fastende C-peptidniveau. Forsøgspersonen vil også gennemgå en oral glucosetolerancetest (OGTT), hvor 2 ml blod vil blive udtaget med både 0 min og 120 min tidsinterval under OGTT. I løbet af 2 timers OGTT skal forsøgspersonerne udfylde 3 sæt spørgeskemaer vedrørende motivationsniveau, socioøkonomisk status og fysisk aktivitet og kost.

   Familiemedlemmet til det overvægtige forsøgsperson skal gennemgå alle test som beskrevet ovenfor for forsøgspersonen, bortset fra at de ikke behøver at gennemgå OGTT.

3. Afsluttende studiebesøg:

   Det endelige studiebesøg vil blive planlagt 2-3 uger efter det første besøg. Screeningsrapporten for forsøgspersonen vil blive gennemgået og evalueret af den behandlende læge til forsøgspersonen.

4. Opfølgning og procedurer efter undersøgelse Forsøgspersonen vil være i stand til at beholde en kopi af deres helbredsscreeningstestrapporter. For forsøgspersoner, der lider af medicinske tilstande såsom dyslipidæmi, forhøjet blodtryk, høj kropsfedtprocent, leverfejl eller glukoseintolerans, vil de blive henvist til andre afdelinger for yderligere test og lægehjælp for at bekræfte resultatmål. Forsøgspersoner, der viser sig at have en sjælden genetisk variant gennem genetisk testning, vil også blive kaldt tilbage til yderligere og gentagen klinisk undersøgelse og test.
5. Afbrydelsesbesøg og procedurer Forsøgspersoner kan til enhver tid trække sig frivilligt fra deltagelse i undersøgelsen. De biologiske prøver af forsøgspersonen vil blive kasseret efter anmodning fra forsøgspersonen. Men hvis patienten blev fundet at lide af andre komplikationer under undersøgelsens helbredsscreening, vil de blive informeret og henvist til andre afdelinger for medicinsk behandling.

Datakvalitetssikring:

Den elektroniske indtastning af patienters data i systemet vil blive varetaget af 2 forskningskoordinatorer, som udfører dataindtastningen selvstændigt. Data for hvert emne vil således blive indtastet to gange i systemet af de 2 uafhængige forskningskoordinatorer. Vi vil lave en systemsammenligning mellem de 2 indtastninger pr. emne for at sikre, at alle oplysninger om emnet er indtastet korrekt og nøjagtigt. Den primære investigator vil også tilfældigt tjekke systemet igennem hver måned for at sikre datakvalitet.

Dataindtastning og lagring:

De kliniske testdata og spørgeskemaet vil blive indtastet af forsøgspersonerne på papir. Papirdokumentationen vil blive overført eller transporteret tilbage til PI's kontor, og hvert emnes data vil blive indtastet elektronisk af 2 uafhængige forskningskoordinatorer for at sikre datakvalitetssikring. Al elektronisk indtastning af dokumentationen kan kun foretages på kontoret ved hjælp af kontorcomputeren, og al papirdokumentation skal returneres til låsning sidst på dagen. Den elektroniske dokumentation vil være kodeordsbeskyttet, og papirdokumentationen vil blive opbevaret i et låse- og nøgleadgangsskab på PI's kontor. Diskuter kort, hvor data vil blive indtastet (dvs. vil disse indtastninger være på papir eller elektronisk), opbevares og håndteres.

Bestemmelse af prøvestørrelse:

Effektberegninger blev udført med Quanto (ver 1.2.4). For at detektere varianter med en styrke af ulige forhold på 2,0-5,0 i opdagelsesstadiet ved varierende MAF (α=0,01), er stikprøvestørrelsen på 400 overvægtige børn ca. 51 % til 98 % magt til at opdage varianter med store effekter (ELLER = 3,5) i vores opdagelsesstadie, ved MAF mellem henholdsvis 0,5 % og 3,0 % (α=0,01).

Statistiske og analytiske planer:

Alle prioriterede skadelige ikke-synonyme varianter vil blive testet for statistisk sammenhæng i et case-control design ved hjælp af SPSS. Den 2-halede Fishers eksakte test vil blive brugt for varianter med MAF < 3% og logistisk regression, justering for køn vil blive udført for varianter med MAF ≥ 3%. Disse vil blive udført ved hjælp af PLINK. Vi vil også udføre en belastningstest på genniveau ved hjælp af Sequencing Kernel Association Test (SKAT) softwaren. Alle enkelt-variant- og gen-niveau resultater vil blive korrigeret for flere tests ved hjælp af en Bonferonni korrektion. Eventuelle varianter identificeret af forudsigelsesværktøjet (Polyphen2) til at være stærkt forstyrrende (defineret som nonsens, splejsningssted og frameshift-ændringer, som alvorligt forstyrrer proteinstrukturen) vil blive prioriteret til valideringer.

Statistiske analyser af de novo genotypedata vil ligne dem i primært mål 1. Efterfølgende vil vi meta-analysere data fra opdagelses- og valideringsstadierne ved hjælp af en invers variansvægtet metode, forudsat en fast-effekt model, for at udlede den samlede pulje. estimater og tosidede p-værdier. Heterogenitetstjek vil blive udført (Cochrans Q- og I2-indeks), og ved varianter, hvor signifikant (Q p-værdi <0,05 og/eller I2-indeks >40%) er detekteret heterogenitet, vil metaanalysen blive udført i tilfældig effekttilstand såvel.

OPBEVARING AF PRØVEDOKUMENTER:

Optegnelserne for alle deltagere, som inkluderer sygehistorie, klinisk rapport, blodprøveresultater, spørgeskema, OSHE-dokumentation, IRB-dokumentation og DSRB-dokumentation vil blive opbevaret af den primære investigator i et låst kabinet på hans kortadgangskontor. Kun hovedefterforskeren vil holde nøglen og have direkte adgang til aflåsningsskabet. Disse dokumenter vil blive opbevaret i en periode på 6 år efter afslutningen af ​​forskningsstudiet.

For hovedefterforsker påbegyndte forsøg:

Alle alvorlige bivirkninger (SAE), som er uventede og relateret til undersøgelseslægemidlet, skal rapporteres til HSA.

"En alvorlig bivirkning eller alvorlig lægemiddelbivirkning er enhver uønsket medicinsk hændelse ved enhver dosis, der:

• Medfører død.
• Er livstruende (umiddelbar risiko for død).
• Kræver døgnindlæggelse eller forlængelse af eksisterende indlæggelse.
• Resulterer i vedvarende eller betydelig invaliditet/inhabilitet.
• Resulterer i medfødt anomali/fødselsdefekt.
• Er en medicinsk vigtig begivenhed.

Der bør udøves medicinsk og videnskabelig vurdering for at afgøre, om en begivenhed er en vigtig medicinsk begivenhed. En vigtig medicinsk begivenhed må ikke umiddelbart være livstruende og/eller resultere i død eller hospitalsindlæggelse. Men hvis det fastslås, at hændelsen kan bringe forsøgspersonen i fare og/eller kan kræve intervention for at forhindre en af ​​de andre bivirkninger, skal den vigtige medicinske hændelse rapporteres som alvorlig."

Alle SAE'er, der er uventede og relateret til undersøgelseslægemidlet, vil blive rapporteret. Efterforskeren er ansvarlig for at informere HSA senest 15 kalenderdage efter første kendskab til, at sagen berettiger til fremskyndet indberetning. Følgeoplysninger vil aktivt blive søgt og indsendt, efterhånden som de bliver tilgængelige. Ved fatale eller livstruende tilfælde vil HSA blive underrettet hurtigst muligt, dog senest 7 kalenderdage efter første kendskab til, at en sag kvalificerer sig, efterfulgt af en fuldstændig rapport inden for 8 yderligere kalenderdage.