周産期精密医療 (NSIGHT2)

未診断の病気を患っている急性疾患の入院患者とその家族は、研究に参加する資格があります。 治験責任医師は、最大 1,000 人の乳児を登録します。 地元では、研究集団は、主に新生児集中治療室（NICU）、小児集中治療室（PICU）、および心臓血管集中治療室（CVICU）のRady Children's Hospital（RCH）入院患者集団から募集されます。他の病院の入院患者サービスへ。 募集は RCH のメイン キャンパスを対象としますが、RCH ネットワーク (特に、サン ディエゴ郡全体の RCH NICU ネットワーク) のサテライト ロケーションからの紹介が含まれる場合があります。 すべての患者は、臨床的に示されているように、州の新生児スクリーニングや、治療提供者によって決定されたその他の遺伝子検査など、定期的なケアを受け続けます。 影響を受ける研究参加者の半分は無作為化されて高速全ゲノム配列決定 (WGS) を受け、残りの半分は迅速な全エクソーム配列決定 (WES) を受けます。 各アームは、最初に患者 (発端者) のサンプルのみを使用して分析されます。 発端者のみの分析で診断が得られない場合、利用可能な場合は、生物学的家族のメンバー (通常は両親) からのゲノム データを使用して分析を補完します (トリオ分析)。 時折、2 番目の影響を受けた兄弟が家族分析に利用できる場合があります。 父親が研究に応じられないことも珍しくありません。 同様に、研究者は、診断結果を確認したり、遺伝に関する追加情報を提供したりするために、生物学的両親、およびおそらく他の家族の対象を絞った遺伝子分析の必要性を予測しています。

調査官は、まれに、新生児が非常に病気で、チームが平衡状態を欠いている可能性があると予想しており、その子供は、送信されるエクソームテストの推定10日間のターンアラウンドタイムを待つことができます. これらのまれなケースでは、PI またはその代理人が、子供が無作為化の資格がないかどうかを決定します。 これらの子供たちは、研究全体を通して調査研究にとどまりますが、Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCIGM、RadyPGSMI とも呼ばれる) 研究所による社内の超高速全ゲノム配列決定を受けます。または急速なエクソーム (どちらも 10 日間のターンアラウンドと予想される)。

登録は、RCH または RCH ネットワーク ICU への入院後最初の 96 時間以内、または乳児が以前に適格ではなかった場合は研究の基準を満たしてから 96 時間以内に求められます。 参加に同意した患者とその家族は採血され、Rapid WGSまたはRapid WESのいずれかを受けるように無作為化されます。 最初の症状駆動型分析は、患者のサンプルのみで実施されます (シングルトン分析)。 シングルトン分析によって診断が迅速に（24時間以内に）見つからない場合、家族（または両親および/または他の家族メンバーの任意の組み合わせ）は、患者が受けるように無作為化されたのと同じ技術を使用して分析されます. 患者の現在の表現型に部分的または全体的に関連する病原性および可能性のある病原性変異体 (American College of Medical Genetics (ACMG) ガイドラインによって決定される) は、臨床的に確認され、患者の医療記録に報告されます。 この研究の意図は、症状に基づく結果を医療記録に戻すことですが、症状に基づく所見を確認するための臨床報告には、検査の否定的な所見が含まれる場合があります。 私たちの解析により、罹患率および/または死亡率を改善するための治療または介入が存在する病的バリアントが偶然発見された場合、家族はこの追加情報を受け取らないことを選択する可能性があります.