Medicina de Precisión Perinatal (NSIGHT2)

Los pacientes hospitalizados con enfermedades agudas que tengan una enfermedad no diagnosticada y sus familias serán elegibles para participar en el estudio. Los investigadores inscribirán hasta 1.000 bebés. A nivel local, la población del estudio se reclutará de la población de pacientes hospitalizados del Rady Children's Hospital (RCH), principalmente la unidad de cuidados intensivos neonatales (NICU), la unidad de cuidados intensivos pediátricos (PICU) y la unidad de cuidados intensivos cardiovasculares (CVICU), con una población más pequeña que presenta a otros servicios hospitalarios para pacientes internados. El reclutamiento estará dirigido al campus principal de RCH, pero puede incluir referencias de ubicaciones satélite en la red de RCH (en particular, la red de NICU de RCH en todo el condado de San Diego). Todos los pacientes continuarán recibiendo la atención de rutina según lo indicado clínicamente, incluida la evaluación estatal para recién nacidos y otras pruebas genéticas según lo determinen sus proveedores tratantes. La mitad de los participantes del estudio afectados serán aleatorizados para recibir la secuenciación rápida del genoma completo (WGS) y la otra mitad recibirá la secuenciación rápida del exoma completo (WES). Inicialmente, cada brazo se analizará utilizando únicamente la muestra del paciente (probando). Si un análisis de probandos solo no produce un diagnóstico, los datos genómicos de los miembros de la familia biológica (por lo general, los padres), cuando estén disponibles, se utilizarán para complementar el análisis (análisis de trío). Ocasionalmente, un segundo hermano afectado puede estar disponible para el análisis familiar. No pocas veces, el padre no está disponible para el estudio. De manera similar, los investigadores anticipan la necesidad de un análisis genético específico de los padres biológicos y posiblemente de otros miembros de la familia, para confirmar los resultados del diagnóstico y/o proporcionar información adicional sobre la herencia.

Los investigadores anticipan que, en casos excepcionales, un recién nacido puede estar tan enfermo que el equipo carece de equilibrio y el niño puede esperar el tiempo de respuesta estimado de diez días de nuestra prueba de exoma de envío. En estos raros casos, el PI, o su delegado, decidirá si el niño no es elegible para la aleatorización. Estos niños permanecerán en el estudio de investigación durante todo el estudio, pero recibirán una secuenciación interna ultrarrápida del genoma completo por parte del laboratorio Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCIGM, también llamado RadyPGSMI) en lugar de un genoma rápido o exoma rápido (ambos se anticipa que serán tiempos de respuesta de 10 días).

Se solicitará la inscripción dentro de las primeras 96 horas posteriores a la admisión en RCH o en una UCI de la red de RCH o dentro de las 96 horas posteriores al cumplimiento de los criterios para el estudio si el bebé no era elegible anteriormente. A los pacientes y sus familiares que den su consentimiento para participar se les extraerá sangre y se les asignará aleatoriamente para recibir WGS rápido o WES rápido. El análisis inicial basado en los síntomas se realizará solo en la muestra del paciente (análisis singleton). Si no se encuentra un diagnóstico de inmediato (dentro de las 24 horas) a través de un análisis único, la familia (o cualquier combinación de padres y/u otros miembros de la familia) se analizará utilizando la misma tecnología que el paciente fue aleatorizado para recibir. Las variantes patogénicas y probablemente patogénicas (según lo determinado por las pautas del Colegio Americano de Genética Médica (ACMG)) que se relacionen en parte o en su totalidad con el fenotipo actual del paciente se confirmarán clínicamente y se informarán en la historia clínica del paciente. Aunque la intención del estudio es devolver los resultados basados ​​en los síntomas a la historia clínica, el informe clínico para la confirmación de los hallazgos basados ​​en los síntomas puede incluir resultados negativos de las pruebas. En el caso de que nuestro análisis encuentre incidentalmente una variante patogénica para la que exista un tratamiento o intervención para mejorar la morbilidad y/o mortalidad, las familias pueden optar por no recibir esta información adicional.