Perinatale Präzisionsmedizin (NSIGHT2)

Akut erkrankte stationäre Säuglingspatienten mit einer nicht diagnostizierten Krankheit und ihre Familien können an der Studie teilnehmen. Die Ermittler werden bis zu 1.000 Säuglinge einschreiben. Lokal wird die Studienpopulation aus der stationären Patientenpopulation des Rady Children's Hospital (RCH) rekrutiert, in erster Linie der neonatalen Intensivstation (NICU), der pädiatrischen Intensivstation (PICU) und der kardiovaskulären Intensivstation (CVICU), wobei sich eine kleinere Population vorstellt zu anderen stationären Krankenhausleistungen. Die Rekrutierung wird auf den RCH-Hauptcampus ausgerichtet, kann aber auch Überweisungen von Satellitenstandorten im RCH-Netzwerk beinhalten (insbesondere das RCH NICU-Netzwerk im gesamten San Diego County). Alle Patienten werden weiterhin routinemäßig wie klinisch indiziert behandelt, einschließlich des staatlichen Neugeborenen-Screenings und anderer Gentests, die von ihren behandelnden Anbietern festgelegt werden. Die Hälfte der betroffenen Studienteilnehmer wird randomisiert einer Rapid Whole Genome Sequencing (WGS) und der anderen Hälfte einer Rapid Whole Exome Sequencing (WES) unterzogen. Jeder Arm wird zunächst nur mit der Probe des Patienten (Probanden) analysiert. Wenn eine reine Probandenanalyse keine Diagnose liefert, werden genomische Daten der biologischen Familienmitglieder (typischerweise Eltern), sofern verfügbar, zur Ergänzung der Analyse verwendet (Trio-Analyse). Gelegentlich kann ein zweites betroffenes Geschwisterkind für eine Familienanalyse zur Verfügung stehen. Nicht selten steht der Vater für ein Studium nicht zur Verfügung. Ebenso erwarten die Ermittler die Notwendigkeit einer gezielten genetischen Analyse biologischer Eltern und möglicherweise anderer Familienmitglieder, um diagnostische Ergebnisse zu bestätigen und/oder zusätzliche Informationen zur Vererbung bereitzustellen.

Die Ermittler gehen davon aus, dass in seltenen Fällen ein Neugeborenes so krank sein kann, dass dem Team die Ausgeglichenheit fehlt, dass das Kind die geschätzte zehntägige Bearbeitungszeit unserer ausgesandten Exomtests abwarten kann. In diesen seltenen Fällen entscheidet der PI oder sein Stellvertreter, ob das Kind für eine Randomisierung nicht infrage kommt. Diese Kinder bleiben während der gesamten Studie in der Forschungsstudie, erhalten jedoch anstelle eines schnellen Genoms eine interne ultraschnelle Gesamtgenomsequenzierung durch das Labor des Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCIGM, auch RadyPGSMI genannt). oder schnelles Exom (beide voraussichtlich 10 Tage Turnaround).

Die Aufnahme wird innerhalb der ersten 96 Stunden nach der Aufnahme in das RCH oder eine Intensivstation des RCH-Netzwerks oder innerhalb von 96 Stunden nach Erfüllung der Kriterien für die Studie beantragt, wenn das Kind zuvor nicht geeignet war. Patienten und ihren Familienmitgliedern, die der Teilnahme zustimmen, wird Blut abgenommen und sie werden randomisiert, um entweder schnelles WGS oder schnelles WES zu erhalten. Die anfängliche symptomorientierte Analyse wird nur an der Patientenprobe durchgeführt (Singleton-Analyse). Wenn eine Diagnose nicht umgehend (innerhalb von 24 Stunden) durch eine Singleton-Analyse gefunden wird, wird die Familie (oder eine beliebige Kombination von Eltern und/oder anderen Familienmitgliedern) mit derselben Technologie analysiert, für die der Patient randomisiert wurde. Pathogene und wahrscheinlich pathogene Varianten (wie in den Richtlinien des American College of Medical Genetics (ACMG) festgelegt), die sich teilweise oder vollständig auf den aktuellen Phänotyp des Patienten beziehen, werden klinisch bestätigt und in die Krankenakte des Patienten aufgenommen. Obwohl die Absicht der Studie darin besteht, symptombezogene Ergebnisse in die Krankenakte zurückzugeben, kann der klinische Bericht zur Bestätigung symptombezogener Ergebnisse negative Testergebnisse enthalten. Für den Fall, dass unsere Analyse zufällig eine pathogene Variante findet, für die eine Behandlung oder Intervention zur Verbesserung der Morbidität und/oder Mortalität existiert, können Familien entscheiden, diese zusätzlichen Informationen nicht zu erhalten.