Medicina de Precisão Perinatal (NSIGHT2)

Pacientes infantis gravemente doentes que tenham uma doença não diagnosticada e suas famílias serão elegíveis para participar do estudo. Os investigadores irão inscrever até 1.000 bebês. Localmente, a população do estudo será recrutada na população internada do Rady Children's Hospital (RCH), principalmente na unidade de terapia intensiva neonatal (UTIN), unidade de terapia intensiva pediátrica (PICU) e unidade de terapia intensiva cardiovascular (CVICU), com uma população menor apresentando para outros serviços hospitalares de internação. O recrutamento será direcionado ao campus principal do RCH, mas pode incluir referências de locais satélites na rede RCH (particularmente a rede RCH NICU em todo o condado de San Diego). Todos os pacientes continuarão a receber cuidados de rotina conforme indicado clinicamente, incluindo a triagem do estado do recém-nascido e outros testes genéticos conforme determinado por seus provedores de tratamento. Metade dos participantes afetados do estudo serão randomizados para receber o sequenciamento rápido do genoma inteiro (WGS) e a outra metade receberá o sequenciamento rápido do exoma inteiro (WES). Cada braço será inicialmente analisado usando apenas a amostra do paciente (probando). Se uma análise apenas do probando falhar em fornecer um diagnóstico, os dados genômicos dos membros da família biológica (normalmente os pais), quando disponíveis, serão usados ​​para complementar a análise (análise de trio). Ocasionalmente, um segundo irmão afetado pode estar disponível para análise familiar. Não raro, o pai não está disponível para estudar. Da mesma forma, os investigadores antecipam a necessidade de análise genética direcionada dos pais biológicos e, possivelmente, de outros membros da família, para confirmar os resultados do diagnóstico e/ou fornecer informações adicionais sobre herança.

Os investigadores antecipam que, em casos raros, um recém-nascido pode estar tão doente que a equipe não tem equilíbrio para que a criança possa esperar pelo prazo estimado de dez dias para o envio de nossos testes de exoma. Nesses casos raros, o PI, ou seu representante, decidirá se a criança não é elegível para randomização. Essas crianças permanecerão no estudo de pesquisa durante todo o estudo, mas receberão sequenciamento ultrarrápido do genoma completo pelo laboratório Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCIGM, também chamado RadyPGSMI) em vez de um genoma rápido ou exoma rápido (ambos previstos para retornos de 10 dias).

A inscrição será solicitada dentro das primeiras 96 horas após a admissão no RCH ou em uma UTI da rede RCH ou dentro de 96 horas após o cumprimento dos critérios para o estudo se o bebê não for elegível anteriormente. Os pacientes e seus familiares que consentirem em participar terão seu sangue coletado e serão randomizados para receber WGS rápido ou WES rápido. A análise inicial baseada em sintomas será realizada apenas na amostra do paciente (análise de singleton). Se um diagnóstico não for encontrado prontamente (dentro de 24 horas) por meio de uma análise única, a família (ou qualquer combinação de pais e/ou outros membros da família) será analisada usando a mesma tecnologia que o paciente foi randomizado para receber. Variantes patogênicas e provavelmente patogênicas (conforme determinado pelas diretrizes do American College of Medical Genetics (ACMG)) que se relacionam em parte ou totalmente com o fenótipo atual do paciente serão clinicamente confirmadas e relatadas no prontuário médico do paciente. Embora a intenção do estudo seja retornar resultados baseados em sintomas para o prontuário médico, o relatório clínico para confirmação de achados baseados em sintomas pode incluir resultados negativos de testes. No caso de nossa análise encontrar acidentalmente uma variante patogênica para a qual existe um tratamento ou intervenção para melhorar a morbidade e/ou mortalidade, as famílias podem optar por não receber essas informações adicionais.