Perinatális precíziós gyógyászat (NSIGHT2)

A vizsgálatban olyan akut beteg csecsemőbetegek vehetnek részt, akiknek még nem diagnosztizált betegségük van, valamint családjaik. A nyomozók legfeljebb 1000 csecsemőt vesznek fel. Helyileg a vizsgált populációt a Rady Children's Hospital (RCH) fekvőbeteg-populációjából toborozzák, elsősorban az újszülött intenzív osztályról (NICU), a gyermek intenzív osztályról (PICU) és a kardiovaszkuláris intenzív osztályról (CVICU), kisebb populációval. más kórházi fekvőbeteg szolgálatokhoz. A toborzás az RCH fő campusát célozza meg, de magában foglalhatja az RCH hálózat műholdhelyeiről (különösen az RCH NICU hálózatról, San Diego megyében) érkező ajánlásokat. Minden beteg továbbra is a klinikailag indokolt rutinkezelésben részesül, beleértve az újszülöttek állami szűrését és a kezelőorvosa által meghatározott egyéb genetikai vizsgálatokat. Az érintett vizsgálati résztvevők felét randomizálják, hogy gyors teljes genom szekvenálást (WGS) kapjanak, a másik fele pedig gyors teljes genom szekvenálást (WES) kap. Kezdetben mindegyik kart csak a páciens (próba) mintájának felhasználásával elemzik. Ha a csak proband-analízis nem ad diagnózist, a biológiai családtagoktól (jellemzően szülőktől) származó genomiális adatokat, ha rendelkezésre állnak, az elemzés kiegészítésére használják fel (trio elemzés). Esetenként egy második érintett testvér is rendelkezésre állhat a családelemzés céljából. Nem ritkán az apa nem áll rendelkezésre tanulásra. Hasonlóképpen, a kutatók arra számítanak, hogy a biológiai szülők és esetleg más családtagok célzott genetikai elemzésére van szükség a diagnosztikai eredmények megerősítésére és/vagy az öröklődésre vonatkozó további információk biztosítására.

A kutatók arra számítanak, hogy ritka esetekben egy újszülött annyira beteg lehet, hogy a csapatnak nincs kiegyensúlyozottsága ahhoz, hogy a gyermek kivárja az exome-tesztünk becsült tíz napos átfutási idejét. Ezekben a ritka esetekben a PI vagy megbízottja dönti el, hogy a gyermek nem jogosult-e véletlenszerű besorolásra. Ezek a gyerekek a vizsgálat teljes ideje alatt a kutatásban maradnak, de házon belüli ultragyors teljes genom szekvenálást kapnak a Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCIGM, más néven RadyPGSMI) laboratóriumában a gyors genom helyett. vagy gyors exome (mindkettő várhatóan 10 napos fordulatot vesz igénybe).

A felvételt az RCH-ra vagy egy RCH-hálózati intenzív osztályra való felvételt követő első 96 órán belül kell kérni, vagy a vizsgálati kritériumok teljesítését követő 96 órán belül, ha a csecsemő korábban nem volt jogosult. Azon betegek és családtagjaik, akik beleegyeznek a részvételbe, vért vesznek, és véletlenszerű besorolást kapnak, hogy gyors WGS-t vagy rapid WES-t kapjanak. A kezdeti tünet-vezérelt elemzés csak a páciens mintáján történik (singleton elemzés). Ha a diagnózist nem találják meg azonnal (24 órán belül) egyszemélyes elemzéssel, akkor a családot (vagy a szülők és/vagy más családtagok bármilyen kombinációját) ugyanazzal a technológiával elemzik, amelyre a pácienst véletlenszerűen besorolták. Azok a patogén és valószínű patogén változatok (amelyeket az American College of Medical Genetics (ACMG) irányelvei határoznak meg), amelyek részben vagy egészben kapcsolódnak a páciens jelenlegi fenotípusához, klinikailag megerősítik, és bejelentik a betegek egészségügyi nyilvántartásába. Bár a vizsgálat célja, hogy a tünetvezérelt eredményeket visszaadja az orvosi nyilvántartásba, a klinikai jelentés a tünetvezérelt leletek megerősítésére tartalmazhat negatív vizsgálati eredményeket. Abban az esetben, ha elemzésünk véletlenül olyan patogén változatot talál, amelyre létezik kezelés vagy beavatkozás a morbiditás és/vagy mortalitás javítására, a családok dönthetnek úgy, hogy nem kapják meg ezt a kiegészítő információt.