- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT03211039
Perinatal presisjonsmedisin (NSIGHT2)
Prenatal presisjonsmedisin (NSIGHT2): En randomisert, blindet, prospektiv studie av den kliniske nytten av rask genomisk sekvensering for spedbarn i akuttomsorgsmiljøet
Studieoversikt
Status
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Akutt syke spedbarnspasienter som har en udiagnostisert sykdom, og deres familier, vil være kvalifisert til å delta i studien. Etterforskerne vil registrere opptil 1000 spedbarn. Lokalt vil studiepopulasjonen rekrutteres fra Rady Children's Hospital (RCH) stasjonær populasjon, primært neonatal intensivavdeling (NICU), pediatrisk intensivavdeling (PICU) og kardiovaskulær intensivavdeling (CVICU), med en mindre populasjon som presenterer til andre sykehustjenester. Rekruttering vil være målrettet mot RCH hovedcampus, men det kan inkludere henvisninger fra satellittsteder i RCH-nettverket (spesielt RCH NICU-nettverket i hele San Diego County). Alle pasienter vil fortsette å motta rutinemessig behandling som klinisk indisert, inkludert statens nyfødtscreening og annen genetisk testing som bestemt av deres behandlende leverandør. Halvparten av de berørte studiedeltakerne vil bli randomisert til å motta rask helgenomsekvensering (WGS) og den andre halvparten vil motta rask heleksomsekvensering (WES). Hver arm vil først bli analysert med kun pasientens (probands) prøve. Hvis en analyse med kun proband ikke gir en diagnose, vil genomiske data fra de biologiske familiemedlemmene (typisk foreldre), når de er tilgjengelige, bli brukt som supplement til analyse (trioanalyse). Noen ganger kan et annet berørt søsken være tilgjengelig for familieanalyse. Ikke sjelden er far ikke tilgjengelig for studier. Tilsvarende forventer etterforskerne behovet for målrettet genetisk analyse av biologiske foreldre, og muligens andre familiemedlemmer, for å bekrefte diagnostiske resultater og/eller gi tilleggsinformasjon angående arv.
Etterforskerne forventer at en nyfødt i sjeldne tilfeller kan være så syk at teamet mangler likevekt at barnet kan vente på den estimerte ti-dagers behandlingstiden for vår utsendte eksomtesting. I disse sjeldne tilfellene vil PI, eller hans delegat, avgjøre om barnet ikke er kvalifisert for randomisering. Disse barna vil forbli i forskningsstudien gjennom hele studien, men vil motta intern ultrarask helgenomsekvensering av Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCIGM, også kalt RadyPGSMI) i stedet for enten et raskt genom eller rask exome (begge antatt å være 10 dagers omstilling).
Påmelding vil bli søkt innen de første 96 timene etter opptak til RCH eller en RCH-nettverk ICU eller innen 96 timer etter oppfyllelse av kriteriene for studien hvis spedbarnet ikke tidligere var kvalifisert. Pasienter og deres familiemedlemmer som samtykker til å delta vil få blodtappet og vil bli randomisert til å motta enten rask WGS eller rask WES. Den første symptomdrevne analysen vil kun bli utført på pasientens prøve (singleton-analyse). Hvis en diagnose ikke blir funnet umiddelbart (innen 24 timer) via en singleton-analyse, vil familien (eller en hvilken som helst kombinasjon av foreldre og/eller andre familiemedlemmer) bli analysert ved hjelp av samme teknologi som pasienten ble randomisert til å motta. Patogene og sannsynlige patogene varianter (som bestemt av American College of Medical Genetics (ACMG) retningslinjer) som er helt eller delvis relatert til pasientens gjeldende fenotype vil bli klinisk bekreftet og rapportert inn i pasientens journal. Selv om intensjonen med studien er å returnere symptomdrevne resultater til journalen, kan den kliniske rapporten for bekreftelse av symptomdrevne funn inkludere negative funn av testing. I tilfelle analysen vår tilfeldigvis finner en patogen variant som det finnes en behandling eller intervensjon for for å forbedre sykelighet og/eller dødelighet, kan familier velge å ikke motta denne tilleggsinformasjonen.
Studietype
Registrering (Faktiske)
Fase
- Ikke aktuelt
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
California
-
San Diego, California, Forente stater, 92123
- Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCIGM)
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
Person der ett av følgende kriterier er oppfylt:
- Akutt syk inneliggende pasient under 4 måneders alder og innen 96 timer etter innleggelse.
- Akutt syk innlagt pasient under 4 måneders alder og innen 96 timer etter utvikling av en unormal respons på standardbehandling for en underliggende tilstand.
- Akutt syk innlagt pasient under 4 måneders alder og innen 96 timer etter utvikling av kliniske egenskaper eller laboratorietestverdier som tyder på en genetisk tilstand.
- Biologisk slektning til et spedbarn som ble registrert i denne studien.
Ekskluderingskriterier:
Innlagte pasienter eldre enn 4 måneder, eller som ikke oppfyller noen av inklusjonskriteriene, eller med:
- Neonatal infeksjon eller sepsis med normal respons på behandlingen
- Isolert prematuritet
- Isolert ukonjugert hyperbilirubinemi
- Hypoksisk iskemisk encefalopati med tydelig utløsende hendelse
- Tidligere bekreftet genetisk diagnose som forklarer deres kliniske tilstand (dvs. har en positiv genetisk test)
- Isolert forbigående neonatal takypné
- Tillatelse kan ikke innhentes av en juridisk verge eller en rettsoppnevnt representant innen 96 timer etter å ha blitt kvalifisert for påmelding.
- Ikke-levedyktige nyfødte - nyfødte mindre enn 28 dager av livet med modifisert kodestatus (kun pasienter med full kode kan registreres).
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Primært formål: Diagnostisk
- Tildeling: Randomisert
- Intervensjonsmodell: Parallell tildeling
- Masking: Enkelt
Våpen og intervensjoner
Deltakergruppe / Arm |
Intervensjon / Behandling |
---|---|
Annen: Helgenomsekvensering
Genetisk test som ser på alle kodende og ikke-kodende områder av genomet
|
Pasienter og deres familier vil bli randomisert til enten å motta helgenomsekvensering eller heleksomsekvensering.
|
Annen: Hel Exome-sekvensering
Genetisk test som ser på alle kodende områder av genomet
|
Pasienter og deres familier vil bli randomisert til enten å motta helgenomsekvensering eller heleksomsekvensering.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Subjektets hovedleverandørs oppfattede kliniske nytte av genomisk sekvensering
Tidsramme: Innen en uke etter at resultatene er returnert
|
Opplevd nytte/fordel med sekvensering basert på "Clinician Assessment" spørreskjema utfylt av pasientens leverandør.
Spørsmål: Var testen klinisk nyttig?
Responsen ble målt på en 5-punkts Likert-skala (veldig nyttig=5, nyttig=4, nøytral=3, ikke veldig nyttig=2, ikke nyttig i det hele tatt=1.
|
Innen en uke etter at resultatene er returnert
|
Testresultater førte til endring i pasientbehandling
Tidsramme: Innen 1 uke etter returnering av resultater
|
Testresultater førte til endring i klinisk ledelse (velg alle som passer):
|
Innen 1 uke etter returnering av resultater
|
Test førte til endringer i ledelsen som endret pasientresultatet
Tidsramme: 1 år
|
Primærlegens oppfatning av endring i utfall
|
1 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Diagnostisk proporsjon for hele genomsekvensering (WGS) og hele eksomsekvensering (WES)
Tidsramme: Innen omtrent 30 dager etter påmelding
|
WGS og WES er to kliniske diagnostiske testmodaliteter.
Resultater av testing ble lagt inn i den elektroniske journalen.
Resultatene ga enten en molekylær diagnose som forklarte pasientens tilstand eller ikke.
Den diagnostiske andelen er antall pasienter som mottok en molekylær diagnose etter testmodaliteten delt på det totale antallet pasienter som ble testet med denne modaliteten.
|
Innen omtrent 30 dager etter påmelding
|
Resultat innen 7 dager etter prøvemottak
Tidsramme: Innen 7 dager etter mottak av prøven
|
Tid til resultat.
|
Innen 7 dager etter mottak av prøven
|
Foreldre oppfattet nytten av testen
Tidsramme: Innen en uke etter returnering av resultater og omtrent ett år etter påmelding
|
Foreldres oppfatning av at testen var nyttig
|
Innen en uke etter returnering av resultater og omtrent ett år etter påmelding
|
Foreldres oppfatning av testfordelen for spedbarnet deres
Tidsramme: Innen en uke etter returnering av resultater og omtrent ett år etter påmelding
|
Foreldres oppfatning av at testen var til nytte for spedbarnet deres
|
Innen en uke etter returnering av resultater og omtrent ett år etter påmelding
|
Foreldrebeslutningsbeklagelse med sekvensering
Tidsramme: Innen en uke etter returnering av resultater og omtrent ett år etter påmelding
|
Skademarkører i genetisk diagnose som dokumentert av Brehauts Decisional Regret-skala.
Skala 0-100.
Høyere score indikerer høyere anger.
|
Innen en uke etter returnering av resultater og omtrent ett år etter påmelding
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Stephen F Kingsmore, MD, DSc, Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Milko LV, Chen F, Chan K, Brower AM, Agrawal PB, Beggs AH, Berg JS, Brenner SE, Holm IA, Koenig BA, Parad RB, Powell CM, Kingsmore SF. FDA oversight of NSIGHT genomic research: the need for an integrated systems approach to regulation. NPJ Genom Med. 2019 Dec 10;4:32. doi: 10.1038/s41525-019-0105-8. eCollection 2019.
- Dimmock DP, Clark MM, Gaughran M, Cakici JA, Caylor SA, Clarke C, Feddock M, Chowdhury S, Salz L, Cheung C, Bird LM, Hobbs C, Wigby K, Farnaes L, Bloss CS, Kingsmore SF; RCIGM Investigators. An RCT of Rapid Genomic Sequencing among Seriously Ill Infants Results in High Clinical Utility, Changes in Management, and Low Perceived Harm. Am J Hum Genet. 2020 Nov 5;107(5):942-952. doi: 10.1016/j.ajhg.2020.10.003.
- Cakici JA, Dimmock DP, Caylor SA, Gaughran M, Clarke C, Triplett C, Clark MM, Kingsmore SF, Bloss CS. A Prospective Study of Parental Perceptions of Rapid Whole-Genome and -Exome Sequencing among Seriously Ill Infants. Am J Hum Genet. 2020 Nov 5;107(5):953-962. doi: 10.1016/j.ajhg.2020.10.004.
- Kingsmore SF, Cakici JA, Clark MM, Gaughran M, Feddock M, Batalov S, Bainbridge MN, Carroll J, Caylor SA, Clarke C, Ding Y, Ellsworth K, Farnaes L, Hildreth A, Hobbs C, James K, Kint CI, Lenberg J, Nahas S, Prince L, Reyes I, Salz L, Sanford E, Schols P, Sweeney N, Tokita M, Veeraraghavan N, Watkins K, Wigby K, Wong T, Chowdhury S, Wright MS, Dimmock D; RCIGM Investigators. A Randomized, Controlled Trial of the Analytic and Diagnostic Performance of Singleton and Trio, Rapid Genome and Exome Sequencing in Ill Infants. Am J Hum Genet. 2019 Oct 3;105(4):719-733. doi: 10.1016/j.ajhg.2019.08.009. Epub 2019 Sep 26.
- Laurenzano SE, McFall C, Nguyen L, Savla D, Coufal NG, Wright MS, Tokita M, Dimmock D, Kingsmore SF, Newfield RS. Neonatal diabetes mellitus due to a novel variant in the INS gene. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2019 Aug 1;5(4):a004085. doi: 10.1101/mcs.a004085. Print 2019 Aug.
- Kingsmore SF, Cole FS. The Role of Genome Sequencing in Neonatal Intensive Care Units. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2022 Aug 31;23:427-448. doi: 10.1146/annurev-genom-120921-103442. Epub 2022 Jun 8.
- Kingsmore SF, Nofsinger R, Ellsworth K. Rapid genomic sequencing for genetic disease diagnosis and therapy in intensive care units: a review. NPJ Genom Med. 2024 Feb 27;9(1):17. doi: 10.1038/s41525-024-00404-0.
- Chan K, Hu Z, Bush LW, Cope H, Holm IA, Kingsmore SF, Wilhelm K, Scharfe C, Brower A. NBSTRN Tools to Advance Newborn Screening Research and Support Newborn Screening Stakeholders. Int J Neonatal Screen. 2023 Oct 30;9(4):63. doi: 10.3390/ijns9040063.
- Owen MJ, Lefebvre S, Hansen C, Kunard CM, Dimmock DP, Smith LD, Scharer G, Mardach R, Willis MJ, Feigenbaum A, Niemi AK, Ding Y, Van Der Kraan L, Ellsworth K, Guidugli L, Lajoie BR, McPhail TK, Mehtalia SS, Chau KK, Kwon YH, Zhu Z, Batalov S, Chowdhury S, Rego S, Perry J, Speziale M, Nespeca M, Wright MS, Reese MG, De La Vega FM, Azure J, Frise E, Rigby CS, White S, Hobbs CA, Gilmer S, Knight G, Oriol A, Lenberg J, Nahas SA, Perofsky K, Kim K, Carroll J, Coufal NG, Sanford E, Wigby K, Weir J, Thomson VS, Fraser L, Lazare SS, Shin YH, Grunenwald H, Lee R, Jones D, Tran D, Gross A, Daigle P, Case A, Lue M, Richardson JA, Reynders J, Defay T, Hall KP, Veeraraghavan N, Kingsmore SF. An automated 13.5 hour system for scalable diagnosis and acute management guidance for genetic diseases. Nat Commun. 2022 Jul 26;13(1):4057. doi: 10.1038/s41467-022-31446-6.
- Cakici JA, Dimmock D, Caylor S, Gaughran M, Clarke C, Triplett C, Clark MM, Kingsmore SF, Bloss CS. Assessing Diversity in Newborn Genomic Sequencing Research Recruitment: Race/Ethnicity and Primary Spoken Language Variation in Eligibility, Enrollment, and Reasons for Declining. Clin Ther. 2023 Aug;45(8):736-744. doi: 10.1016/j.clinthera.2023.06.014. Epub 2023 Jul 8.
- Owen MJ, Batalov S, Ellsworth KA, Wright M, Breeding S, Hugh K, Kingsmore SF, Ding Y. Rapid Whole Genome Sequencing for Diagnosis of Single Locus Genetic Diseases in Critically Ill Children. Methods Mol Biol. 2023;2621:217-239. doi: 10.1007/978-1-0716-2950-5_12.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Antatt)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Antatt)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 161983
- U19HD077693 (U.S. NIH-stipend/kontrakt)
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
IPD-delingstidsramme
Tilgangskriterier for IPD-deling
IPD-deling Støtteinformasjonstype
- STUDY_PROTOCOL
- SEVJE
- ICF
Studiedata/dokumenter
-
Datasett for individuell deltaker
Informasjonsidentifikator: 37114
-
Oppsummering av fenotypedata
Informasjonsidentifikator: 37114
-
Emne Sample Telemetri Report (SSTR) for emne- og prøve-ID-er, samtykker, oppsummeringstall, behandlingsstatus og bruk av molekyl- og sekvensprøver
Informasjonsidentifikator: 37114
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
produkt produsert i og eksportert fra USA
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .