人工呼吸器を装着した集中治療患者における下気道大腸菌分離株の特徴 (COLOCOLI)
2017年10月5日 更新者：Prof Jean-Damien RICARD、Hôpital Louis Mourier
下部気道の特徴 大腸菌分離株のコロニー形成と人工呼吸器を使用した集中治療患者の感染: フランスの多施設共同前向きコレクション
大腸菌（E.
大腸菌) 機械的に換気された集中治療室 (ICU) 患者に由来する分離株;換気された患者の下気道から回収された大腸菌株の表現型と遺伝子型を特徴付けるために。
調査の概要
詳細な説明
フランスの 14 の ICU で実施された、大腸菌 (E. 大腸菌) 機械的に換気された集中治療室 (ICU) 患者に由来する分離株;換気された患者の下気道から回収された大腸菌株の表現型と遺伝子型を特徴付けるために。 微生物学研究室で同定され、ICU 患者由来の肺検体 (気管吸引液、気管支肺胞洗浄液、または伸縮式プラグカテーテルのいずれか) から取得されたすべての大腸菌分離株は、脳心臓注入液で-80°C で保存されます。グリセロール 20% を含むブロス。 それらはその後、抗菌薬感受性、大腸菌系統型、O型、病原性因子遺伝子含有量の決定を含むさらなる分析のために、研究者の研究ユニットに集中されます。
これらの分離株は、以前に公開された 2 つのコレクションの分離株と比較されます。1 つは共生株と見なされるコミュニティ 被験者の便からのもので、もう 1 つは菌血症患者の血液からのものです。
研究の種類
観察的
入学 (実際)
289
参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
18年歳以上 (アダルト、OLDER_ADULT)
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
受講資格のある性別
全て
サンプリング方法
確率サンプル
調査対象母集団
侵襲的機械換気下で ICU に入院し、下気道サンプルで大腸菌が陽性である成人の重症患者
説明
包含基準:
- 成人、集中治療室に入院
- 侵襲的機械換気下
- 下気道検体における大腸菌の存在
除外基準:
-
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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系統群の決定
時間枠：50分
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四重鎖ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) 法を使用して、大腸菌の系統群 (A、B1、B2、C、D、E、F)、または Escherichia clade I の所属を決定しました。
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50分
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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O型判定
時間枠：50分
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ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) 法を使用して、腸外感染症で最も予想される血清型を検索しました: O1、O2a、O2b、O4、O6、O7、O12、O15、O16、O17、O18、O22、O25a、O25b、 O45a、O75、O78
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50分
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病原性因子 (VF) 遺伝子含有量の決定
時間枠：90分
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マルチプレックス PCR を使用して、頻繁に遭遇する 11 の腸外 VF (S および F 線毛 (sfa/foc)、腎盂腎炎に関連する線毛 (papC)、P アドヘシン (papGII、papGIII)、鉄エルシアニアバクチン取り込み受容体 (fyuA)、鉄輸送 (iroN)、エアロバクチン (aer)、接合伝達タンパク質 (traT)、N-アセチルグルコサミン 2-エピメラーゼタンパク質 (neuC)、溶血素 (hlyC)、および細胞傷害性壊死因子 1 (cnf1)
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90分
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抗菌薬感受性の決定
時間枠：24時間
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各分離株の抗菌薬感受性は、フランス微生物学会によるディスク拡散法によって決定されました。
耐性スコアは、各分離株の不活性な in vitro 抗菌剤の合計として定義されました
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24時間
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ベータラクタマーゼの存在
時間枠：90分
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CTX-M および TEM 酵素をコードする遺伝子配列の検出は、ゲノム DNA を用いた PCR によって行いました。
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90分
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その他の成果指標
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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他の既存の大腸菌コレクションに属する系統群
時間枠：24時間
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現在の分離株に属する系統群と、フランスのパリ地域に由来する、以前に公開された 2 つのコレクションの系統群との比較。 1 つは 2010 年に地域社会の成人被験者の便から分離された 280 の大腸菌株 (「COLIVILLE」) を含み、共生株と見なすことができ、もう 1 つは 373 人の入院患者の血液から分離された 373 の大腸菌株を含みます。 2005 年に菌血症の経過中に 7 つの異なる病院 (COLIBAFI 研究)
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24時間
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他の既存大腸菌コレクションにおけるO型分布
時間枠：24時間
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現在の分離株の O 型分布と、フランスのパリ地域に由来する以前に公開された 2 つのコレクションの O 型分布の比較。 1 つは 2010 年に地域社会の成人被験者の便から分離された 280 の大腸菌株 (「COLIVILLE」) を含み、共生株と見なすことができ、もう 1 つは 373 人の入院患者の血液から分離された 373 の大腸菌株を含みます。 2005 年に菌血症の経過中に 7 つの異なる病院 (COLIBAFI 研究)
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24時間
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他の既存の大腸菌コレクションの病原性因子 (VF) 遺伝子コンテンツ
時間枠：24時間
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現在の分離株の病原性因子（VF）遺伝子含有量と、フランスのパリ地域に由来する以前に公開された2つのコレクションの比較。 1 つは 2010 年に地域社会の成人被験者の便から分離された 280 の大腸菌株 (「COLIVILLE」) を含み、共生株と見なすことができ、もう 1 つは 373 人の入院患者の血液から分離された 373 の大腸菌株を含みます。 2005 年に菌血症の経過中に 7 つの異なる病院 (COLIBAFI 研究)
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24時間
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肺炎の原因となる大腸菌分離株および単純なコロニー形成の原因となる分離株に属する系統群
時間枠：期間の中央値は 11.5 日で、最大 35 日です。
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肺炎の原因となる分離株と単純なコロニー形成の原因となる分離株に属する系統群の比較
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期間の中央値は 11.5 日で、最大 35 日です。
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肺炎の原因となる大腸菌分離株および単純なコロニー形成の原因となる大腸菌分離株における O 型の分布
時間枠：期間の中央値は 11.5 日で、最大 35 日です。
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肺炎の原因となる分離株と単純な定着の原因となる分離株の間の O 型分布の比較
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期間の中央値は 11.5 日で、最大 35 日です。
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肺炎の原因となる大腸菌分離株および単純なコロニー形成の原因となる病原性因子 (VF) 遺伝子含有量
時間枠：期間の中央値は 11.5 日で、最大 35 日です。
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肺炎の原因となる分離株と単純なコロニー形成の原因となる分離株との間の病原性因子（VF）遺伝子含有量の比較
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期間の中央値は 11.5 日で、最大 35 日です。
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
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出版物と役立つリンク
研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。
一般刊行物
- Messika J, Magdoud F, Clermont O, Margetis D, Gaudry S, Roux D, Branger C, Dreyfuss D, Denamur E, Ricard JD. Pathophysiology of Escherichia coli ventilator-associated pneumonia: implication of highly virulent extraintestinal pathogenic strains. Intensive Care Med. 2012 Dec;38(12):2007-16. doi: 10.1007/s00134-012-2699-5. Epub 2012 Sep 28.
- Dufour N, Clermont O, La Combe B, Messika J, Dion S, Khanna V, Denamur E, Ricard JD, Debarbieux L; ColoColi group. Bacteriophage LM33_P1, a fast-acting weapon against the pandemic ST131-O25b:H4 Escherichia coli clonal complex. J Antimicrob Chemother. 2016 Nov;71(11):3072-3080. doi: 10.1093/jac/dkw253. Epub 2016 Jul 7.
- Massot M, Daubie AS, Clermont O, Jaureguy F, Couffignal C, Dahbi G, Mora A, Blanco J, Branger C, Mentre F, Eddi A, Picard B, Denamur E, The Coliville Group. Phylogenetic, virulence and antibiotic resistance characteristics of commensal strain populations of Escherichia coli from community subjects in the Paris area in 2010 and evolution over 30 years. Microbiology (Reading). 2016 Apr;162(4):642-650. doi: 10.1099/mic.0.000242. Epub 2016 Jan 28.
- Lefort A, Panhard X, Clermont O, Woerther PL, Branger C, Mentre F, Fantin B, Wolff M, Denamur E; COLIBAFI Group. Host factors and portal of entry outweigh bacterial determinants to predict the severity of Escherichia coli bacteremia. J Clin Microbiol. 2011 Mar;49(3):777-83. doi: 10.1128/JCM.01902-10. Epub 2010 Dec 22.
- Royer G, Poirel L, La Combe B, Clermont O, Chau F, Mercier-Darty M, Denamur E, Nordmann P, Ricard JD, Decousser JW. Lack of association between colistin resistance and chlorhexidine reduced susceptibility in clinical isolates of Escherichia coli. J Antimicrob Chemother. 2021 Sep 15;76(10):2736-2737. doi: 10.1093/jac/dkab235. No abstract available.
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2012年3月27日
一次修了 (実際)
2015年6月10日
研究の完了 (実際)
2016年6月6日
試験登録日
最初に提出
2017年9月25日
QC基準を満たした最初の提出物
2017年10月5日
最初の投稿 (実際)
2017年10月6日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2017年10月6日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2017年10月5日
最終確認日
2017年10月1日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- HLM_JDR8
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
未定
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
いいえ
米国FDA規制機器製品の研究
いいえ
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