Alempien hengitysteiden Escherichia coli -isolaattien ominaisuudet mekaanisesti tuuletetuilla tehohoitopotilailla (COLOCOLI)
torstai 5. lokakuuta 2017 päivittänyt: Prof Jean-Damien RICARD, Hôpital Louis Mourier
Alempien hengitysteiden ominaisuudet Escherichia Coli eristää kolonisoivia ja infektoivia mekaanisesti ventiloituja tehohoitopotilaita: ranskalainen monikeskuspotentiaalinen kokoelma
Prospektiivinen monikeskustutkimus Escherichia colin (E.
coli) isolaatit, jotka ovat peräisin mekaanisesti ventiloiduista tehohoitoyksiköistä (ICU) olevista potilaista; Hengitettyjen potilaiden alemmista hengitysteistä saatujen E. coli -kantojen fenotyypin ja genotyypin karakterisoimiseksi.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Valmis
Yksityiskohtainen kuvaus
Prospektiivinen, havainnollinen, monikeskustutkimus, joka suoritettiin 14 teho-osastolla Ranskassa Escherichia colin (E. coli) isolaatit, jotka ovat peräisin mekaanisesti ventiloiduista tehohoitoyksiköistä (ICU) olevista potilaista; Hengitettyjen potilaiden alemmista hengitysteistä saatujen E. coli -kantojen fenotyypin ja genotyypin karakterisoimiseksi. Kaikki teho-osastopotilaalta peräisin olevasta keuhkonäytteestä (joko henkitorven aspiraatiosta, bronkoalveolaarisesta huuhtelusta tai teleskooppisesta tukkeutuneesta katetrista) mikrobiologialaboratoriossa tunnistetut E. coli -isolaatit säilytetään ja säilytetään -80°C:ssa aivo-sydän-infuusiona. 20 % glyserolia sisältävä liemi. Ne keskitetään sitten tutkijoiden tutkimusyksikköön lisäanalyysiä varten, joka sisältää antimikrobisen herkkyyden, E. colin fylotyypin, O-tyypin ja virulenssitekijägeenin sisällön määrittämisen.
Näitä isolaatteja verrataan kahden aiemmin julkaistun kokoelman isolaatteihin, joista toinen on peräisin yhteisön koehenkilöiden ulosteista, joita pidetään kommensaalikannoina, ja toinen bakteremiapotilaiden verestä.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Todellinen)
289
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
18 vuotta ja vanhemmat (AIKUINEN, OLDER_ADULT)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
jokainen kriittisesti sairas aikuinen potilas, joka on otettu teho-osastolle invasiivisen mekaanisen ventilaation alaisena ja jonka alahengitysteiden näyte on positiivinen Escherichia coli -bakteerin suhteen
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- aikuinen, joutunut tehohoitoon
- invasiivisen mekaanisen ventilaation alla
- Escherichia colin esiintyminen alempien hengitysteiden näytteessä
Poissulkemiskriteerit:
-
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
fylogeneettisen ryhmän määritys
Aikaikkuna: 50 minuuttia
|
Quadruplex-polymeraasiketjureaktio (PCR) -menetelmää käytettiin E. colin fylogeneettisen ryhmän (A, B1, B2, C, D, E, F) tai Escherichia-klade I:n määrittämiseen.
|
50 minuuttia
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
O-tyypin määritys
Aikaikkuna: 50 minuuttia
|
Polymeraasiketjureaktiomenetelmällä (PCR) etsittiin odotetuimmat serotyypit suolen ulkopuolisissa infektioissa: O1, O2a, O2b, O4, O6, O7, O12, O15, O16, O17, O18, O22, O25a, O25b, O45a, O75, O78
|
50 minuuttia
|
|
virulenssitekijän (VF) geenisisällön määritys
Aikaikkuna: 90 minuuttia
|
Multiplex PCR:llä havaittiin geenejä, jotka koodaavat yhtätoista usein esiintyvää suoliston ulkopuolista VF:tä (S- ja F-fimbriae (sfa/foc), pyelonefriittiin liittyviä pilejä (papC), P-adhesiinia (papGII, papGIII), ferri-yersiniabaktiinin sisäänottoreseptoria (fyuA), raudankuljetus (iroN), aerobaktiini (aer), avioliiton siirtoproteiini (traT), N-asetyyliglukosamiini-2-epimeraasiproteiini (neuC), hemolysiini (hlyC) ja sytotoksinen nekrotisoiva tekijä 1 (cnf1)
|
90 minuuttia
|
|
antimikrobisen herkkyyden määrittäminen
Aikaikkuna: 24 tuntia
|
Kunkin isolaatin antimikrobinen herkkyys määritettiin levydiffuusiomenetelmällä French Society of Microbiologyn mukaan.
Resistenssipistemäärä määriteltiin inaktiivisten in vitro antimikrobisten aineiden summana jokaiselle isolaatille
|
24 tuntia
|
|
beetalaktamaasin läsnäolo
Aikaikkuna: 90 minuuttia
|
CTX-M- ja TEM-entsyymejä koodaavien geenisekvenssien havaitseminen suoritettiin PCR:llä genomisella DNA:lla
|
90 minuuttia
|
Muut tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
fylogeneettinen ryhmä, joka kuuluu muihin olemassa oleviin Escherichia coli -kokoelmiin
Aikaikkuna: 24 tuntia
|
nykyisten isolaattien fylogeneettisten ryhmien vertailu kahden aiemmin julkaistun kokoelman ryhmiin, jotka ovat peräisin Pariisin alueelta, Ranskasta; yksi, joka sisältää 280 E. coli -kantaa, jotka on eristetty yhteisön aikuisten koehenkilöiden ulosteista vuonna 2010 ("COLIVILLE") ja jota voidaan pitää kommensaalikannoina, ja toinen, joka sisältää 373 E. coli -kantaa, jotka on eristetty 373 vuonna sairaalahoitoon otetun potilaan verestä. seitsemän eri sairaalaa bakteremian aikana vuonna 2005 (COLIBAFI-tutkimus)
|
24 tuntia
|
|
O-tyypin jakelu muissa olemassa olevissa Escherichia coli -kokoelmissa
Aikaikkuna: 24 tuntia
|
nykyisten isolaattien O-tyypin jakauman vertailu kahden aiemmin julkaistun kokoelman vastaaviin, jotka ovat peräisin Pariisin alueelta, Ranskasta; yksi, joka sisältää 280 E. coli -kantaa, jotka on eristetty yhteisön aikuisten koehenkilöiden ulosteista vuonna 2010 ("COLIVILLE") ja jota voidaan pitää kommensaalikannoina, ja toinen, joka sisältää 373 E. coli -kantaa, jotka on eristetty 373 vuonna sairaalahoitoon otetun potilaan verestä. seitsemän eri sairaalaa bakteremian aikana vuonna 2005 (COLIBAFI-tutkimus)
|
24 tuntia
|
|
virulenssitekijän (VF) geenisisältöä muissa olemassa olevissa Escherichia coli -kokoelmissa
Aikaikkuna: 24 tuntia
|
virulenssitekijän (VF) geenisisällön vertailu esillä olevissa isolaateissa kahden aiemmin julkaistun kokoelman vastaaviin, jotka ovat peräisin Pariisin alueelta, Ranskasta; yksi, joka sisältää 280 E. coli -kantaa, jotka on eristetty yhteisön aikuisten koehenkilöiden ulosteista vuonna 2010 ("COLIVILLE") ja jota voidaan pitää kommensaalikannoina, ja toinen, joka sisältää 373 E. coli -kantaa, jotka on eristetty 373 vuonna sairaalahoitoon otetun potilaan verestä. seitsemän eri sairaalaa bakteremian aikana vuonna 2005 (COLIBAFI-tutkimus)
|
24 tuntia
|
|
fylogeneettinen ryhmä, joka kuuluu E. coli -isolaateihin, jotka ovat vastuussa keuhkokuumeesta ja niistä, jotka ovat vastuussa yksinkertaisesta kolonisaatiosta
Aikaikkuna: mediaaniaika on 11,5 päivää ja enintään 35 päivää
|
keuhkokuumeesta vastuussa olevien ja yksinkertaista kolonisaatiota aiheuttavien isolaattien välisen fylogeneettisen ryhmän vertailu
|
mediaaniaika on 11,5 päivää ja enintään 35 päivää
|
|
O-tyypin jakautuminen E. coli -isolaateissa, jotka ovat vastuussa keuhkokuumeesta ja niistä, jotka ovat vastuussa yksinkertaisesta kolonisaatiosta
Aikaikkuna: mediaaniaika on 11,5 päivää ja enintään 35 päivää
|
O-tyypin jakautumisen vertailu keuhkokuumeesta vastuussa olevien ja yksinkertaista kolonisaatiota aiheuttavien isolaattien välillä
|
mediaaniaika on 11,5 päivää ja enintään 35 päivää
|
|
virulenssitekijän (VF) geenipitoisuus E. coli -isolaateissa, jotka ovat vastuussa keuhkokuumeesta ja niistä, jotka ovat vastuussa yksinkertaisesta kolonisaatiosta
Aikaikkuna: mediaaniaika on 11,5 päivää ja enintään 35 päivää
|
virulenssitekijän (VF) geenisisällön vertailu keuhkokuumeesta vastuussa olevien ja yksinkertaista kolonisaatiota aiheuttavien isolaattien välillä
|
mediaaniaika on 11,5 päivää ja enintään 35 päivää
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Messika J, Magdoud F, Clermont O, Margetis D, Gaudry S, Roux D, Branger C, Dreyfuss D, Denamur E, Ricard JD. Pathophysiology of Escherichia coli ventilator-associated pneumonia: implication of highly virulent extraintestinal pathogenic strains. Intensive Care Med. 2012 Dec;38(12):2007-16. doi: 10.1007/s00134-012-2699-5. Epub 2012 Sep 28.
- Dufour N, Clermont O, La Combe B, Messika J, Dion S, Khanna V, Denamur E, Ricard JD, Debarbieux L; ColoColi group. Bacteriophage LM33_P1, a fast-acting weapon against the pandemic ST131-O25b:H4 Escherichia coli clonal complex. J Antimicrob Chemother. 2016 Nov;71(11):3072-3080. doi: 10.1093/jac/dkw253. Epub 2016 Jul 7.
- Massot M, Daubie AS, Clermont O, Jaureguy F, Couffignal C, Dahbi G, Mora A, Blanco J, Branger C, Mentre F, Eddi A, Picard B, Denamur E, The Coliville Group. Phylogenetic, virulence and antibiotic resistance characteristics of commensal strain populations of Escherichia coli from community subjects in the Paris area in 2010 and evolution over 30 years. Microbiology (Reading). 2016 Apr;162(4):642-650. doi: 10.1099/mic.0.000242. Epub 2016 Jan 28.
- Lefort A, Panhard X, Clermont O, Woerther PL, Branger C, Mentre F, Fantin B, Wolff M, Denamur E; COLIBAFI Group. Host factors and portal of entry outweigh bacterial determinants to predict the severity of Escherichia coli bacteremia. J Clin Microbiol. 2011 Mar;49(3):777-83. doi: 10.1128/JCM.01902-10. Epub 2010 Dec 22.
- Royer G, Poirel L, La Combe B, Clermont O, Chau F, Mercier-Darty M, Denamur E, Nordmann P, Ricard JD, Decousser JW. Lack of association between colistin resistance and chlorhexidine reduced susceptibility in clinical isolates of Escherichia coli. J Antimicrob Chemother. 2021 Sep 15;76(10):2736-2737. doi: 10.1093/jac/dkab235. No abstract available.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (TODELLINEN)
Tiistai 27. maaliskuuta 2012
Ensisijainen valmistuminen (TODELLINEN)
Keskiviikko 10. kesäkuuta 2015
Opintojen valmistuminen (TODELLINEN)
Maanantai 6. kesäkuuta 2016
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Maanantai 25. syyskuuta 2017
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Torstai 5. lokakuuta 2017
Ensimmäinen Lähetetty (TODELLINEN)
Perjantai 6. lokakuuta 2017
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (TODELLINEN)
Perjantai 6. lokakuuta 2017
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Torstai 5. lokakuuta 2017
Viimeksi vahvistettu
Sunnuntai 1. lokakuuta 2017
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Patologiset prosessit
- Infektiot
- Hengitysteiden infektiot
- Hengityselinten sairaudet
- Keuhkosairaudet
- Sairauden ominaisuudet
- Merkit ja oireet, ruoansulatus
- Gram-negatiiviset bakteeri-infektiot
- Bakteeri-infektiot
- Bakteeri-infektiot ja mykoosit
- Ristiinfektio
- Iatrogeeninen sairaus
- Enterobacteriaceae-infektiot
- Terveydenhuoltoon liittyvä keuhkokuume
- Keuhkokuume
- Ripuli
- Hengityslaitteeseen liittyvä keuhkokuume
- Escherichia coli -infektiot
Muut tutkimustunnusnumerot
- HLM_JDR8
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
PÄÄTTÄMÄTÖN
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .