- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT03303937
Caratteristiche degli isolati di Escherichia Coli del tratto respiratorio inferiore nei pazienti in terapia intensiva ventilati meccanicamente (COLOCOLI)
Caratteristiche degli isolati di Escherichia Coli del tratto respiratorio inferiore che colonizzano e infettano i pazienti in terapia intensiva ventilati meccanicamente: una raccolta prospettica multicentrica francese
Panoramica dello studio
Stato
Descrizione dettagliata
Studio prospettico, osservazionale, multicentrico condotto in 14 ICU in Francia per raccogliere Escherichia coli (E. coli) isolati provenienti da pazienti in unità di terapia intensiva (ICU) ventilate meccanicamente; per caratterizzare il fenotipo e il genotipo di ceppi di E. coli prelevati dal tratto respiratorio inferiore di pazienti ventilati. Tutti gli isolati di E. coli identificati nel laboratorio di microbiologia e recuperati da un campione polmonare (aspirato tracheale, lavaggio broncoalveolare o catetere telescopico inserito) provenienti da un paziente in terapia intensiva saranno conservati e conservati a -80 ° C in infusione cuore-cervello brodo contenente glicerolo 20 %. Saranno quindi centralizzati nell'unità di ricerca dei ricercatori per ulteriori analisi che includono la determinazione della suscettibilità antimicrobica, del filotipo di E. coli, del tipo O e del contenuto genico del fattore di virulenza.
Questi isolati saranno confrontati con quelli di due raccolte precedentemente pubblicate, una dalle feci di soggetti comunitari, considerati come ceppi commensali, l'altra dal sangue di pazienti batteriemici.
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- adulto, ricoverato in terapia intensiva
- sotto ventilazione meccanica invasiva
- presenza di Escherichia coli nel campione del tratto respiratorio inferiore
Criteri di esclusione:
-
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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determinazione del gruppo filogenetico
Lasso di tempo: 50 minuti
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Il metodo della reazione a catena della polimerasi quadruplex (PCR) è stato utilizzato per determinare il gruppo filogenetico di E. coli (A, B1, B2, C, D, E, F) o Escherichia clade I appartenente
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50 minuti
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Determinazione del tipo O
Lasso di tempo: 50 minuti
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Il metodo della reazione a catena della polimerasi (PCR) è stato utilizzato per cercare i sierotipi più attesi nelle infezioni extra-intestinali: O1, O2a, O2b, O4, O6, O7, O12, O15, O16, O17, O18, O22, O25a, O25b, O45a, O75, O78
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50 minuti
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determinazione del contenuto genico del fattore di virulenza (VF).
Lasso di tempo: 90 minuti
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La PCR multiplex è stata utilizzata per rilevare i geni che codificano per undici VF extraintestinali frequentemente riscontrati (fimbrie S e F (sfa/foc), pili associati a pielonefrite (papC), P-adesina (papGII, papGIII), il recettore di assorbimento della yersiniabactina ferrica (fyuA), trasporto del ferro (iroN), aerobactina (aer), proteina di trasferimento coniugale (traT), proteina N-acetilglucosamina 2-epimerasi (neuC), emolisina (hlyC) e fattore necrotizzante citotossico 1 (cnf1)
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90 minuti
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determinazione della sensibilità antimicrobica
Lasso di tempo: 24 ore
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La sensibilità antimicrobica di ciascun isolato è stata determinata mediante il metodo di diffusione del disco secondo la Società francese di microbiologia.
Il punteggio di resistenza è stato definito come la somma degli agenti antimicrobici in vitro inattivi per ciascun isolato
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24 ore
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presenza di betalattamasi
Lasso di tempo: 90 minuti
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Il rilevamento delle sequenze geniche che codificano per gli enzimi CTX-M e TEM è stato eseguito mediante PCR con DNA genomico
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90 minuti
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Altre misure di risultato
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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gruppo filogenetico appartenente ad altre collezioni esistenti di Escherichia coli
Lasso di tempo: 24 ore
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confronto del gruppo filogenetico di appartenenza dei presenti isolati con quelli di due raccolte precedentemente pubblicate, originarie dell'area parigina, Francia; uno che comprende 280 ceppi di E. coli isolati dalle feci di soggetti adulti comunitari nel 2010 ("COLIVILLE") e che possono essere considerati ceppi commensali e l'altro che comprende 373 ceppi di E. coli isolati dal sangue di 373 pazienti ricoverati in sette diversi ospedali, durante il corso della batteriemia nel 2005 (studio COLIBAFI)
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24 ore
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Distribuzione di tipo O in altre collezioni esistenti di Escherichia coli
Lasso di tempo: 24 ore
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confronto della distribuzione di tipo O dei presenti isolati con quelli di due raccolte precedentemente pubblicate, originarie dell'area di Parigi, Francia; uno che comprende 280 ceppi di E. coli isolati dalle feci di soggetti adulti comunitari nel 2010 ("COLIVILLE") e che possono essere considerati ceppi commensali e l'altro che comprende 373 ceppi di E. coli isolati dal sangue di 373 pazienti ricoverati in sette diversi ospedali, durante il corso della batteriemia nel 2005 (studio COLIBAFI)
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24 ore
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contenuto del gene del fattore di virulenza (VF) in altre collezioni esistenti di Escherichia coli
Lasso di tempo: 24 ore
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confronto del contenuto genico del fattore di virulenza (VF) dei presenti isolati con quelli di due raccolte precedentemente pubblicate, originarie dell'area di Parigi, Francia; uno che comprende 280 ceppi di E. coli isolati dalle feci di soggetti adulti comunitari nel 2010 ("COLIVILLE") e che possono essere considerati ceppi commensali e l'altro che comprende 373 ceppi di E. coli isolati dal sangue di 373 pazienti ricoverati in sette diversi ospedali, durante il corso della batteriemia nel 2005 (studio COLIBAFI)
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24 ore
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gruppo filogenetico appartenente agli isolati di E. coli responsabili della polmonite e in quelli responsabili della semplice colonizzazione
Lasso di tempo: il periodo di tempo mediano è di 11,5 giorni con un massimo di 35 giorni
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confronto di appartenenza filogenetica tra gli isolati responsabili di polmonite e quelli di semplice colonizzazione
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il periodo di tempo mediano è di 11,5 giorni con un massimo di 35 giorni
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Distribuzione di tipo O negli isolati di E. coli responsabili di polmonite e in quelli responsabili di semplice colonizzazione
Lasso di tempo: il periodo di tempo mediano è di 11,5 giorni con un massimo di 35 giorni
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confronto della distribuzione di tipo O tra gli isolati responsabili di polmonite e quelli di semplice colonizzazione
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il periodo di tempo mediano è di 11,5 giorni con un massimo di 35 giorni
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contenuto del gene del fattore di virulenza (VF) negli isolati di E. coli responsabili della polmonite e in quelli responsabili della colonizzazione semplice
Lasso di tempo: il periodo di tempo mediano è di 11,5 giorni con un massimo di 35 giorni
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confronto del contenuto genico del fattore di virulenza (VF) tra gli isolati responsabili di polmonite e quelli per semplice colonizzazione
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il periodo di tempo mediano è di 11,5 giorni con un massimo di 35 giorni
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Messika J, Magdoud F, Clermont O, Margetis D, Gaudry S, Roux D, Branger C, Dreyfuss D, Denamur E, Ricard JD. Pathophysiology of Escherichia coli ventilator-associated pneumonia: implication of highly virulent extraintestinal pathogenic strains. Intensive Care Med. 2012 Dec;38(12):2007-16. doi: 10.1007/s00134-012-2699-5. Epub 2012 Sep 28.
- Dufour N, Clermont O, La Combe B, Messika J, Dion S, Khanna V, Denamur E, Ricard JD, Debarbieux L; ColoColi group. Bacteriophage LM33_P1, a fast-acting weapon against the pandemic ST131-O25b:H4 Escherichia coli clonal complex. J Antimicrob Chemother. 2016 Nov;71(11):3072-3080. doi: 10.1093/jac/dkw253. Epub 2016 Jul 7.
- Massot M, Daubie AS, Clermont O, Jaureguy F, Couffignal C, Dahbi G, Mora A, Blanco J, Branger C, Mentre F, Eddi A, Picard B, Denamur E, The Coliville Group. Phylogenetic, virulence and antibiotic resistance characteristics of commensal strain populations of Escherichia coli from community subjects in the Paris area in 2010 and evolution over 30 years. Microbiology (Reading). 2016 Apr;162(4):642-650. doi: 10.1099/mic.0.000242. Epub 2016 Jan 28.
- Lefort A, Panhard X, Clermont O, Woerther PL, Branger C, Mentre F, Fantin B, Wolff M, Denamur E; COLIBAFI Group. Host factors and portal of entry outweigh bacterial determinants to predict the severity of Escherichia coli bacteremia. J Clin Microbiol. 2011 Mar;49(3):777-83. doi: 10.1128/JCM.01902-10. Epub 2010 Dec 22.
- Royer G, Poirel L, La Combe B, Clermont O, Chau F, Mercier-Darty M, Denamur E, Nordmann P, Ricard JD, Decousser JW. Lack of association between colistin resistance and chlorhexidine reduced susceptibility in clinical isolates of Escherichia coli. J Antimicrob Chemother. 2021 Sep 15;76(10):2736-2737. doi: 10.1093/jac/dkab235. No abstract available.
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Completamento primario (EFFETTIVO)
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Primo Inserito (EFFETTIVO)
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Ultimo aggiornamento pubblicato (EFFETTIVO)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
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Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
- Processi patologici
- Infezioni
- Infezioni delle vie respiratorie
- Malattie delle vie respiratorie
- Malattie polmonari
- Attributi della malattia
- Segni e sintomi, Digestivo
- Infezioni batteriche Gram-negative
- Infezioni batteriche
- Infezioni batteriche e micosi
- Infezione incrociata
- Malattia iatrogena
- Infezioni da Enterobatteriacee
- Polmonite nosocomiale
- Polmonite
- Diarrea
- Polmonite, associata al ventilatore
- Escherichia coli Infezioni
Altri numeri di identificazione dello studio
- HLM_JDR8
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