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筋骨格系感染症の小児における病原体の検出と定量のための次世代シーケンシング (KDG-002)

2023年11月11日 更新者:Jack Schneider、Indiana University

筋骨格系感染症の小児における病原体の検出と定量化のための血漿ベースの次世代シーケンシング

この研究の目的は、血液検査の使用を評価することです。Karius® プラズマベースの次世代シーケンス検査 (Karius Test) で、筋骨格感染症 (MSKI) の子供の感染原因物質を検出および測定できるかどうかを確認します。 .

調査の概要

詳細な説明

筋骨格感染症(骨髄炎、敗血症性関節炎、または化膿性筋炎)でRiley Hospital for Children(RHC)に12か月以上入院した子供は、前向きに登録されます。 適格な被験者は、RHCの感染症および整形外科サービスからの紹介によって特定されます。血液サンプルは、入院当日(48時間以内)、およびカリウス研究所(カリフォルニア州レッドウッドシティ)でのリアルタイムNGS(次世代シーケンシング)検査のために入院サンプルの24時間後に取得されます。 病原体が NGS によって特定された場合、最初の 2 つのサンプルのいずれかで、その後のサンプルは入院中に 48 ~ 72 時間ごとに送信され、MSKI の治療を受けている間(最大 3 週間)、退院後 1 ~ 2 週間ごとに収集されます。 -up サンプル)。 最初の入院患者の NGS サンプルが両方とも陰性である場合、NGS のためにそれ以上のサンプルは送信されません。 NGS による病原体の同定は、標準的な培養法と比較され、定量的な cfDNA (無細胞 DNA) が経時的に評価されます。

研究の種類

介入

入学 (実際)

38

段階

  • 適用できない

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究場所

    • Indiana
      • Indianapolis、Indiana、アメリカ、46202
        • Riley Hospital for Children

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

6ヶ月~18年 (子、大人)

健康ボランティアの受け入れ

いいえ

調査対象母集団

筋骨格感染症(骨髄炎、敗血症性関節炎、または化膿性筋炎; MSKI)と一致する臨床症状で、インディアナ州インディアナポリスのRiley Hospital for Children(RHC)に入院した子供。

説明

包含基準:

  1. 18歳までの6か月(十分な血液量を確保するため)。
  2. -発熱、骨関節痛(例: 関節の触診に対する圧痛、骨の痛み、または体重を支えることの拒否); ESR(赤血球沈降速度)またはCRP(C反応性タンパク質)の上昇。

除外基準:

  • 別の診断を示唆する臨床的証拠がある場合、被験者は除外されます。 -研究に同意できない、または同意したくない

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか?

デザインの詳細

  • 主な目的:診断
  • 割り当て:なし
  • 介入モデル:単一グループの割り当て
  • マスキング:なし(オープンラベル)

武器と介入

参加者グループ / アーム
介入・治療
実験的:カリウステスト
参加者は、カリウス検査で分析する目的で追加の採血を行います。
筋骨格感染症の小児における病原体同定のための血液および滑液サンプルの次世代シーケンス

この研究は何を測定していますか?

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
初期カリウス検査 (IP1) および標準培養法により病原体が特定された参加者の数
時間枠:入院患者サンプル 1 (IP1) - 入院後 48 時間以内

我々は、最初の(IP1)カリウス検査(「陽性カリウス検査」)によって病原体が特定された参加者の総数を評価しました。

私たちは、各参加者について、カリウス テストの結果を文化 (ゴールド スタンダード) と比較しました。 カリウス 培養結果 (同じ属および種) と一致するテスト結果は、「肯定的な一致」とみなされました。

また、陰性の文化を持っているが、カリウステストが陽性だった参加者の数も評価しました。

入院患者サンプル 1 (IP1) - 入院後 48 時間以内
カリウス検査 (IP2 時点) および標準培養法により病原体が特定された参加者の数
時間枠:入院患者サンプル 2 (IP2) - 最初のサンプルから 48 時間以内

IP2時点(最初のサンプル採取から48時間以内)でカリウス検査(「カリウス検査陽性」)によって病原体が特定された参加者の総数を評価した。

各参加者について、カリウス テストの結果を、陽性文化 (ゴールド スタンダード) の結果と比較しました。

カリウス 培養結果 (同じ属および種) と一致するテスト結果は、「肯定的な一致」とみなされました。

培養で特定された微生物とは異なる微生物を特定したカリウス テスト結果は「不一致の結果」とみなされます。カリウス テスト結果が微生物を特定しなかった場合は「陰性」とみなされます。

入院患者サンプル 2 (IP2) - 最初のサンプルから 48 時間以内

二次結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
マイクロリットルあたりの分子数 (MPM) で表した微生物の無細胞 DNA レベル (cfDNA)
時間枠:入院から退院まで最長3ヶ月

私たちは、非重度の MSKI 患者と重度の MSKI 患者(集中治療室 (ICU) での治療の必要性、2 つ以上の非連続的な解剖学的部位(播種性)の感染として定義される)の患者間の微生物の cfDNA レベル(初期サンプル、IP1)を比較しました。疾患)、複数のデブリードマン処置の必要性、深部静脈血栓症または血栓塞栓性疾患、または病的骨折)。

最初のカリウステスト (IP1) と培養物との間に陽性の一致があるもののみを分析しました (n=15)。

Mann-Whitney U を使用して、非重症 MSKI 患者と重症 MSKI 患者の間で微生物の cfDNA 中央値を比較しました。

入院から退院まで最長3ヶ月
IP1 時点での微生物の無細胞 DNA (cfDNA) のマイクロリットルあたりの分子数 (MPM)
時間枠:入院患者サンプル 1 (IP1) - 入院後 48 時間以内

私たちは、cfDNA レベル(MPM 単位)が、MSKI の小児で追跡される一般的な炎症マーカーである C 反応性タンパク質(CRP)、赤血球沈降速度(ESR)、および白血球数(WBC)と相関するかどうかを評価しました。

スピアマンの相関関係を使用して、MPM 値を CRP、ESR、および WBC と比較しました。

入院患者サンプル 1 (IP1) - 入院後 48 時間以内
IP2 時点での微生物の無細胞 DNA (cfDNA) のマイクロリットルあたりの分子数 (MPM)
時間枠:入院患者サンプル 2 (IP2) - 入院サンプルから 48 時間以内

私たちは、cfDNA レベル (MPM における) が C 反応性タンパク質 (MSKI の小児の炎症を追跡するために使用される一般的な炎症マーカー) と相関するかどうかを評価しました。

スピアマンの相関関係を使用して、MPM 値と CRP を比較しました。

入院患者サンプル 2 (IP2) - 入院サンプルから 48 時間以内
IP3 時点での微生物の無細胞 DNA (cfDNA) のマイクロリットルあたりの分子数 (MPM)
時間枠:入院患者サンプル 3 (IP3) - 2 番目の入院患者サンプルから 48 時間以内

われわれは、カリウステストと培養物との間に陽性の一致が見られた参加者を対象に、IP3 時点での cfDNA レベル(MPM 中の)が C 反応性タンパク質(MSKI の小児の炎症を追跡するために使用される一般的な炎症マーカー)と相関するかどうかを評価しました。

スピアマンの相関関係を使用して、MPM 値と CRP を比較しました。

入院患者サンプル 3 (IP3) - 2 番目の入院患者サンプルから 48 時間以内
IP4 時点での微生物の無細胞 DNA (cfDNA) のマイクロリットルあたりの分子数 (MPM)
時間枠:入院患者サンプル 4 (IP4) - 3 回目の入院患者サンプルから 48 時間以内
私たちは、cfDNA レベル (MPM における) が C 反応性タンパク質 (MSKI の小児の炎症を追跡するために使用される一般的な炎症マーカー) と相関するかどうかを評価しました。
入院患者サンプル 4 (IP4) - 3 回目の入院患者サンプルから 48 時間以内
時点 OP1 における微生物の無細胞 DNA (cfDNA) のマイクロリットルあたりの分子数 (MPM)
時間枠:外来サンプル 1 (OP1) - 退院後 1 ~ 2 週間
私たちは、cfDNA レベル (MPM における) が C 反応性タンパク質 (MSKI の小児の炎症を追跡するために使用される一般的な炎症マーカー) と相関するかどうかを評価しました。
外来サンプル 1 (OP1) - 退院後 1 ~ 2 週間
OP2 時点での微生物の無細胞 DNA (cfDNA) のマイクロリットルあたりの分子数 (MPM)
時間枠:外来サンプル 2 (OP2) - 退院後 3 ~ 6 週間
私たちは、cfDNA レベル (MPM における) が C 反応性タンパク質 (MSKI の小児の炎症を追跡するために使用される一般的な炎症マーカー) と相関するかどうかを評価しました。
外来サンプル 2 (OP2) - 退院後 3 ~ 6 週間
OP3 時点での微生物の無細胞 DNA (cfDNA) のマイクロリットルあたりの分子数 (MPM)
時間枠:外来サンプル 3 (OP3) - 退院後 6 ~ 8 週間
私たちは、cfDNA レベル (MPM における) が C 反応性タンパク質 (MSKI の小児の炎症を追跡するために使用される一般的な炎症マーカー) と相関するかどうかを評価しました。
外来サンプル 3 (OP3) - 退院後 6 ~ 8 週間

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

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協力者

捜査官

  • 主任研究者:Jack G Schneider, MD、Indiana University School of Medicine - Pediatrics

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2019年9月1日

一次修了 (実際)

2022年6月2日

研究の完了 (実際)

2022年6月2日

試験登録日

最初に提出

2019年2月13日

QC基準を満たした最初の提出物

2019年2月15日

最初の投稿 (実際)

2019年2月20日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (推定)

2023年12月1日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2023年11月11日

最終確認日

2023年11月1日

詳しくは

本研究に関する用語

個々の参加者データ (IPD) の計画

個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?

いいえ

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

はい

米国で製造され、米国から輸出された製品。

いいえ

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

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