Biofire Filmarray を使用した下気道感染症の診断

急性呼吸器感染症 (ARI) は、世界中の罹患率と死亡率の主要な原因です。 通常、子供、高齢者、免疫不全患者ではより重症ですが、すべての集団と年齢層が影響を受けやすくなっています。

下気道感染症は、世界で 3 番目に多い死因であり、世界中で 200 万人近くの小児期の死亡が ARI に起因しており、その大部分は発展途上国で発生しています。地中海地域は ARI に起因していました。 ただし、これらの感染症の罹患率と病因に関する地域データは不足しています。

これらの感染症は、抗菌薬の処方、入院、仕事や学校からの時間の損失に大きな影響を与えます。 ARI の原因となる最も頻度の高い病原体は呼吸器ウイルスであり、次に細菌です。ウイルス感染の可能性が高い場合でも、抗生物質による経験的治療が頻繁に開始され、不必要な抗生物質の使用につながります。 病原体の早期診断は、医薬品の正確な選択に有益であり、抗生物質の過剰使用や乱用を大幅に回避し、患者の臨床ケアを改善できます。 さらに重要なことは、百日咳菌 (B. 百日咳) とインフルエンザ ウイルスは、患者の早期隔離を可能にし、病原体の拡散を減らすことができます。

現在、呼吸器病原体の日常的な検出方法は、主に免疫学的方法に基づいています。

免疫蛍光アッセイ (IFA) を使用した抗原検出による呼吸器ウイルスの直接診断は今でも使用されていますが、通常は 8 つのウイルス (アデノウイルス [AdV]、インフルエンザ A [FluA]、インフルエンザ B [FluB]、パラインフルエンザ [PIV]、ヒトメタニューモウイルス) に限定されています。 [HMPV] および呼吸器合胞体ウイルス [RSV]) に感染しており、ウイルス力価、患者の年齢、および症状の発症に関連する検査の時間によっては、感受性に欠ける場合があります。

ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) などの分子法は、抗原検出やウイルス培養などの従来の方法と比較して分析感度が高いため、ウイルス検出が増加します。

微生物学的分析と生物の同定には48〜72時間かかる場合があり、偽陰性の結果は、同時または以前の抗生物質治療の結果として発生する可能性がありますが、偽陽性はコロニー形成またはサンプリングエラーを表す場合があります.

VITEK 2 は、一次接種が準備され、標準化された後、微生物同定および抗菌薬感受性試験 (AST) のための完全に自動化されたシステムです。 比色試薬カードにより、VITEK 2 は表現型同定法のための最先端技術プラットフォームを提供します (6)。 下気道感染症の診断における FilmArray 呼吸器パネルのアプリケーションは、微生物の同定時間を短縮するように設計されています。 分子システムには、自動化された核酸抽出、最初の逆転写ステップ、マルチプレックス ネステッド PCR、続いて融解曲線分析が含まれます。

BIOFIRE® FILMARRAY® Pneumonia Panel は、18 種類の細菌 (11 グラム陰性、4 グラム陽性、3 種類の非定型)、7 種類の抗生物質耐性マーカー、および肺炎やその他の下気道感染症を引き起こす 9 種類のウイルスを検査します。 気管支肺胞 (BAL) 様サンプルの全体的な感度と特異度はそれぞれ 96.2% と 98.3% であり、喀痰サンプルの感度と特異度はそれぞれ 96.3% と 97.2% です。 5 分のハンズオン時間と 65 分の計測時間を必要とするシステム。 FilmArray と他の呼吸器検査との比較研究では、同等の結果が得られました。