Диагностика инфекций нижних дыхательных путей с помощью Biofire Filmarray

Острые респираторные инфекции (ОРЗ) являются ведущей причиной заболеваемости и смертности во всем мире. Хотя обычно заболевание протекает более тяжело у детей, пожилых людей и пациентов с ослабленным иммунитетом, восприимчивы все популяции и возрастные группы.

Инфекции нижних дыхательных путей являются третьей ведущей причиной смерти во всем мире, и почти два миллиона детских смертей во всем мире связаны с ОРЗ, причем подавляющее большинство из них приходится на развивающиеся страны. По оценкам Всемирной организации здравоохранения, в 2013 г. Средиземноморский регион были связаны с ОРИ. Однако региональные данные о заболеваемости и этиологии этих инфекций отсутствуют.

Эти инфекции оказывают значительное влияние на назначение противомикробных препаратов, госпитализации и потери времени на работе и в школе. Наиболее частыми агентами, ответственными за ОРЗ, являются респираторные вирусы, за которыми следуют бактерии. Эмпирическое лечение антибиотиками часто начинают, даже когда высока вероятность вирусной инфекции, что приводит к ненужному использованию антибиотиков. Ранняя диагностика возбудителя полезна для точного подбора лекарств, что позволяет в значительной степени избежать чрезмерного использования или даже злоупотребления антибиотиками и улучшить клиническую помощь пациентам. Что еще более важно, ранняя диагностика инфекционных патогенов, таких как Bordetella pertussis (B. pertussis) и вирусы гриппа могут обеспечить раннюю изоляцию пациентов, тем самым уменьшая распространение возбудителей.

В настоящее время рутинные методы выявления респираторных возбудителей в основном основаны на иммунологических методах.

Прямая диагностика респираторных вирусов путем обнаружения антигена с использованием иммунофлюоресцентных анализов (ИФА) все еще используется, но обычно ограничивается восемью вирусами (аденовирус [AdV], грипп A [FluA], грипп B [FluB], парагрипп [PIV], метапневмовирус человека [HMPV] и респираторно-синцитиальный вирус [RSV]) и может быть недостаточно чувствительным в зависимости от титра вируса, возраста пациента и времени тестирования в связи с появлением симптомов.

Молекулярные методы, такие как полимеразная цепная реакция (ПЦР), увеличивают обнаружение вирусов благодаря большей аналитической чувствительности по сравнению с традиционными методами, такими как обнаружение антигена и/или посев вируса.

Микробиологический анализ и идентификация микроорганизмов могут занять 48-72 часа, ложноотрицательные результаты могут быть результатом сопутствующего или предшествующего лечения антибиотиками, тогда как ложноположительные результаты могут свидетельствовать об ошибках колонизации или отбора проб.

VITEK 2 представляет собой полностью автоматизированную систему для микробной идентификации и тестирования чувствительности к противомикробным препаратам (AST) после подготовки и стандартизации первичного инокулята. Благодаря колориметрическим картам реагентов VITEK 2 предлагает современную технологическую платформу для методов фенотипической идентификации.(6) Применение респираторной панели FilmArray в диагностике инфекций нижних дыхательных путей призвано сократить время идентификации микроорганизмов. FilmArray представляет собой небольшой настольный полностью автоматизированный мультиплексный ПЦР-прибор. Молекулярная система включает автоматизированное извлечение нуклеиновых кислот, начальную стадию обратной транскрипции и мультиплексную вложенную ПЦР с последующим анализом кривой плавления.

Панель BIOFIRE® FILMARRAY® Pneumonia Panel плюс тесты на 18 бактерий (11 грамотрицательных, 4 грамположительных и 3 атипичных), 7 маркеров устойчивости к антибиотикам и 9 вирусов, вызывающих пневмонию и другие инфекции нижних дыхательных путей. Он обеспечивает общую чувствительность и специфичность для бронхоальвеолярных (БАЛ) образцов 96,2% и 98,3% соответственно, а для образцов мокроты чувствительность и специфичность 96,3% и 97,2% соответственно. Тест проводится в закрытом система, которая требует 5 минут практического времени и 65 минут инструментального времени. Несколько сравнительных исследований между FilmArray и другими тестами на респираторные организмы показали сопоставимые результаты.