Diagnosi delle infezioni del tratto respiratorio inferiore utilizzando Biofire Filmarray

Le infezioni respiratorie acute (ARI) sono una delle principali cause di morbilità e mortalità in tutto il mondo. Anche se di solito è più grave nei bambini, negli anziani e nei pazienti immunocompromessi, tutte le popolazioni e gruppi di età sono suscettibili.

Le infezioni delle basse vie respiratorie sono la terza principale causa di morte nel mondo e quasi due milioni di decessi infantili nel mondo sono attribuibili alle ARI, con la stragrande maggioranza che si verifica nei paesi in via di sviluppo. L'Organizzazione mondiale della sanità stima che nel 2013 oltre l'8% di tutti i decessi nei paesi orientali Regione Mediterranea erano riconducibili alle ARI. Tuttavia, mancano dati regionali sulla morbilità e l'eziologia di queste infezioni.

Queste infezioni hanno un impatto significativo sulle prescrizioni antimicrobiche, sui ricoveri e sul tempo perso dal lavoro e dalla scuola. Gli agenti più frequentemente responsabili di ARI sono i virus respiratori seguiti dai batteri. Il trattamento empirico con antibiotici viene spesso avviato anche quando l'infezione virale è una forte possibilità, portando a un uso non necessario di antibiotici. La diagnosi precoce dell'agente patogeno è utile per la selezione precisa del farmaco, che può in gran parte evitare l'uso eccessivo o addirittura l'abuso degli antibiotici e migliorare l'assistenza clinica dei pazienti. Ancora più importante, la diagnosi precoce di patogeni contagiosi, come Bordetella pertussis (B. pertussis) e virus influenzali, possono consentire l'isolamento precoce dei pazienti, riducendo così la diffusione di agenti patogeni.

Attualmente, i metodi di rilevamento di routine per i patogeni respiratori si basano principalmente su metodi immunologici.

La diagnosi diretta dei virus respiratori mediante rilevamento dell'antigene mediante test di immunofluorescenza (IFA) è ancora utilizzata, ma è tipicamente limitata a otto virus (adenovirus [AdV], influenza A [FluA], influenza B [FluB], parainfluenza [PIV], metapneumovirus umano [HMPV] e virus respiratorio sinciziale [RSV]) e possono mancare di sensibilità a seconda del titolo virale, dell'età del paziente e del momento del test in relazione all'insorgenza dei sintomi.

I metodi molecolari come la reazione a catena della polimerasi (PCR) aumentano il rilevamento virale grazie a una maggiore sensibilità analitica rispetto ai metodi convenzionali come il rilevamento dell'antigene e/o la coltura virale.

L'analisi microbiologica e l'identificazione dei microrganismi possono richiedere 48-72 ore, risultati falsi negativi possono verificarsi a seguito di trattamenti antibiotici concomitanti o precedenti, mentre falsi positivi possono rappresentare errori di colonizzazione o campionamento.

Il VITEK 2 è un sistema completamente automatizzato per l'identificazione microbica e il test di sensibilità antimicrobica (AST), dopo che un inoculo primario è stato preparato e standardizzato. Con le sue schede reagenti colorimetriche, VITEK 2 offre una piattaforma tecnologica all'avanguardia per i metodi di identificazione fenotipica.(6) L'applicazione del pannello respiratorio FilmArray nella diagnosi delle infezioni del tratto respiratorio inferiore è progettata per ridurre il tempo di identificazione dei microrganismi FilmArray è un piccolo dispositivo PCR multiplex desktop completamente automatizzato. Il sistema molecolare include l'estrazione automatizzata dell'acido nucleico, una fase iniziale di trascrizione inversa e PCR multiplex nidificata, seguita da un'analisi della curva di fusione .

Il pannello per polmonite BIOFIRE® FILMARRAY® oltre a test per 18 batteri (11 Gram negativi, 4 Gram positivi e 3 atipici), 7 marcatori di resistenza agli antibiotici e 9 virus che causano polmonite e altre infezioni del tratto respiratorio inferiore. Offre una sensibilità e una specificità complessive per i campioni di tipo broncoalveolare (BAL) rispettivamente del 96,2% e del 98,3% e per i campioni di espettorato una sensibilità e una specificità del 96,3% e del 97,2%, rispettivamente. Il test viene eseguito in un ambiente chiuso sistema che richiede 5 minuti di pratica e 65 minuti di strumentazione. Diversi studi di confronto tra FilmArray e altri test per organismi respiratori hanno mostrato risultati comparabili.