Diagnose van lagere luchtweginfecties met behulp van Biofire Filmarray

Acute luchtweginfecties (ARI) zijn wereldwijd een belangrijke oorzaak van morbiditeit en mortaliteit. Hoewel het meestal ernstiger is bij kinderen, ouderen en immuungecompromitteerde patiënten, zijn alle bevolkingsgroepen en leeftijdsgroepen vatbaar.

Infecties van de onderste luchtwegen zijn wereldwijd de op twee na belangrijkste doodsoorzaak en bijna twee miljoen sterfgevallen bij kinderen wereldwijd zijn toe te schrijven aan ARI, waarvan de overgrote meerderheid voorkomt in ontwikkelingslanden. De Wereldgezondheidsorganisatie schat dat in 2013 meer dan 8% van alle sterfgevallen in de oostelijke Middellandse Zeegebied waren toe te schrijven aan ARI's. Regionale gegevens over morbiditeit en etiologie van deze infecties ontbreken echter.

Deze infecties hebben een aanzienlijke impact op het voorschrijven van antimicrobiële middelen, ziekenhuisopnames en verloren tijd van werk en school. De meest voorkomende agentia die verantwoordelijk zijn voor ARI zijn respiratoire virussen gevolgd door bacteriën. Empirische behandeling met antibiotica wordt vaak gestart, zelfs wanneer een virale infectie een sterke mogelijkheid is, wat leidt tot onnodig antibioticagebruik. De vroege diagnose van de ziekteverwekker is gunstig voor de precieze selectie van medicatie, die overmatig gebruik of zelfs misbruik van de antibiotica grotendeels kan voorkomen en de klinische zorg voor patiënten kan verbeteren. Wat nog belangrijker is, de vroege diagnose van besmettelijke pathogenen, zoals Bordetella pertussis (B. kinkhoest) en griepvirussen, kunnen vroege isolatie van patiënten mogelijk maken, waardoor de verspreiding van ziekteverwekkers wordt verminderd.

Momenteel zijn de routinematige detectiemethoden voor respiratoire pathogenen meestal gebaseerd op immunologische methoden.

Directe diagnose van respiratoire virussen door antigeendetectie met behulp van immunofluorescentietesten (IFA), wordt nog steeds gebruikt, maar is doorgaans beperkt tot acht virussen (adenovirus [AdV], influenza A [FluA], influenza B [FluB], para-influenza [PIV], humaan metapneumovirus [HMPV] en respiratoir syncytieel virus [RSV]) en kan gevoeligheid missen, afhankelijk van de virale titer, de leeftijd van de patiënt en het tijdstip van testen in relatie tot het begin van de symptomen.

Moleculaire methoden zoals de polymerasekettingreactie (PCR) verhogen de virale detectie vanwege een grotere analytische gevoeligheid in vergelijking met conventionele methoden zoals antigeendetectie en/of virale kweek.

Microbiologische analyse en identificatie van organismen kan 48-72 uur duren, fout-negatieve resultaten kunnen optreden als gevolg van gelijktijdige of eerdere behandeling met antibiotica, terwijl fout-positieve kolonisatie- of bemonsteringsfouten kunnen duiden.

De VITEK 2 is een volledig geautomatiseerd systeem voor microbiële identificatie en antimicrobiële gevoeligheidstesten (AST), nadat een primair inoculum is voorbereid en gestandaardiseerd. Met zijn colorimetrische reagenskaarten biedt de VITEK 2 een state-of-the-art technologieplatform voor fenotypische identificatiemethoden.(6) De toepassing van het FilmArray-ademhalingspaneel bij de diagnose van infecties van de onderste luchtwegen is ontworpen om de tijd voor identificatie van de micro-organismen te verkorten. FilmArray is een klein, volledig geautomatiseerd multiplex PCR-apparaat. Het moleculaire systeem omvat geautomatiseerde nucleïnezuurextractie, een initiële reverse transcriptiestap en multiplex geneste PCR, gevolgd door een smeltkrommeanalyse.

Het BIOFIRE® FILMARRAY® pneumoniepanel plus tests voor 18 bacteriën (11 gramnegatief, 4 grampositief en 3 atypisch), 7 markers voor antibioticaresistentie en 9 virussen die longontsteking en andere infecties van de onderste luchtwegen veroorzaken. Het biedt een algehele gevoeligheid en specificiteit voor bronchoalveolaire (BAL)-achtige monsters van respectievelijk 96,2% en 98,3%, en voor sputummonsters een gevoeligheid en specificiteit van respectievelijk 96,3% en 97,2%. De test wordt uitgevoerd in een gesloten systeem dat 5 minuten praktijktijd en 65 minuten instrumentatietijd vereist. Verschillende vergelijkende onderzoeken tussen FilmArray en andere tests voor respiratoire organismen lieten vergelijkbare resultaten zien.