Diagnostika infekcí dolních cest dýchacích pomocí Biofire Filmarray

Akutní respirační infekce (ARI) jsou celosvětově hlavní příčinou morbidity a mortality. Ačkoli obvykle závažnější u dětí, starších pacientů a pacientů s oslabenou imunitou, všechny populace a věkové skupiny jsou náchylné.

Infekce dolních cest dýchacích jsou třetí hlavní příčinou úmrtí na celém světě a téměř dva miliony dětských úmrtí na celém světě lze připsat ARI, přičemž k naprosté většině dochází v rozvojových zemích. Světová zdravotnická organizace odhaduje, že v roce 2013 bylo více než 8 % všech úmrtí ve východních zemích. Středomoří byly přisouzeny ARI. Regionální údaje o morbiditě a etiologii těchto infekcí však chybí.

Tyto infekce mají významný dopad na předepisování antimikrobiálních látek, hospitalizace a ztrátu času z práce a školy. Nejčastějšími původci ARI jsou respirační viry následované bakteriemi. Empirická léčba antibiotiky je často zahajována i v případě, kdy je velká možnost virové infekce, což vede ke zbytečnému užívání antibiotik. Včasná diagnostika patogenu je přínosem pro přesný výběr medikace, která může do značné míry předejít nadužívání či dokonce zneužívání antibiotik a zlepšit klinickou péči o pacienty. Ještě důležitější je včasná diagnostika nakažlivých patogenů, jako je Bordetella pertussis (B. pertussis) a viry chřipky, mohou umožnit včasnou izolaci pacientů, a tak omezit šíření patogenů.

V současnosti jsou rutinní metody detekce respiračních patogenů většinou založeny na imunologických metodách.

Přímá diagnostika respiračních virů detekcí antigenu pomocí imunofluorescenčních testů (IFA) se stále používá, ale je obvykle omezena na osm virů (adenovirus [AdV], chřipka A [FluA], chřipka B [FluB], parainfluenza [PIV], lidský metapneumovirus [HMPV] a respirační syncyciální virus [RSV]) a může postrádat citlivost v závislosti na virovém titru, věku pacienta a době testování ve vztahu k nástupu příznaků.

Molekulární metody, jako je polymerázová řetězová reakce (PCR), zvyšují detekci virů díky vyšší analytické citlivosti ve srovnání s konvenčními metodami, jako je detekce antigenu a/nebo kultivace viru.

Mikrobiologická analýza a identifikace organismů může trvat 48–72 hodin, falešně negativní výsledky se mohou objevit jako důsledek současné nebo předchozí antibiotické léčby, zatímco falešně pozitivní mohou představovat chyby kolonizace nebo odběru vzorků.

VITEK 2 je plně automatizovaný systém pro mikrobiální identifikaci a testování antimikrobiální citlivosti (AST) po přípravě a standardizaci primárního inokula. Se svými kolorimetrickými reagenčními kartami nabízí VITEK 2 nejmodernější technologickou platformu pro metody fenotypové identifikace.(6) Aplikace respiračního panelu FilmArray v diagnostice infekcí dolních cest dýchacích je navržena tak, aby zkrátila čas na identifikaci mikroorganismů FilmArray je malé, stolní, plně automatizované multiplexní PCR zařízení. Molekulární systém zahrnuje automatickou extrakci nukleové kyseliny, počáteční krok reverzní transkripce a multiplexní vnořenou PCR, po které následuje analýza křivky tání.

BIOFIRE® FILMARRAY® Pneumonia Panel plus testuje 18 bakterií (11 gramů negativních, 4 gramy pozitivní a 3 atypické), 7 markerů rezistence na antibiotika a 9 virů, které způsobují zápal plic a další infekce dolních cest dýchacích. Nabízí celkovou senzitivitu a specificitu pro bronchoalveolární (BAL) podobné vzorky 96,2 %, respektive 98,3 %, a pro vzorky sputa senzitivitu a specificitu 96,3 % a 97,2 %, v tomto pořadí. Test se provádí v uzavřeném systém, který vyžaduje 5 minut praktického času a 65 minut přístrojového času. Několik srovnávacích studií mezi FilmArray a jinými testy pro respirační organismy ukázalo srovnatelné výsledky.