Alahengitysteiden infektioiden diagnoosi Biofire Filmarraylla

Akuutit hengitystieinfektiot (ARI) ovat johtava sairastuvuuden ja kuolleisuuden syy maailmanlaajuisesti. Vaikka yleensä vakavampia lapsilla, vanhuksilla ja immuunipuutteisilla potilailla, kaikki populaatiot ja ikäryhmät ovat alttiita.

Alahengitystieinfektiot ovat kolmanneksi yleisin kuolinsyy maailmanlaajuisesti, ja lähes kaksi miljoonaa lapsuuskuolemaa maailmanlaajuisesti johtuu ARI:sta, joista suurin osa tapahtuu kehitysmaissa. Maailman terveysjärjestön arvion mukaan vuonna 2013 yli 8 % kaikista kuolemista Itä-Euroopassa Välimeren alue johtui ARI:sta. Alueelliset tiedot näiden infektioiden sairastavuudesta ja etiologiasta kuitenkin puuttuvat.

Näillä infektioilla on merkittävä vaikutus mikrobilääkemääräyksiin, sairaalahoitoihin sekä työ- ja koulun menetyksiin. Yleisimmät ARI:n aiheuttajat ovat hengitystievirukset ja sen jälkeen bakteerit. Empiirinen hoito antibiooteilla aloitetaan usein, vaikka virusinfektio onkin suuri mahdollisuus, mikä johtaa tarpeettomaan antibioottien käyttöön. Taudinaiheuttajan varhainen diagnosointi on hyödyllistä lääkkeiden tarkalle valinnalle, jolla voidaan suurelta osin välttää antibioottien liikakäyttö tai jopa väärinkäyttö ja parantaa potilaiden kliinistä hoitoa. Vielä tärkeämpää on tarttuvien patogeenien, kuten Bordetella pertussisin (B. pertussis) ja influenssavirukset voivat mahdollistaa potilaiden varhaisen eristämisen, mikä vähentää patogeenien leviämistä.

Tällä hetkellä hengityselinten taudinaiheuttajien rutiininomaiset tunnistusmenetelmät perustuvat pääosin immunologisiin menetelmiin.

Hengitystievirusten suoraa diagnosointia antigeenin havaitsemisen avulla immunofluoresenssimäärityksillä (IFA) käytetään edelleen, mutta se on tyypillisesti rajoitettu kahdeksaan virukseen (adenovirus [AdV], influenssa A [FluA], influenssa B [FluB], parainfluenssa [PIV], ihmisen metapneumovirus [HMPV] ja respiratorinen synsyyttivirus [RSV]), ja niiltä saattaa puuttua herkkyys virustiitterin, potilaan iän ja testausajankohdan mukaan suhteessa oireiden alkamiseen.

Molekyylimenetelmät, kuten polymeraasiketjureaktio (PCR), lisäävät viruksen havaitsemista johtuen suuremmasta analyyttisestä herkkyydestä verrattuna tavanomaisiin menetelmiin, kuten antigeenien havaitsemiseen ja/tai virusviljelyyn.

Mikrobiologinen analyysi ja organismien tunnistaminen voi kestää 48-72 tuntia, vääriä negatiivisia tuloksia voi esiintyä samanaikaisen tai aikaisemman antibioottihoidon seurauksena, kun taas väärät positiiviset voivat olla kolonisaatio- tai näytteenottovirheitä.

VITEK 2 on täysin automatisoitu järjestelmä mikrobien tunnistamiseen ja antimikrobisen herkkyystestaukseen (AST) sen jälkeen, kun ensisijainen siirroste on valmistettu ja standardoitu. Kolorimetristen reagenssikorttien ansiosta VITEK 2 tarjoaa huippuluokan teknologia-alustan fenotyyppisiin tunnistusmenetelmiin.(6) FilmArray-hengityspaneelin käyttö alempien hengitysteiden infektioiden diagnosoinnissa on suunniteltu lyhentämään mikro-organismien tunnistamiseen kuluvaa aikaa. FilmArray on pieni, pöytätietokoneen täysin automatisoitu multiplex-PCR-laite. Molekyylijärjestelmä sisältää automatisoidun nukleiinihapon uuton, ensimmäisen käänteistranskriptiovaiheen ja multipleksisen sisäkkäisen PCR:n, jota seuraa sulamiskäyräanalyysi.

BIOFIRE® FILMARRAY® Pneumonia Panel plus testaa 18 bakteeria (11 gramnegatiivista, 4 grampositiivista ja 3 epätyypillistä), 7 antibioottiresistenssimarkkeria ja 9 viruksia, jotka aiheuttavat keuhkokuumetta ja muita alempien hengitysteiden infektioita. Sen kokonaisherkkyys ja spesifisyys bronkoalveolaaristen (BAL) kaltaisten näytteiden osalta on 96,2 % ja 98,3 % ja yskösnäytteille 96,3 % ja 97,2 %. Testi suoritetaan suljetussa tilassa. järjestelmä, joka vaatii 5 minuuttia käytännön aikaa ja 65 minuuttia instrumentointiaikaa. Useat FilmArrayn ja muiden hengityselimiä koskevien testien vertailututkimukset osoittivat vertailukelpoisia tuloksia.