Az alsó légúti fertőzések diagnosztizálása Biofire Filmarray segítségével

Az akut légúti fertőzések (ARI) a megbetegedések és halálozások vezető okai világszerte. Bár általában súlyosabb gyermekeknél, időseknél és immunhiányos betegeknél, minden populáció és korcsoport fogékony.

Az alsó légúti fertőzések a harmadik vezető halálok világszerte, és világszerte közel kétmillió gyermekkori haláleset tulajdonítható az ARI-nek, amelyek túlnyomó többsége a fejlődő országokban fordul elő. Az Egészségügyi Világszervezet becslése szerint 2013-ban az összes halálozás több mint 8%-a Keleten A mediterrán régió az ARI-knak tulajdonítható. Hiányoznak azonban regionális adatok e fertőzések morbiditásáról és etiológiájáról.

Ezek a fertőzések jelentős hatással vannak az antimikrobiális receptekre, a kórházi kezelésekre, valamint a munkából és az iskolából eltöltött időre. Az ARI-t leggyakrabban a légúti vírusok, majd a baktériumok okozzák. Az empirikus kezelést antibiotikumokkal gyakran még akkor is megkezdik, ha a vírusfertőzés nagy esélye van, ami szükségtelen antibiotikum használathoz vezet. A kórokozó korai diagnosztizálása jótékony hatással van a gyógyszer pontos kiválasztására, mellyel nagymértékben elkerülhető az antibiotikumok túlzott használata vagy akár visszaélése, és javítható a betegek klinikai ellátása. Ennél is fontosabb a fertőző kórokozók, például a Bordetella pertussis (B. pertussis) és influenzavírusok, lehetővé tehetik a betegek korai elkülönítését, ezáltal csökkentve a kórokozók terjedését.

Jelenleg a légúti kórokozók rutin kimutatási módszerei többnyire immunológiai módszereken alapulnak.

A légúti vírusok közvetlen, immunfluoreszcens vizsgálattal (IFA) végzett antigén-detektálással történő diagnosztizálása továbbra is használatos, de jellemzően nyolc vírusra korlátozódik (adenovírus [AdV], influenza A [FluA], influenza B [FluB], parainfluenza [PIV], humán metapneumovírus [HMPV] és légúti syncytial vírus [RSV]), és a vírustitertől, a beteg életkorától és a tünetek megjelenéséhez viszonyított vizsgálat idejétől függően előfordulhat, hogy nem érzékeny.

A molekuláris módszerek, például a polimeráz láncreakció (PCR) növelik a vírusok kimutatását a nagyobb analitikai érzékenység miatt, mint a hagyományos módszerek, például az antigén-detektálás és/vagy a vírustenyésztés.

A mikroorganizmusok mikrobiológiai analízise és azonosítása 48-72 órát is igénybe vehet, az egyidejű vagy korábbi antibiotikum kezelés eredményeként fals negatív eredmények születhetnek, míg a fals pozitív kolonizációs vagy mintavételi hibákat jelezhet.

A VITEK 2 egy teljesen automatizált rendszer a mikrobiális azonosításhoz és az antimikrobiális érzékenységi vizsgálathoz (AST), miután az elsődleges oltóanyagot elkészítették és szabványosították. Kolorimetriás reagenskártyáival a VITEK 2 a legkorszerűbb technológiai platformot kínálja a fenotípusos azonosítási módszerekhez.(6) A FilmArray légúti panel alkalmazása az alsó légúti fertőzések diagnosztizálásában a mikroorganizmusok azonosításának idejét csökkenti. A FilmArray egy kicsi, asztali, teljesen automatizált multiplex PCR eszköz. A molekuláris rendszer magában foglalja az automatizált nukleinsav extrakciót, a kezdeti reverz transzkripciós lépést és a multiplex beágyazott PCR-t, amelyet egy olvadási görbe elemzés követ.

A BIOFIRE® FILMARRAY® Pneumonia Panel plusz 18 baktériumot (11 Gram-negatív, 4 Gram-pozitív és 3 atípusos), 7 antibiotikum-rezisztencia markert és 9 vírust tesztel, amelyek tüdőgyulladást és egyéb alsó légúti fertőzéseket okoznak. A bronchoalveoláris (BAL)-szerű minták esetében 96,2%, illetve 98,3%, a köpetminták szenzitivitását és specificitását pedig 96,3%, illetve 97,2%-os általános szenzitivitást és specificitást biztosít. A tesztet zárt térben végezzük. rendszer, amely 5 perc gyakorlati időt és 65 perc műszerezési időt igényel. Számos összehasonlító tanulmány a FilmArray és más légzőszervi szervezetekre végzett tesztek között hasonló eredményeket mutatott.