Diagnose von Infektionen der unteren Atemwege mit Biofire Filmarray

Akute Atemwegsinfektionen (ARI) sind weltweit eine der Hauptursachen für Morbidität und Mortalität. Obwohl bei Kindern, älteren und immungeschwächten Patienten in der Regel schwerwiegender, sind alle Bevölkerungsgruppen und Altersgruppen anfällig.

Infektionen der unteren Atemwege sind weltweit die dritthäufigste Todesursache, und fast zwei Millionen Todesfälle bei Kindern sind weltweit auf ARI zurückzuführen, wobei die überwiegende Mehrheit in Entwicklungsländern auftritt. Die Weltgesundheitsorganisation schätzt, dass im Jahr 2013 über 8 % aller Todesfälle in den östlichen Mittelmeerraum waren ARIs zuzurechnen. Regionale Daten zur Morbidität und Ätiologie dieser Infektionen fehlen jedoch.

Diese Infektionen haben erhebliche Auswirkungen auf die Verschreibung von Antibiotika, Krankenhausaufenthalte und Fehlzeiten von Arbeit und Schule. Die am häufigsten für ARI verantwortlichen Erreger sind Atemwegsviren, gefolgt von Bakterien. Eine empirische Behandlung mit Antibiotika wird häufig eingeleitet, selbst wenn eine Virusinfektion eine starke Möglichkeit darstellt, was zu einem unnötigen Einsatz von Antibiotika führt. Die frühzeitige Diagnose des Erregers ist vorteilhaft für die präzise Auswahl von Medikamenten, die eine Überdosierung oder gar einen Missbrauch der Antibiotika weitgehend vermeiden und die klinische Versorgung der Patienten verbessern können. Noch wichtiger ist die frühzeitige Diagnose von ansteckenden Krankheitserregern wie Bordetella pertussis (B. Keuchhusten) und Influenzaviren, können eine frühzeitige Isolierung von Patienten ermöglichen und so die Ausbreitung von Krankheitserregern reduzieren.

Derzeit basieren die routinemäßigen Nachweismethoden für Atemwegserreger meist auf immunologischen Methoden.

Die direkte Diagnose von Atemwegsviren durch Antigennachweis mit Immunfluoreszenzassays (IFA) wird immer noch verwendet, ist jedoch typischerweise auf acht Viren beschränkt (Adenovirus [AdV], Influenza A [FluA], Influenza B [FluB], Parainfluenza [PIV], humanes Metapneumovirus [HMPV] und Respiratory Syncytial Virus [RSV]) und können je nach Virustiter, Alter des Patienten und Testzeitpunkt in Bezug auf das Auftreten von Symptomen unempfindlich sein .

Molekulare Methoden wie die Polymerase-Kettenreaktion (PCR) erhöhen den Virusnachweis aufgrund einer größeren analytischen Sensitivität im Vergleich zu herkömmlichen Methoden wie Antigennachweis und/oder Viruskultur.

Die mikrobiologische Analyse und Identifizierung von Organismen kann 48-72 Stunden dauern, falsch negative Ergebnisse können als Folge einer gleichzeitigen oder vorherigen Antibiotikabehandlung auftreten, während falsch positive Ergebnisse auf Kolonisations- oder Probenahmefehler hinweisen können.

Das VITEK 2 ist ein vollautomatisches System für die mikrobielle Identifizierung und antimikrobielle Empfindlichkeitsprüfung (AST), nachdem ein primäres Inokulum hergestellt und standardisiert wurde. Mit seinen kolorimetrischen Reagenzkarten bietet das VITEK 2 eine hochmoderne Technologieplattform für phänotypische Identifizierungsmethoden.(6) Die Anwendung des FilmArray Respiratory Panel bei der Diagnose von Infektionen der unteren Atemwege soll die Zeit für die Identifizierung der Mikroorganismen verkürzen. FilmArray ist ein kleines, vollautomatisiertes Multiplex-PCR-Desktopgerät. Das molekulare System umfasst eine automatisierte Nukleinsäureextraktion, einen ersten Schritt der reversen Transkription und Multiplex-Nested-PCR, gefolgt von einer Schmelzkurvenanalyse .

Das BIOFIRE® FILMARRAY® Pneumonia Panel plus testet auf 18 Bakterien (11 Gram-negativ, 4 Gram-positiv und 3 atypische), 7 Antibiotikaresistenzmarker und 9 Viren, die Lungenentzündung und andere Infektionen der unteren Atemwege verursachen. Er bietet eine Gesamtsensitivität und -spezifität für bronchoalveoläre (BAL)-ähnliche Proben von 96,2 % bzw. 98,3 % und für Sputumproben eine Sensitivität und Spezifität von 96,3 % bzw. 97,2 %. Der Test wird in einem geschlossenen Raum durchgeführt System, das 5 Minuten praktische Zeit und 65 Minuten Instrumentierungszeit erfordert. Mehrere Vergleichsstudien zwischen FilmArray und anderen Tests für Atemwegsorganismen zeigten vergleichbare Ergebnisse.