ベルン出生コホート / 健康なベルン乳児における微生物叢成熟の軌跡 - ネットワークアプローチ (BeBiCo)
背景: 腸内微生物叢の組成は人間の健康の基本であり、生後 2 年間で重大な変化を遂げます。 おそらく微生物叢に影響を与える要因は、母親の微生物叢とスイスの一般的な環境です。 しかし、腸内細菌叢の発達は完全には理解されていません。 微生物叢の成熟の軌跡に関する知識を得ることは、小児期の多くの病状の病因を理解するための鍵となる可能性があります。
目的: 研究者は、構成、多様性、および代謝活動に関する健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。 研究者は、微生物叢の成熟に影響を与えるパラメーターと、乳児の転帰に対する微生物叢の影響を特定することを目指しています。
方法: 調査員は、10 歳まで母子ペアとして追跡される 250 人の妊娠中の母親を募集します。 乳児は臨床的に追跡され、適切な成長と発達、および腹痛を含む病状を判断します。 疫学的パラメーターと乳児の栄養が評価されます。 調査員は、便、母乳、膣交換、皮膚交換などの生物学的サンプルを収集します。
種の構成と多様性は、16S シーケンスによって評価されます。 メタゲノム ショットガン シーケンスと細菌メッセンジャー リボ核酸 (mRNA) 分析は、微生物叢の代謝能と代謝活性について情報を提供します。 質量分析は、便および母乳サンプルの低分子含有量を評価します。 ネットワーク分析は、細菌の代謝活動と低分子量の間の複雑な関係を評価するために使用されます。
期待される結果: 研究者は、加齢に伴う複雑さ、代謝の可能性、および活動の増加を期待しています。 微生物叢のパラメーターは栄養によって異なり、成長や腹痛などの乳児の転帰を予測する可能性があります。 便、皮膚、母乳からの母体および乳児の細菌サンプルを連続して系統的に分析することは、母親から乳児への細菌の移動を特徴付けるのに役立ちます。 高度な分析ツールを使用して、微生物叢を特徴付け、メカニズムの問題に対処します。
調査の概要
状態
詳細な説明
サンプル分析の方法:
研究の主な目的と結果/エンドポイントのために、乳児の便の細菌含有量は次の方法で分析されます。
- 腸内容物 (メタボローム) を評価するための質量分析。 技術は、以前の研究で研究者グループとすでに協力していた U. Sauer 教授の研究室で確立されています。
- 細菌種組成および微生物多様性のための16Sリボソームリボ核酸（rRNA）配列決定。
- 存在する細菌遺伝子 (微生物叢の代謝能) を特定するための、細菌の全ゲノム メタゲノミクス ショットガン シーケンス。
- 微生物叢の転写と機能的役割 (微生物叢の代謝活性) を評価するための細菌の mRNA シーケンス。
- 適切な配列決定または培養技術による腸バイロームおよび真核生物の腸集団の分析。
- ヒトの乳汁および便中の IgA 抗体の分析、および抗体と腸内細菌との相互作用。
二次エンドポイントについては、皮膚スワブ、母乳、母体の膣スワブ、および母体の便で同一の分析が行われます。 幼児の成長、神経発達、免疫の成熟、および病理の潜在的な発生に関するパラメータは、訪問ごとに評価されます。 母親と乳児の栄養、衛生、社会経済的状態、および病歴は、訪問のたびにアンケートによって評価されます。 牛乳サンプルは、フローサイトメトリーと単一細胞 RNA シーケンシングによって細胞内容物、サイトカイン、エキソソームベースの miRNA についてさらに分析されます。 すべてのバイオサンプルは、乳児の代謝と生理機能に対する環境の影響を評価するために、質量分析によって分析されます。
取得したサンプルを使用したさらなる追跡実験が可能です。 具体的には、個々の細菌株を分離して in vitro で培養し、実験動物で単独または組み合わせて試験することもできます。
メタゲノム ショットガン シーケンスでは細菌とヒトの DNA を区別できないため、上記の方法による細菌のシーケンスでは、必然的に母体または幼児の DNA シーケンスも特定されます。 これらのヒト DNA 配列は、このプロジェクトの範囲内では分析されません。 ただし、これらのシーケンスは将来の研究の対象になる可能性があります。 したがって、研究参加者は、同意書内の「さらなる分析」のページで、母親および/または子供からのヒトDNAを分析する許可を求められます. ヒトDNA分析を「オプトアウト」するオプションが提供され、拒否しても研究から除外されることはありません。
参加者の健康に明確に関連する所見（つまり、 母親または子供) は、担当する小児科医と協力して参加者に報告されます。 参加者が通知を希望しない場合は、研究チームに通知する必要があります。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前：Benjamin Misselwitz, Professor
- 電話番号：+41 31 664 04 30
- メール：benjamin.misselwitz@insel.ch
研究連絡先のバックアップ
- 名前：Stephanie Ganal-Vonarburg, Professor
- 電話番号：+41 31 632 49 73
- メール：stephanie.ganal@dbmr.unibe.ch
研究場所
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Bern、スイス、3010
- 募集
- University Hospital of Bern - Insel Spital
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コンタクト：
- Benjamin Misselwitz, Professor
- 電話番号：+41 31 664 04 30
- メール：benjamin.misselwitz@insel.ch
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 署名されたインフォームドコンセント。
- -研究手順を理解して従い、インフォームドコンセントを理解する能力
- 妊娠20週から出産まで
- 一般的な健康状態、つまり、継続的な管理を必要とする深刻な医学的/外科的/精神的状態がないこと。 十分に管理されたマイナーな条件 (例: 医学的に管理された動脈性高血圧症、職業性喘息、妊娠糖尿病) が存在する可能性があります。
- -既知の重度の胎児病理の欠如、予想される正常な妊娠（例： 双子/三つ子の妊娠、最終的な骨盤位置などの軽微な状態が存在する可能性があります)
- 年齢は 18 ～ 45 歳です。
除外基準:
• 研究手順に干渉する別の臨床研究への参加。
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：コホート
- 時間の展望：見込みのある
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の糞便サンプルは、生後0〜3日で収集されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の糞便サンプルは、生後0〜3日で収集されます
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の糞便サンプルは、生後10日で収集されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の糞便サンプルは、生後10日で収集されます
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の便サンプルは、生後6週間で収集されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の便サンプルは、生後6週間で収集されます
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の便サンプルは、生後10週間で収集されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の便サンプルは、生後10週間で収集されます
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の便サンプルは、生後14週間で収集されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の便サンプルは、生後14週間で収集されます
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の便サンプルは、生後24週間で収集されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の便サンプルは、生後24週間で収集されます
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の便サンプルは、生後36週間で収集されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の便サンプルは、生後36週間で収集されます
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の便サンプルは、生後48週間で収集されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の便サンプルは、生後48週間で収集されます
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の便サンプルは、生後96週間で収集されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の便サンプルは、生後96週間で収集されます
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の便サンプルは、生後5年で収集されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の便サンプルは、生後5年で収集されます
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種組成と代謝活動の複雑さに関する健康な乳児の腸内細菌叢の成熟。
時間枠：乳児の糞便サンプルは生後10年で採取されます
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研究者は、構成、多様性、および代謝活動を考慮して、健康な乳児の腸内微生物叢の成熟を深く理解することを目指しています。
研究者は、高度な技術 (16S シーケンシング、メタゲノミクス ショットガン シーケンシング、mRNA シーケンシング) によって、さまざまな時点での組成、代謝能、活性、および質量分析法によって提示される代謝産物を特徴付けます (「詳細な説明」を参照)。
この情報を使用して、研究者は微生物叢の代謝活動のネットワークを推定します。
ネットワーク分析は、存在する小分子に関する情報によって通知されます。
ほとんどの健康な乳児の微生物叢が共有する軌跡は、正常と見なされます。
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乳児の糞便サンプルは生後10年で採取されます
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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母親の微生物叢の乳児への移行
時間枠：登録、生後 0 ～ 3 日、10 日、6 週間、10 週間、14 週間、24 週間、36 週間、48 週間、96 週間、5 年、10 年。
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母体微生物叢の乳児への移行を理解する。 研究者は、母体の糞便、母体の皮膚、膣環境、母体の胎盤、およびさまざまな時点での母乳中の母体の微生物叢の細菌種 (または運用分類単位、OTU) を特定し、これらのパラメーターを特定された種/OTU と関連付けます。さまざまな時点での乳児の腸内および皮膚微生物叢で (方法論については、「詳細な説明」を参照してください)。 生物学的サンプルは次の場所で収集されます。
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登録、生後 0 ～ 3 日、10 日、6 週間、10 週間、14 週間、24 週間、36 週間、48 週間、96 週間、5 年、10 年。
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発展途上国における低栄養と貧弱な衛生状態による資源不足が腸内微生物叢の成熟に及ぼす影響
時間枠：生後0～3日、10日、6週、10週、14週、24週、36週、48週、96週、5年、10年。
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腸内微生物叢の成熟に対する開発途上国の貧弱な栄養と劣悪な衛生状態による低資源の影響を理解すること。
ジンバブエ大学の出生コホートの子供たちは、生物学的サンプルの同じ取得を使用して、ベルンの乳児微生物叢研究の子供たちのために計画されたのと同様の方法で追跡されました。
研究者は、エンドポイント 1 の微生物叢の特性を使用して、健康なスイスの乳児の微生物叢の成熟と、健康なジンバブエの子供、環境性腸疾患および発育不全の子供の微生物叢の成熟を比較します。
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生後0～3日、10日、6週、10週、14週、24週、36週、48週、96週、5年、10年。
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微生物叢の発達に対するスイスの通常の環境の変化の影響。
時間枠：登録、生後 0 ～ 3 日、10 日、6 週間、10 週間、14 週間、24 週間、36 週間、48 週間、96 週間、5 年、10 年。
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微生物叢の発達に対するスイスの通常の環境の変化の影響を理解すること。
この目的のために、栄養と社会経済的状態、微生物叢の特性、およびメタボロミクスのパラメーターを使用し、それらを乳児の発達と免疫のパラメーターと関連付けます。
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登録、生後 0 ～ 3 日、10 日、6 週間、10 週間、14 週間、24 週間、36 週間、48 週間、96 週間、5 年、10 年。
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子どもの発達と健康に対する微生物叢の影響。
時間枠：登録、生後 0 ～ 3 日、10 日、6 週間、10 週間、14 週間、24 週間、36 週間、48 週間、96 週間、5 年、10 年。
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微生物叢が子供の発達と健康に与える影響を理解すること。 研究者は、主要評価項目からの乳児微生物叢の特徴を相関させます。
アンケートを使用して、研究者は臨床パラメーターと子供の発達のパラメーターを評価しますが、登録時および主要な結果のセクションに記載されているのと同じフォローアップ日に、感染性合併症、アレルギー、腹痛に関する情報も取得します。 |
登録、生後 0 ～ 3 日、10 日、6 週間、10 週間、14 週間、24 週間、36 週間、48 週間、96 週間、5 年、10 年。
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母乳の免疫調節特性と新生児の免疫成熟に対する母体の微生物叢の影響
時間枠：登録、生後 0 ～ 3 日、10 日、6 週間、10 週間、14 週間、24 週間、36 週間、48 週間、96 週間、5 年、10 年。
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5) 母体の微生物叢と母体の食事が母乳の免疫調節特性にどの程度影響し、それらの特性が新生児の免疫成熟にどのように影響するかを理解するために、代謝産物に関して糞便と母乳サンプルの組成を分析します。細胞成分、サイトカイン、miRNA。
さらに、この材料を使用して、in vitro (細胞培養) および in vivo (マウス) で母乳の影響をテストします。
免疫調節メカニズムが特定され、新生児の免疫系の発達と成熟に関連する変化が分析されます。
(方法論については、「詳細な説明」を参照してください)
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登録、生後 0 ～ 3 日、10 日、6 週間、10 週間、14 週間、24 週間、36 週間、48 週間、96 週間、5 年、10 年。
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者：Benjamin Misselwitz, Professor、University Hospital of Bern - Insel Spital
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
その他の研究ID番号
- 2019-00510
- 3962 (Direktion Lehre und Forschung Insel Spital Bern)
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
IPD プランの説明
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。