Когорта новорожденных в Берне / Траектория созревания микробиоты у здоровых новорожденных в Берне — сетевой подход (BeBiCo)
Актуальность: состав кишечной микробиоты имеет основополагающее значение для здоровья человека и претерпевает критические изменения в течение первых двух лет жизни. Факторами, вероятно, влияющими на микробиоту, являются материнская микробиота и общая окружающая среда в Швейцарии. Однако развитие кишечной микробиоты изучено не полностью. Получение знаний о траектории созревания микробиоты, вероятно, является ключом к пониманию патогенеза многих патологий в детском возрасте.
Цели. Целью исследователей является глубокое понимание процессов созревания кишечной микробиоты здорового ребенка в отношении состава, разнообразия и метаболической активности. Исследователи стремятся определить параметры, влияющие на созревание микробиоты и влияние микробиоты на исход у младенцев.
Методы: Исследователи наберут 250 беременных матерей, за которыми будут наблюдать как пары мать-ребенок до 10-летнего возраста. Младенцы будут находиться под клиническим наблюдением для определения адекватного роста и развития, а также патологии, включая боль в животе. Будут оценены эпидемиологические параметры и питание младенцев. Исследователи будут собирать биологические образцы, такие как стул, материнское молоко, вагинальные мазки и мазки кожи.
Состав и разнообразие видов будут оцениваться с помощью секвенирования 16S. Метагеномное секвенирование дробовика и анализ рибонуклеиновой кислоты (мРНК) бактериального мессенджера позволят получить информацию о метаболическом потенциале и метаболической активности микробиоты. Масс-спектрометрия позволит оценить содержание малых молекул в образцах стула и материнского молока. Сетевой анализ будет использоваться для оценки сложных взаимосвязей между метаболической активностью бактерий и низкомолекулярным составом.
Ожидаемые результаты: Исследователи ожидают увеличения сложности, метаболического потенциала и активности с возрастом. Параметры микробиоты будут различаться в зависимости от питания и могут прогнозировать такие исходы у младенцев, как рост и боль в животе. Систематический анализ последовательных образцов материнских и младенческих бактерий из стула, кожи и материнского молока поможет охарактеризовать передачу бактерий от матери к ребенку. Вывод: Исследователи предлагают обсервационное исследование здоровых пар матери-младенца Берн с клинической характеристикой и биологическим отбором проб. Инструменты расширенного анализа будут использоваться для характеристики микробиоты и решения механистических вопросов.
Обзор исследования
Статус
Подробное описание
Методы анализа проб:
Для основной цели и исхода/конечной точки исследования бактериальное содержание детского стула будет проанализировано с помощью:
- Масс-спектрометрия для оценки содержимого кишечника (метаболом). Методы были разработаны в лаборатории профессора У. Зауэра, который уже сотрудничал с группой исследователей в предыдущих исследованиях.
- Секвенирование 16S рибосомальной рибонуклеиновой кислоты (рРНК) для определения видового состава бактерий, а также микробного разнообразия.
- Полногеномное метагеномное секвенирование бактерий для идентификации присутствующих бактериальных генов (метаболический потенциал микробиоты).
- Секвенирование мРНК бактерий для оценки транскрипции и функциональной роли микробиоты (метаболической активности микробиоты).
- Анализ кишечного вирома и эукариотических кишечных популяций с помощью соответствующих методов секвенирования или культивирования.
- Анализ антител IgA в грудном молоке и стуле и взаимодействие антител с кишечными бактериями.
Для вторичных конечных точек будут проводиться идентичные анализы мазков с кожи, материнского молока, материнских вагинальных мазков и материнского стула. Параметры роста младенцев, развития нервной системы, иммунного созревания и потенциального возникновения патологии будут оцениваться при каждом посещении. Питание матерей и младенцев, гигиена, социально-экономический статус и история болезни будут оцениваться с помощью вопросников при каждом посещении. Образцы молока будут дополнительно проанализированы на содержание клеток с помощью проточной цитометрии и секвенирования РНК отдельных клеток, а также на наличие цитокинов и микроРНК на основе экзосом. Все биообразцы будут проанализированы с помощью масс-спектрометрии для оценки влияния окружающей среды на метаболизм и физиологию младенцев.
Возможны дальнейшие последующие эксперименты с полученными образцами. В частности, отдельные штаммы бактерий можно выделять и культивировать in vitro, а также тестировать по отдельности или в комбинации на экспериментальных животных.
Бактериальное секвенирование методами, описанными выше, также неизбежно идентифицирует материнские или младенческие последовательности ДНК, поскольку метагеномное дробовое секвенирование не может отличить бактериальную ДНК от ДНК человека. Эти последовательности ДНК человека не будут анализироваться в рамках данного проекта. Однако эти последовательности могут стать предметом будущих исследований. Поэтому у участников исследования будет запрошено разрешение на анализ ДНК человека от матери и / или ребенка на странице «дальнейшие анализы» в форме согласия. Будет предоставлена возможность «отказаться» от анализа ДНК человека, и отказ не приведет к исключению из исследования.
Любые выводы, имеющие явное отношение к здоровью участника (т. мать или ребенок) будет сообщено участнику в сотрудничестве с лечащим педиатром. Участники должны будут сообщить исследовательской группе, если они не хотят быть проинформированы.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Benjamin Misselwitz, Professor
- Номер телефона: +41 31 664 04 30
- Электронная почта: benjamin.misselwitz@insel.ch
Учебное резервное копирование контактов
- Имя: Stephanie Ganal-Vonarburg, Professor
- Номер телефона: +41 31 632 49 73
- Электронная почта: stephanie.ganal@dbmr.unibe.ch
Места учебы
-
-
-
Bern, Швейцария, 3010
- Рекрутинг
- University Hospital of Bern - Insel Spital
-
Контакт:
- Benjamin Misselwitz, Professor
- Номер телефона: +41 31 664 04 30
- Электронная почта: benjamin.misselwitz@insel.ch
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Подписанное информированное согласие.
- Способность понимать и следовать процедурам исследования и понимать информированное согласие
- С 20 недели беременности до родов
- Общее хорошее здоровье, т. е. отсутствие серьезного медицинского/хирургического/психиатрического состояния, требующего постоянного лечения. Незначительные хорошо контролируемые состояния (например, могут отмечаться медикаментозно контролируемая артериальная гипертензия, профессиональная астма, гестационный сахарный диабет).
- Отсутствие известных тяжелых эмбриональных патологий, ожидаемая нормальная беременность (например, незначительные состояния, включая беременность двойней/тройней, может присутствовать окончательное положение таза)
- Возраст 18-45 лет.
Критерий исключения:
• Участие в другом клиническом исследовании, препятствующее проведению исследования.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Когорта
- Временные перспективы: Перспективный
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы стула младенцев будут собираться через 0–3 дня после рождения.
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы стула младенцев будут собираться через 0–3 дня после рождения.
|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы стула младенцев будут собираться через 10 дней после рождения.
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы стула младенцев будут собираться через 10 дней после рождения.
|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы стула младенцев будут собираться через 6 недель после рождения.
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы стула младенцев будут собираться через 6 недель после рождения.
|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы стула младенцев будут собираться через 10 недель после рождения.
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы стула младенцев будут собираться через 10 недель после рождения.
|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы стула младенцев будут собираться через 14 недель после рождения.
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы стула младенцев будут собираться через 14 недель после рождения.
|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы стула младенцев будут собираться через 24 недели после рождения.
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы стула младенцев будут собираться через 24 недели после рождения.
|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы кала младенцев будут собирать через 36 недель после рождения.
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы кала младенцев будут собирать через 36 недель после рождения.
|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы стула младенцев будут собирать через 48 недель после рождения.
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы стула младенцев будут собирать через 48 недель после рождения.
|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы кала младенцев будут собирать через 96 недель после рождения.
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы кала младенцев будут собирать через 96 недель после рождения.
|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы стула младенцев будут собираться через 5 лет после рождения
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы стула младенцев будут собираться через 5 лет после рождения
|
|
Созревание кишечной микробиоты здорового младенца в отношении сложности видового состава и метаболической активности.
Временное ограничение: Образцы стула младенцев будут собирать через 10 лет после рождения
|
Исследователи стремятся к глубокому пониманию процесса созревания кишечной микробиоты здорового младенца с учетом состава, разнообразия и метаболической активности.
Исследователи будут характеризовать состав, метаболический потенциал и активность в различные моменты времени с помощью передовых методов (секвенирование 16S, метагеномное секвенирование дробовиком и секвенирование мРНК) и метаболитов, присутствующих с помощью масс-спектрометрии (см. «Подробное описание»).
Используя эту информацию, исследователи будут оценивать сети метаболической активности микробиоты.
Сетевой анализ может быть основан на информации о присутствующих малых молекулах.
Траектории, характерные для микробиоты большинства здоровых младенцев, будут считаться нормальными.
|
Образцы стула младенцев будут собирать через 10 лет после рождения
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Передача материнской микробиоты ребенку
Временное ограничение: Зачисление, 0-3 дня, 10 дней, 6 недель, 10 недель, 14 недель, 24 недель, 36 недель, 48 недель, 96 недель, 5 лет и 10 лет после рождения.
|
Понять передачу материнской микробиоты ребенку. Исследователи будут идентифицировать виды бактерий (или операционные таксономические единицы, OTU) в материнской микробиоте в материнском стуле, материнской коже, вагинальной среде, материнской плаценте, а также в материнском молоке в различные моменты времени и сопоставлять эти параметры с идентифицированными видами/OTU. в микробиоте кишечника и кожи ребенка в различные моменты времени (методику см. в «подробном описании»). Биологические образцы будут взяты по адресу:
|
Зачисление, 0-3 дня, 10 дней, 6 недель, 10 недель, 14 недель, 24 недель, 36 недель, 48 недель, 96 недель, 5 лет и 10 лет после рождения.
|
|
Влияние нехватки ресурсов при плохом питании и плохой гигиене в развивающихся странах на созревание кишечной микробиоты
Временное ограничение: 0-3 дня, 10 дней, 6 недель, 10 недель, 14 недель, 24 недели, 36 недель, 48 недель, 96 недель, 5 лет и 10 лет после рождения.
|
Чтобы понять влияние нехватки ресурсов при плохом питании и плохой гигиене в развивающихся странах на созревание кишечной микробиоты.
За детьми из когорты новорожденных Университета Зимбабве наблюдали так же, как и за детьми из исследования микробиоты младенцев в Берне, с тем же набором биологических образцов.
Исследователи будут использовать характеристики микробиоты из конечной точки 1, чтобы сравнить созревание микробиоты у здоровых швейцарских младенцев с созреванием микробиоты у здоровых зимбабвийских детей, а также детей с экологической энтеропатией и задержкой роста.
|
0-3 дня, 10 дней, 6 недель, 10 недель, 14 недель, 24 недели, 36 недель, 48 недель, 96 недель, 5 лет и 10 лет после рождения.
|
|
Влияние изменений нормальной окружающей среды в Швейцарии на развитие микробиоты.
Временное ограничение: Зачисление, 0-3 дня, 10 дней, 6 недель, 10 недель, 14 недель, 24 недель, 36 недель, 48 недель, 96 недель, 5 лет и 10 лет после рождения.
|
Понять влияние изменений нормальной окружающей среды в Швейцарии на развитие микробиоты.
С этой целью мы будем использовать параметры питания и социально-экономического статуса, характеристики микробиоты и метаболомики и соотносить их с параметрами развития и иммунитета младенцев.
|
Зачисление, 0-3 дня, 10 дней, 6 недель, 10 недель, 14 недель, 24 недель, 36 недель, 48 недель, 96 недель, 5 лет и 10 лет после рождения.
|
|
Влияние микробиоты на развитие и здоровье ребенка.
Временное ограничение: Зачисление, 0-3 дня, 10 дней, 6 недель, 10 недель, 14 недель, 24 недель, 36 недель, 48 недель, 96 недель, 5 лет и 10 лет после рождения.
|
Понять влияние микробиоты на развитие и здоровье ребенка. Исследователи будут сопоставлять характеристики микробиоты младенцев от первичной конечной точки с
Используя вопросники, исследователи будут оценивать клинические параметры и параметры развития ребенка, а также получать информацию об инфекционных осложнениях, аллергиях и болях в животе при включении в исследование и в те же сроки наблюдения, которые указаны в разделе основных результатов. |
Зачисление, 0-3 дня, 10 дней, 6 недель, 10 недель, 14 недель, 24 недель, 36 недель, 48 недель, 96 недель, 5 лет и 10 лет после рождения.
|
|
Влияние материнской микробиоты на иммуномодулирующие свойства грудного молока и иммунное созревание у новорожденного
Временное ограничение: Зачисление, 0-3 дня, 10 дней, 6 недель, 10 недель, 14 недель, 24 недель, 36 недель, 48 недель, 96 недель, 5 лет и 10 лет после рождения.
|
5) Чтобы понять, в какой степени материнская микробиота и материнский рацион питания влияют на иммуномодулирующие свойства грудного молока и как эти свойства, в свою очередь, влияют на иммунное созревание у новорожденного, мы проанализируем состав образцов стула и грудного молока в отношении метаболитов, клеточные компоненты, цитокины и микроРНК.
В дальнейшем мы будем использовать этот материал для проверки воздействия материнского молока in vitro (культура клеток) и in vivo (мыши).
Будут выявлены иммуномодулирующие механизмы и проанализированы коррелирующие изменения в развитии и созревании иммунной системы новорожденного.
(Для методики см. "подробное описание")
|
Зачисление, 0-3 дня, 10 дней, 6 недель, 10 недель, 14 недель, 24 недель, 36 недель, 48 недель, 96 недель, 5 лет и 10 лет после рождения.
|
Соавторы и исследователи
Соавторы
Следователи
- Главный следователь: Benjamin Misselwitz, Professor, University Hospital of Bern - Insel Spital
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Оцененный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 2019-00510
- 3962 (Direktion Lehre und Forschung Insel Spital Bern)
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .
Клинические исследования Микробная колонизация
-
AstraZenecaРекрутингБронхиэктаз с Pseudomonas aeruginosa colonizationСоединенные Штаты, Австралия, Канада, Дания, Израиль, Соединенное Королевство, Германия, Бельгия, Япония, Испания, Вьетнам, Перу, Франция, Малайзия, Тайвань, Таиланд, Италия, Греция, Филиппины, Нидерланды, Бразилия, Чили, Аргентина, Южная... и более
-
Johns Hopkins UniversityРекрутингМикробная колонизация | Стафилококковая инфекция золотистого стафилококка | Педиатрическая инфекция | S. aureus colonization | Микробная пересадкаСоединенные Штаты