早産におけるマイクロバイオーム

合計 100 人の研究参加者が含まれ、次のグループのいずれかに割り当てられます。

研究グループ：

• このグループは、妊娠 22+5 週から 28+0 週の間に pPROM を経験した 50 人の妊婦で構成され、主要な研究施設で受診したか、他の病院から紹介され、帝王切開による早産で出産しました。

対照群：

• このグループは、妊娠 32+0 から 37+0 の妊娠週の間に、主要研究施設の外来部門で待機的帝王切開が予定され、帝王切開で正期産される 50 人の妊婦で構成されます。

募集：

すべての患者の募集は、ウィーン医科大学の産婦人科で行われます。 研究グループの女性は、外部の病院から紹介されるか、何らかの理由で当科に出席します。 pPROM の検証は、検鏡検査と羊水貯留の検出によって行われます。 所見が不明な場合は、酵素試験（例：Amnisure®、QUIAGEN Sciences, LLC; Germantown, MD 20874, USA）が実施されます。 pPROM 検証に続いて、選択基準を満たす女性は研究への参加を提案されます。 何らかの理由で帝王切開ではなく自然分娩になった場合は、ドロップアウトとみなされます。 対照群の女性は、選択的帝王切開のための定期的なプレゼンテーション中に募集されます（研究の除外基準を満たさない理由で）学期に予定されています。 予定帝王切開予定にもかかわらず、早産を経験した場合は、ドロップアウトとみなされます。 外来部門での相談中に、これらの女性は研究への参加を提案されます。

サンプリング：

すべてのスワブは、標準化された手順を使用して、この研究のサブ研究者から収集されます。 匿名化のため、採取の時点、場所、病棟のみがスワブチューブに記されます。 インフォームド コンセントの後、上皮ブラシと組み合わせた滅菌綿棒を使用して、外側膣壁および後部膣円蓋から鏡検査中に膣スワブを収集します。 直腸スワブは、肛門括約筋に滅菌スワブを挿入することによって収集されます。 胎盤および子宮腔の術中スワブは、無菌条件下での帝王切開中に収集されます。 新生児スワブ（頬粘膜および皮膚）は、分娩直後および新生児期に採取されます。 糞便サンプルは、乳児の最初の糞便および新生児期の新生児の糞便として定義される胎便から採取されます。 すべての標本は、収集後すぐに-80°Cで保存されます。 上皮ブラシを RNAlater® RNA 安定化溶液に入れ、-80°C で保存します。

マイクロバイオーム分析:

マイクロバイオーム解析は、ウィーン医科大学とウィーン大学の共同マイクロバイオーム施設 (JMF) で実施されます。 テストは、JMF のサブ研究者によって実行されます。 収集された糞便スワブ サンプルの微生物群集組成は、16S rRNA 遺伝子アンプリコン シーケンスによって決定されます。 簡単に説明すると、QIAamp Microbiome Kit または QIAamp DNA Mini Kit (それぞれスワブおよび糞便サンプル用) を使用して DNA を抽出した後、前述のように 16S rRNA 遺伝子の増幅とバーコード化を行います。 JMF の Illumina MiSeq プラットフォームでシーケンスされたマルチプレックスアンプリコンサンプル。 DNA 抽出および 16S rRNA 遺伝子増幅中に実行されるネガティブ コントロールは、通常、サンプル処理ワークフローに含まれます。 得られた配列データは、品質フィルター処理および逆多重化され、その後、可能な限り最高の分類学的解像度での分析を可能にする DADA2,16 によるアンプリコン シーケンス バリアント (ASV) の推論が行われます。 得られた ASV 配列は、SILVA SSU rRNA データベースの最新リリースで SINA を使用して分類学的に分類されます。 必要に応じて、デコンタム ソフトウェア パッケージを使用してコンピューター内で汚染物質を除去します。

周産期データ:

スワブのサンプリングと分析に加えて、PIA Fetal Database、バージョン 5.6.16.917 (GE Viewpoint、ミュンヘン、ドイツ) を使用して、次の周産期パラメーターが収集されます。 /いいえ]、民族性[カテゴリ]、交際状況[カテゴリ]、ボディマス指数[数]、ニコチン乱用[はい/いいえ]、pPROMの病歴[はい/いいえ]、PTBの病歴[はい/いいえ]、既往症[カテゴリ]、膣感染症のスクリーニング [はい/いいえ]、子宮頸不全 [はい/いいえ]、子癇前症 [はい/いいえ]、出血 [はい/いいえ]、出生前ステロイド予防 [はい/いいえ]、継続的な抗生物質治療 [はい/いいえ]いいえ]、子宮収縮抑制[はい/いいえ]、マグネシウム予防[はい/いいえ]、分娩時の妊娠週数[数値]、出生時体重[数値]、1/5/10分でのアプガースコア[数値]、臍帯動脈pH[数値] ]、新生児集中治療室への移送 [はい/いいえ]。