Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Микробиом при преждевременных родах

1 сентября 2020 г. обновлено: Alex Farr, MD PhD, Medical University of Vienna

Микробиом человека при pPROM, преждевременных родах и новорожденном: проспективное лонгитюдное пилотное исследование

Цели этого проспективного продольного пилотного исследования методом случай-контроль: (1) охарактеризовать изменения вагинального, маточного и плацентарного микробиома у беременных женщин, перенесших pPROM с немедленной госпитализацией и последовательным кесаревым сечением у недоношенных, по сравнению с нормальными доношенными родами с плановое кесарево сечение, а также (2) для оценки влияния матери на микробиом новорожденного и ранние неонатальные исходы в случаях преждевременных родов pPROM по сравнению с доношенными родами без осложнений.

Первая цель будет достигнута путем сбора вагинальных и ректальных мазков для анализа микробиома у женщин, перенесших pPROM, а затем мазков из матки и плаценты, которые собираются во время кесарева сечения. Контрольные образцы будут собираться в те же моменты времени у женщин, перенесших плановое кесарево сечение в срок. Вторая цель будет достигнута путем анализа микробиома ректальных, оральных/буккальных и кожных мазков, взятых у новорожденных, родившихся либо недоношенными после pPROM, либо в срок, как путем кесарева сечения.

Обзор исследования

Статус

Неизвестный

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

Всего будет включено 100 участников исследования, распределенных по одной из следующих групп:

Исследовательская группа:

• Эта группа будет состоять из 50 беременных женщин, перенесших pPROM между 22+5 и 28+0 неделями гестации, либо поступивших в первичный исследовательский центр, либо направленных из других больниц, и родоразрешенных преждевременно путем кесарева сечения.

Контрольная группа:

• Эта группа будет состоять из 50 беременных женщин, которым запланировано плановое кесарево сечение в амбулаторном отделении основного исследовательского центра, между 32+0 и 37+0 неделями гестации, и которые родоразрешены в срок путем кесарева сечения.

Прием на работу:

Набор всех пациентов будет проходить в Венском медицинском университете, на кафедре акушерства и гинекологии. Женщины в исследовательской группе будут направлены из других больниц или по какой-либо причине будут представлены в нашем отделении. Верификация pPROM будет проводиться путем осмотра в зеркале и обнаружения скопления амниотической жидкости. В случае неясных результатов будет проведен ферментативный тест (например, Amnisure®, QUIAGEN Sciences, LLC; Germantown, MD 20874, США). После проверки pPROM женщинам, отвечающим критериям включения, будет предложено принять участие в исследовании. Те, у кого по какой-либо причине происходят спонтанные вагинальные роды вместо кесарева сечения, будут считаться выбывшими. Женщины в контрольной группе будут набраны во время их обычного представления для планового кесарева сечения (по любой причине, которая не соответствует критериям исключения исследования), которое будет запланировано в срок. Те, у кого произошли преждевременные роды, хотя им запланировано плановое кесарево сечение в срок, будут считаться выбывшими. Во время консультации в поликлинике этим женщинам будет предложено принять участие в исследовании.

Выборка:

Все мазки будут взяты у суб-исследователей этого исследования с использованием стандартизированной процедуры. В целях анонимности на пробирках для мазков будут отмечены только время сбора, место и отделение. После информированного согласия во время осмотра в зеркале будут взяты вагинальные мазки с боковой стенки влагалища и заднего свода влагалища с использованием стерильного ватного тампона в сочетании с эпителиальной щеткой. Ректальный мазок берется путем введения стерильного тампона в анальный сфинктер. Интраоперационные мазки из плаценты и полости матки будут собираться во время кесарева сечения в стерильных условиях. Неонатальные мазки (со слизистой оболочки щек и кожи) будут собираться непосредственно после родов и в неонатальном периоде. Образцы стула будут взяты из мекония, определяемого как первый стул младенца и стул новорожденного в неонатальном периоде. Все образцы будут немедленно храниться при -80°C после сбора. Эпителиальную щеточку помещают в раствор для стабилизации РНК RNAlater® и хранят при температуре -80°C.

Анализ микробиома:

Анализ микробиома будет проводиться в Объединенном центре микробиома (JMF) Венского медицинского университета и Венского университета. Тестирование будет проводиться младшими следователями ЕММ. Состав микробного сообщества в собранных образцах мазка кала будет определяться секвенированием ампликона гена 16S рРНК. Вкратце, ДНК будет извлечена с помощью набора QIAamp Microbiome Kit или мини-набора QIAamp DNA (для образцов мазка и кала соответственно), после чего будет проведена амплификация гена 16S рРНК и штрих-кодирование, как описано ранее. Мультиплексированные образцы ампликонов, секвенированные на платформе Illumina MiSeq в JMF. Отрицательные контроли, выполняемые во время выделения ДНК и амплификации гена 16S рРНК, обычно включаются в рабочий процесс обработки образцов. Полученные данные о последовательности будут отфильтрованы по качеству и демультиплексированы, после чего будет сделан вывод о варианте секвенирования ампликона (ASV) с помощью DADA2,16, что позволит провести анализ с максимально возможным таксономическим разрешением. Полученные последовательности ASV будут таксономически классифицированы с использованием SINA с новейшим выпуском базы данных рРНК SILVA SSU. При необходимости загрязнения будут удалены in silico с помощью программного пакета decontam.

Перинатальные данные:

В дополнение к забору и анализу мазка будут собраны следующие перинатальные параметры с использованием базы данных плода PIA, версия 5.6.16.917 (GE Viewpoint, Мюнхен, Германия): возраст матери [число], паритет [число], высшее образование [да /нет], этническая принадлежность [категория], семейное положение [категория], индекс массы тела [число], злоупотребление никотином [да/нет], история pPROM [да/нет], история ЛТБ [да/нет], ранее существовавшие заболевания [категория], скрининг на вагинальные инфекции [да/нет], недостаточность шейки матки [да/нет], преэклампсия [да/нет], кровотечение [да/нет], антенатальная стероидная профилактика [да/нет], продолжающееся лечение антибиотиками [да/ нет], токолиз [да/нет], профилактика магнием [да/нет], неделя гестации при родах [число], масса тела при рождении [число], оценка по шкале Апгар на 1/5/10 минуте [число], рН артерий пуповины [число] ], перевод в отделение интенсивной терапии новорожденных [да/нет].

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Ожидаемый)

100

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

Учебное резервное копирование контактов

  • Имя: Nikolaus Keil, MD
  • Номер телефона: +4314040028190
  • Электронная почта: nikolaus.keil@gmail.com

Места учебы

  • Австрия
      • Vienna, Австрия, 1090
        • Рекрутинг
        • Medical University of Vienna, Dept. of Obstetrics and Gynecology
        • Контакт:
        • Контакт:
          • Alex Farr, MD PhD
          • Номер телефона: 28220 +43140400
          • Электронная почта: alex.farr@muv.ac.at

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

  • Ребенок
  • Взрослый
  • Пожилой взрослый

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Женский

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Всего будет включено 100 участников исследования, отвечающих всем критериям включения и исключения, которые будут отнесены к одной из следующих групп:

Исследовательская группа:

• Эта группа будет состоять из 50 беременных женщин, перенесших pPROM между 22+5 и 28+0 неделями гестации, либо поступивших в первичный исследовательский центр, либо направленных из других больниц, и родоразрешенных преждевременно путем кесарева сечения.

Контрольная группа:

• Эта группа будет состоять из 50 беременных женщин, которым запланировано плановое кесарево сечение в амбулаторном отделении основного исследовательского центра, между 32+0 и 37+0 неделями гестации, и которые родоразрешены в срок путем кесарева сечения.

Описание

Критерии включения:

  • Возраст матери ≥18 лет на момент включения в исследование
  • Одноплодная беременность
  • Подписанное информированное согласие
  • Подтвержденный преждевременный разрыв плодных оболочек (pPROM) или плановое кесарево сечение по поводу срочных родов (в зависимости от исследуемой группы)
  • Гестационный возраст на момент PROM от 22+5 до 28+0 недель или ≥37+0 недель беременности на момент доношенного кесарева сечения (в зависимости от исследуемой группы)

Критерий исключения:

  • Материнский возраст
  • Многоплодная беременность
  • Невозможность дать согласие на участие в исследовании
  • Текущее лечение антибиотиками или лечение антибиотиками ≤2 недель до включения в исследование
  • Вагинальный половой акт в течение 48 часов до включения в исследование
  • Свежее вагинальное кровотечение в течение 48 часов до включения в исследование
  • Материнская инфекция гепатита В или гепатита С (т. е. положительный результат ПЦР)
  • Материнская ВИЧ-инфекция (т.е. положительный результат ПЦР)
  • Сахарный диабет матери или гестационный диабет

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Наблюдательные модели: Кейс-контроль
  • Временные перспективы: Перспективный

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
Исследовательская группа
Эта группа будет состоять из 50 беременных женщин, перенесших PROM между 22+5 и 28+0 гестационными неделями, либо поступивших в первичный исследовательский центр, либо направленных из других больниц и родившихся недоношенными путем кесарева сечения.
Генетический: Мазки для анализа микробиома
После информированного согласия во время осмотра в зеркале будут взяты вагинальные мазки с боковой стенки влагалища и заднего свода влагалища с использованием стерильного ватного тампона в сочетании с эпителиальной щеткой. Ректальный мазок берется путем введения стерильного тампона в анальный сфинктер. Интраоперационные мазки из плаценты и полости матки будут собираться во время кесарева сечения в стерильных условиях. Неонатальные мазки (со слизистой оболочки щек и кожи) будут собираться непосредственно после родов и в неонатальном периоде. Образцы стула будут взяты из мекония, определяемого как первый стул младенца и стул новорожденного в неонатальном периоде.
Контрольная группа
Эта группа будет состоять из 50 беременных женщин, которым запланировано плановое кесарево сечение в амбулаторном отделении основного исследовательского центра, между 32+0 и 37+0 неделями гестации, и родоразрешены в срок путем кесарева сечения.
Генетический: Мазки для анализа микробиома
После информированного согласия во время осмотра в зеркале будут взяты вагинальные мазки с боковой стенки влагалища и заднего свода влагалища с использованием стерильного ватного тампона в сочетании с эпителиальной щеткой. Ректальный мазок берется путем введения стерильного тампона в анальный сфинктер. Интраоперационные мазки из плаценты и полости матки будут собираться во время кесарева сечения в стерильных условиях. Неонатальные мазки (со слизистой оболочки щек и кожи) будут собираться непосредственно после родов и в неонатальном периоде. Образцы стула будут взяты из мекония, определяемого как первый стул младенца и стул новорожденного в неонатальном периоде.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Изменения вагинального микробиома после pPROM по сравнению с доношенными родами
Временное ограничение: До июля 2021 г.
Измерения численности (подсчеты) вариантов последовательностей ампликонов (ASV), а также суммарные подсчеты ASV на более высоких таксономических уровнях будут оцениваться для проверки значительного совпадения или различий в составе микробного сообщества в разных группах образцов. Эти параметры будут проанализированы в каждой из исследуемых групп, включая лонгитюдный анализ для выявления потенциальной разницы между началом pPROM и временем родов или позже (исследуемая группа), или между беременностью и временем родов или позже (контрольная группа). ). Кроме того, значения ASV и суммы ASV будут сравниваться между исследуемой и контрольной группой в заранее определенные моменты времени. Будет выполнено обнаружение значительно более распространенных вариантов последовательности ампликона между группами, и скорректированные значения P будут рассчитаны с использованием метода Бенджамини-Хохберга, а различия будут подтверждены значениями P.
До июля 2021 г.
Изменения ректального микробиома после pPROM по сравнению с доношенными родами
Временное ограничение: До июля 2021 г.
Измерения численности (подсчеты) вариантов последовательностей ампликонов (ASV), а также суммарные подсчеты ASV на более высоких таксономических уровнях будут оцениваться для проверки значительного совпадения или различий в составе микробного сообщества в разных группах образцов. Эти параметры будут проанализированы в каждой из исследуемых групп, включая лонгитюдный анализ для выявления потенциальной разницы между началом pPROM и временем родов или позже (исследуемая группа), или между беременностью и временем родов или позже (контрольная группа). ). Кроме того, значения ASV и суммы ASV будут сравниваться между исследуемой и контрольной группой в заранее определенные моменты времени. Будет выполнено обнаружение значительно более распространенных вариантов последовательности ампликона между группами, и скорректированные значения P будут рассчитаны с использованием метода Бенджамини-Хохберга, а различия будут подтверждены значениями P.
До июля 2021 г.
Изменения микробиома плаценты после pPROM по сравнению с доношенными родами
Временное ограничение: До июля 2021 г.
Измерения численности (подсчеты) вариантов последовательностей ампликонов (ASV), а также суммарные подсчеты ASV на более высоких таксономических уровнях будут оцениваться для проверки значительного совпадения или различий в составе микробного сообщества в разных группах образцов. Эти параметры будут проанализированы в каждой из исследуемых групп, включая лонгитюдный анализ для выявления потенциальной разницы между началом pPROM и временем родов или позже (исследуемая группа), или между беременностью и временем родов или позже (контрольная группа). ). Кроме того, значения ASV и суммы ASV будут сравниваться между исследуемой и контрольной группой в заранее определенные моменты времени. Будет выполнено обнаружение значительно более распространенных вариантов последовательности ампликона между группами, и скорректированные значения P будут рассчитаны с использованием метода Бенджамини-Хохберга, а различия будут подтверждены значениями P.
До июля 2021 г.
Изменения микробиома матки после pPROM по сравнению с доношенными родами
Временное ограничение: До июля 2021 г.
Измерения численности (подсчеты) вариантов последовательностей ампликонов (ASV), а также суммарные подсчеты ASV на более высоких таксономических уровнях будут оцениваться для проверки значительного совпадения или различий в составе микробного сообщества в разных группах образцов. Эти параметры будут проанализированы в каждой из исследуемых групп, включая лонгитюдный анализ для выявления потенциальной разницы между началом pPROM и временем родов или позже (исследуемая группа), или между беременностью и временем родов или позже (контрольная группа). ). Кроме того, значения ASV и суммы ASV будут сравниваться между исследуемой и контрольной группой в заранее определенные моменты времени. Будет выполнено обнаружение значительно более распространенных вариантов последовательности ампликона между группами, и скорректированные значения P будут рассчитаны с использованием метода Бенджамини-Хохберга, а различия будут подтверждены значениями P.
До июля 2021 г.
Изменения неонатального микробиома новорожденных, родившихся после pPROM, по сравнению с новорожденными, родившимися в срок
Временное ограничение: До июля 2021 г.
Измерения численности (подсчеты) вариантов последовательностей ампликонов (ASV), а также суммарные подсчеты ASV на более высоких таксономических уровнях будут оцениваться для проверки значительного совпадения или различий в составе микробного сообщества в разных группах образцов. Эти параметры будут проанализированы в каждой из исследуемых групп, включая лонгитюдный анализ для выявления потенциальной разницы между началом pPROM и временем родов или позже (исследуемая группа), или между беременностью и временем родов или позже (контрольная группа). ). Кроме того, значения ASV и суммы ASV будут сравниваться между исследуемой и контрольной группой в заранее определенные моменты времени. Будет выполнено обнаружение значительно более распространенных вариантов последовательности ампликона между группами, и скорректированные значения P будут рассчитаны с использованием метода Бенджамини-Хохберга, а различия будут подтверждены значениями P.
До июля 2021 г.

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Medical University of Vienna

Соавторы

University of Vienna

Следователи

  • Главный следователь: Alex Farr, MD PhD, Medical University of Vienna
  • Учебный стул: Herbert Kiss, MD MBA, Medical University of Vienna
  • Учебный стул: Angelika Berger, MD MBA, Medical University of Vienna

Публикации и полезные ссылки

Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.

Общие публикации

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

27 июля 2020 г.

Первичное завершение (Ожидаемый)

1 июля 2021 г.

Завершение исследования (Ожидаемый)

1 декабря 2021 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

20 июля 2020 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

23 июля 2020 г.

Первый опубликованный (Действительный)

28 июля 2020 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

2 сентября 2020 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

1 сентября 2020 г.

Последняя проверка

1 сентября 2020 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • 1668/2020

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

Не определился

Описание плана IPD

Анонимизированные данные, если это необходимо и в соответствии с правилами защиты данных

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Клинические исследования Вагинальный микробиом

Искать похожие исследования

Спонсоры и соавторы

Заболевания

Медикаментозные вмешательства

CROs by country

CROs in Congo, DR of

Заболевания

Редкие заболевания

Медикаментозные вмешательства

Пищевые добавки

Спонсор / Соавторы

Места

Подписаться