Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Mikrobiom v předčasném porodu

1. září 2020 aktualizováno: Alex Farr, MD PhD, Medical University of Vienna

Lidský mikrobiom v pPROM, předčasný porod a novorozenec: prospektivní longitudinální pilotní studie

Cílem této prospektivní longitudinální pilotní studie případové kontroly je (1) charakterizovat změny vaginálního, děložního a placentárního mikrobiomu u těhotných žen, které prodělaly pPROM s okamžitou hospitalizací a následným císařským řezem u předčasně narozených dětí, ve srovnání s bezproblémovými termínovanými porody s elektivní císařský řez, stejně jako (2) k vyhodnocení vlivu matky na novorozenecký mikrobiom a časný neonatální výsledek u předčasných případů pPROM ve srovnání s porody v termínu bez příhod.

Prvního cíle bude dosaženo odběrem vaginálních a rektálních výtěrů pro analýzu mikrobiomu u žen s pPROM, následovanými výtěry dělohy a placenty, které se odebírají během císařského řezu. Kontrolní vzorky budou odebírány ve stejných časových intervalech od žen podstupujících plánovaný císařský řez v termínu. Druhého cíle bude dosaženo mikrobiomální analýzou rektálních, orálních/bukálních a kožních stěrů odebraných novorozencům, kteří se narodili předčasně po pPROM, nebo v termínu, obojí císařským řezem.

Přehled studie

Postavení

Neznámý

Detailní popis

Celkem bude zahrnuto 100 účastníků studie, kteří budou zařazeni do jedné z následujících skupin:

Studijní skupina:

• Tato skupina se bude skládat z 50 těhotných žen, které prodělaly pPROM mezi 22+5 a 28+0 gestačním týdnem, buď v místě primární studie, nebo byly odeslány z jiných nemocnic a porodily předčasně císařským řezem.

Kontrolní skupina:

• Tato skupina se bude skládat z 50 těhotných žen, které jsou naplánovány na elektivní císařský řez na ambulanci primárního pracoviště studie mezi 32+0 a 37+0 gestačním týdnem a porodí v termínu císařským řezem.

Nábor:

Nábor všech pacientek bude probíhat na Lékařské univerzitě ve Vídni, oddělení porodnictví a gynekologie. Ženy ve studijní skupině budou doporučeny z jiných nemocnic nebo budou z jakéhokoli důvodu přítomny na našem oddělení. Verifikace pPROM bude provedena vyšetřením spekulátu a detekcí hromadění plodové vody. V případě nejasných nálezů bude proveden enzymatický test (např. Amnisure®, QUIAGEN Sciences, LLC; Germantown, MD 20874, USA). Po ověření pPROM bude ženám, které splňují kritéria pro zařazení, nabídnuta účast ve studii. Ti, kteří z jakéhokoli důvodu zažijí spontánní vaginální porod namísto císařského řezu, budou považováni za předčasně ukončenou. Ženy v kontrolní skupině budou přijaty během své rutinní prezentace pro volitelný císařský řez (z jakéhokoli důvodu, který nesplňuje kritéria vyloučení studie), která bude naplánována na termín. Ti, kteří zažijí předčasný porod, ačkoli mají naplánovaný volitelný císařský řez v termínu, budou považováni za předčasně ukončené. Těmto ženám bude při konzultaci na ambulanci nabídnuta účast ve studii.

Vzorkování:

Všechny výtěry budou odebrány od dílčích řešitelů této studie pomocí standardizovaného postupu. Pro anonymizaci bude na zkumavkách s tampony vyznačen pouze čas odběru, místo a oddělení. Po informovaném souhlasu budou vaginální výtěry odebírány při vyšetření zrcadlem z laterální poševní stěny a zadního fornixu vaginae pomocí sterilního vatového tamponu kombinovaného s epiteliálním kartáčkem. Rektální výtěr bude odebrán vložením sterilního tamponu do análního svěrače. Intraoperační výtěry z placenty a dutiny děložní budou odebrány při císařském řezu za sterilních podmínek. Novorozenecké výtěry (bukální sliznice a kůže) budou odebrány přímo po porodu a v novorozeneckém období. Vzorky stolice budou odebrány z mekonia, definovaného jako první stolice kojence a stolice novorozence v novorozeneckém období. Všechny vzorky budou ihned po odběru skladovány při -80°C. Epiteliální kartáček bude vložen do stabilizačního roztoku RNAlater® RNA a uložen při -80 °C.

Analýza mikrobiomu:

Analýza mikrobiomů bude provedena v Joint Microbiome Facility (JMF) Lékařské univerzity ve Vídni a Vídeňské univerzity. Testování provedou dílčí řešitelé na JMF. Složení mikrobiální komunity v odebraných vzorcích výtěrů stolice bude stanoveno sekvenováním amplikonu genu 16S rRNA. Stručně řečeno, DNA bude extrahována pomocí QIAamp Microbiome Kit nebo QIAamp DNA Mini Kit (pro vzorky výtěru a stolice, v daném pořadí), následovaná amplifikací genu 16S rRNA a čárovým kódováním, jak bylo popsáno výše. Multiplexované vzorky amplikonu sekvenované na platformě Illumina MiSeq na JMF. Negativní kontroly prováděné během extrakce DNA a amplifikace genu 16S rRNA jsou běžně součástí pracovního postupu zpracování vzorků. Získaná sekvenční data budou kvalitativně filtrována a demultiplexována, následovaná inferencí varianty sekvenování amplikonu (ASV) s DADA2,16 umožňující analýzu v nejvyšším možném taxonomickém rozlišení. Výsledné sekvence ASV budou taxonomicky klasifikovány pomocí SINA s nejnovější verzí databáze SILVA SSU rRNA. V případě potřeby budou nečistoty odstraněny in silico pomocí softwarového balíčku pro dekontaminaci.

Perinatální údaje:

Kromě odběru stěrů a analýzy budou shromážděny následující perinatální parametry pomocí PIA Fetal Database, verze 5.6.16.917 (GE Viewpoint, Mnichov, Německo): Věk matky [číslo], parita [číslo], terciární vzdělání [ano /ne], etnická příslušnost [kategorie], stav vztahu [kategorie], index tělesné hmotnosti [číslo], zneužívání nikotinu [ano/ne], historie pPROM [ano/ne], historie PTB [ano/ne], již existující onemocnění [kategorie], screening vaginální infekce [ano/ne], cervikální insuficience [ano/ne], preeklampsie [ano/ne], krvácení [ano/ne], prenatální steroidní profylaxe [ano/ne], pokračující léčba antibiotiky [ano/ ne], tokolýza [ano/ne], profylaxe hořčíkem [ano/ne], gestační týden při porodu [číslo], porodní hmotnost [číslo], Apgar skóre v 1/5/10 minutě [počet], pH pupečníkové tepny [číslo ], převoz na neonatologickou jednotku intenzivní péče [ano/ne].

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Očekávaný)

100

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

      • Vienna, Rakousko, 1090
        • Nábor
        • Medical University of Vienna, Dept. of Obstetrics and Gynecology
        • Kontakt:
        • Kontakt:

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

  • Dítě
  • Dospělý
  • Starší dospělý

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Ženský

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Celkem bude zahrnuto 100 účastníků studie, kteří splňují všechna kritéria pro zařazení a nevyloučení, a budou zařazeni do jedné z následujících skupin:

Studijní skupina:

• Tato skupina se bude skládat z 50 těhotných žen, které prodělaly pPROM mezi 22+5 a 28+0 gestačním týdnem, buď v místě primární studie, nebo byly odeslány z jiných nemocnic a porodily předčasně císařským řezem.

Kontrolní skupina:

• Tato skupina se bude skládat z 50 těhotných žen, které jsou naplánovány na elektivní císařský řez na ambulanci primárního pracoviště studie mezi 32+0 a 37+0 gestačním týdnem a porodí v termínu císařským řezem.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Věk matky ≥18 let v době zápisu do studia
  • Singleton těhotenství
  • Podepsaný informovaný souhlas
  • Potvrzená předčasná ruptura blan (pPROM) nebo elektivní císařský řez pro termín porodu (v závislosti na studijní skupině)
  • Gestační věk v době pPROM mezi 22+5 a 28+0 týdny nebo ≥37+0 gestačních týdnů v době termínu císařského řezu (v závislosti na studijní skupině)

Kritéria vyloučení:

  • Mateřský věk
  • Vícečetné těhotenství
  • Neschopnost vyjádřit souhlas s účastí ve studii
  • Pokračující léčba antibiotiky nebo léčba antibiotiky ≤ 2 týdny před zařazením do studie
  • Vaginální pohlavní styk do 48 hodin před zápisem do studie
  • Čerstvé vaginální krvácení do 48 hodin před zařazením do studie
  • Infekce matky hepatitidou-B nebo hepatitidou-C (tj. pozitivní na PCR)
  • HIV infekce matky (tj. pozitivní na PCR)
  • Diabetes mellitus matky nebo těhotenská cukrovka

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Case-Control
  • Časové perspektivy: Budoucí

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
Studijní skupina
Tato skupina se bude skládat z 50 těhotných žen, které prodělaly pPROM mezi 22+5 a 28+0 gestačním týdnem, buď v místě primární studie, nebo byly odeslány z jiných nemocnic a porodily předčasně císařským řezem.
Po informovaném souhlasu budou vaginální výtěry odebírány při vyšetření zrcadlem z laterální poševní stěny a zadního fornixu vaginae pomocí sterilního vatového tamponu kombinovaného s epiteliálním kartáčkem. Rektální výtěr bude odebrán vložením sterilního tamponu do análního svěrače. Intraoperační výtěry z placenty a dutiny děložní budou odebrány při císařském řezu za sterilních podmínek. Novorozenecké výtěry (bukální sliznice a kůže) budou odebrány přímo po porodu a v novorozeneckém období. Vzorky stolice budou odebrány z mekonia, definovaného jako první stolice kojence a stolice novorozence v novorozeneckém období.
Kontrolní skupina
Tato skupina se bude skládat z 50 těhotných žen, které jsou naplánovány na elektivní císařský řez na ambulanci primárního pracoviště studie mezi 32+0 a 37+0 gestačním týdnem a porodí v termínu císařským řezem.
Po informovaném souhlasu budou vaginální výtěry odebírány při vyšetření zrcadlem z laterální poševní stěny a zadního fornixu vaginae pomocí sterilního vatového tamponu kombinovaného s epiteliálním kartáčkem. Rektální výtěr bude odebrán vložením sterilního tamponu do análního svěrače. Intraoperační výtěry z placenty a dutiny děložní budou odebrány při císařském řezu za sterilních podmínek. Novorozenecké výtěry (bukální sliznice a kůže) budou odebrány přímo po porodu a v novorozeneckém období. Vzorky stolice budou odebrány z mekonia, definovaného jako první stolice kojence a stolice novorozence v novorozeneckém období.

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Změny vaginálního mikrobiomu po pPROM ve srovnání s termínovanými porody
Časové okno: Do července 2021
Budou vyhodnocena měření četnosti (počet) variant amplikonových sekvencí (ASV), stejně jako počty součtů ASV na vyšších taxonomických úrovních, aby se otestovalo významné překrývání nebo rozdíly ve složení mikrobiální komunity v různých skupinách vzorků. Tyto parametry budou analyzovány v rámci každé ze studijních skupin, včetně longitudinálních analýz ke zjištění potenciálního rozdílu od začátku pPROM do doby porodu nebo později (studovaná skupina), nebo od těhotenství do doby porodu nebo později (kontrolní skupina ). Kromě toho budou ASV a součty ASV porovnány mezi studijní a kontrolní skupinou v předem stanovených časových bodech. Bude provedena detekce výrazně hojnějších variant sekvencí amplikonu mezi skupinami a upravené P-hodnoty budou vypočteny pomocí Benjamini-Hochbergovy metody a rozdíly podpořeny P-hodnotami
Do července 2021
Změny rektálního mikrobiomu po pPROM ve srovnání s termínovanými porody
Časové okno: Do července 2021
Budou vyhodnocena měření četnosti (počet) variant amplikonových sekvencí (ASV), stejně jako počty součtů ASV na vyšších taxonomických úrovních, aby se otestovalo významné překrývání nebo rozdíly ve složení mikrobiální komunity v různých skupinách vzorků. Tyto parametry budou analyzovány v rámci každé ze studijních skupin, včetně longitudinálních analýz ke zjištění potenciálního rozdílu od začátku pPROM do doby porodu nebo později (studovaná skupina), nebo od těhotenství do doby porodu nebo později (kontrolní skupina ). Kromě toho budou ASV a součty ASV porovnány mezi studijní a kontrolní skupinou v předem stanovených časových bodech. Bude provedena detekce výrazně hojnějších variant sekvencí amplikonu mezi skupinami a upravené P-hodnoty budou vypočteny pomocí Benjamini-Hochbergovy metody a rozdíly podpořeny P-hodnotami
Do července 2021
Změny placentárního mikrobiomu po pPROM ve srovnání s termínovanými porody
Časové okno: Do července 2021
Budou vyhodnocena měření četnosti (počet) variant amplikonových sekvencí (ASV), stejně jako počty součtů ASV na vyšších taxonomických úrovních, aby se otestovalo významné překrývání nebo rozdíly ve složení mikrobiální komunity v různých skupinách vzorků. Tyto parametry budou analyzovány v rámci každé ze studijních skupin, včetně longitudinálních analýz ke zjištění potenciálního rozdílu od začátku pPROM do doby porodu nebo později (studovaná skupina), nebo od těhotenství do doby porodu nebo později (kontrolní skupina ). Kromě toho budou ASV a součty ASV porovnány mezi studijní a kontrolní skupinou v předem stanovených časových bodech. Bude provedena detekce výrazně hojnějších variant sekvencí amplikonu mezi skupinami a upravené P-hodnoty budou vypočteny pomocí Benjamini-Hochbergovy metody a rozdíly podpořeny P-hodnotami
Do července 2021
Změny děložního mikrobiomu po pPROM ve srovnání s termínovanými porody
Časové okno: Do července 2021
Budou vyhodnocena měření četnosti (počet) variant amplikonových sekvencí (ASV), stejně jako počty součtů ASV na vyšších taxonomických úrovních, aby se otestovalo významné překrývání nebo rozdíly ve složení mikrobiální komunity v různých skupinách vzorků. Tyto parametry budou analyzovány v rámci každé ze studijních skupin, včetně longitudinálních analýz ke zjištění potenciálního rozdílu od začátku pPROM do doby porodu nebo později (studovaná skupina), nebo od těhotenství do doby porodu nebo později (kontrolní skupina ). Kromě toho budou ASV a součty ASV porovnány mezi studijní a kontrolní skupinou v předem stanovených časových bodech. Bude provedena detekce výrazně hojnějších variant sekvencí amplikonu mezi skupinami a upravené P-hodnoty budou vypočteny pomocí Benjamini-Hochbergovy metody a rozdíly podpořeny P-hodnotami
Do července 2021
Změny novorozeneckého mikrobiomu novorozenců narozených po pPROM ve srovnání s novorozenci prožívajícími termín porodu
Časové okno: Do července 2021
Budou vyhodnocena měření četnosti (počet) variant amplikonových sekvencí (ASV), stejně jako počty součtů ASV na vyšších taxonomických úrovních, aby se otestovalo významné překrývání nebo rozdíly ve složení mikrobiální komunity v různých skupinách vzorků. Tyto parametry budou analyzovány v rámci každé ze studijních skupin, včetně longitudinálních analýz ke zjištění potenciálního rozdílu od začátku pPROM do doby porodu nebo později (studovaná skupina), nebo od těhotenství do doby porodu nebo později (kontrolní skupina ). Kromě toho budou ASV a součty ASV porovnány mezi studijní a kontrolní skupinou v předem stanovených časových bodech. Bude provedena detekce výrazně hojnějších variant sekvencí amplikonu mezi skupinami a upravené P-hodnoty budou vypočteny pomocí Benjamini-Hochbergovy metody a rozdíly podpořeny P-hodnotami
Do července 2021

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Spolupracovníci

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Alex Farr, MD PhD, Medical University of Vienna
  • Studijní židle: Herbert Kiss, MD MBA, Medical University of Vienna
  • Studijní židle: Angelika Berger, MD MBA, Medical University of Vienna

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Obecné publikace

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

27. července 2020

Primární dokončení (Očekávaný)

1. července 2021

Dokončení studie (Očekávaný)

1. prosince 2021

Termíny zápisu do studia

První předloženo

20. července 2020

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

23. července 2020

První zveřejněno (Aktuální)

28. července 2020

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

2. září 2020

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

1. září 2020

Naposledy ověřeno

1. září 2020

Více informací

Termíny související s touto studií

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

Nerozhodný

Popis plánu IPD

V případě potřeby anonymizované údaje a v souladu s předpisy o ochraně údajů

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Vaginální mikrobiom

3
Předplatit