- ICH GCP
- Register voor klinische proeven in de VS.
- Klinische proef NCT04489056
Microbioom bij vroeggeboorte
Het menselijk microbioom in pPROM, vroeggeboorte en de neonatale baby: een prospectieve longitudinale pilotstudie
De doelstellingen van deze prospectieve longitudinale case-control pilot-studie zijn (1) het karakteriseren van de veranderingen van het microbioom van de vagina, de baarmoeder en de placenta bij zwangere vrouwen die pPROM ervaren met onmiddellijke ziekenhuisopname en opeenvolgende keizersneden bij prematuren, in vergelijking met saaie voldragen geboorten met electieve keizersnede, evenals (2) om de invloed van de moeder op het neonatale microbioom en de vroege neonatale uitkomst in pPROM premature gevallen te evalueren, in vergelijking met saaie voldragen geboorten.
Het eerste doel zal worden bereikt door het afnemen van vaginale en rectale uitstrijkjes voor microbioomanalyse bij vrouwen met pPROM, gevolgd door baarmoeder- en placenta-uitstrijkjes die tijdens de keizersnede worden afgenomen. Controlemonsters zullen op dezelfde tijdstippen worden verzameld van vrouwen die op termijn een electieve keizersnede ondergaan. Het tweede doel zal worden bereikt door microbioomanalyse van rectale, orale/buccale en huiduitstrijkjes van pasgeborenen die hetzij te vroeg geboren zijn na pPROM, hetzij voldragen, beide via een keizersnede.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Er zullen in totaal 100 studiedeelnemers worden opgenomen, toegewezen aan een van de volgende groepen:
Studiegroep:
• Deze groep zal bestaan uit 50 zwangere vrouwen die pPROM doormaakten tussen 22+5 en 28+0 zwangerschapsweken, ofwel op de primaire onderzoekslocatie, ofwel doorverwezen vanuit andere ziekenhuizen, en te vroeg bevallen via een keizersnede.
Controlegroep:
• Deze groep zal bestaan uit 50 zwangere vrouwen, die gepland staan voor een electieve keizersnede op de polikliniek van de primaire onderzoekslocatie, tussen 32+0 en 37+0 zwangerschapsweken, en op tijd bevallen door middel van een keizersnede.
Werving:
Werving van alle patiënten vindt plaats aan de Medische Universiteit van Wenen, Afdeling Verloskunde en Gynaecologie. Vrouwen in de onderzoeksgroep worden doorverwezen van buiten ziekenhuizen of komen om welke reden dan ook op onze afdeling. Verificatie van pPROM zal worden uitgevoerd door speculumonderzoek en detectie van ophoping van vruchtwater. In geval van onduidelijke bevindingen zal een enzymatische test (bijv. Amnisure®, QUIAGEN Sciences, LLC; Germantown, MD 20874, VS) worden uitgevoerd. Na pPROM-verificatie zullen vrouwen die voldoen aan de inclusiecriteria worden aangeboden om deel te nemen aan het onderzoek. Wie om wat voor reden dan ook een spontane vaginale bevalling meemaakt in plaats van een keizersnede, wordt beschouwd als drop-out. Vrouwen in de controlegroep zullen worden gerekruteerd tijdens hun routinematige presentatie voor een electieve keizersnede (om welke reden dan ook die niet voldoet aan de uitsluitingscriteria van de studie) die op termijn zal worden gepland. Degenen die een vroeggeboorte ervaren, hoewel ze op termijn een electieve keizersnede moeten ondergaan, worden als drop-out beschouwd. Tijdens hun consultatie op de polikliniek zullen deze vrouwen worden aangeboden om deel te nemen aan het onderzoek.
bemonstering:
Alle uitstrijkjes zullen worden afgenomen bij subonderzoekers van dit onderzoek volgens een gestandaardiseerde procedure. Voor anonimisering worden alleen het tijdstip van afname, de locatie en de afdeling gemarkeerd op de buisjes met uitstrijkjes. Na geïnformeerde toestemming zullen vaginale uitstrijkjes worden afgenomen tijdens speculumonderzoek van de laterale vaginale wand en achterste fornix vaginae met behulp van een steriel wattenstaafje in combinatie met een epitheliale borstel. Een rectaal uitstrijkje wordt afgenomen door een steriel uitstrijkje in de anale sluitspier te brengen. Tijdens de keizersnede worden onder steriele omstandigheden intraoperatieve uitstrijkjes van de placenta en de baarmoederholte afgenomen. Neonatale uitstrijkjes (mondslijmvlies en huid) worden direct na de bevalling en in de neonatale periode afgenomen. Er worden ontlastingsmonsters genomen van het meconium, gedefinieerd als de eerste ontlasting van het kind en de ontlasting van de pasgeborene in de neonatale periode. Alle monsters worden na afname onmiddellijk bij -80°C bewaard. De epitheelborstel wordt in de RNAlater® RNA-stabilisatieoplossing geplaatst en bij -80°C bewaard.
Microbioom analyse:
Microbiome-analyse zal worden uitgevoerd in de Joint Microbiome Facility (JMF) van de Medische Universiteit van Wenen en de Universiteit van Wenen. Het testen zal worden uitgevoerd door subonderzoekers van het JMF. De samenstelling van de microbiële gemeenschap in verzamelde ontlastingsmonsters zal worden bepaald door middel van 16S rRNA-gen-amplicon-sequencing. In het kort, er zal DNA worden geëxtraheerd met de QIAamp Microbiome Kit of QIAamp DNA Mini Kit (respectievelijk voor uitstrijkjes en ontlastingsmonsters), gevolgd door 16S rRNA-genamplificatie en barcodering zoals eerder beschreven. Gemultiplexte amplicon-samples gesequenced op het Illumina MiSeq-platform bij de JMF. Negatieve controles die worden uitgevoerd tijdens DNA-extractie en 16S rRNA-genamplificatie worden routinematig opgenomen in de workflow voor monsterverwerking. De verkregen sequentiegegevens zullen op kwaliteit worden gefilterd en gedemultiplext, gevolgd door amplicon sequencing variant (ASV) inferentie met DADA2,16 waardoor analyse met de hoogst mogelijke taxonomische resolutie mogelijk wordt. De resulterende ASV-sequenties zullen taxonomisch worden geclassificeerd met behulp van SINA met de nieuwste release van de SILVA SSU rRNA-database. Indien nodig worden verontreinigingen in silico verwijderd met behulp van het softwarepakket decontam.
Perinatale gegevens:
Naast het afnemen en analyseren van uitstrijkjes zullen de volgende perinatale parameters worden verzameld, gebruikmakend van de PIA Fetal Database, versie 5.6.16.917 (GE Viewpoint, München, Duitsland): leeftijd van de moeder [getal], pariteit [getal], tertiair onderwijs [ja /nee], etniciteit [categorie], relatiestatus [categorie], body mass index [nummer], nicotinemisbruik [ja/nee], geschiedenis van pPROM [ja/nee], geschiedenis van PTB [ja/nee], reeds bestaande ziekten [categorie], screening op vaginale infectie [ja/nee], cervicale insufficiëntie [ja/nee], pre-eclampsie [ja/nee], bloeding [ja/nee], antenatale steroïde profylaxe [ja/nee], lopende antibioticabehandeling [ja/nee] nee], tocolyse [ja/nee], magnesiumprofylaxe [ja/nee], zwangerschapsweek bij bevalling [getal], geboortegewicht [getal], Apgar-score op 1/5/10 minuten [getal], arteriële navelstreng-pH [getal ], overplaatsing naar neonatale intensive care [ja/nee].
Studietype
Inschrijving (Verwacht)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Philipp Foessleitner, MD BSc
- Telefoonnummer: +4314040028190
- E-mail: philipp.foessleitner@meduniwien.ac.at
Studie Contact Back-up
- Naam: Nikolaus Keil, MD
- Telefoonnummer: +4314040028190
- E-mail: nikolaus.keil@gmail.com
Studie Locaties
-
-
-
Vienna, Oostenrijk, 1090
- Werving
- Medical University of Vienna, Dept. of Obstetrics and Gynecology
-
Contact:
- Philipp Foessleitner, MD BSc
- Telefoonnummer: 28220 +43140400
- E-mail: philipp.foessleitner@muv.ac.at
-
Contact:
- Alex Farr, MD PhD
- Telefoonnummer: 28220 +43140400
- E-mail: alex.farr@muv.ac.at
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
In totaal zullen 100 studiedeelnemers, die aan alle inclusie- en niet-exclusiecriteria voldoen, worden opgenomen, toegewezen aan een van de volgende groepen:
Studiegroep:
• Deze groep zal bestaan uit 50 zwangere vrouwen die pPROM doormaakten tussen 22+5 en 28+0 zwangerschapsweken, ofwel op de primaire onderzoekslocatie, ofwel doorverwezen vanuit andere ziekenhuizen, en te vroeg bevallen via een keizersnede.
Controlegroep:
• Deze groep zal bestaan uit 50 zwangere vrouwen, die gepland staan voor een electieve keizersnede op de polikliniek van de primaire onderzoekslocatie, tussen 32+0 en 37+0 zwangerschapsweken, en op tijd bevallen door middel van een keizersnede.
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Maternale leeftijd ≥18 jaar op het moment van inschrijving voor de studie
- Eenling zwangerschap
- Ondertekende geïnformeerde toestemming
- Bevestigde vroegtijdige voortijdige breuk van de vliezen (pPROM) of electieve keizersnede voor voldragen geboorte (afhankelijk van de onderzoeksgroep)
- Zwangerschapsduur ten tijde van pPROM tussen 22+5 en 28+0 weken of ≥37+0 weken zwangerschap ten tijde van de keizersnede (afhankelijk van de onderzoeksgroep)
Uitsluitingscriteria:
- Moederlijke leeftijd
- Meerling zwangerschap
- Onvermogen om toestemming te geven voor deelname aan het onderzoek
- Lopende antibioticabehandeling of antibioticabehandeling ≤2 weken voor inschrijving in het onderzoek
- Vaginale geslachtsgemeenschap binnen 48 uur vóór inschrijving voor de studie
- Nieuwe vaginale bloeding binnen 48 uur vóór inschrijving in het onderzoek
- Hepatitis-B- of hepatitis-C-infectie bij de moeder (d.w.z. positief op PCR)
- Maternale HIV-infectie (d.w.z. positief op PCR)
- Maternale diabetes mellitus of zwangerschapsdiabetes
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-control
- Tijdsperspectieven: Prospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
---|---|
Studiegroep
Deze groep zal bestaan uit 50 zwangere vrouwen, die pPROM doormaakten tussen 22+5 en 28+0 zwangerschapsweken, hetzij op de primaire studielocatie, hetzij doorverwezen vanuit andere ziekenhuizen, en te vroeg bevallen door een keizersnede.
|
Na geïnformeerde toestemming zullen vaginale uitstrijkjes worden afgenomen tijdens speculumonderzoek van de laterale vaginale wand en achterste fornix vaginae met behulp van een steriel wattenstaafje in combinatie met een epitheliale borstel.
Een rectaal uitstrijkje wordt afgenomen door een steriel uitstrijkje in de anale sluitspier te brengen.
Tijdens de keizersnede worden onder steriele omstandigheden intraoperatieve uitstrijkjes van de placenta en de baarmoederholte afgenomen.
Neonatale uitstrijkjes (mondslijmvlies en huid) worden direct na de bevalling en in de neonatale periode afgenomen.
Er worden ontlastingsmonsters genomen van het meconium, gedefinieerd als de eerste ontlasting van het kind en de ontlasting van de pasgeborene in de neonatale periode.
|
Controlegroep
Deze groep zal bestaan uit 50 zwangere vrouwen, die gepland staan voor een electieve keizersnede op de polikliniek van de primaire onderzoekslocatie, tussen 32+0 en 37+0 zwangerschapsweken, en op termijn worden bevallen door middel van een keizersnede.
|
Na geïnformeerde toestemming zullen vaginale uitstrijkjes worden afgenomen tijdens speculumonderzoek van de laterale vaginale wand en achterste fornix vaginae met behulp van een steriel wattenstaafje in combinatie met een epitheliale borstel.
Een rectaal uitstrijkje wordt afgenomen door een steriel uitstrijkje in de anale sluitspier te brengen.
Tijdens de keizersnede worden onder steriele omstandigheden intraoperatieve uitstrijkjes van de placenta en de baarmoederholte afgenomen.
Neonatale uitstrijkjes (mondslijmvlies en huid) worden direct na de bevalling en in de neonatale periode afgenomen.
Er worden ontlastingsmonsters genomen van het meconium, gedefinieerd als de eerste ontlasting van het kind en de ontlasting van de pasgeborene in de neonatale periode.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
---|---|---|
Veranderingen van het vaginale microbioom na pPROM in vergelijking met voldragen geboorten
Tijdsspanne: Tot juli 2021
|
Abundantiemetingen (tellingen) van de ampliconsequentievarianten (ASV's), evenals ASV-somtellingen op hogere taxonomische niveaus zullen worden geëvalueerd om te testen op significante overlap of verschillen in de samenstelling van de microbiële gemeenschap in verschillende steekproefgroepen.
Deze parameters zullen binnen elk van de onderzoeksgroepen worden geanalyseerd, inclusief longitudinale analyses om een mogelijk verschil te detecteren vanaf het begin van pPROM tot het tijdstip van bevalling of later (studiegroep), of van zwangerschap tot het tijdstip van bevalling of later (controlegroep). ).
Bovendien zullen ASV's en ASV-somtellingen worden vergeleken tussen de studie- en controlegroep op vooraf bepaalde tijdstippen.
Detectie van aanzienlijk meer overvloedige ampliconsequentievarianten tussen groepen zal worden uitgevoerd, en aangepaste P-waarden zullen worden berekend met behulp van de Benjamini-Hochberg-methode en verschillen worden ondersteund met P-waarden
|
Tot juli 2021
|
Veranderingen van het rectale microbioom na pPROM in vergelijking met voldragen geboorten
Tijdsspanne: Tot juli 2021
|
Abundantiemetingen (tellingen) van de ampliconsequentievarianten (ASV's), evenals ASV-somtellingen op hogere taxonomische niveaus zullen worden geëvalueerd om te testen op significante overlap of verschillen in de samenstelling van de microbiële gemeenschap in verschillende steekproefgroepen.
Deze parameters zullen binnen elk van de onderzoeksgroepen worden geanalyseerd, inclusief longitudinale analyses om een mogelijk verschil te detecteren vanaf het begin van pPROM tot het tijdstip van bevalling of later (studiegroep), of van zwangerschap tot het tijdstip van bevalling of later (controlegroep). ).
Bovendien zullen ASV's en ASV-somtellingen worden vergeleken tussen de studie- en controlegroep op vooraf bepaalde tijdstippen.
Detectie van aanzienlijk meer overvloedige ampliconsequentievarianten tussen groepen zal worden uitgevoerd, en aangepaste P-waarden zullen worden berekend met behulp van de Benjamini-Hochberg-methode en verschillen worden ondersteund met P-waarden
|
Tot juli 2021
|
Veranderingen van het placenta-microbioom na pPROM in vergelijking met voldragen geboorten
Tijdsspanne: Tot juli 2021
|
Abundantiemetingen (tellingen) van de ampliconsequentievarianten (ASV's), evenals ASV-somtellingen op hogere taxonomische niveaus zullen worden geëvalueerd om te testen op significante overlap of verschillen in de samenstelling van de microbiële gemeenschap in verschillende steekproefgroepen.
Deze parameters zullen binnen elk van de onderzoeksgroepen worden geanalyseerd, inclusief longitudinale analyses om een mogelijk verschil te detecteren vanaf het begin van pPROM tot het tijdstip van bevalling of later (studiegroep), of van zwangerschap tot het tijdstip van bevalling of later (controlegroep). ).
Bovendien zullen ASV's en ASV-somtellingen worden vergeleken tussen de studie- en controlegroep op vooraf bepaalde tijdstippen.
Detectie van aanzienlijk meer overvloedige ampliconsequentievarianten tussen groepen zal worden uitgevoerd, en aangepaste P-waarden zullen worden berekend met behulp van de Benjamini-Hochberg-methode en verschillen worden ondersteund met P-waarden
|
Tot juli 2021
|
Veranderingen van het baarmoedermicrobioom na pPROM in vergelijking met voldragen geboorten
Tijdsspanne: Tot juli 2021
|
Abundantiemetingen (tellingen) van de ampliconsequentievarianten (ASV's), evenals ASV-somtellingen op hogere taxonomische niveaus zullen worden geëvalueerd om te testen op significante overlap of verschillen in de samenstelling van de microbiële gemeenschap in verschillende steekproefgroepen.
Deze parameters zullen binnen elk van de onderzoeksgroepen worden geanalyseerd, inclusief longitudinale analyses om een mogelijk verschil te detecteren vanaf het begin van pPROM tot het tijdstip van bevalling of later (studiegroep), of van zwangerschap tot het tijdstip van bevalling of later (controlegroep). ).
Bovendien zullen ASV's en ASV-somtellingen worden vergeleken tussen de studie- en controlegroep op vooraf bepaalde tijdstippen.
Detectie van aanzienlijk meer overvloedige ampliconsequentievarianten tussen groepen zal worden uitgevoerd, en aangepaste P-waarden zullen worden berekend met behulp van de Benjamini-Hochberg-methode en verschillen worden ondersteund met P-waarden
|
Tot juli 2021
|
Veranderingen van het neonatale microbioom van pasgeborenen geboren na pPROM in vergelijking met pasgeborenen die een voldragen geboorte meemaken
Tijdsspanne: Tot juli 2021
|
Abundantiemetingen (tellingen) van de ampliconsequentievarianten (ASV's), evenals ASV-somtellingen op hogere taxonomische niveaus zullen worden geëvalueerd om te testen op significante overlap of verschillen in de samenstelling van de microbiële gemeenschap in verschillende steekproefgroepen.
Deze parameters zullen binnen elk van de onderzoeksgroepen worden geanalyseerd, inclusief longitudinale analyses om een mogelijk verschil te detecteren vanaf het begin van pPROM tot het tijdstip van bevalling of later (studiegroep), of van zwangerschap tot het tijdstip van bevalling of later (controlegroep). ).
Bovendien zullen ASV's en ASV-somtellingen worden vergeleken tussen de studie- en controlegroep op vooraf bepaalde tijdstippen.
Detectie van aanzienlijk meer overvloedige ampliconsequentievarianten tussen groepen zal worden uitgevoerd, en aangepaste P-waarden zullen worden berekend met behulp van de Benjamini-Hochberg-methode en verschillen worden ondersteund met P-waarden
|
Tot juli 2021
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Medewerkers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Alex Farr, MD PhD, Medical University of Vienna
- Studie stoel: Herbert Kiss, MD MBA, Medical University of Vienna
- Studie stoel: Angelika Berger, MD MBA, Medical University of Vienna
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature. 2012 Jun 13;486(7402):207-14. doi: 10.1038/nature11234.
- Jovel J, Patterson J, Wang W, Hotte N, O'Keefe S, Mitchel T, Perry T, Kao D, Mason AL, Madsen KL, Wong GK. Characterization of the Gut Microbiome Using 16S or Shotgun Metagenomics. Front Microbiol. 2016 Apr 20;7:459. doi: 10.3389/fmicb.2016.00459. eCollection 2016.
- Dominguez-Bello MG, Costello EK, Contreras M, Magris M, Hidalgo G, Fierer N, Knight R. Delivery mode shapes the acquisition and structure of the initial microbiota across multiple body habitats in newborns. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Jun 29;107(26):11971-5. doi: 10.1073/pnas.1002601107. Epub 2010 Jun 21.
- Brown RG, Marchesi JR, Lee YS, Smith A, Lehne B, Kindinger LM, Terzidou V, Holmes E, Nicholson JK, Bennett PR, MacIntyre DA. Vaginal dysbiosis increases risk of preterm fetal membrane rupture, neonatal sepsis and is exacerbated by erythromycin. BMC Med. 2018 Jan 24;16(1):9. doi: 10.1186/s12916-017-0999-x.
- Chu DM, Ma J, Prince AL, Antony KM, Seferovic MD, Aagaard KM. Maturation of the infant microbiome community structure and function across multiple body sites and in relation to mode of delivery. Nat Med. 2017 Mar;23(3):314-326. doi: 10.1038/nm.4272. Epub 2017 Jan 23.
- Chu DM, Seferovic M, Pace RM, Aagaard KM. The microbiome in preterm birth. Best Pract Res Clin Obstet Gynaecol. 2018 Oct;52:103-113. doi: 10.1016/j.bpobgyn.2018.03.006. Epub 2018 Apr 9.
- Klindworth A, Pruesse E, Schweer T, Peplies J, Quast C, Horn M, Glockner FO. Evaluation of general 16S ribosomal RNA gene PCR primers for classical and next-generation sequencing-based diversity studies. Nucleic Acids Res. 2013 Jan 7;41(1):e1. doi: 10.1093/nar/gks808. Epub 2012 Aug 28.
- Gosmann C, Anahtar MN, Handley SA, Farcasanu M, Abu-Ali G, Bowman BA, Padavattan N, Desai C, Droit L, Moodley A, Dong M, Chen Y, Ismail N, Ndung'u T, Ghebremichael MS, Wesemann DR, Mitchell C, Dong KL, Huttenhower C, Walker BD, Virgin HW, Kwon DS. Lactobacillus-Deficient Cervicovaginal Bacterial Communities Are Associated with Increased HIV Acquisition in Young South African Women. Immunity. 2017 Jan 17;46(1):29-37. doi: 10.1016/j.immuni.2016.12.013. Epub 2017 Jan 10.
- O'Hanlon DE, Moench TR, Cone RA. In vaginal fluid, bacteria associated with bacterial vaginosis can be suppressed with lactic acid but not hydrogen peroxide. BMC Infect Dis. 2011 Jul 19;11:200. doi: 10.1186/1471-2334-11-200.
- Callahan BJ, DiGiulio DB, Goltsman DSA, Sun CL, Costello EK, Jeganathan P, Biggio JR, Wong RJ, Druzin ML, Shaw GM, Stevenson DK, Holmes SP, Relman DA. Replication and refinement of a vaginal microbial signature of preterm birth in two racially distinct cohorts of US women. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Sep 12;114(37):9966-9971. doi: 10.1073/pnas.1705899114. Epub 2017 Aug 28.
- Brown RG, Al-Memar M, Marchesi JR, Lee YS, Smith A, Chan D, Lewis H, Kindinger L, Terzidou V, Bourne T, Bennett PR, MacIntyre DA. Establishment of vaginal microbiota composition in early pregnancy and its association with subsequent preterm prelabor rupture of the fetal membranes. Transl Res. 2019 May;207:30-43. doi: 10.1016/j.trsl.2018.12.005. Epub 2018 Dec 27.
- Stout MJ, Zhou Y, Wylie KM, Tarr PI, Macones GA, Tuuli MG. Early pregnancy vaginal microbiome trends and preterm birth. Am J Obstet Gynecol. 2017 Sep;217(3):356.e1-356.e18. doi: 10.1016/j.ajog.2017.05.030. Epub 2017 May 23.
- Thorsen J, Brejnrod A, Mortensen M, Rasmussen MA, Stokholm J, Al-Soud WA, Sorensen S, Bisgaard H, Waage J. Large-scale benchmarking reveals false discoveries and count transformation sensitivity in 16S rRNA gene amplicon data analysis methods used in microbiome studies. Microbiome. 2016 Nov 25;4(1):62. doi: 10.1186/s40168-016-0208-8.
- Davis NM, Proctor DM, Holmes SP, Relman DA, Callahan BJ. Simple statistical identification and removal of contaminant sequences in marker-gene and metagenomics data. Microbiome. 2018 Dec 17;6(1):226. doi: 10.1186/s40168-018-0605-2.
- Pruesse E, Peplies J, Glockner FO. SINA: accurate high-throughput multiple sequence alignment of ribosomal RNA genes. Bioinformatics. 2012 Jul 15;28(14):1823-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bts252. Epub 2012 May 3.
- Quast C, Pruesse E, Yilmaz P, Gerken J, Schweer T, Yarza P, Peplies J, Glockner FO. The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web-based tools. Nucleic Acids Res. 2013 Jan;41(Database issue):D590-6. doi: 10.1093/nar/gks1219. Epub 2012 Nov 28.
- Callahan BJ, McMurdie PJ, Rosen MJ, Han AW, Johnson AJ, Holmes SP. DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nat Methods. 2016 Jul;13(7):581-3. doi: 10.1038/nmeth.3869. Epub 2016 May 23.
- Herbold CW, Pelikan C, Kuzyk O, Hausmann B, Angel R, Berry D, Loy A. Corrigendum: A flexible and economical barcoding approach for highly multiplexed amplicon sequencing of diverse target genes. Front Microbiol. 2016 Jun 6;7:870. doi: 10.3389/fmicb.2016.00870. eCollection 2016.
- Huurre A, Kalliomaki M, Rautava S, Rinne M, Salminen S, Isolauri E. Mode of delivery - effects on gut microbiota and humoral immunity. Neonatology. 2008;93(4):236-40. doi: 10.1159/000111102. Epub 2007 Nov 16.
- Mueller NT, Bakacs E, Combellick J, Grigoryan Z, Dominguez-Bello MG. The infant microbiome development: mom matters. Trends Mol Med. 2015 Feb;21(2):109-17. doi: 10.1016/j.molmed.2014.12.002. Epub 2014 Dec 11.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Verwacht)
Studie voltooiing (Verwacht)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 1668/2020
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .