Mikrobiomi ennenaikaisessa synnytyksessä
Ihmisen mikrobiomi pPROMissa, ennenaikainen synnytys ja vastasyntynyt vauva: tuleva pitkittäinen pilottitutkimus
Tämän tulevan pitkittäisen tapauskontrolli-pilottitutkimuksen tavoitteena on (1) karakterisoida emättimen, kohdun ja istukan mikrobiomin muutoksia raskaana olevilla naisilla, joilla on pPROM välittömässä sairaalahoidossa ja peräkkäisessä keisarileikkauksessa keskosena verrattuna tapahtumattomiin synnytyksiin. valinnainen keisarinleikkaus, sekä (2) arvioida äidin vaikutusta vastasyntyneen mikrobiomiin ja varhaiseen vastasyntyneen lopputulokseen pPROM-keskostapauksissa verrattuna tapahtumattomiin synnytyksiin.
Ensimmäinen tavoite saavutetaan keräämällä emättimen ja peräsuolen pyyhkäisynäytteitä mikrobiomianalyysiä varten naisilta, joilla on pPROM, ja sen jälkeen keisarileikkauksen aikana kerätyt kohtu- ja istukkanäytteet. Kontrollinäytteet otetaan samaan aikaan naisilta, joille tehdään elektiivinen keisarileikkaus keskeneräisenä. Toinen tavoite saavutetaan mikrobiomianalyysillä peräsuolen, suun/bukkaalin ja ihon vanupuikoista, jotka on otettu vastasyntyneiltä, jotka ovat syntyneet ennenaikaisesti pPROM:n jälkeen tai aikaisin, molemmat keisarinleikkauksella.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Mukana on yhteensä 100 osallistujaa, jotka jaetaan johonkin seuraavista ryhmistä:
Opiskeluryhmä:
• Tämä ryhmä koostuu 50 raskaana olevasta naisesta, joilla oli pPROM raskausviikolla 22+5 ja 28+0, joko ensisijaisessa tutkimuspaikassa tai lähetellään muista sairaaloista ja ennenaikaisena keisarinleikkauksella.
Kontrolliryhmä:
• Tähän ryhmään kuuluu 50 raskaana olevaa naista, joille on määrä tehdä elektiivinen keisarileikkaus ensisijaisen tutkimuspaikan poliklinikalla, raskausviikkojen 32+0 ja 37+0 välillä ja synnytyksen aikana keisarileikkauksella.
Rekrytointi:
Kaikkien potilaiden rekrytointi tapahtuu Wienin lääketieteellisen yliopiston synnytys- ja gynekologian osastolla. Tutkimusryhmän naiset lähetetään sairaaloiden ulkopuolelta tai esiintyvät mistä tahansa syystä osastollamme. pPROM varmistetaan tähystystutkimuksella ja lapsivesien kerääntymisen havaitsemisella. Jos löydökset ovat epäselviä, suoritetaan entsymaattinen testi (esim. Amnisure®, QUIAGEN Sciences, LLC; Germantown, MD 20874, USA). PPROM-tarkastuksen jälkeen osallistumiskriteerit täyttäville naisille tarjotaan osallistumista tutkimukseen. Ne, jotka jostain syystä joutuvat spontaaniin emättimeen keisarinleikkauksen sijaan, katsotaan keskeyttäneiksi. Vertailuryhmän naiset rekrytoidaan heidän rutiiniesityksensä aikana elektiivistä keisarinleikkausta varten (josta tahansa syystä, joka ei täytä tutkimuksen poissulkemiskriteerejä), joka on määräaikana. Ne, jotka kokevat ennenaikaisen synnytyksen, vaikka heille on määräaikainen elektiivinen keisarileikkaus, katsotaan keskeyttäneiksi. Näille naisille tarjotaan osallistumista tutkimukseen poliklinikalla käydyn konsultoinnin aikana.
Näytteenotto:
Kaikki pyyhkäisynäytteet kerätään tämän tutkimuksen osatutkijoilta käyttäen standardoitua menettelyä. Anonymisointia varten vain keräysajankohta, -paikka ja -osasto merkitään vanupuikkoputkiin. Ilmoitetun suostumuksen jälkeen emättimestä otetaan näytteitä pehmustetutkimuksen aikana emättimen lateraalisesta seinämästä ja posteriorisesta fornix vaginaesta käyttämällä steriiliä vanupuikkoa yhdistettynä epiteeliharjaan. Rektaalinen vanupuikko otetaan työntämällä steriili vanupuikko peräaukon sulkijalihakseen. Leikkauksensisäiset vanupuitteet istukasta ja kohdun ontelosta kerätään keisarinleikkauksen aikana steriileissä olosuhteissa. Vastasyntyneiden pyyhkäisynäytteet (suun limakalvot ja iho) kerätään heti synnytyksen jälkeen ja vastasyntyneen aikana. Ulostenäytteet otetaan mekoniumista, joka määritellään vauvan ensimmäiseksi ulosteeksi ja vastasyntyneen ulosteeksi vastasyntyneen aikana. Kaikki näytteet säilytetään välittömästi -80°C:ssa keräyksen jälkeen. Epiteelin harja laitetaan RNAlater® RNA:n stabilointiliuokseen ja säilytetään -80 °C:ssa.
Mikrobiomianalyysi:
Mikrobiomianalyysi suoritetaan Wienin lääketieteellisen yliopiston ja Wienin yliopiston Joint Microbiome Facilityssä (JMF). Testauksen suorittavat JMF:n osatutkijat. Mikrobiyhteisön koostumus kerätyissä ulostepuikkonäytteissä määritetään 16S rRNA -geeniamplikonin sekvensoinnilla. Lyhyesti sanottuna DNA uutetaan QIAamp Microbiome Kit- tai QIAamp DNA Mini Kit -pakkauksella (vanupuikko- ja ulostenäytteitä varten), mitä seuraa 16S-rRNA-geenin monistus ja viivakoodaus, kuten aiemmin on kuvattu. Multipleksoidut amplikoninäytteet sekvensoitu Illumina MiSeq -alustalla JMF:ssä. DNA-uuton ja 16S rRNA -geenin monistamisen aikana suoritetut negatiiviset kontrollit sisällytetään rutiininomaisesti näytteenkäsittelyn työnkulkuun. Saadut sekvenssitiedot suodatetaan laatusuodatuksella ja demultipleksoidaan, mitä seuraa amplikonin sekvensointivariantti (ASV) päättely DADA2,16:lla, mikä mahdollistaa analyysin korkeimmalla mahdollisella taksonomisella resoluutiolla. Tuloksena saadut ASV-sekvenssit luokitellaan taksonomisesti käyttämällä SINAa SILVA SSU rRNA -tietokannan uusimman julkaisun kanssa. Tarvittaessa epäpuhtaudet poistetaan in silico decontam-ohjelmistopaketin avulla.
Perinataalista tiedot:
Vanupuikkonäytteiden oton ja analyysin lisäksi seuraavat perinataaliset parametrit kerätään käyttämällä PIA Fetal Database -tietokantaa, versiota 5.6.16.917 (GE Viewpoint, München, Saksa): Äidin ikä [numero], pariteetti [numero], korkea-asteen koulutus [kyllä /ei], etnisyys [luokka], parisuhde [luokka], painoindeksi [luku], nikotiinin väärinkäyttö [kyllä/ei], pPROM-historia [kyllä/ei], PTB-historia [kyllä/ei], olemassa olevat sairaudet [luokka], emättimen infektioseulonta [kyllä/ei], kohdunkaulan vajaatoiminta [kyllä/ei], preeklampsia [kyllä/ei], verenvuoto [kyllä/ei], synnytystä edeltävä steroidien ehkäisy [kyllä/ei], meneillään oleva antibioottihoito [kyllä/ ei], tokolyysi [kyllä/ei], magnesiumprofylaksia [kyllä/ei], raskausviikko synnytyksessä [numero], syntymäpaino [numero], Apgar-pistemäärä 1/5/10 minuutin kohdalla [numero], napanuoran valtimon pH [numero] ], siirto vastasyntyneiden teho-osastolle [kyllä/ei].
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Philipp Foessleitner, MD BSc
- Puhelinnumero: +4314040028190
- Sähköposti: philipp.foessleitner@meduniwien.ac.at
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Nikolaus Keil, MD
- Puhelinnumero: +4314040028190
- Sähköposti: nikolaus.keil@gmail.com
Opiskelupaikat
-
-
-
Vienna, Itävalta, 1090
- Rekrytointi
- Medical University of Vienna, Dept. of Obstetrics and Gynecology
-
Ottaa yhteyttä:
- Philipp Foessleitner, MD BSc
- Puhelinnumero: 28220 +43140400
- Sähköposti: philipp.foessleitner@muv.ac.at
-
Ottaa yhteyttä:
- Alex Farr, MD PhD
- Puhelinnumero: 28220 +43140400
- Sähköposti: alex.farr@muv.ac.at
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Mukaan otetaan yhteensä 100 tutkimukseen osallistunutta, jotka täyttävät kaikki sisällyttämis- ja poissulkemiskriteerit ja jotka jaetaan johonkin seuraavista ryhmistä:
Opiskeluryhmä:
• Tämä ryhmä koostuu 50 raskaana olevasta naisesta, joilla oli pPROM raskausviikolla 22+5 ja 28+0, joko ensisijaisessa tutkimuspaikassa tai lähetellään muista sairaaloista ja ennenaikaisena keisarinleikkauksella.
Kontrolliryhmä:
• Tähän ryhmään kuuluu 50 raskaana olevaa naista, joille on määrä tehdä elektiivinen keisarileikkaus ensisijaisen tutkimuspaikan poliklinikalla, raskausviikkojen 32+0 ja 37+0 välillä ja synnytyksen aikana keisarileikkauksella.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Äidin ikä ≥ 18 vuotta tutkimukseen ilmoittautumishetkellä
- Yksittäinen raskaus
- Allekirjoitettu tietoinen suostumus
- Vahvistettu ennenaikainen ennenaikainen kalvojen repeämä (pPROM) tai elektiivinen keisarileikkaus synnytyksen vuoksi (riippuen tutkimusryhmästä)
- Raskausaika pPROM:n aikaan välillä 22+5 ja 28+0 viikkoa tai ≥37+0 raskausviikkoa keisarileikkauksen aikaan (riippuen tutkimusryhmästä)
Poissulkemiskriteerit:
- Äidin ikä
- Moniraskaus
- Kyvyttömyys suostua tutkimukseen osallistumiseen
- Jatkuva antibioottihoito tai antibioottihoito ≤2 viikkoa ennen tutkimukseen ilmoittautumista
- Emättimen seksuaalinen kanssakäyminen 48 tunnin sisällä ennen tutkimukseen ilmoittautumista
- Tuore emättimen verenvuoto 48 tunnin sisällä ennen tutkimukseen ilmoittautumista
- Äidin hepatiitti-B- tai hepatiitti-C-infektio (eli positiivinen PCR:ssä)
- Äidin HIV-infektio (eli positiivinen PCR:ssä)
- Äidin diabetes mellitus tai raskausdiabetes
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Case-Control
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Opiskeluryhmä
Tämä ryhmä koostuu 50 raskaana olevasta naisesta, jotka kokivat pPROM:n 22+5–28+0 raskausviikolla, joko ensisijaisessa tutkimuspaikassa tai lähetellään muista sairaaloista ja synnytettiin ennenaikaisesti keisarinleikkauksella.
|
Ilmoitetun suostumuksen jälkeen emättimestä otetaan näytteitä pehmustetutkimuksen aikana emättimen lateraalisesta seinämästä ja posteriorisesta fornix vaginaesta käyttämällä steriiliä vanupuikkoa yhdistettynä epiteeliharjaan.
Rektaalinen vanupuikko otetaan työntämällä steriili vanupuikko peräaukon sulkijalihakseen.
Leikkauksensisäiset vanupuitteet istukasta ja kohdun ontelosta kerätään keisarinleikkauksen aikana steriileissä olosuhteissa.
Vastasyntyneiden pyyhkäisynäytteet (suun limakalvot ja iho) kerätään heti synnytyksen jälkeen ja vastasyntyneen aikana.
Ulostenäytteet otetaan mekoniumista, joka määritellään vauvan ensimmäiseksi ulosteeksi ja vastasyntyneen ulosteeksi vastasyntyneen aikana.
|
|
Kontrolliryhmä
Tähän ryhmään kuuluu 50 raskaana olevaa naista, joille on määrä tehdä elektiivinen keisarileikkaus ensisijaisen tutkimuspaikan avohoidossa raskausviikkojen 32+0 ja 37+0 välillä ja synnytyksen aikana keisarileikkauksella.
|
Ilmoitetun suostumuksen jälkeen emättimestä otetaan näytteitä pehmustetutkimuksen aikana emättimen lateraalisesta seinämästä ja posteriorisesta fornix vaginaesta käyttämällä steriiliä vanupuikkoa yhdistettynä epiteeliharjaan.
Rektaalinen vanupuikko otetaan työntämällä steriili vanupuikko peräaukon sulkijalihakseen.
Leikkauksensisäiset vanupuitteet istukasta ja kohdun ontelosta kerätään keisarinleikkauksen aikana steriileissä olosuhteissa.
Vastasyntyneiden pyyhkäisynäytteet (suun limakalvot ja iho) kerätään heti synnytyksen jälkeen ja vastasyntyneen aikana.
Ulostenäytteet otetaan mekoniumista, joka määritellään vauvan ensimmäiseksi ulosteeksi ja vastasyntyneen ulosteeksi vastasyntyneen aikana.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Muutokset emättimen mikrobiomissa pPROM:n jälkeen verrattuna aikaisiin synnytyksiin
Aikaikkuna: Heinäkuuhun 2021 asti
|
Amplikonisekvenssivarianttien (ASV:iden) runsausmittaukset (laskurit) sekä ASV-summamäärät korkeammilla taksonomisilla tasoilla arvioidaan, jotta voidaan testata merkittäviä päällekkäisyyksiä tai eroja mikrobiyhteisön koostumuksessa eri näyteryhmissä.
Nämä parametrit analysoidaan kussakin tutkimusryhmässä, mukaan lukien pitkittäisanalyysit mahdollisten erojen havaitsemiseksi pPROM:n alkamisesta synnytyshetkeen tai myöhemmin (tutkimusryhmä) tai raskaudesta synnytykseen tai myöhemmin (kontrolliryhmä). ).
Lisäksi ASVs- ja ASV-summalaskuja verrataan tutkimuksen ja kontrolliryhmän välillä ennalta määrättyinä ajankohtina.
Huomattavasti runsaampien amplikonisekvenssivarianttien havaitseminen ryhmien välillä suoritetaan ja säädetyt P-arvot lasketaan käyttämällä Benjamini-Hochberg-menetelmää ja P-arvoilla tuettuja eroja.
|
Heinäkuuhun 2021 asti
|
|
Peräsuolen mikrobiomin muutokset pPROM:n jälkeen verrattuna aikaisiin synnytyksiin
Aikaikkuna: Heinäkuuhun 2021 asti
|
Amplikonisekvenssivarianttien (ASV:iden) runsausmittaukset (laskurit) sekä ASV-summamäärät korkeammilla taksonomisilla tasoilla arvioidaan, jotta voidaan testata merkittäviä päällekkäisyyksiä tai eroja mikrobiyhteisön koostumuksessa eri näyteryhmissä.
Nämä parametrit analysoidaan kussakin tutkimusryhmässä, mukaan lukien pitkittäisanalyysit mahdollisten erojen havaitsemiseksi pPROM:n alkamisesta synnytyshetkeen tai myöhemmin (tutkimusryhmä) tai raskaudesta synnytykseen tai myöhemmin (kontrolliryhmä). ).
Lisäksi ASVs- ja ASV-summalaskuja verrataan tutkimuksen ja kontrolliryhmän välillä ennalta määrättyinä ajankohtina.
Huomattavasti runsaampien amplikonisekvenssivarianttien havaitseminen ryhmien välillä suoritetaan ja säädetyt P-arvot lasketaan käyttämällä Benjamini-Hochberg-menetelmää ja P-arvoilla tuettuja eroja.
|
Heinäkuuhun 2021 asti
|
|
Muutokset istukan mikrobiomissa pPROM:n jälkeen verrattuna aikaisiin synnytyksiin
Aikaikkuna: Heinäkuuhun 2021 asti
|
Amplikonisekvenssivarianttien (ASV:iden) runsausmittaukset (laskurit) sekä ASV-summamäärät korkeammilla taksonomisilla tasoilla arvioidaan, jotta voidaan testata merkittäviä päällekkäisyyksiä tai eroja mikrobiyhteisön koostumuksessa eri näyteryhmissä.
Nämä parametrit analysoidaan kussakin tutkimusryhmässä, mukaan lukien pitkittäisanalyysit mahdollisten erojen havaitsemiseksi pPROM:n alkamisesta synnytyshetkeen tai myöhemmin (tutkimusryhmä) tai raskaudesta synnytykseen tai myöhemmin (kontrolliryhmä). ).
Lisäksi ASVs- ja ASV-summalaskuja verrataan tutkimuksen ja kontrolliryhmän välillä ennalta määrättyinä ajankohtina.
Huomattavasti runsaampien amplikonisekvenssivarianttien havaitseminen ryhmien välillä suoritetaan ja säädetyt P-arvot lasketaan käyttämällä Benjamini-Hochberg-menetelmää ja P-arvoilla tuettuja eroja.
|
Heinäkuuhun 2021 asti
|
|
Kohdun mikrobiomin muutokset pPROM:n jälkeen verrattuna aikaisiin synnytyksiin
Aikaikkuna: Heinäkuuhun 2021 asti
|
Amplikonisekvenssivarianttien (ASV:iden) runsausmittaukset (laskurit) sekä ASV-summamäärät korkeammilla taksonomisilla tasoilla arvioidaan, jotta voidaan testata merkittäviä päällekkäisyyksiä tai eroja mikrobiyhteisön koostumuksessa eri näyteryhmissä.
Nämä parametrit analysoidaan kussakin tutkimusryhmässä, mukaan lukien pitkittäisanalyysit mahdollisten erojen havaitsemiseksi pPROM:n alkamisesta synnytyshetkeen tai myöhemmin (tutkimusryhmä) tai raskaudesta synnytykseen tai myöhemmin (kontrolliryhmä). ).
Lisäksi ASVs- ja ASV-summalaskuja verrataan tutkimuksen ja kontrolliryhmän välillä ennalta määrättyinä ajankohtina.
Huomattavasti runsaampien amplikonisekvenssivarianttien havaitseminen ryhmien välillä suoritetaan ja säädetyt P-arvot lasketaan käyttämällä Benjamini-Hochberg-menetelmää ja P-arvoilla tuettuja eroja.
|
Heinäkuuhun 2021 asti
|
|
Muutokset pPROM:n jälkeen syntyneiden vastasyntyneiden mikrobiomissa verrattuna vastasyntyneisiin, jotka kokevat aikasynnytyksen
Aikaikkuna: Heinäkuuhun 2021 asti
|
Amplikonisekvenssivarianttien (ASV:iden) runsausmittaukset (laskurit) sekä ASV-summamäärät korkeammilla taksonomisilla tasoilla arvioidaan, jotta voidaan testata merkittäviä päällekkäisyyksiä tai eroja mikrobiyhteisön koostumuksessa eri näyteryhmissä.
Nämä parametrit analysoidaan kussakin tutkimusryhmässä, mukaan lukien pitkittäisanalyysit mahdollisten erojen havaitsemiseksi pPROM:n alkamisesta synnytyshetkeen tai myöhemmin (tutkimusryhmä) tai raskaudesta synnytykseen tai myöhemmin (kontrolliryhmä). ).
Lisäksi ASVs- ja ASV-summalaskuja verrataan tutkimuksen ja kontrolliryhmän välillä ennalta määrättyinä ajankohtina.
Huomattavasti runsaampien amplikonisekvenssivarianttien havaitseminen ryhmien välillä suoritetaan ja säädetyt P-arvot lasketaan käyttämällä Benjamini-Hochberg-menetelmää ja P-arvoilla tuettuja eroja.
|
Heinäkuuhun 2021 asti
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Alex Farr, MD PhD, Medical University of Vienna
- Opintojen puheenjohtaja: Herbert Kiss, MD MBA, Medical University of Vienna
- Opintojen puheenjohtaja: Angelika Berger, MD MBA, Medical University of Vienna
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature. 2012 Jun 13;486(7402):207-14. doi: 10.1038/nature11234.
- Jovel J, Patterson J, Wang W, Hotte N, O'Keefe S, Mitchel T, Perry T, Kao D, Mason AL, Madsen KL, Wong GK. Characterization of the Gut Microbiome Using 16S or Shotgun Metagenomics. Front Microbiol. 2016 Apr 20;7:459. doi: 10.3389/fmicb.2016.00459. eCollection 2016.
- Dominguez-Bello MG, Costello EK, Contreras M, Magris M, Hidalgo G, Fierer N, Knight R. Delivery mode shapes the acquisition and structure of the initial microbiota across multiple body habitats in newborns. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Jun 29;107(26):11971-5. doi: 10.1073/pnas.1002601107. Epub 2010 Jun 21.
- Brown RG, Marchesi JR, Lee YS, Smith A, Lehne B, Kindinger LM, Terzidou V, Holmes E, Nicholson JK, Bennett PR, MacIntyre DA. Vaginal dysbiosis increases risk of preterm fetal membrane rupture, neonatal sepsis and is exacerbated by erythromycin. BMC Med. 2018 Jan 24;16(1):9. doi: 10.1186/s12916-017-0999-x.
- Chu DM, Ma J, Prince AL, Antony KM, Seferovic MD, Aagaard KM. Maturation of the infant microbiome community structure and function across multiple body sites and in relation to mode of delivery. Nat Med. 2017 Mar;23(3):314-326. doi: 10.1038/nm.4272. Epub 2017 Jan 23.
- Chu DM, Seferovic M, Pace RM, Aagaard KM. The microbiome in preterm birth. Best Pract Res Clin Obstet Gynaecol. 2018 Oct;52:103-113. doi: 10.1016/j.bpobgyn.2018.03.006. Epub 2018 Apr 9.
- Klindworth A, Pruesse E, Schweer T, Peplies J, Quast C, Horn M, Glockner FO. Evaluation of general 16S ribosomal RNA gene PCR primers for classical and next-generation sequencing-based diversity studies. Nucleic Acids Res. 2013 Jan 7;41(1):e1. doi: 10.1093/nar/gks808. Epub 2012 Aug 28.
- Gosmann C, Anahtar MN, Handley SA, Farcasanu M, Abu-Ali G, Bowman BA, Padavattan N, Desai C, Droit L, Moodley A, Dong M, Chen Y, Ismail N, Ndung'u T, Ghebremichael MS, Wesemann DR, Mitchell C, Dong KL, Huttenhower C, Walker BD, Virgin HW, Kwon DS. Lactobacillus-Deficient Cervicovaginal Bacterial Communities Are Associated with Increased HIV Acquisition in Young South African Women. Immunity. 2017 Jan 17;46(1):29-37. doi: 10.1016/j.immuni.2016.12.013. Epub 2017 Jan 10.
- O'Hanlon DE, Moench TR, Cone RA. In vaginal fluid, bacteria associated with bacterial vaginosis can be suppressed with lactic acid but not hydrogen peroxide. BMC Infect Dis. 2011 Jul 19;11:200. doi: 10.1186/1471-2334-11-200.
- Callahan BJ, DiGiulio DB, Goltsman DSA, Sun CL, Costello EK, Jeganathan P, Biggio JR, Wong RJ, Druzin ML, Shaw GM, Stevenson DK, Holmes SP, Relman DA. Replication and refinement of a vaginal microbial signature of preterm birth in two racially distinct cohorts of US women. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Sep 12;114(37):9966-9971. doi: 10.1073/pnas.1705899114. Epub 2017 Aug 28.
- Brown RG, Al-Memar M, Marchesi JR, Lee YS, Smith A, Chan D, Lewis H, Kindinger L, Terzidou V, Bourne T, Bennett PR, MacIntyre DA. Establishment of vaginal microbiota composition in early pregnancy and its association with subsequent preterm prelabor rupture of the fetal membranes. Transl Res. 2019 May;207:30-43. doi: 10.1016/j.trsl.2018.12.005. Epub 2018 Dec 27.
- Stout MJ, Zhou Y, Wylie KM, Tarr PI, Macones GA, Tuuli MG. Early pregnancy vaginal microbiome trends and preterm birth. Am J Obstet Gynecol. 2017 Sep;217(3):356.e1-356.e18. doi: 10.1016/j.ajog.2017.05.030. Epub 2017 May 23.
- Thorsen J, Brejnrod A, Mortensen M, Rasmussen MA, Stokholm J, Al-Soud WA, Sorensen S, Bisgaard H, Waage J. Large-scale benchmarking reveals false discoveries and count transformation sensitivity in 16S rRNA gene amplicon data analysis methods used in microbiome studies. Microbiome. 2016 Nov 25;4(1):62. doi: 10.1186/s40168-016-0208-8.
- Davis NM, Proctor DM, Holmes SP, Relman DA, Callahan BJ. Simple statistical identification and removal of contaminant sequences in marker-gene and metagenomics data. Microbiome. 2018 Dec 17;6(1):226. doi: 10.1186/s40168-018-0605-2.
- Pruesse E, Peplies J, Glockner FO. SINA: accurate high-throughput multiple sequence alignment of ribosomal RNA genes. Bioinformatics. 2012 Jul 15;28(14):1823-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bts252. Epub 2012 May 3.
- Quast C, Pruesse E, Yilmaz P, Gerken J, Schweer T, Yarza P, Peplies J, Glockner FO. The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web-based tools. Nucleic Acids Res. 2013 Jan;41(Database issue):D590-6. doi: 10.1093/nar/gks1219. Epub 2012 Nov 28.
- Callahan BJ, McMurdie PJ, Rosen MJ, Han AW, Johnson AJ, Holmes SP. DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nat Methods. 2016 Jul;13(7):581-3. doi: 10.1038/nmeth.3869. Epub 2016 May 23.
- Herbold CW, Pelikan C, Kuzyk O, Hausmann B, Angel R, Berry D, Loy A. Corrigendum: A flexible and economical barcoding approach for highly multiplexed amplicon sequencing of diverse target genes. Front Microbiol. 2016 Jun 6;7:870. doi: 10.3389/fmicb.2016.00870. eCollection 2016.
- Huurre A, Kalliomaki M, Rautava S, Rinne M, Salminen S, Isolauri E. Mode of delivery - effects on gut microbiota and humoral immunity. Neonatology. 2008;93(4):236-40. doi: 10.1159/000111102. Epub 2007 Nov 16.
- Mueller NT, Bakacs E, Combellick J, Grigoryan Z, Dominguez-Bello MG. The infant microbiome development: mom matters. Trends Mol Med. 2015 Feb;21(2):109-17. doi: 10.1016/j.molmed.2014.12.002. Epub 2014 Dec 11.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 1668/2020
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Emättimen mikrobiomi
-
Rambam Health Care CampusAktiivinen, ei rekrytointi
-
Hospices Civils de LyonValmisAnterior prolapsin leikkaus käyttämällä transobturaattorin korjausta, jonka on valmistanut Vaginal PlastronRanska
-
NorthShore University HealthSystemEi vielä rekrytointiaLeikkauksen jälkeinen virtsanpidätys | Lantion korjaava kirurgia | Sacrospinous vaginal Vault Suspension