조산의 마이크로바이옴

총 100명의 연구 참가자가 포함되어 다음 그룹 중 하나에 할당됩니다.

스터디 그룹:

• 이 그룹은 임신 22+5주에서 28+0주 사이에 pPROM을 경험한 50명의 임산부로 구성되며, 1차 연구 사이트에 있거나 다른 병원에서 의뢰되어 제왕절개로 조기 분만을 합니다.

대조군:

• 이 그룹은 임신 32+0~37+0주 사이에 1차 연구 기관의 외래 부서에서 선택적 제왕절개를 예정하고 제왕절개를 통해 만삭 분만하는 50명의 임산부로 구성됩니다.

신병 모집:

모든 환자 모집은 비엔나 의과 대학 산부인과에서 이루어집니다. 연구 그룹의 여성은 외부 병원에서 추천되거나 어떤 이유로든 우리 부서에 참석할 것입니다. pPROM의 확인은 검경 검사 및 양수 고임의 감지에 의해 수행됩니다. 결과가 불분명한 경우 효소 검사(예: Amnisure®, QUIAGEN Sciences, LLC; Germantown, MD 20874, USA)를 실시합니다. pPROM 확인 후 포함 기준을 충족하는 여성에게 연구 참여가 제안됩니다. 어떤 이유로든 제왕절개가 아닌 자연 분만을 경험한 분은 탈락자로 간주됩니다. 통제 그룹의 여성은 학기에 예정된 선택적 제왕절개(연구의 제외 기준을 충족하지 않는 어떤 이유로든)를 위한 일상적인 프리젠테이션 중에 모집됩니다. 만기에 선택적 제왕절개를 예정하고 있지만 조산을 경험한 사람은 중도 탈락한 것으로 간주됩니다. 외래환자 부서에서 상담하는 동안 이 여성들은 연구에 참여하도록 제안될 것입니다.

견본 추출:

모든 면봉은 표준화된 절차를 사용하여 이 연구의 하위 조사자로부터 수집됩니다. 익명화를 위해 채취 시점, 위치, 병동만 면봉 튜브에 표시합니다. 정보에 입각한 동의 후, 상피 브러시와 결합된 멸균 면봉을 사용하여 외측 질벽과 후방 질궁에서 검경 검사 중에 질 면봉을 수집합니다. 멸균 면봉을 항문 괄약근에 삽입하여 직장 면봉을 채취합니다. 태반과 자궁강의 수술 중 면봉은 무균 상태에서 제왕 절개 중에 수집됩니다. 신생아 면봉(구강 점막 및 피부)은 분만 직후 및 신생아기에 수집됩니다. 대변 ​​샘플은 태변(태변)에서 채취하며, 이는 유아의 첫 번째 대변과 신생아 시기의 신생아 대변으로 정의됩니다. 모든 검체는 수집 후 즉시 -80°C에서 보관됩니다. 상피 브러시를 RNAlater® RNA 안정화 용액에 넣고 -80°C에서 보관합니다.

마이크로바이옴 분석:

마이크로바이옴 분석은 비엔나 의과대학과 비엔나 대학교의 JMF(Joint Microbiome Facility)에서 수행됩니다. 테스트는 JMF의 하위 조사관이 수행합니다. 수집된 대변 면봉 샘플의 미생물 군집 구성은 16S rRNA 유전자 앰플리콘 시퀀싱에 의해 결정됩니다. 간단히 말해, DNA는 QIAamp Microbiome Kit 또는 QIAamp DNA Mini Kit(각각 면봉 및 대변 샘플용)를 사용하여 추출한 다음 이전에 설명한 대로 16S rRNA 유전자 증폭 및 바코드화를 수행합니다. JMF의 Illumina MiSeq 플랫폼에서 시퀀싱된 다중 앰플리콘 샘플. DNA 추출 및 16S rRNA 유전자 증폭 중에 수행되는 음성 대조군은 시료 처리 작업 흐름에 일상적으로 포함됩니다. 획득한 시퀀스 데이터는 품질 필터링 및 역다중화되고 DADA2,16를 사용한 ASV(amplicon sequencing variant) 추론을 통해 가능한 가장 높은 분류학적 분해능에서 분석할 수 있습니다. 생성된 ASV 서열은 SILVA SSU rRNA 데이터베이스의 최신 릴리스와 함께 SINA를 사용하여 분류학적으로 분류됩니다. 필요한 경우 decontam 소프트웨어 패키지를 사용하여 in silico에서 오염 물질을 제거합니다.

주산기 데이터:

면봉 채취 및 분석 외에도 PIA Fetal Database, 버전 5.6.16.917(GE Viewpoint, Munich, Germany)을 사용하여 다음과 같은 주산기 매개변수를 수집합니다. /아니요], 민족[범주], 관계 상태[범주], 체질량 지수[숫자], 니코틴 남용[예/아니요], pPROM 병력[예/아니요], PTB 병력[예/아니요], 기존 질병 [카테고리], 질 감염 선별검사 [예/아니오], 자궁경부 부전 [예/아니오], 자간전증 [예/아니오], 출혈 [예/아니오], 산전 스테로이드 예방 [예/아니오], 지속적인 항생제 치료 [예/아니오] 아니요], tocolysis [예/아니요], 마그네슘 예방 [예/아니요], 분만 시 임신 주수 [숫자], 출생 체중 [숫자], 1/5/10분의 아프가 점수 [숫자], 제대 동맥 pH [숫자] ], 신생아 중환자실로 이송 [예/아니오].