早产中的微生物组

总共将包括 100 名研究参与者，分配到以下组之一：

学习小组：

• 该组将由 50 名孕妇组成，她们在 22+5 和 28+0 妊娠周之间经历过 pPROM，要么出现在主要研究地点，要么从其他医院转诊，并通过剖宫产早产。

控制组：

• 该组将由50 名孕妇组成，她们计划在主要研究地点的门诊部进行择期剖宫产，孕周在32+0 和37+0 之间，并通过剖宫产足月分娩。

招聘：

所有患者的招募将在维也纳医科大学妇产科进行。 研究组中的女性将从外部医院转诊或出于任何原因出现在我们部门。 pPROM 的验证将通过窥镜检查和检测羊水汇集来进行。 如果发现不明确，将进行酶促测试（例如，Amnisure®, QUIAGEN Sciences, LLC；Germantown, MD 20874, USA）。 在 pPROM 验证之后，符合纳入标准的女性将被邀请参加该研究。 由于任何原因经历自然阴道分娩而不是剖腹产的人将被视为辍学。 对照组中的妇女将在她们定期进行择期剖宫产（出于任何不符合研究排除标准的原因）的例行报告期间被招募，该计划将在足月进行。 足月择期剖腹产但发生早产者，视为辍学。 在门诊部会诊期间，这些女性将被邀请参加该研究。

采样：

所有拭子将使用标准化程序从本研究的子调查员处收集。 为匿名化，拭子管上只会标注采集时间点、地点和病房。 在知情同意后，将在窥器检查期间使用无菌棉签结合上皮刷从阴道外侧壁和阴道后穹窿收集阴道拭子。 通过将无菌拭子插入肛门括约肌来收集直肠拭子。 将在无菌条件下在剖腹产期间收集胎盘和子宫腔的术中拭子。 新生儿拭子（口腔粘膜和皮肤）将在分娩后和新生儿期直接采集。 粪便样本将从胎粪中采集，胎粪被定义为婴儿的第一次粪便和新生儿期新生儿的粪便。 所有标本在采集后将立即储存在-80°C。 将上皮刷放入 RNAlater® RNA 稳定溶液中并在-80°C 下保存。

微生物组分析：

微生物组分析将在维也纳医科大学和维也纳大学的联合微生物组设施 (JMF) 进行。 测试将由 JMF 的子调查员进行。 收集的粪便拭子样本中的微生物群落组成将通过 16S rRNA 基因扩增子测序确定。 简而言之，将使用 QIAamp Microbiome Kit 或 QIAamp DNA Mini Kit（分别用于拭子和粪便样本）提取 DNA，然后如前所述进行 16S rRNA 基因扩增和条形码编码。 在 JMF 的 Illumina MiSeq 平台上测序的多重扩增子样本。 在 DNA 提取和 16S rRNA 基因扩增过程中进行的阴性对照通常包含在样品处理工作流程中。 获得的序列数据将经过质量过滤和多路分解，然后使用 DADA2,16 进行扩增子测序变体 (ASV) 推断，从而能够以尽可能高的分类分辨率进行分析。 生成的 ASV 序列将使用 SINA 和最新发布的 SILVA SSU rRNA 数据库进行分类学分类。 如有必要，将使用 decontam 软件包在计算机中去除污染物。

围产期数据：

除了拭子取样和分析外，还将使用 PIA 胎儿数据库 5.6.16.917 版（GE Viewpoint，德国慕尼黑）收集以下围产期参数：产妇年龄[人数]、产次[人数]、高等教育[是/否]、种族[类别]、关系状态[类别]、体重指数[数量]、尼古丁滥用[是/否]、pPROM 病史[是/否]、PTB 病史[是/否]、既往疾病[类别]、阴道感染筛查[是/否]、宫颈机能不全[是/否]、先兆子痫[是/否]、出血[是/否]、产前类固醇预防[是/否]、正在进行的抗生素治疗[是/否]、安胎药 [是/否]、镁预防 [是/否]、分娩时的孕周 [人数]、出生体重 [人数]、1/5/10 分钟 Apgar 评分 [人数]、脐带动脉 pH [人数]，转移到新生儿重症监护病房[是/否]。