胸膜感染症の微生物学 (TORPIDS)
次世代シーケンスを使用した胸膜感染症の細菌学: オックスフォード胸膜感染症メタゲノミクス研究 (TORPIDS)
胸膜感染症 (PI) は、罹患率と死亡率が非常に高い、一般的で重篤かつ複雑な疾患です。 (1,2) 胸膜感染微生物学の知識は依然として不完全です。 細菌の 16S rRNA 遺伝子の配列決定は、複雑なサンプルの全マイクロバイオームを発見するための信頼できる方法論です。
研究者らは、胸膜感染症の細菌学を研究するトランスレーショナルメタゲノミクス研究を設計した。 研究者らは、a)「胸膜感染症の成人患者におけるRAPID臨床リスク予測スコアの前向き検証：PILOT研究」(3)臨床試験、およびb)非胸膜感染症患者からの胸水検体を使用する。 胸水標本は 16S rRNA 次世代シーケンスに供されます。
調査の概要
詳細な説明
胸膜感染症 (PI) は、罹患率と死亡率がかなり高い、一般的で重篤かつ複雑な疾患です 1,2。 患者は、感染した体液の胸水を発症します。 胸膜感染症マイクロバイオームを理解することで患者の臨床管理が改善される可能性がありますが、知識は依然として不完全です。 細菌の 16S rRNA 遺伝子の配列決定は、複雑なサンプルのマイクロバイオーム全体を発見するための信頼できる方法論です。
研究者らは、胸膜感染症の細菌学を研究するトランスレーショナル研究を計画した。 a) 「成人胸膜感染患者における RAPID 臨床リスク予測スコアの前向き検証: PILOT 研究」(3) 臨床試験、および b) 非胸膜感染患者からの胸水検体は、細菌 DNA 抽出の対象となります。 16S rRNA 次世代シーケンス。 さらに研究者らは、細菌のパターンと生存、入院期間、手術の必要性などの重要な臨床転帰との関連性を研究する予定だ。
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
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Oxfordshire
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Oxford、Oxfordshire、イギリス、OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
- 胸膜感染症患者（PILOTコホート）
- 胸水はあるが胸膜感染症のない患者（陰性対照群）
説明
胸水検体は、「成人胸膜感染症患者における RAPID 臨床リスク予測スコアの前向き検証: PILOT 研究」のために収集されました。 PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020。 研究者らはサンプルを遡及的に分析した。
包含基準:
- 「成人胸膜感染症患者における RAPID 臨床リスク予測スコアの前向き検証: PILOT 研究」のプロトコールに従って。 PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020
除外基準:
- 「成人胸膜感染症患者における RAPID 臨床リスク予測スコアの前向き検証: PILOT 研究」のプロトコールに従って。 PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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胸膜感染症
臨床的に確認された進行中の胸膜感染症の患者。
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適用できない。
観察研究。
サンプルの遡及分析。
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ネガティブコントロール
胸膜感染症のない患者。
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適用できない。
観察研究。
サンプルの遡及分析。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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マイクロバイオーム
時間枠：登録
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各サンプルのマイクロバイオームを発見する
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登録
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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細菌パターンと臨床転帰との関連性
時間枠：生存期間は12か月、外科的ドレナージが必要
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マイクロバイオームと臨床転帰との関連性を研究する
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生存期間は12か月、外科的ドレナージが必要
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協力者と研究者
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出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Davies HE, Davies RJ, Davies CW; BTS Pleural Disease Guideline Group. Management of pleural infection in adults: British Thoracic Society Pleural Disease Guideline 2010. Thorax. 2010 Aug;65 Suppl 2:ii41-53. doi: 10.1136/thx.2010.137000. No abstract available.
- Corcoran JP, Psallidas I, Gerry S, Piccolo F, Koegelenberg CF, Saba T, Daneshvar C, Fairbairn I, Heinink R, West A, Stanton AE, Holme J, Kastelik JA, Steer H, Downer NJ, Haris M, Baker EH, Everett CF, Pepperell J, Bewick T, Yarmus L, Maldonado F, Khan B, Hart-Thomas A, Hands G, Warwick G, De Fonseka D, Hassan M, Munavvar M, Guhan A, Shahidi M, Pogson Z, Dowson L, Popowicz ND, Saba J, Ward NR, Hallifax RJ, Dobson M, Shaw R, Hedley EL, Sabia A, Robinson B, Collins GS, Davies HE, Yu LM, Miller RF, Maskell NA, Rahman NM. Prospective validation of the RAPID clinical risk prediction score in adult patients with pleural infection: the PILOT study. Eur Respir J. 2020 Nov 26;56(5):2000130. doi: 10.1183/13993003.00130-2020. Print 2020 Nov. Erratum In: Eur Respir J. 2020 Dec 17;56(6):
- Corcoran JP, Wrightson JM, Belcher E, DeCamp MM, Feller-Kopman D, Rahman NM. Pleural infection: past, present, and future directions. Lancet Respir Med. 2015 Jul;3(7):563-77. doi: 10.1016/S2213-2600(15)00185-X.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
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