흉막 감염의 미생물학 (TORPIDS)
차세대 시퀀싱을 사용한 흉막 감염의 세균학: The Oxford Pleural Infection Metagenomics Studies(TORPIDS)
흉막 감염(PI)은 상당한 이환율과 사망률을 보이는 흔하고 심각하며 복잡한 질병입니다. (1,2) 흉막 감염 미생물학에 대한 지식은 불완전합니다. 박테리아 16S rRNA 유전자의 시퀀싱은 복잡한 샘플의 전체 미생물 군집을 발견하는 신뢰할 수 있는 방법론입니다.
연구자들은 흉막 감염의 세균학을 연구하기 위해 병진 metagenomics 연구를 설계했습니다. 조사관은 a) "흉막 감염이 있는 성인 환자의 RAPID 임상 위험 예측 점수의 전향적 검증: PILOT 연구"(3) 임상 시험 및 b) 비흉막 감염 환자의 흉수 표본을 사용할 것입니다. 흉막액 표본은 16S rRNA 차세대 시퀀싱을 받게 됩니다.
연구 개요
상세 설명
흉막 감염(PI)은 상당한 이환율과 사망률을 보이는 흔하고 심각하며 복잡한 질병입니다1,2. 환자는 솔직히 감염된 유체의 흉막 삼출액을 개발합니다. 흉막 감염 마이크로바이옴에 대한 이해는 환자 임상 관리를 개선할 수 있지만 지식은 불완전합니다. 박테리아 16S rRNA 유전자의 시퀀싱은 복잡한 샘플의 전체 미생물 군집을 발견하는 신뢰할 수 있는 방법론입니다.
연구자들은 흉막 감염의 세균학을 연구하기 위해 번역 연구를 설계했습니다. a) "성인 흉막 감염 환자의 RAPID 임상 위험 예측 점수의 전향적 검증: PILOT 연구"(3) 임상 시험 및 b) 비흉막 감염 환자의 흉막액 표본은 박테리아 DNA 추출 후 16S rRNA 차세대 시퀀싱. 또한 연구자들은 박테리아 패턴과 생존, 입원 기간 및 수술 필요성을 포함한 중요한 임상 결과 사이의 연관성을 연구할 것입니다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Oxfordshire
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Oxford, Oxfordshire, 영국, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
샘플링 방법
연구 인구
- 흉막 감염 환자(PILOT 코호트)
- 흉막삼출액은 있으나 흉막감염은 없는 환자(음성대조군)
설명
흉막액 표본은 "성인 흉막 감염 환자의 RAPID 임상 위험 예측 점수의 전향적 검증: PILOT 연구"를 위해 수집되었습니다. PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020. 조사관은 샘플을 소급하여 분석했습니다.
포함 기준:
- "흉막 감염이 있는 성인 환자의 RAPID 임상 위험 예측 점수의 전향적 검증: PILOT 연구"의 프로토콜에 따름. PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020
제외 기준:
- "흉막 감염이 있는 성인 환자의 RAPID 임상 위험 예측 점수의 전향적 검증: PILOT 연구"의 프로토콜에 따름. PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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흉막 감염
진행 중인 흉막 감염이 임상적으로 확인된 환자.
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적용되지 않습니다.
관찰 연구.
샘플의 소급 분석.
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네거티브 컨트롤
흉막 감염이 없는 환자.
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적용되지 않습니다.
관찰 연구.
샘플의 소급 분석.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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마이크로바이옴
기간: 등록
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각 샘플의 마이크로바이옴 발견
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등록
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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박테리아 패턴과 임상 결과 간의 연관성
기간: 12개월 생존 및 외과적 배액 필요
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마이크로바이옴과 임상 결과 간의 연관성 연구
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12개월 생존 및 외과적 배액 필요
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공동 작업자 및 조사자
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Davies HE, Davies RJ, Davies CW; BTS Pleural Disease Guideline Group. Management of pleural infection in adults: British Thoracic Society Pleural Disease Guideline 2010. Thorax. 2010 Aug;65 Suppl 2:ii41-53. doi: 10.1136/thx.2010.137000. No abstract available.
- Corcoran JP, Psallidas I, Gerry S, Piccolo F, Koegelenberg CF, Saba T, Daneshvar C, Fairbairn I, Heinink R, West A, Stanton AE, Holme J, Kastelik JA, Steer H, Downer NJ, Haris M, Baker EH, Everett CF, Pepperell J, Bewick T, Yarmus L, Maldonado F, Khan B, Hart-Thomas A, Hands G, Warwick G, De Fonseka D, Hassan M, Munavvar M, Guhan A, Shahidi M, Pogson Z, Dowson L, Popowicz ND, Saba J, Ward NR, Hallifax RJ, Dobson M, Shaw R, Hedley EL, Sabia A, Robinson B, Collins GS, Davies HE, Yu LM, Miller RF, Maskell NA, Rahman NM. Prospective validation of the RAPID clinical risk prediction score in adult patients with pleural infection: the PILOT study. Eur Respir J. 2020 Nov 26;56(5):2000130. doi: 10.1183/13993003.00130-2020. Print 2020 Nov. Erratum In: Eur Respir J. 2020 Dec 17;56(6):
- Corcoran JP, Wrightson JM, Belcher E, DeCamp MM, Feller-Kopman D, Rahman NM. Pleural infection: past, present, and future directions. Lancet Respir Med. 2015 Jul;3(7):563-77. doi: 10.1016/S2213-2600(15)00185-X.
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
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마지막으로 확인됨
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