胸膜感染的微生物学 (TORPIDS)
使用下一代测序的胸膜感染细菌学:牛津胸膜感染宏基因组学研究 (TORPIDS)
胸膜感染 (PI) 是一种常见、严重且复杂的疾病,具有相当高的发病率和死亡率。 (1,2) 胸膜感染微生物学知识仍然不完整。 细菌 16S rRNA 基因的测序是发现复杂样品的总微生物组的可靠方法。
研究人员设计了一项转化宏基因组学研究来研究胸膜感染的细菌学。 研究人员将使用来自 a)“成人胸膜感染患者 RAPID 临床风险预测评分的前瞻性验证:PILOT 研究”(3) 临床试验和 b) 非胸膜感染患者的胸水标本。 胸水标本将进行 16S rRNA 下一代测序。
研究概览
详细说明
胸膜感染 (PI) 是一种常见、严重且复杂的疾病,具有相当高的发病率和死亡率 1,2。 患者出现明显感染液体的胸腔积液。 了解胸膜感染微生物组可以改善患者的临床管理,但知识仍然不完整。 细菌 16S rRNA 基因的测序是发现复杂样品的总微生物组的可靠方法。
研究人员设计了一项转化研究来研究胸膜感染的细菌学。 来自 a)“成人胸膜感染患者 RAPID 临床风险预测评分的前瞻性验证:PILOT 研究”(3) 临床试验和 b) 非胸膜感染患者的胸水样本将接受细菌 DNA 提取,然后进行16S rRNA 下一代测序。 此外,研究人员将研究细菌模式与重要临床结果(包括存活率、住院时间和手术需求)之间的关系。
研究类型
注册 (实际的)
联系人和位置
学习地点
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Oxfordshire
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Oxford、Oxfordshire、英国、OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
- 胸膜感染患者(试点队列)
- 有胸腔积液但无胸膜感染者(阴性对照组)
描述
收集胸腔积液标本用于“成人胸膜感染患者 RAPID 临床风险预测评分的前瞻性验证:PILOT 研究”。 PMID:32675200 DOI:10.1183/13993003.00130-2020。 研究人员对样本进行了回顾性分析。
纳入标准:
- 根据“成人胸膜感染患者 RAPID 临床风险预测评分的前瞻性验证:PILOT 研究”的方案。 PMID:32675200 DOI:10.1183/13993003.00130-2020
排除标准:
- 根据“成人胸膜感染患者 RAPID 临床风险预测评分的前瞻性验证:PILOT 研究”的方案。 PMID:32675200 DOI:10.1183/13993003.00130-2020
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
|---|---|
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胸膜感染
临床证实持续性胸膜感染的患者。
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不适用。
观察性研究。
样品的回顾性分析。
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阴性对照
无胸膜感染的患者。
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不适用。
观察性研究。
样品的回顾性分析。
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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微生物组
大体时间:招生
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发现每个样品的微生物组
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招生
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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细菌模式与临床结果之间的关联
大体时间:生存期 12 个月,需要手术引流
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研究微生物组与临床结果之间的关联
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生存期 12 个月,需要手术引流
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合作者和调查者
出版物和有用的链接
一般刊物
- Davies HE, Davies RJ, Davies CW; BTS Pleural Disease Guideline Group. Management of pleural infection in adults: British Thoracic Society Pleural Disease Guideline 2010. Thorax. 2010 Aug;65 Suppl 2:ii41-53. doi: 10.1136/thx.2010.137000. No abstract available.
- Corcoran JP, Psallidas I, Gerry S, Piccolo F, Koegelenberg CF, Saba T, Daneshvar C, Fairbairn I, Heinink R, West A, Stanton AE, Holme J, Kastelik JA, Steer H, Downer NJ, Haris M, Baker EH, Everett CF, Pepperell J, Bewick T, Yarmus L, Maldonado F, Khan B, Hart-Thomas A, Hands G, Warwick G, De Fonseka D, Hassan M, Munavvar M, Guhan A, Shahidi M, Pogson Z, Dowson L, Popowicz ND, Saba J, Ward NR, Hallifax RJ, Dobson M, Shaw R, Hedley EL, Sabia A, Robinson B, Collins GS, Davies HE, Yu LM, Miller RF, Maskell NA, Rahman NM. Prospective validation of the RAPID clinical risk prediction score in adult patients with pleural infection: the PILOT study. Eur Respir J. 2020 Nov 26;56(5):2000130. doi: 10.1183/13993003.00130-2020. Print 2020 Nov. Erratum In: Eur Respir J. 2020 Dec 17;56(6):
- Corcoran JP, Wrightson JM, Belcher E, DeCamp MM, Feller-Kopman D, Rahman NM. Pleural infection: past, present, and future directions. Lancet Respir Med. 2015 Jul;3(7):563-77. doi: 10.1016/S2213-2600(15)00185-X.
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (实际的)
研究完成 (实际的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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