Keuhkopussin infektion mikrobiologia (TORPIDS)
Keuhkopussin infektion bakteriologia seuraavan sukupolven sekvensointia käyttämällä: Oxfordin keuhkopussin infektion metagenomiikkatutkimukset (TORPIDS)
Keuhkopussin infektio (PI) on yleinen, vakava ja monimutkainen sairaus, jolla on huomattava sairastuvuus ja kuolleisuus. (1,2) Tieto keuhkopussin infektioiden mikrobiologiasta on edelleen epätäydellinen. Bakteerien 16S-rRNA-geenin sekvensointi on luotettava menetelmä monimutkaisten näytteiden kokonaismikrobiomin löytämiseksi.
Tutkijat suunnittelivat translaatiometagenomiikan tutkimuksen tutkiakseen keuhkopussin infektion bakteriologiaa. Tutkijat käyttävät keuhkopussin nestenäytteitä a) "kliinisen RAPID-riskin ennustamispistemäärän tulevasta validoinnista aikuispotilailla, joilla on keuhkopussin tulehdus: PILOT-tutkimus" (3) kliinisestä tutkimuksesta ja b) ei-keuhkopussin infektiopotilaista. Keuhkopussin nestenäytteille suoritetaan seuraavan sukupolven 16S rRNA:n sekvensointi.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Keuhkopussin infektio (PI) on yleinen, vakava ja monimutkainen sairaus, jolla on huomattava sairastuvuus ja kuolleisuus1,2. Potilaille kehittyy keuhkopussin effuusiota suoraan infektoituneesta nesteestä. Keuhkopussin infektion mikrobiomin ymmärtäminen voisi parantaa potilaan kliinistä hoitoa, mutta tieto on edelleen epätäydellinen. Bakteerien 16S-rRNA-geenin sekvensointi on luotettava menetelmä monimutkaisten näytteiden kokonaismikrobiomin löytämiseksi.
Tutkijat suunnittelivat translaatiotutkimuksen keuhkopussin infektion bakteriologian tutkimiseksi. Keuhkopussin nestenäytteet a) "kliinisen RAPID-riskin ennustepisteiden tuleva validointi aikuispotilailla, joilla on keuhkopussin tulehdus: PILOT-tutkimus" (3) kliinisestä tutkimuksesta ja b) potilaista, joilla ei ole keuhkopussin infektiota, tehdään bakteeri-DNA-uutto ja sen jälkeen 16S rRNA:n seuraavan sukupolven sekvensointi. Lisäksi tutkijat tutkivat yhteyttä bakteerikuvioiden ja tärkeiden kliinisten tulosten välillä, mukaan lukien eloonjääminen, sairaalahoidon kesto ja leikkauksen tarve.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
Oxfordshire
-
Oxford, Oxfordshire, Yhdistynyt kuningaskunta, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
- Potilaat, joilla on keuhkopussin tulehdus (PILOT-kohortti)
- Potilaat, joilla on keuhkopussin effuusio, mutta ilman keuhkopussin infektiota (negatiivinen kontrolliryhmä)
Kuvaus
Keuhkopussin nestenäytteet kerättiin "RAPID-kliinisen riskiennustepisteiden tulevaa validointia varten aikuispotilailla, joilla on keuhkopussin tulehdus: PILOT-tutkimus". PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020. Tutkijat analysoivat näytteet takautuvasti.
Sisällyttämiskriteerit:
- PILOT-tutkimuksen "RAPID-kliinisen riskiennustepisteiden mahdollinen validointi aikuispotilailla, joilla on keuhkopussin tulehdus" -protokollan mukaisesti. PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020
Poissulkemiskriteerit:
- PILOT-tutkimuksen "RAPID-kliinisen riskiennustepisteiden mahdollinen validointi aikuispotilailla, joilla on keuhkopussin tulehdus" -protokollan mukaisesti. PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Keuhkopussin infektio
Potilaat, joilla on kliinisesti varmistettu meneillään oleva pleuratulehdus.
|
Ei sovellettavissa.
Havainnointitutkimus.
Näytteiden retrospektiivinen analyysi.
|
|
Negatiivinen kontrolli
Potilaat, joilla ei ole pleuratulehdusta.
|
Ei sovellettavissa.
Havainnointitutkimus.
Näytteiden retrospektiivinen analyysi.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Mikrobiomi
Aikaikkuna: Ilmoittautuminen
|
Tutustu kunkin näytteen mikrobiomiin
|
Ilmoittautuminen
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Bakteerimallien ja kliinisten tulosten välinen yhteys
Aikaikkuna: 12 kuukautta eloonjäämisaika ja vaatimus kirurgisesta tyhjennyksestä
|
Tutki mikrobiomin ja kliinisten tulosten välistä yhteyttä
|
12 kuukautta eloonjäämisaika ja vaatimus kirurgisesta tyhjennyksestä
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Davies HE, Davies RJ, Davies CW; BTS Pleural Disease Guideline Group. Management of pleural infection in adults: British Thoracic Society Pleural Disease Guideline 2010. Thorax. 2010 Aug;65 Suppl 2:ii41-53. doi: 10.1136/thx.2010.137000. No abstract available.
- Corcoran JP, Psallidas I, Gerry S, Piccolo F, Koegelenberg CF, Saba T, Daneshvar C, Fairbairn I, Heinink R, West A, Stanton AE, Holme J, Kastelik JA, Steer H, Downer NJ, Haris M, Baker EH, Everett CF, Pepperell J, Bewick T, Yarmus L, Maldonado F, Khan B, Hart-Thomas A, Hands G, Warwick G, De Fonseka D, Hassan M, Munavvar M, Guhan A, Shahidi M, Pogson Z, Dowson L, Popowicz ND, Saba J, Ward NR, Hallifax RJ, Dobson M, Shaw R, Hedley EL, Sabia A, Robinson B, Collins GS, Davies HE, Yu LM, Miller RF, Maskell NA, Rahman NM. Prospective validation of the RAPID clinical risk prediction score in adult patients with pleural infection: the PILOT study. Eur Respir J. 2020 Nov 26;56(5):2000130. doi: 10.1183/13993003.00130-2020. Print 2020 Nov. Erratum In: Eur Respir J. 2020 Dec 17;56(6):
- Corcoran JP, Wrightson JM, Belcher E, DeCamp MM, Feller-Kopman D, Rahman NM. Pleural infection: past, present, and future directions. Lancet Respir Med. 2015 Jul;3(7):563-77. doi: 10.1016/S2213-2600(15)00185-X.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 248005
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .