Mikrobiologia zakażenia opłucnej (TORPIDS)
Bakteriologia infekcji opłucnej przy użyciu sekwencjonowania nowej generacji: badania metagenomiczne infekcji opłucnej w Oksfordzie (TORPIDS)
Zakażenie opłucnej (PI) jest powszechną, ciężką i skomplikowaną chorobą o znacznej zachorowalności i śmiertelności. (1,2) Wiedza na temat mikrobiologii zakażeń opłucnej pozostaje niepełna. Sekwencjonowanie bakteryjnego genu 16S rRNA to niezawodna metodologia odkrywania całego mikrobiomu złożonych próbek.
Badacze zaprojektowali translacyjne badanie metagenomiczne w celu zbadania bakteriologii infekcji opłucnej. Badacze wykorzystają próbki płynu opłucnowego z a) badania klinicznego „Prospective validation of the RAPID klinicznego wskaźnika przewidywania ryzyka u dorosłych pacjentów z zakażeniem opłucnej: badanie PILOT” (3) oraz b) pacjentów z zakażeniem innym niż zapalenie opłucnej. Próbki płynu opłucnowego zostaną poddane sekwencjonowaniu nowej generacji 16S rRNA.
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Zakażenie opłucnej (PI) jest powszechną, ciężką i skomplikowaną chorobą o znacznej zachorowalności i śmiertelności1,2. U pacjentów rozwijają się wysięki opłucnowe zawierające płyn zakażony. Zrozumienie mikrobiomu zakażenia opłucnej może poprawić postępowanie kliniczne z pacjentem, jednak wiedza pozostaje niepełna. Sekwencjonowanie bakteryjnego genu 16S rRNA jest niezawodną metodologią odkrywania całego mikrobiomu złożonych próbek.
Badacze zaprojektowali badanie translacyjne w celu zbadania bakteriologii infekcji opłucnej. Próbki płynu opłucnowego z badania klinicznego „Prospective validation of RAPID klinicznego ryzyka przewidywania ryzyka u dorosłych pacjentów z zakażeniem opłucnej: badanie PILOT” (3) oraz b) pacjentów z zakażeniem niezwiązanym z opłucną zostaną poddane ekstrakcji bakteryjnego DNA, a następnie Sekwencjonowanie nowej generacji 16S rRNA. Ponadto badacze zbadają związek między wzorcami bakteryjnymi a ważnymi wynikami klinicznymi, w tym przeżyciem, czasem hospitalizacji i potrzebą operacji.
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
Oxfordshire
-
Oxford, Oxfordshire, Zjednoczone Królestwo, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
- Pacjenci z zakażeniem opłucnej (kohorta PILOT)
- Pacjenci z wysiękiem opłucnowym, ale bez zakażenia opłucnej (grupa kontrolna ujemna)
Opis
Próbki płynu opłucnowego pobrano do „Prospektywnej walidacji oceny ryzyka klinicznego RAPID u dorosłych pacjentów z zakażeniem opłucnej: badanie PILOT”. PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020. Badacze przeanalizowali próbki retrospektywnie.
Kryteria przyjęcia:
- Zgodnie z protokołem „Prospektywnej walidacji oceny ryzyka klinicznego RAPID u dorosłych pacjentów z zakażeniem opłucnej: badanie PILOT”. PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020
Kryteria wyłączenia:
- Zgodnie z protokołem „Prospektywnej walidacji oceny ryzyka klinicznego RAPID u dorosłych pacjentów z zakażeniem opłucnej: badanie PILOT”. PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Zakażenie opłucnej
Pacjenci z klinicznie potwierdzonym trwającym zakażeniem opłucnej.
|
Nie dotyczy.
Badania obserwacyjne.
Retrospektywna analiza próbek.
|
|
Negatywna kontrola
Pacjenci bez zakażenia opłucnej.
|
Nie dotyczy.
Badania obserwacyjne.
Retrospektywna analiza próbek.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Mikrobiom
Ramy czasowe: Zapisy
|
Odkryj mikrobiom każdej próbki
|
Zapisy
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Związek między wzorcami bakteryjnymi a wynikami klinicznymi
Ramy czasowe: 12 miesięcy na przeżycie i konieczność drenażu chirurgicznego
|
Zbadaj związek między mikrobiomem a wynikami klinicznymi
|
12 miesięcy na przeżycie i konieczność drenażu chirurgicznego
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Davies HE, Davies RJ, Davies CW; BTS Pleural Disease Guideline Group. Management of pleural infection in adults: British Thoracic Society Pleural Disease Guideline 2010. Thorax. 2010 Aug;65 Suppl 2:ii41-53. doi: 10.1136/thx.2010.137000. No abstract available.
- Corcoran JP, Psallidas I, Gerry S, Piccolo F, Koegelenberg CF, Saba T, Daneshvar C, Fairbairn I, Heinink R, West A, Stanton AE, Holme J, Kastelik JA, Steer H, Downer NJ, Haris M, Baker EH, Everett CF, Pepperell J, Bewick T, Yarmus L, Maldonado F, Khan B, Hart-Thomas A, Hands G, Warwick G, De Fonseka D, Hassan M, Munavvar M, Guhan A, Shahidi M, Pogson Z, Dowson L, Popowicz ND, Saba J, Ward NR, Hallifax RJ, Dobson M, Shaw R, Hedley EL, Sabia A, Robinson B, Collins GS, Davies HE, Yu LM, Miller RF, Maskell NA, Rahman NM. Prospective validation of the RAPID clinical risk prediction score in adult patients with pleural infection: the PILOT study. Eur Respir J. 2020 Nov 26;56(5):2000130. doi: 10.1183/13993003.00130-2020. Print 2020 Nov. Erratum In: Eur Respir J. 2020 Dec 17;56(6):
- Corcoran JP, Wrightson JM, Belcher E, DeCamp MM, Feller-Kopman D, Rahman NM. Pleural infection: past, present, and future directions. Lancet Respir Med. 2015 Jul;3(7):563-77. doi: 10.1016/S2213-2600(15)00185-X.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 248005
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .