La microbiologia dell'infezione pleurica (TORPIDS)
La batteriologia dell'infezione pleurica utilizzando il sequenziamento di nuova generazione: gli studi sulla metagenomica dell'infezione pleurica di Oxford (TORPIDS)
L'infezione pleurica (IP) è una malattia comune, grave e complicata con notevole morbilità e mortalità. (1,2) La conoscenza della microbiologia delle infezioni pleuriche rimane incompleta. Il sequenziamento del gene batterico 16S rRNA è una metodologia affidabile per scoprire il microbioma totale di campioni complessi.
I ricercatori hanno progettato uno studio di metagenomica traslazionale per studiare la batteriologia dell'infezione pleurica. Gli investigatori utilizzeranno campioni di liquido pleurico da a) la "Convalida prospettica del punteggio di previsione del rischio clinico RAPID in pazienti adulti con infezione pleurica: lo studio PILOT" (3) sperimentazione clinica eb) pazienti con infezione non pleurica. I campioni di liquido pleurico saranno sottoposti a sequenziamento di nuova generazione del 16S rRNA.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
L'infezione pleurica (PI) è una malattia comune, grave e complicata con notevole morbilità e mortalità1,2. I pazienti sviluppano versamenti pleurici di liquido francamente infetto. La comprensione del microbioma dell'infezione pleurica potrebbe migliorare la gestione clinica del paziente, tuttavia la conoscenza rimane incompleta. Il sequenziamento del gene batterico 16S rRNA è una metodologia affidabile per scoprire il microbioma totale di campioni complessi.
I ricercatori hanno progettato uno studio traslazionale per studiare la batteriologia dell'infezione pleurica. I campioni di liquido pleurico provenienti da a) la "Prospective validation of the RAPID Clinical Risk Prevision Score in Adult Patients with Pleural Infection: The PILOT Study" (3) trial clinico e b) i pazienti con infezione non pleurica saranno sottoposti a estrazione del DNA batterico seguita da Sequenziamento di nuova generazione dell'rRNA 16S. Inoltre, i ricercatori studieranno l'associazione tra modelli batterici e importanti esiti clinici tra cui la sopravvivenza, la durata del ricovero e la necessità di un intervento chirurgico.
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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Oxfordshire
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Oxford, Oxfordshire, Regno Unito, OX3 7FZ
- Laboratory of Pleural Translational Research, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
- Pazienti con infezione pleurica (coorte PILOTA)
- Pazienti con versamento pleurico ma senza infezione pleurica (gruppo di controllo negativo)
Descrizione
I campioni di liquido pleurico sono stati raccolti per la "Validazione prospettica del punteggio di previsione del rischio clinico RAPID in pazienti adulti con infezione pleurica: lo studio PILOT". PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020. I ricercatori hanno analizzato i campioni in modo retrospettivo.
Criterio di inclusione:
- Come da protocollo della "Validazione prospettica del punteggio di previsione del rischio clinico RAPID in pazienti adulti con infezione pleurica: lo studio PILOT". PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020
Criteri di esclusione:
- Come da protocollo della "Validazione prospettica del punteggio di previsione del rischio clinico RAPID in pazienti adulti con infezione pleurica: lo studio PILOT". PMID: 32675200 DOI: 10.1183/13993003.00130-2020
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Infezione pleurica
Pazienti con infezione pleurica in corso clinicamente confermata.
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Non applicabile.
Studio osservazionale.
Analisi retrospettiva dei campioni.
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Controllo negativo
Pazienti senza infezione pleurica.
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Non applicabile.
Studio osservazionale.
Analisi retrospettiva dei campioni.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Microbioma
Lasso di tempo: Iscrizione
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Scopri il microbioma di ciascun campione
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Iscrizione
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Associazione tra modelli batterici ed esiti clinici
Lasso di tempo: 12 mesi di sopravvivenza e necessità di drenaggio chirurgico
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Studiare l'associazione tra il microbioma e gli esiti clinici
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12 mesi di sopravvivenza e necessità di drenaggio chirurgico
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Davies HE, Davies RJ, Davies CW; BTS Pleural Disease Guideline Group. Management of pleural infection in adults: British Thoracic Society Pleural Disease Guideline 2010. Thorax. 2010 Aug;65 Suppl 2:ii41-53. doi: 10.1136/thx.2010.137000. No abstract available.
- Corcoran JP, Psallidas I, Gerry S, Piccolo F, Koegelenberg CF, Saba T, Daneshvar C, Fairbairn I, Heinink R, West A, Stanton AE, Holme J, Kastelik JA, Steer H, Downer NJ, Haris M, Baker EH, Everett CF, Pepperell J, Bewick T, Yarmus L, Maldonado F, Khan B, Hart-Thomas A, Hands G, Warwick G, De Fonseka D, Hassan M, Munavvar M, Guhan A, Shahidi M, Pogson Z, Dowson L, Popowicz ND, Saba J, Ward NR, Hallifax RJ, Dobson M, Shaw R, Hedley EL, Sabia A, Robinson B, Collins GS, Davies HE, Yu LM, Miller RF, Maskell NA, Rahman NM. Prospective validation of the RAPID clinical risk prediction score in adult patients with pleural infection: the PILOT study. Eur Respir J. 2020 Nov 26;56(5):2000130. doi: 10.1183/13993003.00130-2020. Print 2020 Nov. Erratum In: Eur Respir J. 2020 Dec 17;56(6):
- Corcoran JP, Wrightson JM, Belcher E, DeCamp MM, Feller-Kopman D, Rahman NM. Pleural infection: past, present, and future directions. Lancet Respir Med. 2015 Jul;3(7):563-77. doi: 10.1016/S2213-2600(15)00185-X.
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- 248005
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