結腸直腸 PC の腹腔微小環境の単一細胞トランスクリプトミクス (SingleCell)
結腸直腸腹膜癌の病因における腹膜微小環境の役割:単一細胞トランスクリプトミクス
調査の概要
詳細な説明
研究方法
患者を含める前に、研究者の安全を確保するために、患者はB型肝炎、C型肝炎、およびHIVの存在についてスクリーニングされます。 細胞減少手術中に、腫瘍組織の合計 5 つのサンプルが取得されます。 これらのサンプルのうち 3 つは ScRNASeq 分析に利用され、マクロ転移の 2 つのサンプルはスナップ凍結され、凍結保存されます。
単一細胞 RNA シーケンス解析 3 つのサンプル (そのうちの 1 つは大網に由来し、乳白色を含むことが望ましい) で単一細胞 RNA シーケンス (scRNAseq) を利用して、結腸直腸癌の腹膜転移の微小環境における間質細胞タイプを包括的に分類します。スポット)は、細胞減少手術を受ける患者の手術廃棄物から取得されます。 サンプルのプレレベーション後、サンプルは冷却され、10% PBS に浸された状態でできるだけ早く VIB 施設に輸送され、標準的なプロトコルに従って単一細胞懸濁液が作成されます。 FACS (CD45+ およびライブ/デッド染色、免疫細胞と間質細胞の 50/50 ミックスを確保するため) による細胞選択とライブラリー準備の後、ScRNASeq が実行されます。
単一細胞シーケンス解析により、マーカー遺伝子を使用することで、既知のさまざまな細胞系統に割り当てられる細胞クラスターを特定できます。 データの注釈の後、腫瘍間質の組成の「風景」が取得されます。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Wim P Ceelen, MD, PhD
- 電話番号:+32 093326251
- メール:wim.ceelen@ugent.be
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Jesse G Demuytere, MD
- 電話番号:+32 093324278
- メール:jesse.demuytere@ugent.be
研究場所
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Oost-Vlaanderen
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Ghent、Oost-Vlaanderen、ベルギー、9000
- 募集
- UZ Ghent
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コンタクト:
- Wim P Ceelen, MD,PhD
- 電話番号:+32 093326251
- メール:wim.ceelen@ugent.be
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副調査官:
- Jesse G Demuytere, MD
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 結腸直腸由来のPCに対してCRS+HIPECを受けている患者
除外基準:
- 前HIPEC/PIPAC
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:ケースのみ
- 時間の展望:見込みのある
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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単一細胞トランスクリプトミクス
時間枠:24ヶ月
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遺伝子発現データの転写単一細胞 RNA 配列アトラスが報告されます
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24ヶ月
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者:Wim Ceelen, MD, PhD、UZ Ghent
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
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