Jednobuněčná transkriptomika peritoneálního mikroprostředí kolorektálního PC (SingleCell)
Role peritoneálního mikroprostředí v patogenezi kolorektální peritoneální karcinomatózy: jednobuněčná transkriptomika
Přehled studie
Detailní popis
Metodologie výzkumu
Před zařazením pacientů budou pacienti vyšetřeni na přítomnost hepatitidy B, hepatitidy C a HIV, aby byla zajištěna bezpečnost výzkumníků. Při cytoredukční operaci bude odebráno celkem pět vzorků nádorové tkáně. Tři z těchto vzorků budou použity pro analýzu ScRNASeq a dva vzorky makrometastázy budou rychle zmrazeny a kryokonzervovány.
Jednobuněčná RNA-sekvenační analýza Komplexně katalogizujeme typy stromálních buněk v mikroprostředí peritoneálních metastáz kolorektálního karcinomu s využitím jednobuněčného sekvenování RNA (scRNAseq) na třech vzorcích (z nichž jeden by měl přednostně pocházet z omentum majus, aby zahrnoval mléčné skvrny) získané z chirurgického odpadního materiálu pacientů podstupujících cytoredukční operaci. Po prelevaci vzorku budou vzorky co nejdříve dopraveny chlazené a ponořené v 10% PBS do zařízení VIB, kde budou připraveny suspenze jednotlivých buněk podle standardních protokolů. Po selekci buněk pomocí FACS (CD45+ a živé/mrtvé barvení, aby se zajistila směs imunitních a stromálních buněk 50/50) a přípravě knihovny, se provede ScRNASeq.
Analýza sekvenování jednotlivých buněk nám umožní identifikovat buněčné shluky, které budou pomocí markerových genů přiřazeny k různým známým buněčným liniím. Po anotaci dat bude získána "krajina" složení stromatu nádoru.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Wim P Ceelen, MD, PhD
- Telefonní číslo: +32 093326251
- E-mail: wim.ceelen@ugent.be
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Jesse G Demuytere, MD
- Telefonní číslo: +32 093324278
- E-mail: jesse.demuytere@ugent.be
Studijní místa
-
-
Oost-Vlaanderen
-
Ghent, Oost-Vlaanderen, Belgie, 9000
- Nábor
- UZ Ghent
-
Kontakt:
- Wim P Ceelen, MD,PhD
- Telefonní číslo: +32 093326251
- E-mail: wim.ceelen@ugent.be
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Jesse G Demuytere, MD
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti podstupující CRS+HIPEC pro PC kolorektálního původu
Kritéria vyloučení:
- Předchozí HIPEC/PIPAC
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Pouze případ
- Časové perspektivy: Budoucí
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Jednobuněčná transkriptomika
Časové okno: 24 měsíců
|
Bude uveden transkripční jednobuněčný RNA sekvenční atlas dat genové exprese
|
24 měsíců
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Wim Ceelen, MD, PhD, UZ Ghent
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- BC-6978
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .