Transcriptómica unicelular del microambiente peritoneal del CP colorrectal (SingleCell)
El papel del microambiente peritoneal en la patogenia de la carcinomatosis peritoneal colorrectal: transcriptómica unicelular
Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
Metodología de investigación
Antes de la inclusión de los pacientes, estos serán examinados para detectar la presencia de hepatitis B, hepatitis C y VIH para garantizar la seguridad del investigador. Durante la cirugía citorreductora se adquirirán un total de cinco muestras de tejido tumoral. Tres de esas muestras se utilizarán para el análisis de ScRNASeq, y dos muestras de una macrometástasis se congelarán instantáneamente y se criopreservarán.
Análisis de secuenciación de ARN de una sola célula Catalogaremos exhaustivamente los tipos de células del estroma en el microambiente de las metástasis peritoneales del cáncer colorrectal utilizando secuenciación de ARN de una sola célula (scRNAseq) en tres muestras (una de las cuales debe originarse preferiblemente en el epiplón mayor, para abarcar manchas) adquiridas a partir de material de desecho quirúrgico de pacientes sometidos a cirugía citorreductora. Después de la preparación previa de la muestra, las muestras se transportarán lo antes posible mientras se enfrían y se sumergen en PBS al 10 % a las instalaciones de VIB, donde se realizarán suspensiones de células individuales de acuerdo con los protocolos estándar. Después de la selección de células por FACS (CD45+ y tinción viva/muerta, para garantizar una mezcla 50/50 de células inmunes y del estroma) y la preparación de la biblioteca, se realizará ScRNASeq.
El análisis de secuenciación de células individuales nos permitirá identificar grupos de células que mediante el uso de genes marcadores se asignarán a diferentes linajes celulares conocidos. Después de la anotación de datos, se adquirirá un "paisaje" de la composición del estroma tumoral.
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
- Nombre: Wim P Ceelen, MD, PhD
- Número de teléfono: +32 093326251
- Correo electrónico: wim.ceelen@ugent.be
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Jesse G Demuytere, MD
- Número de teléfono: +32 093324278
- Correo electrónico: jesse.demuytere@ugent.be
Ubicaciones de estudio
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Oost-Vlaanderen
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Ghent, Oost-Vlaanderen, Bélgica, 9000
- Reclutamiento
- UZ Ghent
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Contacto:
- Wim P Ceelen, MD,PhD
- Número de teléfono: +32 093326251
- Correo electrónico: wim.ceelen@ugent.be
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Sub-Investigador:
- Jesse G Demuytere, MD
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Niño
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
Criterios de inclusión:
- Pacientes sometidos a CRS+HIPEC por CP de origen colorrectal
Criterio de exclusión:
- HIPEC/PIPAC anterior
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Solo caso
- Perspectivas temporales: Futuro
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Transcriptómica unicelular
Periodo de tiempo: 24 meses
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Se informará un atlas transcripcional de secuencias de ARN de una sola célula de datos de expresión génica.
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24 meses
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Wim Ceelen, MD, PhD, UZ Ghent
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Estimado)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- BC-6978
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
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Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
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