Kolorektaalisen PC:n peritoneaalisen mikroympäristön yksisoluinen transkriptomiikka (SingleCell)
Peritoneaalisen mikroympäristön rooli kolorektaalisen peritoneaalisen karsinomatoosin patogeneesissä: yksisoluinen transkriptomiikka
Tutkimuksen yleiskatsaus
Yksityiskohtainen kuvaus
Tutkimusmenetelmät
Ennen kuin potilaat otetaan mukaan, potilaat seulotaan hepatiitti B:n, hepatiitti C:n ja HIV:n varalta tutkijan turvallisuuden varmistamiseksi. Sytoreduktiivisen leikkauksen aikana otetaan yhteensä viisi näytettä kasvainkudoksesta. Kolmea näistä näytteistä käytetään ScRNASeq-analyysiin, ja kaksi makrometastaasinäytettä pikapakastetaan ja kylmäsäilytetään.
Yksisoluinen RNA-sekvensointianalyysi Luetteloimme kattavasti stroomasolutyypit paksu- ja peräsuolen syövän vatsakalvon etäpesäkkeiden mikroympäristössä käyttämällä yksisoluista RNA-sekvensointia (scRNAseq) kolmessa näytteessä (joista yhden tulisi mieluiten olla peräisin omentum majusista, jotta se sisältää maitomaisen täplät), jotka on saatu sytoreduktiivisen leikkauksen saaneiden potilaiden kirurgisesta jätemateriaalista. Näytteen esikäsittelyn jälkeen näytteet kuljetetaan mahdollisimman pian jäähdytettynä ja 10-prosenttiseen PBS:ään upotettuna VIB-tiloihin, joissa valmistetaan yksisolususpensioita standardikäytäntöjen mukaisesti. FACS:lla (CD45+ ja elävä/kuollut värjäys, jotta varmistetaan immuuni- ja stroomasolujen 50/50 sekoitus) ja kirjaston valmistelun jälkeen suoritetaan ScRNASeq.
Yksittäisen solun sekvensointianalyysin avulla voimme tunnistaa soluklusterit, jotka markkerigeenejä käyttämällä osoitetaan erilaisiin tunnettuihin solulinjoihin. Tietojen annotoinnin jälkeen saadaan "maisema" kasvainstrooman koostumuksesta.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Wim P Ceelen, MD, PhD
- Puhelinnumero: +32 093326251
- Sähköposti: wim.ceelen@ugent.be
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Jesse G Demuytere, MD
- Puhelinnumero: +32 093324278
- Sähköposti: jesse.demuytere@ugent.be
Opiskelupaikat
-
-
Oost-Vlaanderen
-
Ghent, Oost-Vlaanderen, Belgia, 9000
- Rekrytointi
- UZ Ghent
-
Ottaa yhteyttä:
- Wim P Ceelen, MD,PhD
- Puhelinnumero: +32 093326251
- Sähköposti: wim.ceelen@ugent.be
-
Alatutkija:
- Jesse G Demuytere, MD
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Potilaat, joille suoritetaan CRS+HIPEC kolorektaalisesta PC:stä
Poissulkemiskriteerit:
- Edellinen HIPEC/PIPAC
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Vain tapaus
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Yksisoluinen transkriptomiikka
Aikaikkuna: 24 kuukautta
|
Geeniekspressiotietojen transkription yksisoluinen RNA-seq atlas raportoidaan
|
24 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Wim Ceelen, MD, PhD, UZ Ghent
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- BC-6978
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .