好中球媒介炎症性皮膚疾患の遺伝的構造 (NEUTROSKIN)
2023年8月21日 更新者：University Hospital, Basel, Switzerland
好中球媒介性炎症性皮膚疾患の遺伝的構造に関する症例対照研究
この研究は、いくつかのまれな好中球皮膚病のまれな、病気を引き起こす突然変異を特定することです。
NMID とゲノムのバリアントとの関連を特定するために、次世代シーケンシング、主に全エクソーム シーケンシングが使用されます。
2 番目のアプローチでは、皮膚サンプルにおける既知の炎症性タンパク質の発現レベルが調査されます。
調査の概要
詳細な説明
皮膚科学におけるまれな重度の炎症性皮膚疾患の起源は十分にわかっていません。
それらは食細胞の存在と活性化に共通しており、痛みや炎症、外観の変形を通じて生活の質に影響を与え、致命的なことさえあります.
この研究は、これらの好中球介在性炎症性皮膚病 (NMID) のいくつかが遺伝的背景を持っているという発見に基づいて構築し、いくつかのまれな好中球皮膚病のまれな病気の原因となる変異を特定することを目的としています。
この非臨床症例対照研究は、生物学的材料と健康関連データを使用した研究プロジェクトです。
NMID とゲノムのバリアントとの関連を特定するために、次世代シーケンシング、主に全エクソーム シーケンシングが使用されます。
2 番目のアプローチでは、皮膚サンプルにおける既知の炎症性タンパク質の発現レベルが調査されます。
データは、標準化された方法を使用して取得および検証されます。
ナノストリング、RNA シーケンス、qRT ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR)、プロテオミクス アッセイ、免疫組織化学、フローサイトメトリー、イメージング マスサイトメトリー、ELISA、ウェスタン ブロット。
研究の種類
観察的
入学 (推定)
3370
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究連絡先
- 名前：Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- 電話番号：+41 61 265 40 84
- メール：alexander.navarini@usb.ch
研究連絡先のバックアップ
- 名前：Emmanuel Contassot, Dr.
- 電話番号：+41 61 328 55 45
- メール：emmanuel.contassot@usb.ch
研究場所
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Basel、スイス、4031
- 募集
- University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
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主任研究者：
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
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コンタクト：
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- 電話番号：+41 61 265 40 84
- メール：alexander.navarini@usb.ch
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コンタクト：
- Emmanuel Contassot, Dr.
- 電話番号：+41 61 328 55 45
- メール：emmanuel.contassot@usb.ch
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参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
18年～100年 (大人、高齢者)
健康ボランティアの受け入れ
はい
サンプリング方法
確率サンプル
調査対象母集団
研究参加者は主に、a.) バイオバンクから前向きに収集された患者の生検、または b.) 当クリニックの既存の患者集団 (FFPE 組織) の分析、連絡、および包含/除外によって募集されます。
USB で整形手術を受ける患者から健康な皮膚が得られます。 これらの患者には、手術前に情報が提供され、インフォームド コンセントが得られます。
説明
包含基準:
- 参加者の同意書
- NMID型群または対照群の発端者における疾患の診断
患者の除外基準:
- 2014 年以降にサンプルが収集された場合、インフォームド コンセントが欠落している
- NMIDの診断なし
健康なコントロールの除外基準:
- インフォームドコンセントの欠如
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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バイオバンク - NMID 患者からのサンプル
Biobank Dermatology Unispital Basel (USB) (Biobank USB) およびチューリッヒ大学病院皮膚科 (USZ) (Biobank USZ) のバイオバンクからの NMID 患者からの 600 サンプルが含まれます。
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次世代シーケンシングによる遺伝子バリアントの同定のための血液または唾液サンプルからの DNA 抽出。
Nanostring 分析、定量的 RT-PCR、または RNA シーケンシングのための血液および皮膚サンプルからの RNA 抽出。
バイオバンクの皮膚サンプルは、免疫染色および画像技術によって分析され、病変の細胞タイプを特定し、それらを健康な皮膚と比較します。
バイオバンクの血液および皮膚サンプルから分離された細胞は in vitro で培養され、タンパク質は ELISA (分泌タンパク質) およびウェスタンブロット (細胞タンパク質) によって分析されます。
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ホルマリン固定およびパラフィン包埋 (FFPE) サンプル
RNAおよびタンパク質発現分析のために2014年以前に収集されたDermatology USBからのホルマリン固定およびパラフィン包埋(FFPE)サンプル約50が再利用されます。
問題の患者は、研究とコード化されたサンプルの使用について通知されます。
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次世代シーケンシングによる遺伝子バリアントの同定のための血液または唾液サンプルからの DNA 抽出。
Nanostring 分析、定量的 RT-PCR、または RNA シーケンシングのための血液および皮膚サンプルからの RNA 抽出。
バイオバンクの皮膚サンプルは、免疫染色および画像技術によって分析され、病変の細胞タイプを特定し、それらを健康な皮膚と比較します。
バイオバンクの血液および皮膚サンプルから分離された細胞は in vitro で培養され、タンパク質は ELISA (分泌タンパク質) およびウェスタンブロット (細胞タンパク質) によって分析されます。
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バイオバンク - コントロールからのサンプル
2,700 の匿名化されたコントロール ゲノムとプロテオミクス アプローチの 150 の匿名化されたコントロール サンプルは、チューリッヒ大学病院 (Biobank Dermatology USZ) の皮膚科のバイオバンクからのコントロール サンプルとして使用できます。
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次世代シーケンシングによる遺伝子バリアントの同定のための血液または唾液サンプルからの DNA 抽出。
Nanostring 分析、定量的 RT-PCR、または RNA シーケンシングのための血液および皮膚サンプルからの RNA 抽出。
バイオバンクの皮膚サンプルは、免疫染色および画像技術によって分析され、病変の細胞タイプを特定し、それらを健康な皮膚と比較します。
バイオバンクの血液および皮膚サンプルから分離された細胞は in vitro で培養され、タンパク質は ELISA (分泌タンパク質) およびウェスタンブロット (細胞タンパク質) によって分析されます。
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健康なドナーからの新鮮な皮膚サンプル
皮膚の部位ごとに、健康なドナーから最大 20 の新鮮な皮膚サンプルが必要です。
それらは、研究に関する情報を入手し、インフォームドコンセントを受け取った後、健康なボランティアから要求されます。
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次世代シーケンシングによる遺伝子バリアントの同定のための血液または唾液サンプルからの DNA 抽出。
Nanostring 分析、定量的 RT-PCR、または RNA シーケンシングのための血液および皮膚サンプルからの RNA 抽出。
バイオバンクの皮膚サンプルは、免疫染色および画像技術によって分析され、病変の細胞タイプを特定し、それらを健康な皮膚と比較します。
バイオバンクの血液および皮膚サンプルから分離された細胞は in vitro で培養され、タンパク質は ELISA (分泌タンパク質) およびウェスタンブロット (細胞タンパク質) によって分析されます。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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NMIDの形態に関連するタンパク質をコードするまれなバリアントの数
時間枠：ベースラインでの 1 回限りの評価
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主要評価項目は、新たに同定された、または以前に報告されたまれな遺伝子バリアントと 1 つまたは複数の NMID の形態との関連性の決定に含まれます。 このような遺伝子バリアントの発見は、これらの患者における異常な皮膚免疫反応に関与する欠陥のある分子メカニズムの特定につながります: - 遺伝子データと NMID との間の統計的に有意な関連性
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ベースラインでの 1 回限りの評価
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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イメージングマスサイトメトリー
時間枠：ベースラインでの 1 回限りの評価
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副次的評価項目は、タンパク質相互作用およびネットワーク、免疫細胞、サイトカイン、および NMID の形態の受容体の測定による、NMID 患者の皮膚病変における遺伝子バリアントおよびその後のコード化タンパク質の分子レベルおよび細胞レベルでの結果の決定に含まれます。以下を含む、選択された反応モニタリング結果の統計的に有意な関連性: -Imaging Mass Cytometry
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ベースラインでの 1 回限りの評価
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RNA 発現
時間枠：ベースラインでの 1 回限りの評価
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副次的評価項目は、タンパク質相互作用およびネットワーク、免疫細胞、サイトカイン、および NMID の形態の受容体の測定による、NMID 患者の皮膚病変における遺伝子バリアントおよびその後のコード化タンパク質の分子レベルおよび細胞レベルでの結果の決定に含まれます。以下を含む、選択された反応モニタリング結果の統計的に有意な関連性: - RNA 発現
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ベースラインでの 1 回限りの評価
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免疫細胞数
時間枠：ベースラインでの 1 回限りの評価
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副次的評価項目は、タンパク質相互作用およびネットワーク、免疫細胞、サイトカイン、および NMID の形態の受容体の測定による、NMID 患者の皮膚病変における遺伝子バリアントおよびその後のコード化タンパク質の分子レベルおよび細胞レベルでの結果の決定に含まれます。以下を含む、選択された反応モニタリング結果の統計的に有意な関連性: - 免疫細胞数
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ベースラインでの 1 回限りの評価
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タンパク質の定量化 (ELISA)
時間枠：ベースラインでの 1 回限りの評価
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副次的評価項目は、タンパク質相互作用およびネットワーク、免疫細胞、サイトカイン、および NMID の形態の受容体の測定による、NMID 患者の皮膚病変における遺伝子バリアントおよびその後のコード化タンパク質の分子レベルおよび細胞レベルでの結果の決定に含まれます。以下を含む、選択された反応モニタリング結果の統計的に有意な関連性: - タンパク質の定量化 (ELISA)
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ベースラインでの 1 回限りの評価
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免疫細胞の平均蛍光強度率
時間枠：ベースラインでの 1 回限りの評価
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副次的評価項目は、タンパク質相互作用およびネットワーク、免疫細胞、サイトカイン、および NMID の形態の受容体の測定による、NMID 患者の皮膚病変における遺伝子バリアントおよびその後のコード化タンパク質の分子レベルおよび細胞レベルでの結果の決定に含まれます。以下を含む、選択された反応モニタリング結果の統計的に有意な関連性: - 免疫細胞の平均蛍光強度
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ベースラインでの 1 回限りの評価
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
捜査官
- 主任研究者：Alexander Navarini, Prof. Dr. med.、University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2023年2月3日
一次修了 (推定)
2029年9月1日
研究の完了 (推定)
2029年9月1日
試験登録日
最初に提出
2023年1月30日
QC基準を満たした最初の提出物
2023年2月8日
最初の投稿 (実際)
2023年2月17日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2023年8月22日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2023年8月21日
最終確認日
2023年8月1日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。