Genetische architectuur van door neutrofielen gemedieerde inflammatoire huidziekten (NEUTROSKIN)
21 augustus 2023 bijgewerkt door: University Hospital, Basel, Switzerland
Case-control studie van de genetische architectuur van door neutrofielen gemedieerde inflammatoire huidziekten
Deze studie is bedoeld om zeldzame, ziekteverwekkende mutaties van verschillende zeldzame neutrofiele dermatosen te identificeren.
Om associaties tussen NMID en varianten in het genoom te identificeren, zal sequencing van de volgende generatie, voornamelijk volledige exoomsequencing, worden gebruikt.
In een tweede benadering zal het expressieniveau van reeds bekende inflammatoire eiwitten in huidstalen worden onderzocht.
Studie Overzicht
Toestand
Werving
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
De oorsprong van zeldzame ernstige inflammatoire huidaandoeningen in de dermatologie is onvoldoende bekend.
Ze hebben de aanwezigheid en activatie van fagocyten gemeen, tasten de kwaliteit van leven aan door pijn en ontsteking en misvorming, en kunnen zelfs dodelijk zijn.
Deze studie is bedoeld om voort te bouwen op de bevindingen dat verschillende van deze door neutrofielen gemedieerde inflammatoire dermatosen (NMID) een genetische achtergrond hebben en om zeldzame, ziekteverwekkende mutaties van verschillende zeldzame neutrofieldermatosen te identificeren.
Deze niet-klinische case-control studie is een onderzoeksproject met biologisch materiaal en gezondheidsgerelateerde gegevens.
Om associaties tussen NMID en varianten in het genoom te identificeren, zal sequencing van de volgende generatie, voornamelijk volledige exoomsequencing, worden gebruikt.
In een tweede benadering zal het expressieniveau van reeds bekende inflammatoire eiwitten in huidstalen worden onderzocht.
De gegevens worden verkregen en geverifieerd met behulp van gestandaardiseerde methoden zoals b.v.
Nanostring, RNA-sequencing en qRT-polymerasekettingreactie (PCR), proteomics-assays en immunohistochemie, evenals flowcytometrie en beeldvormende massacytometrie, ELISA en Western Blot.
Studietype
Observationeel
Inschrijving (Geschat)
3370
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studiecontact
- Naam: Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Telefoonnummer: +41 61 265 40 84
- E-mail: alexander.navarini@usb.ch
Studie Contact Back-up
- Naam: Emmanuel Contassot, Dr.
- Telefoonnummer: +41 61 328 55 45
- E-mail: emmanuel.contassot@usb.ch
Studie Locaties
-
-
-
Basel, Zwitserland, 4031
- Werving
- University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
-
Hoofdonderzoeker:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
-
Contact:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Telefoonnummer: +41 61 265 40 84
- E-mail: alexander.navarini@usb.ch
-
Contact:
- Emmanuel Contassot, Dr.
- Telefoonnummer: +41 61 328 55 45
- E-mail: emmanuel.contassot@usb.ch
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
18 jaar tot 100 jaar (Volwassen, Oudere volwassene)
Accepteert gezonde vrijwilligers
Ja
Bemonsteringsmethode
Kanssteekproef
Studie Bevolking
De deelnemers aan het onderzoek zullen grotendeels worden geworven door a.) prospectief verzamelde biopsieën van patiënten uit biobanken of b.) het analyseren, contacteren en opnemen/uitsluiten van de bestaande patiëntenpopulatie van onze kliniek (FFPE-weefsels).
Een gezonde huid wordt verkregen van patiënten die plastische chirurgie ondergaan bij de USB. Deze patiënten zullen worden geïnformeerd en hun geïnformeerde toestemming zal worden verkregen vóór de operatie.
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- schriftelijke toestemming van de deelnemende persoon
- diagnose van een ziekte in de NMID-vormgroep of proband van de controlegroep
Uitsluitingscriteria voor patiënten:
- Ontbrekende geïnformeerde toestemming als monsters na 2014 zijn verzameld
- geen diagnose van NMID
Uitsluitingscriteria voor gezonde controles:
- Ontbrekende geïnformeerde toestemming
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Biobank-monsters van NMID-patiënten
600 monsters van NMID-patiënten van de Biobank Dermatologie Unispital Basel (USB) (Biobank USB) en van de biobank van de afdeling Dermatologie van het Universitair Ziekenhuis Zürich (USZ) (Biobank USZ) zullen worden opgenomen.
|
DNA-extractie uit bloed- of speekselmonsters voor de identificatie van genvarianten door sequencing van de volgende generatie;
RNA-extractie uit bloed- en huidmonsters voor Nanostring-analyses, kwantitatieve RT-PCR of RNA-sequencing.
Biobanked huidmonsters zullen worden geanalyseerd door middel van immunokleuring en beeldvormende technieken om celtypes in laesies te identificeren en ze te vergelijken met gezonde huid.
Cellen geïsoleerd uit bloed- en huidmonsters uit biobanken zullen in vitro worden gekweekt en eiwitten zullen worden geanalyseerd met ELISA (uitgescheiden eiwitten) en western blot (celeiwitten).
|
|
In formaline gefixeerde en in paraffine ingebedde (FFPE) monsters
Ongeveer 50 in formaline gefixeerde en in paraffine ingebedde (FFPE) monsters van de Dermatology USB die vóór 2014 zijn verzameld voor analyses van RNA- en eiwitexpressie, zullen worden hergebruikt.
De betrokken patiënten worden geïnformeerd over het onderzoek en het gecodeerde gebruik van hun monsters.
|
DNA-extractie uit bloed- of speekselmonsters voor de identificatie van genvarianten door sequencing van de volgende generatie;
RNA-extractie uit bloed- en huidmonsters voor Nanostring-analyses, kwantitatieve RT-PCR of RNA-sequencing.
Biobanked huidmonsters zullen worden geanalyseerd door middel van immunokleuring en beeldvormende technieken om celtypes in laesies te identificeren en ze te vergelijken met gezonde huid.
Cellen geïsoleerd uit bloed- en huidmonsters uit biobanken zullen in vitro worden gekweekt en eiwitten zullen worden geanalyseerd met ELISA (uitgescheiden eiwitten) en western blot (celeiwitten).
|
|
Biobank-monsters van controles
2.700 geanonimiseerde controlegenomen en 150 geanonimiseerde controlemonsters voor de proteomics-benadering kunnen worden gebruikt als controlemonsters uit de biobank van de afdeling Dermatologie van het Universitair Ziekenhuis Zürich (Biobank Dermatology USZ).
|
DNA-extractie uit bloed- of speekselmonsters voor de identificatie van genvarianten door sequencing van de volgende generatie;
RNA-extractie uit bloed- en huidmonsters voor Nanostring-analyses, kwantitatieve RT-PCR of RNA-sequencing.
Biobanked huidmonsters zullen worden geanalyseerd door middel van immunokleuring en beeldvormende technieken om celtypes in laesies te identificeren en ze te vergelijken met gezonde huid.
Cellen geïsoleerd uit bloed- en huidmonsters uit biobanken zullen in vitro worden gekweekt en eiwitten zullen worden geanalyseerd met ELISA (uitgescheiden eiwitten) en western blot (celeiwitten).
|
|
Verse huidmonsters van gezonde donoren
Per huidlocatie zijn maximaal 20 verse huidmonsters van gezonde donoren nodig.
Ze zullen worden opgevraagd bij gezonde vrijwilligers na informatie over het onderzoek en het verkrijgen van de geïnformeerde toestemming.
|
DNA-extractie uit bloed- of speekselmonsters voor de identificatie van genvarianten door sequencing van de volgende generatie;
RNA-extractie uit bloed- en huidmonsters voor Nanostring-analyses, kwantitatieve RT-PCR of RNA-sequencing.
Biobanked huidmonsters zullen worden geanalyseerd door middel van immunokleuring en beeldvormende technieken om celtypes in laesies te identificeren en ze te vergelijken met gezonde huid.
Cellen geïsoleerd uit bloed- en huidmonsters uit biobanken zullen in vitro worden gekweekt en eiwitten zullen worden geanalyseerd met ELISA (uitgescheiden eiwitten) en western blot (celeiwitten).
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Aantal eiwitcoderende zeldzame varianten geassocieerd met vormen van NMID
Tijdsspanne: eenmalige beoordeling bij baseline
|
Het primaire eindpunt bestaat uit het bepalen van de associatie tussen nieuw geïdentificeerde of eerder gerapporteerde zeldzame genvarianten en een of meer vormen van NMID's. De ontdekking van dergelijke genetische varianten zal leiden tot de identificatie van defecte moleculaire mechanismen die betrokken zijn bij abnormale huidimmuunreacties bij deze patiënten: - Statistisch significant verband tussen genetische gegevens en NMID
|
eenmalige beoordeling bij baseline
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Beeldvorming van massacytometrie
Tijdsspanne: eenmalige beoordeling bij baseline
|
Het secundaire eindpunt zal bestaan uit het bepalen van de gevolgen op moleculair en cellulair niveau van genvarianten en vervolgens gecodeerde eiwitten in de huidlaesies van NMID-patiënten door het meten van eiwitinteracties en -netwerken, immuuncellen, cytokines en receptoren in vormen van NMID door statistisch significante associatie van geselecteerde resultaten van reactiebewaking, waaronder: - Beeldvorming van massacytometrie
|
eenmalige beoordeling bij baseline
|
|
RNA-expressie
Tijdsspanne: eenmalige beoordeling bij baseline
|
Het secundaire eindpunt zal bestaan uit het bepalen van de gevolgen op moleculair en cellulair niveau van genvarianten en vervolgens gecodeerde eiwitten in de huidlaesies van NMID-patiënten door het meten van eiwitinteracties en -netwerken, immuuncellen, cytokines en receptoren in vormen van NMID door statistisch significante associatie van geselecteerde resultaten van reactiemonitoring, waaronder: - RNA-expressie
|
eenmalige beoordeling bij baseline
|
|
Aantal immuuncellen
Tijdsspanne: eenmalige beoordeling bij baseline
|
Het secundaire eindpunt zal bestaan uit het bepalen van de gevolgen op moleculair en cellulair niveau van genvarianten en vervolgens gecodeerde eiwitten in de huidlaesies van NMID-patiënten door het meten van eiwitinteracties en -netwerken, immuuncellen, cytokines en receptoren in vormen van NMID door statistisch significante associatie van geselecteerde reactiebewakingsresultaten, waaronder: - Immuunceltelling
|
eenmalige beoordeling bij baseline
|
|
Eiwitkwantificering (ELISA)
Tijdsspanne: eenmalige beoordeling bij baseline
|
Het secundaire eindpunt zal bestaan uit het bepalen van de gevolgen op moleculair en cellulair niveau van genvarianten en vervolgens gecodeerde eiwitten in de huidlaesies van NMID-patiënten door het meten van eiwitinteracties en -netwerken, immuuncellen, cytokines en receptoren in vormen van NMID door statistisch significante associatie van geselecteerde resultaten van reactiebewaking, waaronder: - Eiwitkwantificering (ELISA)
|
eenmalige beoordeling bij baseline
|
|
Snelheid van gemiddelde fluorescentie-intensiteit van immuuncellen
Tijdsspanne: eenmalige beoordeling bij baseline
|
Het secundaire eindpunt zal bestaan uit het bepalen van de gevolgen op moleculair en cellulair niveau van genvarianten en vervolgens gecodeerde eiwitten in de huidlaesies van NMID-patiënten door het meten van eiwitinteracties en -netwerken, immuuncellen, cytokines en receptoren in vormen van NMID door statistisch significante associatie van geselecteerde resultaten van reactiebewaking, waaronder: - Gemiddelde fluorescentie-intensiteit van immuuncellen
|
eenmalige beoordeling bij baseline
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
3 februari 2023
Primaire voltooiing (Geschat)
1 september 2029
Studie voltooiing (Geschat)
1 september 2029
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
30 januari 2023
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
8 februari 2023
Eerst geplaatst (Werkelijk)
17 februari 2023
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
22 augustus 2023
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
21 augustus 2023
Laatst geverifieerd
1 augustus 2023
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 2020-02645; sp19Navarini3
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Nee
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Nee
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .