Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Genetická architektura zánětlivých kožních onemocnění zprostředkovaných neutrofily (NEUTROSKIN)

21. srpna 2023 aktualizováno: University Hospital, Basel, Switzerland

Případová kontrolní studie genetické architektury zánětlivých kožních onemocnění zprostředkovaných neutrofily

Tato studie má identifikovat vzácné, onemocnění způsobující mutace několika vzácných neutrofilních dermatóz. K identifikaci asociací mezi NMID a variantami v genomu bude použito sekvenování nové generace, zejména sekvenování celého exomu. Ve druhém přístupu bude zkoumána hladina exprese již známých zánětlivých proteinů ve vzorcích kůže.

Přehled studie

Postavení

Nábor

Podmínky

Intervence / Léčba

Detailní popis

Původ vzácných závažných zánětlivých kožních onemocnění v dermatologii není dostatečně znám. Mají společnou přítomnost a aktivaci fagocytů, ovlivňují kvalitu života prostřednictvím bolesti, zánětu a deformace a mohou být dokonce smrtelné. Cílem této studie je stavět na zjištěních, že několik z těchto neutrofilně zprostředkovaných zánětlivých dermatóz (NMID) má genetické pozadí, a identifikovat vzácné, onemocnění způsobující mutace několika vzácných neutrofilních dermatóz. Tato neklinická případová-kontrolní studie je výzkumným projektem s biologickým materiálem a údaji souvisejícími se zdravím. K identifikaci asociací mezi NMID a variantami v genomu bude použito sekvenování nové generace, zejména sekvenování celého exomu. Ve druhém přístupu bude zkoumána hladina exprese již známých zánětlivých proteinů ve vzorcích kůže. Data jsou získávána a ověřována pomocí standardizovaných metod jako např. Nanostring, sekvenování RNA a qRT-polymerázová řetězová reakce (PCR), proteomické testy a imunohistochemie, stejně jako průtoková cytometrie a zobrazovací hmotnostní cytometrie, ELISA a Western Blot.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Odhadovaný)

3370

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní záloha kontaktů

Studijní místa

  • Švýcarsko
      • Basel, Švýcarsko, 4031
        • Nábor
        • University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
        • Vrchní vyšetřovatel:
          • Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
        • Kontakt:
        • Kontakt:

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let až 100 let (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ano

Metoda odběru vzorků

Ukázka pravděpodobnosti

Studijní populace

Účastníci studie budou z velké části získáváni a.) prospektivně shromážděnými biopsiemi pacientů z biobank nebo b.) analyzováním, kontaktováním a zahrnutím/vyloučením stávající populace pacientů naší kliniky (tkáň FFPE).

Zdravá kůže se získává od pacientů podstupujících plastickou operaci na JU. Tito pacienti budou informováni a jejich informovaný souhlas bude získán před operací.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • písemný souhlas zúčastněné osoby
  • diagnóza onemocnění ve skupině formy NMID nebo proband kontrolní skupiny

Kritéria vyloučení pro pacienty:

  • Chybějící informovaný souhlas u vzorků odebraných po roce 2014
  • žádná diagnóza NMID

Kritéria vyloučení pro zdravé kontroly:

  • Chybí informovaný souhlas

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
Biobanka – vzorky od pacientů s NMID
Zařazeno bude 600 vzorků od pacientů s NMID z Biobank Dermatology Unispital Basel (USB) (Biobank USB) az biobanky Dermatologického oddělení Fakultní nemocnice Zürich (USZ) (Biobank USZ).
Jiný: Analýza vzorků
Extrakce DNA ze vzorků krve nebo slin pro identifikaci genových variant sekvenováním nové generace;
Jiný: Analýza vzorků
Extrakce RNA ze vzorků krve a kůže pro analýzy Nanostring, kvantitativní RT-PCR nebo sekvenování RNA.
Jiný: Analýza vzorků
Vzorky kůže v biobankách budou analyzovány imunobarvením a zobrazovacími technikami k identifikaci typů buněk v lézích a jejich porovnání se zdravou kůží.
Jiný: Analýza vzorků
Buňky izolované z biobanky vzorků krve a kůže budou kultivovány in vitro a proteiny budou analyzovány pomocí ELISA (sekretované proteiny) a western blot (buněčné proteiny).
Vzorky fixované ve formalínu a zalité v parafínu (FFPE).
Asi 50 vzorků fixovaných ve formalínu a zalitých v parafínu (FFPE) z Dermatology USB odebraných před rokem 2014 pro analýzy exprese RNA a proteinů bude znovu použito. Dotazovaní pacienti jsou informováni o studii a kódovaném použití jejich vzorků.
Jiný: Analýza vzorků
Extrakce DNA ze vzorků krve nebo slin pro identifikaci genových variant sekvenováním nové generace;
Jiný: Analýza vzorků
Extrakce RNA ze vzorků krve a kůže pro analýzy Nanostring, kvantitativní RT-PCR nebo sekvenování RNA.
Jiný: Analýza vzorků
Vzorky kůže v biobankách budou analyzovány imunobarvením a zobrazovacími technikami k identifikaci typů buněk v lézích a jejich porovnání se zdravou kůží.
Jiný: Analýza vzorků
Buňky izolované z biobanky vzorků krve a kůže budou kultivovány in vitro a proteiny budou analyzovány pomocí ELISA (sekretované proteiny) a western blot (buněčné proteiny).
Biobanka- vzorky z kontrol
2'700 anonymizovaných kontrolních genomů a také 150 anonymizovaných kontrolních vzorků pro proteomický přístup lze použít jako kontrolní vzorky z biobanky Dermatologického oddělení Fakultní nemocnice Zürich (Biobank Dermatology USZ).
Jiný: Analýza vzorků
Extrakce DNA ze vzorků krve nebo slin pro identifikaci genových variant sekvenováním nové generace;
Jiný: Analýza vzorků
Extrakce RNA ze vzorků krve a kůže pro analýzy Nanostring, kvantitativní RT-PCR nebo sekvenování RNA.
Jiný: Analýza vzorků
Vzorky kůže v biobankách budou analyzovány imunobarvením a zobrazovacími technikami k identifikaci typů buněk v lézích a jejich porovnání se zdravou kůží.
Jiný: Analýza vzorků
Buňky izolované z biobanky vzorků krve a kůže budou kultivovány in vitro a proteiny budou analyzovány pomocí ELISA (sekretované proteiny) a western blot (buněčné proteiny).
Čerstvé vzorky kůže od zdravých dárců
Na jedno místo kůže je potřeba maximálně 20 vzorků čerstvé kůže od zdravých dárců. Budou požadovány od zdravých dobrovolníků po informaci o studii a obdržení informovaného souhlasu.
Jiný: Analýza vzorků
Extrakce DNA ze vzorků krve nebo slin pro identifikaci genových variant sekvenováním nové generace;
Jiný: Analýza vzorků
Extrakce RNA ze vzorků krve a kůže pro analýzy Nanostring, kvantitativní RT-PCR nebo sekvenování RNA.
Jiný: Analýza vzorků
Vzorky kůže v biobankách budou analyzovány imunobarvením a zobrazovacími technikami k identifikaci typů buněk v lézích a jejich porovnání se zdravou kůží.
Jiný: Analýza vzorků
Buňky izolované z biobanky vzorků krve a kůže budou kultivovány in vitro a proteiny budou analyzovány pomocí ELISA (sekretované proteiny) a western blot (buněčné proteiny).

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Počet vzácných variant kódujících protein spojený s formami NMID
Časové okno: jednorázové hodnocení na začátku

Primární cíl spočívá ve stanovení asociace mezi nově identifikovanými nebo dříve hlášenými vzácnými genovými variantami a jednou nebo více formami NMID. Objev takových genetických variant povede k identifikaci defektních molekulárních mechanismů zapojených do abnormálních kožních imunitních reakcí u těchto pacientů: - Statisticky významná asociace mezi genetickými daty a NMID

  • Detekce protein-kódujících vzácných variant spojených s formami NMID
  • Identifikace aktivace zánětu v různých stádiích NMID
jednorázové hodnocení na začátku

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Zobrazovací hmotnostní cytometrie
Časové okno: jednorázové hodnocení na začátku
Sekundární cíl bude spočívat ve stanovení následků na molekulární a buněčné úrovni genových variant a následně kódovaných proteinů v kožních lézích pacientů s NMID měřením proteinových interakcí a sítí, imunitních buněk, cytokinů a receptorů ve formách NMID pomocí statisticky významné spojení vybraných výsledků monitorování reakcí včetně: -Zobrazovací hmotnostní cytometrie
jednorázové hodnocení na začátku
RNA exprese
Časové okno: jednorázové hodnocení na začátku
Sekundární cíl bude spočívat ve stanovení následků na molekulární a buněčné úrovni genových variant a následně kódovaných proteinů v kožních lézích pacientů s NMID měřením proteinových interakcí a sítí, imunitních buněk, cytokinů a receptorů ve formách NMID pomocí statisticky významná asociace vybraných výsledků monitorování reakcí včetně: - exprese RNA
jednorázové hodnocení na začátku
Počet imunitních buněk
Časové okno: jednorázové hodnocení na začátku
Sekundární cíl bude spočívat ve stanovení následků na molekulární a buněčné úrovni genových variant a následně kódovaných proteinů v kožních lézích pacientů s NMID měřením proteinových interakcí a sítí, imunitních buněk, cytokinů a receptorů ve formách NMID pomocí statisticky významná asociace vybraných výsledků monitorování reakcí zahrnujících: - Počet imunitních buněk
jednorázové hodnocení na začátku
Kvantifikace proteinů (ELISA)
Časové okno: jednorázové hodnocení na začátku
Sekundární cíl bude spočívat ve stanovení následků na molekulární a buněčné úrovni genových variant a následně kódovaných proteinů v kožních lézích pacientů s NMID měřením proteinových interakcí a sítí, imunitních buněk, cytokinů a receptorů ve formách NMID pomocí statisticky významná asociace vybraných výsledků sledování reakcí včetně: - kvantifikace proteinů (ELISA)
jednorázové hodnocení na začátku
Míra střední intenzity fluorescence imunitních buněk
Časové okno: jednorázové hodnocení na začátku
Sekundární cíl bude spočívat ve stanovení následků na molekulární a buněčné úrovni genových variant a následně kódovaných proteinů v kožních lézích pacientů s NMID měřením proteinových interakcí a sítí, imunitních buněk, cytokinů a receptorů ve formách NMID pomocí statisticky významná asociace vybraných výsledků monitorování reakcí zahrnujících: - Střední intenzitu fluorescence imunitních buněk
jednorázové hodnocení na začátku

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

University Hospital, Basel, Switzerland

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

3. února 2023

Primární dokončení (Odhadovaný)

1. září 2029

Dokončení studie (Odhadovaný)

1. září 2029

Termíny zápisu do studia

První předloženo

30. ledna 2023

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

8. února 2023

První zveřejněno (Aktuální)

17. února 2023

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

22. srpna 2023

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

21. srpna 2023

Naposledy ověřeno

1. srpna 2023

Více informací

Termíny související s touto studií

Klíčová slova

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • 2020-02645; sp19Navarini3

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Analýza vzorků

Prohledejte podobné pokusy

Sponzoři a spolupracovníci

Zdravotní podmínky

Drogové intervence

CROs by country

CROs in Pakistan

Podmínky

Vzácné nemoci

Drogové intervence

Doplňky stravy

Sponzor / Spolupracovníci

Místa

Předplatit