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Architettura genetica delle malattie infiammatorie della pelle mediate dai neutrofili (NEUTROSKIN)

21 agosto 2023 aggiornato da: University Hospital, Basel, Switzerland

Studio caso-controllo dell'architettura genetica delle malattie infiammatorie della pelle mediate da neutrofili

Questo studio ha lo scopo di identificare mutazioni rare che causano malattie di diverse dermatosi neutrofile rare. Per identificare le associazioni tra NMID e varianti nel genoma verrà utilizzato il sequenziamento di nuova generazione, principalmente il sequenziamento dell'intero esoma. In un secondo approccio sarà studiato il livello di espressione di proteine ​​infiammatorie già note in campioni di pelle.

Panoramica dello studio

Stato

Reclutamento

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

L'origine delle rare malattie infiammatorie cutanee gravi in ​​dermatologia non è sufficientemente nota. Hanno in comune la presenza e l'attivazione dei fagociti, influenzano la qualità della vita attraverso il dolore, l'infiammazione e la deturpazione e possono anche essere fatali. Questo studio ha lo scopo di basarsi sui risultati secondo cui molte di queste dermatosi infiammatorie mediate da neutrofili (NMID) hanno un background genetico e di identificare mutazioni rare che causano malattie di diverse rare dermatosi da neutrofili. Questo studio caso-controllo non clinico è un progetto di ricerca con materiale biologico e dati relativi alla salute. Per identificare le associazioni tra NMID e varianti nel genoma verrà utilizzato il sequenziamento di nuova generazione, principalmente il sequenziamento dell'intero esoma. In un secondo approccio sarà studiato il livello di espressione di proteine ​​infiammatorie già note in campioni di pelle. I dati sono ottenuti e verificati utilizzando metodi standardizzati come ad es. Nanostring, sequenziamento dell'RNA e reazione a catena della polimerasi qRT (PCR), analisi di proteomica e immunoistochimica, nonché citometria a flusso e citometria di massa per imaging, ELISA e Western Blot.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Stimato)

3370

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

Luoghi di studio

  • Svizzera
      • Basel, Svizzera, 4031
        • Reclutamento
        • University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
        • Investigatore principale:
          • Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
        • Contatto:
        • Contatto:

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 18 anni a 100 anni (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

Sì

Metodo di campionamento

Campione di probabilità

Popolazione di studio

I partecipanti allo studio saranno in gran parte reclutati da a.) biopsie di pazienti raccolte in modo prospettico da biobanche o b.) analizzando, contattando e includendo/escludendo la popolazione di pazienti esistente della nostra clinica (tessuti FFPE).

La pelle sana è ottenuta da pazienti sottoposti a chirurgia plastica presso l'USB. Questi pazienti saranno informati e il loro consenso informato ottenuto prima dell'intervento chirurgico.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • consenso scritto del partecipante
  • diagnosi di una malattia nel gruppo di forma NMID o probando del gruppo di controllo

Criteri di esclusione per i pazienti:

  • Consenso informato mancante se campioni raccolti dopo il 2014
  • nessuna diagnosi di NMID

Criteri di esclusione per controlli sani:

  • Consenso informato mancante

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Biobanca- campioni da pazienti NMID
Saranno inclusi 600 campioni di pazienti NMID della Biobank Dermatology Unispital Basel (USB) (Biobank USB) e della biobank del Dipartimento di Dermatologia dell'Ospedale Universitario di Zurigo (USZ) (Biobank USZ).
Altro: Analisi dei campioni
Estrazione del DNA da campioni di sangue o saliva per l'identificazione di varianti geniche mediante sequenziamento di nuova generazione;
Altro: Analisi dei campioni
Estrazione dell'RNA da campioni di sangue e pelle per analisi Nanostring, RT-PCR quantitativa o sequenziamento dell'RNA.
Altro: Analisi dei campioni
I campioni di pelle raccolti in biobanca saranno analizzati mediante immunocolorazione e tecniche di imaging per identificare i tipi di cellule nelle lesioni e confrontarli con la pelle sana.
Altro: Analisi dei campioni
Le cellule isolate da campioni di sangue e pelle biobancati saranno coltivate in vitro e le proteine ​​saranno analizzate mediante ELISA (proteine ​​secrete) e western blot (proteine ​​cellulari).
Campioni fissati in formalina e inclusi in paraffina (FFPE).
Verranno riutilizzati circa 50 campioni fissati in formalina e inclusi in paraffina (FFPE) dal Dermatology USB raccolti prima del 2014 per le analisi di espressione di RNA e proteine. I pazienti in questione vengono informati sullo studio e sull'uso codificato dei loro campioni.
Altro: Analisi dei campioni
Estrazione del DNA da campioni di sangue o saliva per l'identificazione di varianti geniche mediante sequenziamento di nuova generazione;
Altro: Analisi dei campioni
Estrazione dell'RNA da campioni di sangue e pelle per analisi Nanostring, RT-PCR quantitativa o sequenziamento dell'RNA.
Altro: Analisi dei campioni
I campioni di pelle raccolti in biobanca saranno analizzati mediante immunocolorazione e tecniche di imaging per identificare i tipi di cellule nelle lesioni e confrontarli con la pelle sana.
Altro: Analisi dei campioni
Le cellule isolate da campioni di sangue e pelle biobancati saranno coltivate in vitro e le proteine ​​saranno analizzate mediante ELISA (proteine ​​secrete) e western blot (proteine ​​cellulari).
Biobanca- campioni dai controlli
2'700 genomi di controllo anonimizzati e 150 campioni di controllo anonimizzati per l'approccio proteomico possono essere utilizzati come campioni di controllo dalla biobanca del reparto di dermatologia dell'ospedale universitario di Zurigo (Biobank Dermatology USZ).
Altro: Analisi dei campioni
Estrazione del DNA da campioni di sangue o saliva per l'identificazione di varianti geniche mediante sequenziamento di nuova generazione;
Altro: Analisi dei campioni
Estrazione dell'RNA da campioni di sangue e pelle per analisi Nanostring, RT-PCR quantitativa o sequenziamento dell'RNA.
Altro: Analisi dei campioni
I campioni di pelle raccolti in biobanca saranno analizzati mediante immunocolorazione e tecniche di imaging per identificare i tipi di cellule nelle lesioni e confrontarli con la pelle sana.
Altro: Analisi dei campioni
Le cellule isolate da campioni di sangue e pelle biobancati saranno coltivate in vitro e le proteine ​​saranno analizzate mediante ELISA (proteine ​​secrete) e western blot (proteine ​​cellulari).
Campioni di pelle fresca da donatori sani
Sono richiesti un massimo di 20 campioni di pelle fresca da donatori sani per sede della pelle. Saranno richiesti a volontari sani dopo aver ricevuto informazioni sullo studio e aver ricevuto il consenso informato.
Altro: Analisi dei campioni
Estrazione del DNA da campioni di sangue o saliva per l'identificazione di varianti geniche mediante sequenziamento di nuova generazione;
Altro: Analisi dei campioni
Estrazione dell'RNA da campioni di sangue e pelle per analisi Nanostring, RT-PCR quantitativa o sequenziamento dell'RNA.
Altro: Analisi dei campioni
I campioni di pelle raccolti in biobanca saranno analizzati mediante immunocolorazione e tecniche di imaging per identificare i tipi di cellule nelle lesioni e confrontarli con la pelle sana.
Altro: Analisi dei campioni
Le cellule isolate da campioni di sangue e pelle biobancati saranno coltivate in vitro e le proteine ​​saranno analizzate mediante ELISA (proteine ​​secrete) e western blot (proteine ​​cellulari).

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Numero di varianti rare codificanti proteine ​​associate a forme di NMID
Lasso di tempo: valutazione una tantum al basale

L'endpoint primario consiste nella determinazione dell'associazione tra varianti geniche rare recentemente identificate o precedentemente segnalate e una o più forme di NMID. La scoperta di tali varianti genetiche porterà all'identificazione di meccanismi molecolari difettosi coinvolti nelle reazioni immunitarie cutanee anormali in questi pazienti: - Associazione statisticamente significativa tra dati genetici e NMID

  • Rilevazione di varianti rare codificanti proteine ​​​​associate a forme di NMID
  • Identificazione dell'attivazione dell'inflammasoma in diversi stadi di NMID
valutazione una tantum al basale

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Citometria di massa per immagini
Lasso di tempo: valutazione una tantum al basale
L'endpoint secondario consisterà nella determinazione delle conseguenze a livello molecolare e cellulare delle varianti geniche e successivamente delle proteine ​​codificate nelle lesioni cutanee dei pazienti NMID mediante la misurazione delle interazioni e delle reti proteiche, delle cellule immunitarie, delle citochine e dei recettori nelle forme di NMID mediante associazione statisticamente significativa dei risultati del monitoraggio della reazione selezionata, tra cui: -Imaging Mass Cytometry
valutazione una tantum al basale
Espressione dell'RNA
Lasso di tempo: valutazione una tantum al basale
L'endpoint secondario consisterà nella determinazione delle conseguenze a livello molecolare e cellulare delle varianti geniche e successivamente delle proteine ​​codificate nelle lesioni cutanee dei pazienti NMID mediante la misurazione delle interazioni e delle reti proteiche, delle cellule immunitarie, delle citochine e dei recettori nelle forme di NMID mediante associazione statisticamente significativa dei risultati del monitoraggio della reazione selezionata, tra cui: - Espressione dell'RNA
valutazione una tantum al basale
Conta delle cellule immunitarie
Lasso di tempo: valutazione una tantum al basale
L'endpoint secondario consisterà nella determinazione delle conseguenze a livello molecolare e cellulare delle varianti geniche e successivamente delle proteine ​​codificate nelle lesioni cutanee dei pazienti NMID mediante la misurazione delle interazioni e delle reti proteiche, delle cellule immunitarie, delle citochine e dei recettori nelle forme di NMID mediante associazione statisticamente significativa dei risultati del monitoraggio della reazione selezionata, tra cui: - Conteggio delle cellule immunitarie
valutazione una tantum al basale
Quantificazione delle proteine ​​(ELISA)
Lasso di tempo: valutazione una tantum al basale
L'endpoint secondario consisterà nella determinazione delle conseguenze a livello molecolare e cellulare delle varianti geniche e successivamente delle proteine ​​codificate nelle lesioni cutanee dei pazienti NMID mediante la misurazione delle interazioni e delle reti proteiche, delle cellule immunitarie, delle citochine e dei recettori nelle forme di NMID mediante associazione statisticamente significativa dei risultati del monitoraggio della reazione selezionata, tra cui: - Quantificazione delle proteine ​​(ELISA)
valutazione una tantum al basale
Tasso di intensità di fluorescenza media delle cellule immunitarie
Lasso di tempo: valutazione una tantum al basale
L'endpoint secondario consisterà nella determinazione delle conseguenze a livello molecolare e cellulare delle varianti geniche e successivamente delle proteine ​​codificate nelle lesioni cutanee dei pazienti NMID mediante la misurazione delle interazioni e delle reti proteiche, delle cellule immunitarie, delle citochine e dei recettori nelle forme di NMID mediante associazione statisticamente significativa dei risultati del monitoraggio della reazione selezionata, tra cui: - Intensità media della fluorescenza delle cellule immunitarie
valutazione una tantum al basale

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

University Hospital, Basel, Switzerland

Investigatori

  • Investigatore principale: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

3 febbraio 2023

Completamento primario (Stimato)

1 settembre 2029

Completamento dello studio (Stimato)

1 settembre 2029

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

30 gennaio 2023

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

8 febbraio 2023

Primo Inserito (Effettivo)

17 febbraio 2023

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

22 agosto 2023

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

21 agosto 2023

Ultimo verificato

1 agosto 2023

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • 2020-02645; sp19Navarini3

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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