Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Genetisk arkitektur af neutrofilmedierede inflammatoriske hudsygdomme (NEUTROSKIN)

21. august 2023 opdateret af: University Hospital, Basel, Switzerland

Case-Control undersøgelse af den genetiske arkitektur af neutrofilmedierede inflammatoriske hudsygdomme

Denne undersøgelse skal identificere sjældne, sygdomsfremkaldende mutationer af flere sjældne neutrofile dermatoser. For at identificere associationer mellem NMID og varianter i genomet vil næste generations sekventering, hovedsageligt hele exome sekventering, blive brugt. I en anden tilgang vil ekspressionsniveauet af allerede kendte inflammatoriske proteiner i hudprøver blive undersøgt.

Studieoversigt

Detaljeret beskrivelse

Oprindelsen af ​​sjældne alvorlige inflammatoriske hudsygdomme i dermatologi er utilstrækkeligt kendt. Fælles for dem er tilstedeværelsen og aktiveringen af ​​fagocytter, påvirker livskvaliteten gennem smerte og betændelse og skævhed og kan endda være dødelig. Denne undersøgelse har til formål at bygge videre på resultaterne af, at flere af disse neutrofilmedierede inflammatoriske dermatoser (NMID) har en genetisk baggrund og at identificere sjældne, sygdomsfremkaldende mutationer af flere sjældne neutrofile dermatoser. Dette ikke-kliniske case-kontrol studie er et forskningsprojekt med biologisk materiale og sundhedsrelaterede data. For at identificere associationer mellem NMID og varianter i genomet vil næste generations sekventering, hovedsageligt hele exome sekventering, blive brugt. I en anden tilgang vil ekspressionsniveauet af allerede kendte inflammatoriske proteiner i hudprøver blive undersøgt. Dataene indhentes og verificeres ved hjælp af standardiserede metoder som f.eks. Nanostring, RNA-sekventering og qRT-polymerase kædereaktion (PCR), proteomiske assays og immunhistokemi samt flowcytometri og billeddiagnostisk massecytometri, ELISA og Western Blot.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Anslået)

3370

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Undersøgelse Kontakt Backup

Studiesteder

      • Basel, Schweiz, 4031
        • Rekruttering
        • University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
        • Ledende efterforsker:
          • Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
        • Kontakt:
        • Kontakt:

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år til 100 år (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ja

Prøveudtagningsmetode

Sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Studiedeltagerne vil i høj grad blive rekrutteret ved a.) prospektivt indsamlede biopsier af patienter fra biobanker eller b.) at analysere, kontakte og inkludere/ekskludere den eksisterende patientpopulation i vores klinik (FFPE-væv).

Sund hud opnås fra patienter, der gennemgår plastikkirurgi på USB. Disse patienter vil blive informeret og deres informerede samtykke indhentet før operationen.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • skriftligt samtykke fra den deltagende person
  • diagnose af en sygdom i NMID-formgruppen eller proband i kontrolgruppen

Eksklusionskriterier for patienter:

  • Manglende informeret samtykke, hvis prøver indsamlet efter 2014
  • ingen diagnose af NMID

Eksklusionskriterier for sunde kontroller:

  • Mangler informeret samtykke

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Biobank- prøver fra NMID-patienter
600 prøver fra NMID-patienter fra Biobank Dermatology Unispital Basel (USB) (Biobank USB) og fra biobanken for Dermatologisk afdeling på Universitetshospitalet Zürich (USZ) (Biobank USZ) vil blive inkluderet.
DNA-ekstraktion fra blod- eller spytprøver til identifikation af genvarianter ved næste generations sekventering;
RNA-ekstraktion fra blod- og hudprøver til Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekventering.
Biobankede hudprøver vil blive analyseret ved immunfarvning og billeddannelsesteknikker for at identificere celletyper i læsioner og sammenligne dem med sund hud.
Celler isoleret fra biobankede blod- og hudprøver vil blive dyrket in vitro, og proteiner vil blive analyseret ved ELISA (udskilte proteiner) og western blot (celleproteiner).
Formalinfikserede og paraffinindlejrede (FFPE) prøver
Omkring 50 af formalinfikserede og paraffinindlejrede (FFPE) prøver fra Dermatology USB indsamlet før 2014 til RNA- og proteinekspressionsanalyser vil blive genbrugt. De pågældende patienter informeres om undersøgelsen og den kodede brug af deres prøver.
DNA-ekstraktion fra blod- eller spytprøver til identifikation af genvarianter ved næste generations sekventering;
RNA-ekstraktion fra blod- og hudprøver til Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekventering.
Biobankede hudprøver vil blive analyseret ved immunfarvning og billeddannelsesteknikker for at identificere celletyper i læsioner og sammenligne dem med sund hud.
Celler isoleret fra biobankede blod- og hudprøver vil blive dyrket in vitro, og proteiner vil blive analyseret ved ELISA (udskilte proteiner) og western blot (celleproteiner).
Biobank- prøver fra kontroller
2.700 anonymiserede kontrolgenomer samt 150 anonymiserede kontrolprøver til proteomics-tilgangen kan bruges som kontrolprøver fra biobanken i Dermatologisk afdeling på Universitetshospitalet Zürich (Biobank Dermatology USZ).
DNA-ekstraktion fra blod- eller spytprøver til identifikation af genvarianter ved næste generations sekventering;
RNA-ekstraktion fra blod- og hudprøver til Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekventering.
Biobankede hudprøver vil blive analyseret ved immunfarvning og billeddannelsesteknikker for at identificere celletyper i læsioner og sammenligne dem med sund hud.
Celler isoleret fra biobankede blod- og hudprøver vil blive dyrket in vitro, og proteiner vil blive analyseret ved ELISA (udskilte proteiner) og western blot (celleproteiner).
Friske hudprøver fra raske donorer
Der kræves maksimalt 20 friske hudprøver fra raske donorer pr. hudplacering. De vil blive anmodet om fra raske frivillige efter information om undersøgelsen og modtagelse af det informerede samtykke.
DNA-ekstraktion fra blod- eller spytprøver til identifikation af genvarianter ved næste generations sekventering;
RNA-ekstraktion fra blod- og hudprøver til Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekventering.
Biobankede hudprøver vil blive analyseret ved immunfarvning og billeddannelsesteknikker for at identificere celletyper i læsioner og sammenligne dem med sund hud.
Celler isoleret fra biobankede blod- og hudprøver vil blive dyrket in vitro, og proteiner vil blive analyseret ved ELISA (udskilte proteiner) og western blot (celleproteiner).

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Antal proteinkodende sjældne varianter forbundet med former for NMID
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline

Det primære endepunkt består i bestemmelsen af ​​sammenhæng mellem nyligt identificerede eller tidligere rapporterede sjældne genvarianter og en eller flere former for NMID'er. Opdagelsen af ​​sådanne genetiske varianter vil føre til identifikation af defekte molekylære mekanismer involveret i unormale kutane immunreaktioner hos disse patienter: - Statistisk signifikant sammenhæng mellem genetiske data og NMID

  • Påvisning af proteinkodende sjældne varianter forbundet med former for NMID
  • Identifikation af inflammasomaktivering i forskellige stadier af NMID
engangsvurdering ved baseline

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Billeddannende massecytometri
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Det sekundære endepunkt vil bestå i bestemmelse af konsekvenser på molekylære og cellulære niveauer af genvarianter og efterfølgende kodede proteiner i de kutane læsioner fra NMID-patienter ved måling af proteininteraktioner og -netværk, immunceller, cytokiner og receptorer i form af NMID vha. statistisk signifikant sammenhæng mellem udvalgte reaktionsmonitoreringsresultater, herunder: -Imaging Mass Cytometri
engangsvurdering ved baseline
RNA-ekspression
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Det sekundære endepunkt vil bestå i bestemmelse af konsekvenser på molekylære og cellulære niveauer af genvarianter og efterfølgende kodede proteiner i de kutane læsioner fra NMID-patienter ved måling af proteininteraktioner og -netværk, immunceller, cytokiner og receptorer i form af NMID vha. statistisk signifikant association af udvalgte reaktionsmonitoreringsresultater, herunder: - RNA-ekspression
engangsvurdering ved baseline
Antal immunceller
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Det sekundære endepunkt vil bestå i bestemmelse af konsekvenser på molekylære og cellulære niveauer af genvarianter og efterfølgende kodede proteiner i de kutane læsioner fra NMID-patienter ved måling af proteininteraktioner og -netværk, immunceller, cytokiner og receptorer i form af NMID vha. statistisk signifikant sammenhæng mellem udvalgte reaktionsmonitoreringsresultater, herunder: - Immuncelleantal
engangsvurdering ved baseline
Protein kvantificering (ELISA)
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Det sekundære endepunkt vil bestå i bestemmelse af konsekvenser på molekylære og cellulære niveauer af genvarianter og efterfølgende kodede proteiner i de kutane læsioner fra NMID-patienter ved måling af proteininteraktioner og -netværk, immunceller, cytokiner og receptorer i form af NMID vha. statistisk signifikant sammenhæng mellem udvalgte reaktionsmonitoreringsresultater, herunder: - Proteinkvantificering (ELISA)
engangsvurdering ved baseline
Hastighed for gennemsnitlig fluorescensintensitet af immunceller
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Det sekundære endepunkt vil bestå i bestemmelse af konsekvenser på molekylære og cellulære niveauer af genvarianter og efterfølgende kodede proteiner i de kutane læsioner fra NMID-patienter ved måling af proteininteraktioner og -netværk, immunceller, cytokiner og receptorer i form af NMID vha. statistisk signifikant sammenhæng mellem udvalgte reaktionsovervågningsresultater, herunder: - Gennemsnitlig fluorescensintensitet af immunceller
engangsvurdering ved baseline

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

3. februar 2023

Primær færdiggørelse (Anslået)

1. september 2029

Studieafslutning (Anslået)

1. september 2029

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

30. januar 2023

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

8. februar 2023

Først opslået (Faktiske)

17. februar 2023

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

22. august 2023

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

21. august 2023

Sidst verificeret

1. august 2023

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • 2020-02645; sp19Navarini3

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Inflammatoriske dermatoser

Kliniske forsøg med Analyse af prøver

Abonner