Neutrofiilivälitteisten tulehduksellisten ihosairauksien geneettinen arkkitehtuuri (NEUTROSKIN)
maanantai 21. elokuuta 2023 päivittänyt: University Hospital, Basel, Switzerland
Neutrofiilivälitteisten tulehduksellisten ihosairauksien geneettisen arkkitehtuurin tapauskontrollitutkimus
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on tunnistaa harvinaisia, sairauksia aiheuttavia mutaatioita useissa harvinaisissa neutrofiilidermatooseissa.
NMID:n ja genomin muunnelmien välisten assosiaatioiden tunnistamiseksi käytetään seuraavan sukupolven sekvensointia, pääasiassa koko eksomin sekvensointia.
Toisessa lähestymistavassa tutkitaan jo tunnettujen tulehdusproteiinien ilmentymistasoa ihonäytteissä.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Rekrytointi
Yksityiskohtainen kuvaus
Harvinaisten vakavien tulehduksellisten ihosairauksien alkuperää ihotautien alalla ei tunneta riittävästi.
Niille on yhteistä fagosyyttien läsnäolo ja aktivoituminen, ne vaikuttavat elämänlaatuun kivun, tulehduksen ja muodonmuutoksen kautta ja voivat olla jopa kohtalokkaita.
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on perustua havaintoihin, että useilla näistä neutrofiilivälitteisistä tulehduksellisista dermatooseista (NMID) on geneettinen tausta, ja tunnistaa useiden harvinaisten neutrofiilidermatoosien harvinaisia, sairauksia aiheuttavia mutaatioita.
Tämä ei-kliininen tapauskontrollitutkimus on tutkimusprojekti, joka sisältää biologista materiaalia ja terveyteen liittyviä tietoja.
NMID:n ja genomin muunnelmien välisten assosiaatioiden tunnistamiseksi käytetään seuraavan sukupolven sekvensointia, pääasiassa koko eksomin sekvensointia.
Toisessa lähestymistavassa tutkitaan jo tunnettujen tulehdusproteiinien ilmentymistasoa ihonäytteissä.
Tiedot saadaan ja varmistetaan standardoiduilla menetelmillä, kuten esim.
Nanostring, RNA-sekvensointi ja qRT-polymeraasiketjureaktio (PCR), proteomiikkamääritykset ja immunohistokemia sekä virtaussytometria ja kuvantamismassasytometria, ELISA ja Western Blot.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
3370
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskeluyhteys
- Nimi: Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Puhelinnumero: +41 61 265 40 84
- Sähköposti: alexander.navarini@usb.ch
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Emmanuel Contassot, Dr.
- Puhelinnumero: +41 61 328 55 45
- Sähköposti: emmanuel.contassot@usb.ch
Opiskelupaikat
-
-
-
Basel, Sveitsi, 4031
- Rekrytointi
- University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
-
Päätutkija:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
-
Ottaa yhteyttä:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Puhelinnumero: +41 61 265 40 84
- Sähköposti: alexander.navarini@usb.ch
-
Ottaa yhteyttä:
- Emmanuel Contassot, Dr.
- Puhelinnumero: +41 61 328 55 45
- Sähköposti: emmanuel.contassot@usb.ch
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
18 vuotta - 100 vuotta (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Joo
Näytteenottomenetelmä
Todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Tutkimukseen osallistujat rekrytoidaan suurelta osin a.) prospektiivisesti kerätyillä biopsioilla potilaista biopankeista tai b.) analysoimalla, ottamalla yhteyttä ja sisällyttämällä/poissulkemalla klinikkamme olemassa oleva potilaspopulaatio (FFPE-kudokset).
Terve iho saadaan potilailta, joille tehdään USB:n plastiikkakirurgia. Näille potilaille tiedotetaan ja heidän tietoinen suostumuksensa hankitaan ennen leikkausta.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- osallistuvan henkilön kirjallinen suostumus
- taudin diagnoosi NMID-muotoryhmässä tai kontrolliryhmän koetapa
Potilaiden poissulkemiskriteerit:
- Tietoinen suostumus puuttuu, jos näytteet on otettu vuoden 2014 jälkeen
- ei NMID-diagnoosia
Terveiden kontrollien poissulkemiskriteerit:
- Tietoinen suostumus puuttuu
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Biopankki - näytteet NMID-potilailta
Mukana on 600 näytettä NMID-potilailta Biobank Dermatology Unispital Baselista (USB) (Biobank USB) ja Zürichin yliopistollisen sairaalan (USZ) ihotautiosaston biopankista (Biobank USZ).
|
DNA:n erottaminen veri- tai sylkinäytteistä geenivarianttien tunnistamiseksi seuraavan sukupolven sekvensoinnilla;
RNA:n erottaminen veri- ja ihonäytteistä Nanostring-analyysejä, kvantitatiivista RT-PCR:ää tai RNA-sekvensointia varten.
Biopankkitut ihonäytteet analysoidaan immunovärjäys- ja kuvantamistekniikoilla leesioiden solutyyppien tunnistamiseksi ja niiden vertaamiseksi terveeseen ihoon.
Biopankkiveristä ja ihonäytteistä eristettyjä soluja viljellään in vitro ja proteiinit analysoidaan ELISA:lla (erittyneet proteiinit) ja Western blotilla (soluproteiinit).
|
|
Formaliinikiinnitetyt ja parafiiniin upotetut (FFPE) näytteet
Noin 50 ennen vuotta 2014 RNA- ja proteiiniekspressioanalyysejä varten kerättyä formaliinikiinnitettyä ja parafiiniin upotettua (FFPE) näytettä Dermatology USB:stä.
Kyseisille potilaille tiedotetaan tutkimuksesta ja näytteiden koodatusta käytöstä.
|
DNA:n erottaminen veri- tai sylkinäytteistä geenivarianttien tunnistamiseksi seuraavan sukupolven sekvensoinnilla;
RNA:n erottaminen veri- ja ihonäytteistä Nanostring-analyysejä, kvantitatiivista RT-PCR:ää tai RNA-sekvensointia varten.
Biopankkitut ihonäytteet analysoidaan immunovärjäys- ja kuvantamistekniikoilla leesioiden solutyyppien tunnistamiseksi ja niiden vertaamiseksi terveeseen ihoon.
Biopankkiveristä ja ihonäytteistä eristettyjä soluja viljellään in vitro ja proteiinit analysoidaan ELISA:lla (erittyneet proteiinit) ja Western blotilla (soluproteiinit).
|
|
Biopankki - näytteet kontrolleista
Zürichin yliopistollisen sairaalan ihotautiosaston biopankista (Biobank Dermatology USZ) voidaan käyttää kontrollinäytteinä 2700 anonymisoitua kontrolligenomia sekä 150 anonymisoitua kontrollinäytettä proteomiikan lähestymistapaa varten.
|
DNA:n erottaminen veri- tai sylkinäytteistä geenivarianttien tunnistamiseksi seuraavan sukupolven sekvensoinnilla;
RNA:n erottaminen veri- ja ihonäytteistä Nanostring-analyysejä, kvantitatiivista RT-PCR:ää tai RNA-sekvensointia varten.
Biopankkitut ihonäytteet analysoidaan immunovärjäys- ja kuvantamistekniikoilla leesioiden solutyyppien tunnistamiseksi ja niiden vertaamiseksi terveeseen ihoon.
Biopankkiveristä ja ihonäytteistä eristettyjä soluja viljellään in vitro ja proteiinit analysoidaan ELISA:lla (erittyneet proteiinit) ja Western blotilla (soluproteiinit).
|
|
Tuoreet ihonäytteet terveiltä luovuttajilta
Ihokohtaa kohden tarvitaan enintään 20 tuoretta ihonäytettä terveiltä luovuttajilta.
Niitä pyydetään terveiltä vapaaehtoisilta saatuaan tiedon tutkimuksesta ja saatuaan tietoisen suostumuksen.
|
DNA:n erottaminen veri- tai sylkinäytteistä geenivarianttien tunnistamiseksi seuraavan sukupolven sekvensoinnilla;
RNA:n erottaminen veri- ja ihonäytteistä Nanostring-analyysejä, kvantitatiivista RT-PCR:ää tai RNA-sekvensointia varten.
Biopankkitut ihonäytteet analysoidaan immunovärjäys- ja kuvantamistekniikoilla leesioiden solutyyppien tunnistamiseksi ja niiden vertaamiseksi terveeseen ihoon.
Biopankkiveristä ja ihonäytteistä eristettyjä soluja viljellään in vitro ja proteiinit analysoidaan ELISA:lla (erittyneet proteiinit) ja Western blotilla (soluproteiinit).
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
NMID-muotoihin liittyvien proteiinia koodaavien harvinaisten varianttien lukumäärä
Aikaikkuna: kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
Ensisijainen päätetapahtuma on äskettäin tunnistetun tai aiemmin raportoitujen harvinaisten geenivarianttien ja yhden tai useamman NMID-muodon välisen yhteyden määrittäminen. Tällaisten geneettisten muunnelmien löytäminen johtaa viallisten molekyylimekanismien tunnistamiseen, jotka liittyvät epänormaaleihin ihon immuunireaktioihin näillä potilailla: - Tilastollisesti merkitsevä yhteys geneettisten tietojen ja NMID:n välillä
|
kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Kuvantamismassasytometria
Aikaikkuna: kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
Toissijainen päätepiste koostuu seurausten määrittämisestä geenivarianttien ja myöhemmin koodattujen proteiinien molekyyli- ja solutasoilla NMID-potilaiden ihovaurioissa mittaamalla proteiinien vuorovaikutuksia ja verkostoja, immuunisoluja, sytokiinejä ja reseptoreja NMID-muodoissa. tilastollisesti merkitsevä yhteys valittujen reaktion seurantatulosten mukaan lukien: - Kuvantamismassasytometria
|
kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
|
RNA:n ilmentyminen
Aikaikkuna: kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
Toissijainen päätepiste koostuu seurausten määrittämisestä geenivarianttien ja myöhemmin koodattujen proteiinien molekyyli- ja solutasoilla NMID-potilaiden ihovaurioissa mittaamalla proteiinien vuorovaikutuksia ja verkostoja, immuunisoluja, sytokiinejä ja reseptoreja NMID-muodoissa. tilastollisesti merkitsevä yhteys valittujen reaktioiden seurantatuloksiin mukaan lukien: - RNA:n ilmentyminen
|
kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
|
Immuunisolujen määrä
Aikaikkuna: kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
Toissijainen päätepiste koostuu seurausten määrittämisestä geenivarianttien ja myöhemmin koodattujen proteiinien molekyyli- ja solutasoilla NMID-potilaiden ihovaurioissa mittaamalla proteiinien vuorovaikutuksia ja verkostoja, immuunisoluja, sytokiinejä ja reseptoreja NMID-muodoissa. tilastollisesti merkitsevä yhteys valittujen reaktioiden seurantatuloksiin mukaan lukien: - Immuunisolumäärä
|
kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
|
Proteiinin kvantifiointi (ELISA)
Aikaikkuna: kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
Toissijainen päätepiste koostuu seurausten määrittämisestä geenivarianttien ja myöhemmin koodattujen proteiinien molekyyli- ja solutasoilla NMID-potilaiden ihovaurioissa mittaamalla proteiinien vuorovaikutuksia ja verkostoja, immuunisoluja, sytokiinejä ja reseptoreja NMID-muodoissa. tilastollisesti merkitsevä yhteys valittujen reaktioiden seurantatuloksiin mukaan lukien: - Proteiinin kvantifiointi (ELISA)
|
kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
|
Immuunisolujen keskimääräisen fluoresenssin intensiteetin nopeus
Aikaikkuna: kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
Toissijainen päätepiste koostuu seurausten määrittämisestä geenivarianttien ja myöhemmin koodattujen proteiinien molekyyli- ja solutasoilla NMID-potilaiden ihovaurioissa mittaamalla proteiinien vuorovaikutuksia ja verkostoja, immuunisoluja, sytokiinejä ja reseptoreja NMID-muodoissa. tilastollisesti merkitsevä yhteys valittuihin reaktioseurantatuloksiin, mukaan lukien: - Immuunisolujen keskimääräinen fluoresenssin intensiteetti
|
kerta-arviointi lähtötilanteessa
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Tutkijat
- Päätutkija: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Perjantai 3. helmikuuta 2023
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Lauantai 1. syyskuuta 2029
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Lauantai 1. syyskuuta 2029
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Maanantai 30. tammikuuta 2023
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Keskiviikko 8. helmikuuta 2023
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Perjantai 17. helmikuuta 2023
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Tiistai 22. elokuuta 2023
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Maanantai 21. elokuuta 2023
Viimeksi vahvistettu
Tiistai 1. elokuuta 2023
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2020-02645; sp19Navarini3
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .