Genetisk arkitektur av nøytrofilmedierte inflammatoriske hudsykdommer (NEUTROSKIN)
21. august 2023 oppdatert av: University Hospital, Basel, Switzerland
Kasuskontrollstudie av den genetiske arkitekturen til nøytrofilmedierte inflammatoriske hudsykdommer
Denne studien skal identifisere sjeldne, sykdomsfremkallende mutasjoner av flere sjeldne nøytrofile dermatoser.
For å identifisere assosiasjoner mellom NMID og varianter i genomet vil neste generasjons sekvensering, hovedsakelig hele eksomsekvensering, bli brukt.
I en andre tilnærming vil ekspresjonsnivået av allerede kjente inflammatoriske proteiner i hudprøver bli undersøkt.
Studieoversikt
Status
Rekruttering
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Opprinnelsen til sjeldne alvorlige inflammatoriske hudsykdommer i dermatologi er utilstrekkelig kjent.
De har til felles tilstedeværelse og aktivering av fagocytter, påvirker livskvaliteten gjennom smerte og betennelse og skjevhet, og kan til og med være dødelige.
Denne studien er ment å bygge på funnene om at flere av disse nøytrofilmediert inflammatoriske dermatosene (NMID) har en genetisk bakgrunn og å identifisere sjeldne, sykdomsfremkallende mutasjoner av flere sjeldne nøytrofile dermatoser.
Denne ikke-kliniske case-control studien er et forskningsprosjekt med biologisk materiale og helserelaterte data.
For å identifisere assosiasjoner mellom NMID og varianter i genomet vil neste generasjons sekvensering, hovedsakelig hele eksomsekvensering, bli brukt.
I en andre tilnærming vil ekspresjonsnivået av allerede kjente inflammatoriske proteiner i hudprøver bli undersøkt.
Dataene innhentes og verifiseres ved bruk av standardiserte metoder som f.eks.
Nanostring, RNA-sekvensering og qRT-polymerasekjedereaksjon (PCR), proteomikkanalyser og immunhistokjemi samt flowcytometri og bildediagnostisk massecytometri, ELISA og Western Blot.
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Antatt)
3370
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiekontakt
- Navn: Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Telefonnummer: +41 61 265 40 84
- E-post: alexander.navarini@usb.ch
Studer Kontakt Backup
- Navn: Emmanuel Contassot, Dr.
- Telefonnummer: +41 61 328 55 45
- E-post: emmanuel.contassot@usb.ch
Studiesteder
-
-
-
Basel, Sveits, 4031
- Rekruttering
- University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
-
Hovedetterforsker:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
-
Ta kontakt med:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Telefonnummer: +41 61 265 40 84
- E-post: alexander.navarini@usb.ch
-
Ta kontakt med:
- Emmanuel Contassot, Dr.
- Telefonnummer: +41 61 328 55 45
- E-post: emmanuel.contassot@usb.ch
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
18 år til 100 år (Voksen, Eldre voksen)
Tar imot friske frivillige
Ja
Prøvetakingsmetode
Sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
Studiedeltakerne vil i stor grad bli rekruttert av a.) prospektivt innsamlede biopsier av pasienter fra biobanker eller b.) analysere, kontakte og inkludere/ekskludere den eksisterende pasientpopulasjonen på vår klinikk (FFPE-vev).
Sunn hud oppnås fra pasienter som gjennomgår plastisk kirurgi ved USB. Disse pasientene vil bli informert og deres informerte samtykke innhentet før operasjonen.
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- skriftlig samtykke fra den deltakende personen
- diagnostisering av en sykdom i NMID-formgruppen eller proband av kontrollgruppen
Ekskluderingskriterier for pasienter:
- Mangler informert samtykke dersom prøver tatt etter 2014
- ingen diagnose av NMID
Eksklusjonskriterier for sunne kontroller:
- Mangler informert samtykke
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Biobank- prøver fra NMID-pasienter
600 prøver fra NMID-pasienter fra Biobank Dermatology Unispital Basel (USB) (Biobank USB) og fra biobanken til Dermatologisk avdeling ved Universitetssykehuset Zürich (USZ) (Biobank USZ) vil bli inkludert.
|
DNA-ekstraksjon fra blod- eller spyttprøver for identifikasjon av genvarianter ved neste generasjons sekvensering;
RNA-ekstraksjon fra blod- og hudprøver for Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekvensering.
Biobankede hudprøver vil bli analysert ved immunfarging og bildebehandlingsteknikker for å identifisere celletyper i lesjoner og sammenligne dem med sunn hud.
Celler isolert fra biobankede blod- og hudprøver vil bli dyrket in vitro og proteiner vil bli analysert med ELISA (utskilte proteiner) og western blot (celleproteiner).
|
|
Formalinfikserte og parafininnstøpte (FFPE) prøver
Omtrent 50 av formalinfikserte og parafininnstøpte (FFPE) prøver fra Dermatology USB samlet inn før 2014 for RNA- og proteinekspresjonsanalyser vil bli gjenbrukt.
Pasientene i spørsmålet blir informert om studien og kodet bruk av prøvene deres.
|
DNA-ekstraksjon fra blod- eller spyttprøver for identifikasjon av genvarianter ved neste generasjons sekvensering;
RNA-ekstraksjon fra blod- og hudprøver for Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekvensering.
Biobankede hudprøver vil bli analysert ved immunfarging og bildebehandlingsteknikker for å identifisere celletyper i lesjoner og sammenligne dem med sunn hud.
Celler isolert fra biobankede blod- og hudprøver vil bli dyrket in vitro og proteiner vil bli analysert med ELISA (utskilte proteiner) og western blot (celleproteiner).
|
|
Biobank- prøver fra kontroller
2'700 anonymiserte kontrollgenomer samt 150 anonymiserte kontrollprøver for proteomikk-tilnærmingen kan brukes som kontrollprøver fra biobanken til dermatologisk avdeling ved Universitetssykehuset Zürich (Biobank Dermatology USZ).
|
DNA-ekstraksjon fra blod- eller spyttprøver for identifikasjon av genvarianter ved neste generasjons sekvensering;
RNA-ekstraksjon fra blod- og hudprøver for Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekvensering.
Biobankede hudprøver vil bli analysert ved immunfarging og bildebehandlingsteknikker for å identifisere celletyper i lesjoner og sammenligne dem med sunn hud.
Celler isolert fra biobankede blod- og hudprøver vil bli dyrket in vitro og proteiner vil bli analysert med ELISA (utskilte proteiner) og western blot (celleproteiner).
|
|
Ferske hudprøver fra friske givere
Det kreves maksimalt 20 ferske hudprøver fra friske donorer per hudlokalisering.
De vil bli forespurt fra friske frivillige etter informasjon om studien og mottatt informert samtykke.
|
DNA-ekstraksjon fra blod- eller spyttprøver for identifikasjon av genvarianter ved neste generasjons sekvensering;
RNA-ekstraksjon fra blod- og hudprøver for Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekvensering.
Biobankede hudprøver vil bli analysert ved immunfarging og bildebehandlingsteknikker for å identifisere celletyper i lesjoner og sammenligne dem med sunn hud.
Celler isolert fra biobankede blod- og hudprøver vil bli dyrket in vitro og proteiner vil bli analysert med ELISA (utskilte proteiner) og western blot (celleproteiner).
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Antall proteinkodende sjeldne varianter assosiert med former for NMID
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
|
Det primære endepunktet består i bestemmelse av assosiasjon mellom nylig identifiserte eller tidligere rapporterte sjeldne genvarianter og en eller flere former for NMID. Oppdagelsen av slike genetiske varianter vil føre til identifisering av defekte molekylære mekanismer involvert i unormale kutane immunreaksjoner hos disse pasientene: - Statistisk signifikant assosiasjon mellom genetiske data og NMID
|
engangsvurdering ved baseline
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Imaging massecytometri
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
|
Det sekundære endepunktet vil bestå i å bestemme konsekvenser på molekylære og cellulære nivåer av genvarianter og deretter kodede proteiner i de kutane lesjonene fra NMID-pasienter ved måling av proteininteraksjoner og nettverk, immunceller, cytokiner og reseptorer i form av NMID statistisk signifikant assosiasjon av utvalgte reaksjonsovervåkingsresultater inkludert: -Imaging Mass Cytometri
|
engangsvurdering ved baseline
|
|
RNA uttrykk
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
|
Det sekundære endepunktet vil bestå i å bestemme konsekvenser på molekylære og cellulære nivåer av genvarianter og deretter kodede proteiner i de kutane lesjonene fra NMID-pasienter ved måling av proteininteraksjoner og nettverk, immunceller, cytokiner og reseptorer i form av NMID statistisk signifikant assosiasjon av utvalgte reaksjonsovervåkingsresultater inkludert: - RNA-ekspresjon
|
engangsvurdering ved baseline
|
|
Antall immunceller
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
|
Det sekundære endepunktet vil bestå i å bestemme konsekvenser på molekylære og cellulære nivåer av genvarianter og deretter kodede proteiner i de kutane lesjonene fra NMID-pasienter ved måling av proteininteraksjoner og nettverk, immunceller, cytokiner og reseptorer i form av NMID statistisk signifikant assosiasjon av utvalgte reaksjonsovervåkingsresultater inkludert: - Antall immunceller
|
engangsvurdering ved baseline
|
|
Proteinkvantifisering (ELISA)
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
|
Det sekundære endepunktet vil bestå i å bestemme konsekvenser på molekylære og cellulære nivåer av genvarianter og deretter kodede proteiner i de kutane lesjonene fra NMID-pasienter ved måling av proteininteraksjoner og nettverk, immunceller, cytokiner og reseptorer i form av NMID statistisk signifikant assosiasjon av utvalgte reaksjonsovervåkingsresultater inkludert: - Proteinkvantifisering (ELISA)
|
engangsvurdering ved baseline
|
|
Hastighet for gjennomsnittlig fluorescensintensitet for immunceller
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
|
Det sekundære endepunktet vil bestå i å bestemme konsekvenser på molekylære og cellulære nivåer av genvarianter og deretter kodede proteiner i de kutane lesjonene fra NMID-pasienter ved måling av proteininteraksjoner og nettverk, immunceller, cytokiner og reseptorer i form av NMID statistisk signifikant assosiasjon av utvalgte reaksjonsovervåkingsresultater inkludert: - Gjennomsnittlig fluorescensintensitet for immunceller
|
engangsvurdering ved baseline
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
3. februar 2023
Primær fullføring (Antatt)
1. september 2029
Studiet fullført (Antatt)
1. september 2029
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
30. januar 2023
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
8. februar 2023
Først lagt ut (Faktiske)
17. februar 2023
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
22. august 2023
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
21. august 2023
Sist bekreftet
1. august 2023
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 2020-02645; sp19Navarini3
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .