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Architecture génétique des maladies cutanées inflammatoires médiées par les neutrophiles (NEUTROSKIN)

21 août 2023 mis à jour par: University Hospital, Basel, Switzerland

Étude cas-témoins de l'architecture génétique des maladies cutanées inflammatoires médiées par les neutrophiles

Cette étude vise à identifier les mutations rares et pathogènes de plusieurs dermatoses rares à neutrophiles. Pour identifier les associations entre le NMID et les variants du génome, le séquençage de nouvelle génération, principalement le séquençage de l'exome entier, sera utilisé. Dans une deuxième approche, le niveau d'expression de protéines inflammatoires déjà connues dans des échantillons de peau sera étudié.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

L'origine des dermatoses inflammatoires rares et sévères en dermatologie est insuffisamment connue. Ils ont en commun la présence et l'activation des phagocytes, affectent la qualité de vie par la douleur, l'inflammation et la défiguration, et peuvent même être mortels. Cette étude vise à s'appuyer sur les conclusions selon lesquelles plusieurs de ces dermatoses inflammatoires médiées par les neutrophiles (NMID) ont un arrière-plan génétique et à identifier les mutations rares et pathogènes de plusieurs dermatoses neutrophiles rares. Cette étude cas-témoin non clinique est un projet de recherche avec du matériel biologique et des données liées à la santé. Pour identifier les associations entre le NMID et les variants du génome, le séquençage de nouvelle génération, principalement le séquençage de l'exome entier, sera utilisé. Dans une deuxième approche, le niveau d'expression de protéines inflammatoires déjà connues dans des échantillons de peau sera étudié. Les données sont obtenues et vérifiées à l'aide de méthodes standardisées comme par ex. Nanostring, séquençage d'ARN et réaction en chaîne par polymérase (PCR) qRT, tests de protéomique et immunohistochimie ainsi que cytométrie en flux et imagerie de cytométrie de masse, ELISA et Western Blot.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

3370

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Sauvegarde des contacts de l'étude

Lieux d'étude

  • Suisse
      • Basel, Suisse, 4031
        • Recrutement
        • University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
        • Chercheur principal:
          • Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
        • Contact:
        • Contact:

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans à 100 ans (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Oui

Méthode d'échantillonnage

Échantillon de probabilité

Population étudiée

Les participants à l'étude seront en grande partie recrutés par a.) des biopsies de patients collectées de manière prospective dans des biobanques ou b.) en analysant, contactant et incluant/excluant la population de patients existante de notre clinique (tissus FFPE).

Une peau saine est obtenue à partir de patients subissant une chirurgie plastique à l'USB. Ces patients seront informés et leur consentement éclairé obtenu avant l'intervention chirurgicale.

La description

Critère d'intégration:

  • consentement écrit de la personne participante
  • diagnostic d'une maladie dans le groupe de formulaires NMID ou proposant du groupe témoin

Critères d'exclusion pour les patients :

  • Consentement éclairé manquant si échantillons prélevés après 2014
  • pas de diagnostic de NMID

Critères d'exclusion pour les témoins sains :

  • Absence de consentement éclairé

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Biobanque - échantillons de patients NMID
600 échantillons de patients NMID de la Biobank Dermatology Unispital Basel (USB) (Biobank USB) et de la biobanque du Département de dermatologie de l'Hôpital universitaire de Zürich (USZ) (Biobank USZ) seront inclus.
Autre: Analyse des échantillons
Extraction d'ADN à partir d'échantillons de sang ou de salive pour l'identification de variants génétiques par séquençage de nouvelle génération ;
Autre: Analyse des échantillons
Extraction d'ARN à partir d'échantillons de sang et de peau pour analyses Nanostring, RT-PCR quantitative ou séquençage d'ARN.
Autre: Analyse des échantillons
Des échantillons de peau biobanqués seront analysés par des techniques d'immunomarquage et d'imagerie pour identifier les types de cellules dans les lésions et les comparer à une peau saine.
Autre: Analyse des échantillons
Les cellules isolées à partir d'échantillons de sang et de peau biobanqués seront cultivées in vitro et les protéines seront analysées par ELISA (protéines sécrétées) et western blot (protéines cellulaires).
Échantillons fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE)
Une cinquantaine d'échantillons fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE) de l'USB de dermatologie collectés avant 2014 pour des analyses d'expression d'ARN et de protéines seront réutilisés. Les patients concernés sont informés de l'étude et de l'utilisation codée de leurs échantillons.
Autre: Analyse des échantillons
Extraction d'ADN à partir d'échantillons de sang ou de salive pour l'identification de variants génétiques par séquençage de nouvelle génération ;
Autre: Analyse des échantillons
Extraction d'ARN à partir d'échantillons de sang et de peau pour analyses Nanostring, RT-PCR quantitative ou séquençage d'ARN.
Autre: Analyse des échantillons
Des échantillons de peau biobanqués seront analysés par des techniques d'immunomarquage et d'imagerie pour identifier les types de cellules dans les lésions et les comparer à une peau saine.
Autre: Analyse des échantillons
Les cellules isolées à partir d'échantillons de sang et de peau biobanqués seront cultivées in vitro et les protéines seront analysées par ELISA (protéines sécrétées) et western blot (protéines cellulaires).
Biobanque - échantillons de témoins
2'700 génomes de contrôle anonymisés ainsi que 150 échantillons de contrôle anonymisés pour l'approche protéomique peuvent être utilisés comme échantillons de contrôle de la biobanque du service de dermatologie de l'hôpital universitaire de Zürich (Biobank Dermatology USZ).
Autre: Analyse des échantillons
Extraction d'ADN à partir d'échantillons de sang ou de salive pour l'identification de variants génétiques par séquençage de nouvelle génération ;
Autre: Analyse des échantillons
Extraction d'ARN à partir d'échantillons de sang et de peau pour analyses Nanostring, RT-PCR quantitative ou séquençage d'ARN.
Autre: Analyse des échantillons
Des échantillons de peau biobanqués seront analysés par des techniques d'immunomarquage et d'imagerie pour identifier les types de cellules dans les lésions et les comparer à une peau saine.
Autre: Analyse des échantillons
Les cellules isolées à partir d'échantillons de sang et de peau biobanqués seront cultivées in vitro et les protéines seront analysées par ELISA (protéines sécrétées) et western blot (protéines cellulaires).
Échantillons de peau fraîche de donneurs sains
Un maximum de 20 échantillons de peau fraîche provenant de donneurs sains est requis par emplacement cutané. Elles seront demandées aux volontaires sains après information sur l'étude et réception du consentement éclairé.
Autre: Analyse des échantillons
Extraction d'ADN à partir d'échantillons de sang ou de salive pour l'identification de variants génétiques par séquençage de nouvelle génération ;
Autre: Analyse des échantillons
Extraction d'ARN à partir d'échantillons de sang et de peau pour analyses Nanostring, RT-PCR quantitative ou séquençage d'ARN.
Autre: Analyse des échantillons
Des échantillons de peau biobanqués seront analysés par des techniques d'immunomarquage et d'imagerie pour identifier les types de cellules dans les lésions et les comparer à une peau saine.
Autre: Analyse des échantillons
Les cellules isolées à partir d'échantillons de sang et de peau biobanqués seront cultivées in vitro et les protéines seront analysées par ELISA (protéines sécrétées) et western blot (protéines cellulaires).

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Nombre de variantes rares codant pour des protéines associées à des formes de NMID
Délai: évaluation unique au départ

Le critère d'évaluation principal consiste en la détermination de l'association entre des variants génétiques rares nouvellement identifiés ou précédemment signalés et une ou plusieurs formes de NMID. La découverte de tels variants génétiques conduira à l'identification de mécanismes moléculaires défectueux impliqués dans des réactions immunitaires cutanées anormales chez ces patients : - Association statistiquement significative entre les données génétiques et le NMID

  • Détection de variants rares codant pour des protéines associés à des formes de NMID
  • Identification de l'activation de l'inflammasome à différents stades du NMID
évaluation unique au départ

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Imagerie par cytométrie de masse
Délai: évaluation unique au départ
Le critère d'évaluation secondaire consistera en la détermination des conséquences aux niveaux moléculaire et cellulaire des variants géniques et ultérieurement des protéines codées dans les lésions cutanées des patients NMID par la mesure des interactions et réseaux protéiques, des cellules immunitaires, des cytokines et des récepteurs dans les formes de NMID par association statistiquement significative de résultats sélectionnés de surveillance de la réaction, y compris : -Cytométrie de masse par imagerie
évaluation unique au départ
Expression d'ARN
Délai: évaluation unique au départ
Le critère secondaire consistera en la détermination des conséquences aux niveaux moléculaire et cellulaire des variants géniques puis codés des protéines dans les lésions cutanées des patients NMID par la mesure des interactions et réseaux protéiques, des cellules immunitaires, des cytokines et des récepteurs dans les formes de NMID par association statistiquement significative de résultats de surveillance de réaction sélectionnés, notamment : - expression d'ARN
évaluation unique au départ
Nombre de cellules immunitaires
Délai: évaluation unique au départ
Le critère d'évaluation secondaire consistera en la détermination des conséquences aux niveaux moléculaire et cellulaire des variants géniques et ultérieurement des protéines codées dans les lésions cutanées des patients NMID par la mesure des interactions et réseaux protéiques, des cellules immunitaires, des cytokines et des récepteurs dans les formes de NMID par association statistiquement significative des résultats sélectionnés de surveillance des réactions, notamment : - Nombre de cellules immunitaires
évaluation unique au départ
Quantification des protéines (ELISA)
Délai: évaluation unique au départ
Le critère d'évaluation secondaire consistera en la détermination des conséquences aux niveaux moléculaire et cellulaire des variants géniques et ultérieurement des protéines codées dans les lésions cutanées des patients NMID par la mesure des interactions et réseaux protéiques, des cellules immunitaires, des cytokines et des récepteurs dans les formes de NMID par association statistiquement significative de résultats de surveillance de réaction sélectionnés, notamment : - Quantification des protéines (ELISA)
évaluation unique au départ
Taux d'intensité de fluorescence moyenne des cellules immunitaires
Délai: évaluation unique au départ
Le critère d'évaluation secondaire consistera en la détermination des conséquences aux niveaux moléculaire et cellulaire des variants géniques et ultérieurement des protéines codées dans les lésions cutanées des patients NMID par la mesure des interactions et réseaux protéiques, des cellules immunitaires, des cytokines et des récepteurs dans les formes de NMID par association statistiquement significative de résultats de surveillance de réaction sélectionnés, notamment : - Intensité de fluorescence moyenne des cellules immunitaires
évaluation unique au départ

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

University Hospital, Basel, Switzerland

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

3 février 2023

Achèvement primaire (Estimé)

1 septembre 2029

Achèvement de l'étude (Estimé)

1 septembre 2029

Dates d'inscription aux études

Première soumission

30 janvier 2023

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

8 février 2023

Première publication (Réel)

17 février 2023

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

22 août 2023

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

21 août 2023

Dernière vérification

1 août 2023

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • 2020-02645; sp19Navarini3

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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