Arquitectura genética de las enfermedades cutáneas inflamatorias mediadas por neutrófilos (NEUTROSKIN)
21 de agosto de 2023 actualizado por: University Hospital, Basel, Switzerland
Estudio de casos y controles de la arquitectura genética de las enfermedades cutáneas inflamatorias mediadas por neutrófilos
Este estudio es para identificar mutaciones raras que causan enfermedades de varias dermatosis de neutrófilos raras.
Para identificar asociaciones entre NMID y variantes en el genoma, se utilizará la secuenciación de próxima generación, principalmente la secuenciación del exoma completo.
En un segundo enfoque, se investigará el nivel de expresión de proteínas inflamatorias ya conocidas en muestras de piel.
Descripción general del estudio
Estado
Reclutamiento
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
El origen de las raras enfermedades inflamatorias graves de la piel en dermatología no se conoce suficientemente.
Tienen en común la presencia y activación de fagocitos, afectan la calidad de vida a través del dolor, la inflamación y la desfiguración, e incluso pueden ser fatales.
Este estudio tiene como objetivo aprovechar los hallazgos de que varias de estas dermatosis inflamatorias mediadas por neutrófilos (NMID) tienen antecedentes genéticos e identificar mutaciones raras que causan enfermedades de varias dermatosis de neutrófilos raras.
Este estudio no clínico de casos y controles es un proyecto de investigación con material biológico y datos relacionados con la salud.
Para identificar asociaciones entre NMID y variantes en el genoma, se utilizará la secuenciación de próxima generación, principalmente la secuenciación del exoma completo.
En un segundo enfoque, se investigará el nivel de expresión de proteínas inflamatorias ya conocidas en muestras de piel.
Los datos se obtienen y verifican utilizando métodos estandarizados como p.
Nanostring, secuenciación de ARN y reacción en cadena de la polimerasa qRT (PCR), ensayos de proteómica e inmunohistoquímica, así como citometría de flujo y citometría de masas de imágenes, ELISA y Western Blot.
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Estimado)
3370
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Estudio Contacto
- Nombre: Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Número de teléfono: +41 61 265 40 84
- Correo electrónico: alexander.navarini@usb.ch
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Emmanuel Contassot, Dr.
- Número de teléfono: +41 61 328 55 45
- Correo electrónico: emmanuel.contassot@usb.ch
Ubicaciones de estudio
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Basel, Suiza, 4031
- Reclutamiento
- University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
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Investigador principal:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
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Contacto:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Número de teléfono: +41 61 265 40 84
- Correo electrónico: alexander.navarini@usb.ch
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Contacto:
- Emmanuel Contassot, Dr.
- Número de teléfono: +41 61 328 55 45
- Correo electrónico: emmanuel.contassot@usb.ch
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Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
18 años a 100 años (Adulto, Adulto Mayor)
Acepta Voluntarios Saludables
Sí
Método de muestreo
Muestra de probabilidad
Población de estudio
Los participantes del estudio serán reclutados en gran medida mediante a.) biopsias de pacientes recolectadas prospectivamente de biobancos o b.) análisis, contacto e inclusión/exclusión de la población de pacientes existente de nuestra clínica (tejidos FFPE).
Se obtiene piel sana de pacientes sometidos a cirugía plástica en la USB. Estos pacientes serán informados y se obtendrá su consentimiento informado antes de la cirugía.
Descripción
Criterios de inclusión:
- consentimiento por escrito de la persona participante
- diagnóstico de una enfermedad en el grupo de forma NMID o probando del grupo de control
Criterios de exclusión para pacientes:
- Falta el consentimiento informado si las muestras se recolectaron después de 2014
- sin diagnóstico de NMID
Criterios de exclusión para controles sanos:
- Falta consentimiento informado
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
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Biobanco- muestras de pacientes NMID
Se incluirán 600 muestras de pacientes NMID del Biobank Dermatology Unispital Basel (USB) (Biobank USB) y del biobanco del Departamento de Dermatología del University Hospital Zürich (USZ) (Biobank USZ).
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Extracción de ADN de muestras de sangre o saliva para la identificación de variantes genéticas mediante secuenciación de próxima generación;
Extracción de ARN de muestras de sangre y piel para análisis de Nanostring, RT-PCR cuantitativa o secuenciación de ARN.
Las muestras de piel del biobanco se analizarán mediante inmunotinción y técnicas de imagen para identificar los tipos de células en las lesiones y compararlas con la piel sana.
Las células aisladas de muestras de piel y sangre del biobanco se cultivarán in vitro y las proteínas se analizarán mediante ELISA (proteínas secretadas) y western blot (proteínas celulares).
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Muestras fijadas en formalina e incluidas en parafina (FFPE)
Se reutilizarán unas 50 muestras fijadas en formalina e incluidas en parafina (FFPE) del Dermatology USB recolectadas antes de 2014 para análisis de expresión de ARN y proteínas.
Los pacientes en cuestión son informados sobre el estudio y el uso codificado de sus muestras.
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Extracción de ADN de muestras de sangre o saliva para la identificación de variantes genéticas mediante secuenciación de próxima generación;
Extracción de ARN de muestras de sangre y piel para análisis de Nanostring, RT-PCR cuantitativa o secuenciación de ARN.
Las muestras de piel del biobanco se analizarán mediante inmunotinción y técnicas de imagen para identificar los tipos de células en las lesiones y compararlas con la piel sana.
Las células aisladas de muestras de piel y sangre del biobanco se cultivarán in vitro y las proteínas se analizarán mediante ELISA (proteínas secretadas) y western blot (proteínas celulares).
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Biobanco- muestras de controles
2700 genomas de control anonimizados, así como 150 muestras de control anonimizadas para el enfoque proteómico, se pueden utilizar como muestras de control del biobanco del Departamento de Dermatología del Hospital Universitario de Zúrich (Biobank Dermatology USZ).
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Extracción de ADN de muestras de sangre o saliva para la identificación de variantes genéticas mediante secuenciación de próxima generación;
Extracción de ARN de muestras de sangre y piel para análisis de Nanostring, RT-PCR cuantitativa o secuenciación de ARN.
Las muestras de piel del biobanco se analizarán mediante inmunotinción y técnicas de imagen para identificar los tipos de células en las lesiones y compararlas con la piel sana.
Las células aisladas de muestras de piel y sangre del biobanco se cultivarán in vitro y las proteínas se analizarán mediante ELISA (proteínas secretadas) y western blot (proteínas celulares).
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Muestras de piel fresca de donantes sanos
Se requiere un máximo de 20 muestras de piel fresca de donantes sanos por ubicación de la piel.
Se solicitarán a voluntarios sanos previa información sobre el estudio y obtenido el consentimiento informado.
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Extracción de ADN de muestras de sangre o saliva para la identificación de variantes genéticas mediante secuenciación de próxima generación;
Extracción de ARN de muestras de sangre y piel para análisis de Nanostring, RT-PCR cuantitativa o secuenciación de ARN.
Las muestras de piel del biobanco se analizarán mediante inmunotinción y técnicas de imagen para identificar los tipos de células en las lesiones y compararlas con la piel sana.
Las células aisladas de muestras de piel y sangre del biobanco se cultivarán in vitro y las proteínas se analizarán mediante ELISA (proteínas secretadas) y western blot (proteínas celulares).
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Número de variantes raras que codifican proteínas asociadas con formas de NMID
Periodo de tiempo: evaluación única al inicio
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El criterio principal de valoración consiste en la determinación de la asociación entre variantes genéticas raras recientemente identificadas o notificadas previamente y una o más formas de NMID. El descubrimiento de tales variantes genéticas conducirá a la identificación de mecanismos moleculares defectuosos implicados en reacciones inmunes cutáneas anormales en estos pacientes: - Asociación estadísticamente significativa entre datos genéticos y NMID
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evaluación única al inicio
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Citometría de masas de imágenes
Periodo de tiempo: evaluación única al inicio
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El criterio de valoración secundario consistirá en la determinación de las consecuencias a nivel molecular y celular de las variantes genéticas y las proteínas codificadas posteriormente en las lesiones cutáneas de los pacientes con NMID mediante la medición de las interacciones y redes de proteínas, células inmunitarias, citoquinas y receptores en formas de NMID por asociación estadísticamente significativa de resultados de monitoreo de reacciones seleccionadas que incluyen: -Citometría de masas de imágenes
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evaluación única al inicio
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Expresión de ARN
Periodo de tiempo: evaluación única al inicio
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El criterio de valoración secundario consistirá en la determinación de las consecuencias a nivel molecular y celular de las variantes genéticas y, posteriormente, las proteínas codificadas en las lesiones cutáneas de los pacientes con NMID mediante la medición de las interacciones y redes de proteínas, células inmunitarias, citocinas y receptores en formas de NMID por asociación estadísticamente significativa de resultados de monitoreo de reacciones seleccionadas, que incluyen: - expresión de ARN
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evaluación única al inicio
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Recuento de células inmunitarias
Periodo de tiempo: evaluación única al inicio
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El criterio de valoración secundario consistirá en la determinación de las consecuencias a nivel molecular y celular de las variantes genéticas y, posteriormente, las proteínas codificadas en las lesiones cutáneas de los pacientes con NMID mediante la medición de las interacciones y redes de proteínas, células inmunitarias, citocinas y receptores en formas de NMID por Asociación estadísticamente significativa de resultados de monitoreo de reacciones seleccionadas, que incluyen: - Recuento de células inmunitarias
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evaluación única al inicio
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Cuantificación de proteínas (ELISA)
Periodo de tiempo: evaluación única al inicio
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El criterio de valoración secundario consistirá en la determinación de las consecuencias a nivel molecular y celular de las variantes genéticas y las proteínas codificadas posteriormente en las lesiones cutáneas de los pacientes con NMID mediante la medición de las interacciones y redes de proteínas, células inmunitarias, citoquinas y receptores en formas de NMID por asociación estadísticamente significativa de resultados de monitoreo de reacciones seleccionadas que incluyen: - Cuantificación de proteínas (ELISA)
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evaluación única al inicio
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Tasa de intensidad de fluorescencia media de las células inmunitarias
Periodo de tiempo: evaluación única al inicio
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El criterio de valoración secundario consistirá en la determinación de las consecuencias a nivel molecular y celular de las variantes genéticas y, posteriormente, las proteínas codificadas en las lesiones cutáneas de los pacientes con NMID mediante la medición de las interacciones y redes de proteínas, células inmunitarias, citocinas y receptores en formas de NMID por asociación estadísticamente significativa de los resultados de monitoreo de reacciones seleccionadas que incluyen: - Intensidad de fluorescencia media de las células inmunitarias
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evaluación única al inicio
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Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
3 de febrero de 2023
Finalización primaria (Estimado)
1 de septiembre de 2029
Finalización del estudio (Estimado)
1 de septiembre de 2029
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
30 de enero de 2023
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
8 de febrero de 2023
Publicado por primera vez (Actual)
17 de febrero de 2023
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
22 de agosto de 2023
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
21 de agosto de 2023
Última verificación
1 de agosto de 2023
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- 2020-02645; sp19Navarini3
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
No
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
No
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .